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酵母双杂交报告基因β半乳糖苷酶活性测定方法的研究《上海交通...
来自 : mayitao

JournalofShanghai

JiaotongUniversity(MedicalScience)

文章编号:0258—5898(2009)02—0236一05

技术与方法

酵母双杂交报告基因13一半乳糖苷酶活性测定方法的研究

尽1,

王海侠2。

李京敬1。俞雁1

(1.上海交通大学农业与生物学院上海市兽医生物技术重点实验室,上海200240;2.安徽科技学院理学院,凤阳233100)摘

要:目的建立标准的酵母双杂交系统报告基因表达的B一半乳糖苷酶活性测定方法。方ii采用0一硝基一B—D一半乳

糖苷(ONPG)为底物,以液氮反复冻融破碎酵母细胞壁,通过比较不同测定时间、接种阳性克隆数目、转化方法以及酵母株对B一半乳糖苷酶酶活的影响,确定最佳酶活测定条件。结景相同条件下,单个克隆之间的酶活有差异,相对标准偏差(RSD)>

8%;相同条件下,Y】87酵母株比AHl09酵母株酶活高18—20倍,并且本底水平很低甚至没有;双倍体酵母的酶活介于两个单倍体酵母之间,同预计一致;质粒顺序转化与共转化在AHl09中差异有统计学意义(P<0.001),而在Y187中没有明显差异

(P>0.05)。结论测定酵母双杂交报告基因B一半乳糖苷酶的活性宜采用Y187酵母株,酶活变化范围大,本底小,受转化方法

影响小,测定时选取5个以上阳性克隆混合培养更有利于酶活的准确测定。

关键词:酵母双杂交;中图分类号:Q55

8一半乳糖苷酶;

文献标志码:B

蛋白互作;

酶活测定

酵母双杂交技术是1989年由美国科学家Fields等…人提出的,由于操作简便,该技术一出现便迅速得到广泛应用。经过近20年的不断完善和发展,已经衍生出酵母单杂交旧1、酵母三杂交o和酵母反杂交。等多种技术,并且已经实现高通量和自动化。作为发现和研究在活细胞体内的蛋白质与蛋白质之间的相互作用的最成熟的技术平台,酵母双杂交技术是后基因组时代最常用的方法之一。现在,利用

该技术已经把人‘5。引、果蝇‘7|、线虫‘83和酵母‘93等模式动物的蛋白质组水平的互作图谱绘制完成。

Y187分别属于a型和o【型单倍体酵母株,并带有多种氨基酸等营养缺陷标记,可分别用于作为“猎物”AD融合蛋白和作为“诱饵”的BD融合蛋白的宿主。然后,通过相互作用的蛋白“拉”近GAlA的两个结构域,使其恢复转录活性,启动下游报告的表达。

由于d一半乳糖苷酶在AHl09中是分泌表达,而B一半乳糖苷酶只能表达在酵母细胞内,所以相对于d一半乳糖苷酶的检测,B一半乳糖苷酶的检测更为复杂。本文通过对酵母双杂交系统中诱导的B一半乳糖苷酶活性测定方法多种影响因素的系统考察,拟将B一半乳糖苷酶这一报告基因的酶活测定方法标准化,为相关研究人员提供参考。1材料与方法

1.1

酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的,其原理巧妙利用了酵母反式转录激活因子的组件式结构。以酵母转录因子GAlA为例,结构上可以分为功能上相互独立的结构域,DNA结合结构域

(bindingdomain,BD)和转录激活结构域(activation

材料采用基于GAlA的酵母双杂交系统3

domain,AD)。这两个结构域分开时仍分别具有功能,但不能激活转录,只有当被分开的两个结构域通过适当的途径在空间上较为接近时,才能重新呈现完整的GAL4转录因子活性,并可结合到上游激活序

列(upstream

activating

(Clontech)为操作平台,包括AD、BD空载体,构建完

毕的SV40T抗原和激活结构域融合蛋白质粒AD-T,以及与之配对用于阳性对照的BD.53(Murinep53)和用于阴性对照的BD—Lam(HumanlaminC)。野生

sequence,UAS),激活下游的

型GAlA为构建到AD质粒上的全长的酵母转录因子,包含天然的激活结构域和DNA结合结构域、基础

氮源培养基和全营养培养基(Clontech);各种氨基酸以及PEG3350、醋酸锂、二甲亚砜(dimethylsulfoxide,DMSO)、O一硝基一B—D一半乳糖苷(o-nitrophenylB-Dgalactopyranoside,ONPG)和X-gal(Sigma);Herring

TestesCarrierDNA(Invitrogen);琼脂糖(Biowest);质

启动子,使启动子下游报告基因得以转录。

酵母菌的生活史属于双单性类型,它们的单倍体细胞和二倍体细胞都能进行无限制的分裂。一般单倍体有a和d两种接合型,不同接合型的单倍体酵母株细胞接合生成二倍体细胞0|。基于GAL4的酵母双杂交系统3采用的两个酵母株AHl09和

基金项目:国家高技术研究发展计划(。863”计划)(2007AA022149);安徽省优秀入才基金项目(2006JQlt96)。作者简介:郜尽(1976一)。男.博士生;电子信箱:g..jin@Bjtuedu.cn。通讯作者:俞雁.电子信箱:yanyu@ajta.edu.ca。

万方数据


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