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试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
3.1可溶性总蛋白的提取方法(三氯乙酸/丙酮法)

(1)从拟南芥细胞悬浮培养液中收集细胞。

(2)液氮中研磨细胞。

(3)向研磨好的细胞粉末中加入提取液,在-20℃放置至少30min(见注释7)。

(4)42000g离心以除去不溶物,用洗涤液(见注释8)清洗3次(见注释8)。

(5)将管子放置在空气中使其干燥。

(6)在溶解液中振荡沉淀2h溶解蛋白(见注释9)。

(7)根据Bradford法[3,4]测定蛋白浓度,使用等份样品和血清白蛋白作标准曲线(等份样品是指相同比例的溶液)。

3.2双向凝胶电泳

(1)直接用第一向电泳溶液相匹配的100μg蛋白质溶液水化IPG胶条(18cm,pH4.0~7.0)。

(2)进行等电聚焦直至100kV/h。

(3)进行第二向电泳前,在还原液中将蛋白质还原后再用烷化液将蛋白质进行烷基化处理,两者各15min。

(4)将胶条用琼脂糖溶液包埋在11%的丙烯酰胺胶的顶端。

(5)在电泳缓冲液中进行SDS-PAGE,每块胶15mA,10°C过夜(见注释10)。

3.3CCB染色和成像(见注释11、注释12)

根据Neuhoff等的方法对凝胶进行染色。每一步操作中,每块胶使用300ml溶液。所有操作均需振荡。

(1)将凝胶浸没在固定液中至少2h或者过夜以固定蛋白。

(2)用水清洗凝胶三次,共30min。

(3)将凝胶转移到培育液中培育1h (见注释13),然后再转移到染色液中(见注释13、注释14)。

(4)轻微振荡,在染色液中显影5天。

(5)用水清洗凝胶,用扫描仪在300dpi分辨率下获取图像(图14-1)。


3.4SN染色和成像(见注释11、注释12)

根据Mortz等[15]的方法对凝胶进行染色。每一步操作中,每块胶使用300ml溶液。所有操作均需振荡。

(1)将凝胶浸没在固定液中至少2min或者过夜以固定蛋白质。

(2)用洗涤液清洗凝胶3次共20min。

(3)在敏化液中短时间浸泡凝胶(2min)(见注释15)。

(4)用水清洗凝胶3次,5min。

(5)在染色液中浸染凝胶20min。

(6)用水快速清洗凝胶2次共1min。

(7)将凝胶放入显色液中5~10min (见注释16)。

(8)在终止液中终止显色5min后将凝胶转移到贮存液中。

(9)使用扫描仪在300dpi分辨率下获得图像(图14-1)。

3.5SR染色和成像(见注释11、注释12和注释17)

每一步操作中,每块胶使用300ml溶液。所有操作均需振荡。

(1)将凝胶浸没在固定液中30min以固定蛋白。

(2)凝胶在染色液中侵染至少30min(最多1h)。

(3)用洗涤液清洗凝胶30min。

(4)使用带473nm激光激发和长通道滤光镜Y510的FLA-5000分析仪获取图像。选择条件为100μm分辨率、16位灰度、光电管电压700V(图14-2)。



3.6DP染色和成像(见注释11、注释12和注释17)

每一步操作中,每块胶使用300ml溶液。所有操作均需振荡。

(1)将凝胶浸没在固定液中1h以固定蛋白。

(2)用水清洗凝胶4次,每次10min。

(3)凝胶在染色液中浸染1h。

(4)用洗涤液1清洗凝胶2次、10min,然后再用洗涤液2清洗2次,10min。

(5)使用带532nm激光激发和长通道滤光镜0575的FLA-5000分析仪获取图像。选择条件为100μm分辨率、16位灰度、光电管电压700V(图14-2)。

3.7C16-F染色和成像(见注释10、注释11、注释17和注释18)

根据Kang等[27]的方法对凝胶进行染色。每一步操作中,每块胶使用300ml溶液。所有操作均需振荡。

(1)将凝胶浸没在固定液和染色液中对蛋白同时进行固定和染色。

(2)用洗涤液至少清洗凝胶2次,每次5min。

(3)使用带473nm激光激发和长通道滤光镜Y510的FLA-5000分析仪获取图像,选择条件为100μm分辨率、16位灰度、光电管电压700V (图14-2)。

3.8染料间的比较

以上染色方法中,当上样为100μg拟南芥组培细胞中提取的总可溶性蛋白时,CCB通常可检出250个蛋白质点,C16-F可检出450个蛋白质点、DP可检出550个蛋白质点、SN可检出600个蛋白质点、SR可检出800个蛋白质点(图14-1和图14-2)。表14-1中总结了这些方法的主要特征。根据染料类型、染色步骤和操作时间对染色方法进行了比较。图像质量通过背景效果、点饱和度和染料敏感度进行了评价。