【求助】线粒体tRNA的预测问题
2021-08-16
问题描述：
我用获得的线粒体全基因组序列在网上预测tRNA,预测用的软件为tRNAscan-SE1.21（http://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE/）。
我是这样进行预测的：在“SearchMode:”中选择“rRNAscanonly:”，在“sorce”中选择“mito/chloroplast”,粘贴序列，运行程序。得到了21个tRNA，而鱼中应该是22个tRNA，我觉得很奇怪，在“SearchMode:”和“rRNAscanonly:”中进行其它的设置，都不能得到22个tRNA.
我看的一篇文献“CompletemitochondrialDNAsequenceoftheJapanese
flyingfishCypselurushiraii”中也是说22个tRNA,但是我把文章提交的序列（Genbank号为AB182653.）拿到网上提交，只有21个tRNA，我觉得很奇怪。
不知道是怎么回事？请高手指点，那个软件好像是比较权威的。
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hxppxh
用户
用什么软件可以预测tRNA的二级结构呢?
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名不聊生
用户我也想知道怎么出来的，正在努力找。。。。。
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