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【求助】提组织总RNA不用匀浆器只用液氮研磨行吗
2021-07-20
问题描述:

同学都说提组织总RNA,不用匀浆器只用液氮研磨足够了,但为什么我的总是降解呢?

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wldy0208
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我是用组织提取RNA的,总体来讲,提RNA就怕降解,我是在夏天空调间做的,开始的时候有一批都不是很好,但是总的来讲,组织里的RNA量应该足够的。你提RNA的容器一定要灭RNA酶,我们的办法是包括离心管枪头等都用DEPC水浸泡至少半天,有的文献是1hs就可,然后放在也浸泡过的饭盒(铝质)中高压灭菌,做的时候要戴口罩,手套和帽子,因为有RNA酶的问题,我用匀浆器的处理组织,处理时同时加入1ml trizol,组织不要太大,像上面提的只要半粒绿豆大小约40mg就可(组织取材没有特别要求,我是取下后立即用生理盐水或PBS洗2遍,然后放入已DEPC处理的冻存管中直接浸入液氮,用时直接取出就可),整个过程都在冰上进行,以减少降解。下面是我提RNA的步骤。RNA的抽提:(1~6步骤放在冰上)总RNA最后保存在-80 oC中1.从组织标本置于匀浆器中,同时加入1mlTrizol匀浆并充分溶解。2.加入200ul氯仿,猛烈颠倒20次,充分混匀。放置5分钟。3.4oC、12000g离心15min。4.转移上清至1.5mlEP管中,加入异丙醇500ul混匀(上下颠倒几次,放置10分钟),沉淀2-3分钟后,4oC、12000g离心15min。5.弃去上清,加入600ul75%乙醇混匀;4oC、12000g离心5min~10min)。6.弃去上清,加无水乙醇800ul,混匀;4oC、12000g离心5min~10min)。7.弃去上清,干燥。加DEPC水溶解,定量并将RNA浓度调至0.5ug/ul。这样的RNA用DNA/RNA测定仪测定混合物的浓度和纯度,测定OD260/OD280值能在1.8~2.2之间,我的结果大部分在1.9左右。以上心得仅供参考。
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高枕无忧
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液氮研磨就足够了。降解是你中间什么步骤出了问题吧。比如:1.你的研钵在用之前要灭RNA酶,倒点酒精烧烧就可以了。2.淹没后及时转移,不要等样品融化了再转移。3.操作过程多换手套,少说话,呵呵,防止RNA酶污染。估计其他的你也都注意到了吧,小心操作就是。
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phoenix77
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用液氮研磨就足够了我们前段时间一直在提小鼠各个器官的RNA,提出来的效果都还不错在提的过程中我觉得应该注意几点:1、你的研体和研棒和小勺一定要灭RNA酶。如果不放心用锡箔纸包了高温干烤一下。2、样品在研磨过程中一定始终都要在液氮里,也就是说研磨过程中液氮不能干。希望对你有所帮助
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zhou8p1228
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磨的过程中要注意手套不要到处摸,最好一个就换个手套。
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xxboy
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该注意的都注意了,我只是想补充一点,但很关键:就是用液氮捻磨时,等到组织变成POWDER了(这个过程要及时或者一直保持组织在液氮中),就及时加trizol,然后立即补从液氮,慢慢磨,反复几次。就不用担心因研磨样品而降解组织的问题了!若有问题,就是你取组织的那一步没有把握好时间和操作。我一直都这样做,做表达谱芯片、小RNA表达谱芯片结果都不错!好运!
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72hours
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请问从细胞提取RNA需要匀浆或研磨吗?如果需要,请问应该注意什么?
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applepie118
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1。从细胞中提取RNA是不需要匀浆或是研磨的,其实离开本来生存的环境,不论是细胞还是组织都有可能降解RNA,所以其实要缩短研磨或是匀浆的时间,所以细胞是没有必要研磨的,组织研磨是因为单单靠TRIZOL来裂解他是没有办法是RNA完全释放的,因为组织不像细胞只是一层细胞壁而已有很多其他的物质影响RNA的释放2。我一般使用匀浆器,因为液氮操作起来比较危险,而且液氮要不断加入比较浪费时间,其实匀浆的关键是彻底才能避免杂质污染,最好匀浆后离心一次去除沉淀,恐怕和DEPC处理有关,大凡作RNA的人其实操作都很小心,最关键的就是样本质量以及DEPC处理的问题,只要注意这两点一般是可以得到很好结果的
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wldy0208
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细胞的提取RNA不要研磨的,只要用trizol就可,而组织的话我喜欢用匀浆器研磨都在冰上进行,同时trizol可以减少RNA的降解,经验就是组织千万不要太大,半粒绿豆大小就足够提取RNA了。
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shirlly
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我还想咨询一下,取样这个最前面的步骤需要注意哪些?比方说时间,取样点之类的有没有什么要求,我是学动物营养与饲料科学的
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shirlly
  用户
上次帮师姐做过一批,RNA倒是有浓度可是恨低,不在允许的范围之内,采取的是匀浆方法,百思不得其解。请教。
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wldy0208
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我是用组织提取RNA的,总体来讲,提RNA就怕降解,我是在夏天空调间做的,开始的时候有一批都不是很好,但是总的来讲,组织里的RNA量应该足够的。你提RNA的容器一定要灭RNA酶,我们的办法是包括离心管枪头等都用DEPC水浸泡至少半天,有的文献是1hs就可,然后放在也浸泡过的饭盒(铝质)中高压灭菌,做的时候要戴口罩,手套和帽子,因为有RNA酶的问题,我用匀浆器的处理组织,处理时同时加入1mltrizol,组织不要太大,像上面提的只要半粒绿豆大小约40mg就可(组织取材没有特别要求,我是取下后立即用生理盐水或PBS洗2遍,然后放入已DEPC处理的冻存管中直接浸入液氮,用时直接取出就可),整个过程都在冰上进行,以减少降解。下面是我提RNA的步骤。RNA的抽提:(1~6步骤放在冰上)总RNA最后保存在-80oC中1.从组织标本置于匀浆器中,同时加入1mlTrizol匀浆并充分溶解。2.加入200ul氯仿,猛烈颠倒20次,充分混匀。放置5分钟。3.4oC、12000g离心15min。4.转移上清至1.5mlEP管中,加入异丙醇500ul混匀(上下颠倒几次,放置10分钟),沉淀2-3分钟后,4oC、12000g离心15min。5.弃去上清,加入600ul75%乙醇混匀;4oC、12000g离心5min~10min)。6.弃去上清,加无水乙醇800ul,混匀;4oC、12000g离心5min~10min)。7.弃去上清,干燥。加DEPC水溶解,定量并将RNA浓度调至0.5ug/ul。这样的RNA用DNA/RNA测定仪测定混合物的浓度和纯度,测定OD260/OD280值能在1.8~2.2之间,我的结果大部分在1.9左右。以上心得仅供参考。
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G37012042
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展开引用wldy0208我是用组织提取RNA的,总体来讲,提RNA就怕降解,我是在夏天空调间做的,开始的时候有一批都不是很好,但是总的来讲,组织里的RNA量应该足够的。你提RNA的容器一定要灭RNA酶,我们的办法是包括离心管枪头等都用DEPC水浸泡至少半天,有的文献是1hs就可,然后放在也浸泡过的饭盒(铝质)中高压灭菌,做的时候要戴口罩,手套和帽子,因为有RNA酶的问题,我用匀浆器的处理组织,处理时同时加入1mltrizol,组织不要太大,像上面提的只要半粒绿豆大小约40mg就可(组织取材没有特别要求,我是取下后立即用生理盐水或PBS洗2遍,然后放入已DEPC处理的冻存管中直接浸入液氮,用时直接取出就可),整个过程都在冰上进行,以减少降解。下面是我提RNA的步骤。RNA的抽提:(1~6步骤放在冰上)总RNA最后保存在-80oC中1.从组织标本置于匀浆器中,同时加入1mlTrizol匀浆并充分溶解。2.加入200ul氯仿,猛烈颠倒20次,充分混匀。放置5分钟。3.4oC、12000g离心15min。4.转移上清至1.5mlEP管中,加入异丙醇500ul混匀(上下颠倒几次,放置10分钟),沉淀2-3分钟后,4oC、12000g离心15min。5.弃去上清,加入600ul75%乙醇混匀;4oC、12000g离心5min~10min)。6.弃去上清,加无水乙醇800ul,混匀;4oC、12000g离心5min~10min)。7.弃去上清,干燥。加DEPC水溶解,定量并将RNA浓度调至0.5ug/ul。这样的RNA用DNA/RNA测定仪测定混合物的浓度和纯度,测定OD260/OD280值能在1.8~2.2之间,我的结果大部分在1.9左右。以上心得仅供参考。你好,这个RNA抽提的流程和提取细胞内RNA是一样的?可以用来提取组织里面的RNA吗......
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