PCR扩增制备带标记探针
实验步骤
1.生物素标记
应用bio-11-dUTP部分替代dTTP搀入PCR扩增探针中
1)配制反应体系
dNTP的组成 dATP、dCTP、dGTP各20mmol,dTTP15mmol,bio-11-dUTP5mmol混匀,其他试剂如常规PCR。
2)25循环后,冻存,取出化冻,趁下层水相尚在冰冻状态,吸尽石蜡油
3)水相中20mg/ml糖原1ul,pH5.22.5MnaAC10ul,220ul无水乙醇。混匀后-20℃过夜
4)离心取沉淀,冷冻干燥后100ul水或TE复溶。
2.地标记
应用dig-11-dUTP部分替代dTTP搀入PCR扩增探针中
1)配制反应体系
dNTP的组成 dATP、dCTP、dGTP各200umol,dTTP130umol,bio-11-dUTP70umol混匀,其他试剂如常规PCR。
2)35循环扩增产物
30扩增产物纯化与DIG随机标记探针方法相同(仅沉淀时,50ulPCR反应液中加入5ul4MliCl和150ul冰乙醇)。
注意事项
1.标记时标记基团在dNTP中占的比例不能太高,因标记基团与dTTP相比具位阻效应,比例太高PCR扩增及以后的杂交都要受到影响。
2.靶DNA用量不能太高,生物素标记中控制在0.2fmol左右;地高标记中可低至0.1ng。