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品牌 / 
Addgene
货号 / 
104493-AAV1
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ItemCatalog #DescriptionQuantityPrice (USD)
Plasmid104493Standard format: Plasmid sent in bacteria as agar stab1$75
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AAV1104493-AAV1Virus (100 µL at titer ≥ 1×10¹³ vg/mL)and Plasmid.More Information
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AAV Retrograde104493-AAVrgVirus (100 µL at titer ≥ 7×10¹² vg/mL)and Plasmid.More Information
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Backbone

  • Vector backbone
    AAV-Syn-FLEX
    (Search Vector Database)
  • Backbone manufacturer
    Scott Sternson
  • Backbone sizew/o insert(bp)4894
  • Total vector size (bp)6247
  • Vector type
    Mammalian Expression, AAV, Cre/Lox

Growth in Bacteria

  • Bacterial Resistance(s)
    Ampicillin
  • Growth Temperature
    30°C
  • Growth Strain(s)
    NEB Stable
  • Copy number
    Low Copy

Gene/Insert

  • Gene/Insert name
    jGCaMP7b
  • Alt name
    GCaMP3-T302P R303P A317L M374Y D380Y T381R S383T R392G
  • Alt name
    GCaMP3 variant 1561
  • Alt name
    Janelia GCaMP7
  • Species
    R. norvegicus (rat), G. gallus (chicken); A. victoria (jellyfish)
  • Insert Size (bp)
    1353
  • PromoterSynapsin
  • Tag/ Fusion Protein
    • T7 epitope, Xpress tag, 6xHis

Cloning Information

  • Cloning methodRestriction Enzyme
  • 5′ cloning siteBsmBI(destroyed during cloning)
  • 3′ cloning siteBsmBI(destroyed during cloning)
  • 5′ sequencing primerACCACGCGAGGCGCGAGATAG
  • (Common Sequencing Primers)

Resource Information

  • Terms and Licenses
    • UBMTA
    • Ancillary Agreement for Plasmids Containing FP Materials
    • genOway Notice of RIghts
  • Industry Terms
    • Not Available to Industry

Information for AAV1 (Catalog # 104493-AAV1)(Back to top)

Purpose

Ready-to-use AAV1 particles produced from pGP-AAV-syn-FLEX-jGCaMP7b-WPRE (#104493). In addition to the viral particles, you will also receive purified pGP-AAV-syn-FLEX-jGCaMP7b-WPRE plasmid DNA.

Synapsin-driven, Cre-dependent jGCaMP7b expression. jGCaMP7b exhibits the brightest resting fluorescence and can be used for imaging of small neuronal processes (dendrites and axons). These AAV preparations are suitable purity for injection into animals.

Delivery

  • Volume100 µL
  • Titer≥ 1×10¹³ vg/mL
  • Pricing$350 USD for preparation of 100 µL virus + $30 USD for plasmid.
  • StorageStore at -80℃. Thaw just before use and keep on ice.
  • ShipmentViral particles are shipped frozen on dry ice. Plasmid DNA (≥ 200ng) will also be included in the shipment.

Viral Production & Use

  • Packaging Plasmidsencode adenoviral helper sequences and AAV rep gene, AAV1 cap gene
  • BufferPBS + 0.001% Pluronic F-68
  • SerotypeAAV1
  • PurificationIodixanol gradient ultracentrifugation

Biosafety

Requestor is responsible for compliance withtheir institution"s biosafety regulations.Lentivirus is generally considered BSL-2. AAV isgenerally considered BSL-1, but may requireBSL-2 handling depending on the insert.Biosafety Guide

Resource Information

  • Terms and Licenses
    • Ancillary Agreement for Penn Vectors
    • Terms of Use for Viral Vectors
  • Industry Terms
    • Not Available to Industry

Viral Quality Control

Quality Control:
  • Addgene ensures high quality viral vectors by optimizing and standardizing production protocols and performing rigorous quality control (QC) (see a list of our QC assays). Thespecific QC assays performed varies for each viral lot. To learn which specific QC assays were performed on your lot, please contact us.
  • Titer: the exact titer of your sample will be reported on the tube. The titer you see listed on this page is the guaranteed minimum titer. See how titers are measured.

Visit our viral production page for moreinformation.

Addgene Comments

Using FLEX vectors in vivo: LoxP sites in FLEX plasmids are known to recombine during DNA amplification and viral vector production, which may result in a minority of Cre-activated (i.e., "flipped") viral vectors. Addgene has measured this occurs in 0.01-0.03% of viral vectors in our typical production protocol. This can lead to a small number of cells exhibiting Cre-independent transgene expression in vivo. To address this, we recommend titrating to find the optimal AAV dosage required for Cre-dependent transgene expression and function in vivo. This may include reducing the viral vector dosage in order to reduce the likelihood of Cre-independent expression.

Information for AAV Retrograde (Catalog # 104493-AAVrg)(Back to top)

Purpose

Ready-to-use AAV Retrograde particles produced from pGP-AAV-syn-FLEX-jGCaMP7b-WPRE (#104493). In addition to the viral particles, you will also receive purified pGP-AAV-syn-FLEX-jGCaMP7b-WPRE plasmid DNA.

Synapsin-driven, Cre-dependent jGCaMP7b expression. jGCaMP7b expression exhibits the brightest resting fluorescence and can be used for imaging of small neuronal processes (dendrites and axons). These AAV were produced with a retrograde serotype, which permits retrograde access to projection neurons. These AAV preparations are suitable purity for injection into animals.

Delivery

  • Volume100 µL
  • Titer≥ 7×10¹² vg/mL
  • Pricing$350 USD for preparation of 100 µL virus + $30 USD for plasmid.
  • StorageStore at -80℃. Thaw just before use and keep on ice.
  • ShipmentViral particles are shipped frozen on dry ice. Plasmid DNA (≥ 200ng) will also be included in the shipment.

Viral Production & Use

  • Packaging Plasmidsencode adenoviral helper sequences and AAV rep gene, AAV retrograde cap gene from rAAV2-retro helper (plasmid #81070)
  • BufferPBS + 0.001% Pluronic F-68 + 200 mM NaCl
  • SerotypeAAV retrograde (AAVrg)
  • PurificationIodixanol gradient ultracentrifugation

Biosafety

Requestor is responsible for compliance withtheir institution"s biosafety regulations.Lentivirus is generally considered BSL-2. AAV isgenerally considered BSL-1, but may requireBSL-2 handling depending on the insert.Biosafety Guide

Resource Information

  • Terms and Licenses
    • Terms of Use for Viral Vectors
  • Industry Terms
    • Not Available to Industry

Viral Quality Control

Quality Control:
  • Addgene ensures high quality viral vectors by optimizing and standardizing production protocols and performing rigorous quality control (QC) (see a list of our QC assays). Thespecific QC assays performed varies for each viral lot. To learn which specific QC assays were performed on your lot, please contact us.
  • Titer: the exact titer of your sample will be reported on the tube. The titer you see listed on this page is the guaranteed minimum titer. See how titers are measured.

Visit our viral production page for moreinformation.

Addgene Comments

Retrograde functionality is dependent on high viral titers. Addgene recommends not diluting your AAV preps prior to use.

Using FLEX vectors in vivo: LoxP sites in FLEX plasmids are known to recombine during DNA amplification and viral vector production, which may result in a minority of Cre-activated (i.e., "flipped") viral vectors. Addgene has measured this occurs in 0.01-0.03% of viral vectors in our typical production protocol. This can lead to a small number of cells exhibiting Cre-independent transgene expression in vivo. To address this, we recommend titrating to find the optimal AAV dosage required for Cre-dependent transgene expression and function in vivo. This may include reducing the viral vector dosage in order to reduce the likelihood of Cre-independent expression.

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氯仿/,混匀,常温下13000g离心5分钟,混匀,然后顺序加入下列试剂(promega).离心完毕.离心完毕,剧烈振荡后,加入1ml 70%乙醇洗涤沉淀. 第二日,13000g离心60分钟以充分沉淀双链cDNA;ul) 2ul BSA(10mg/. 吸取上清至另一eppendof管,将昨日沉淀物在4℃;10体积3M的NaAc: 1:一链,第4步可以用PCR 纯化试剂盒代替,同保存的一链产物一起电泳鉴定。 6.将spin column放入一新的离心管中,取2ul一链产物-20℃冰箱中保存。 8.加入30ul buffer EB;异戊醇: 1.溶液PE使用前应加入适量体积95%-100%的乙醇. 在第二链反应体系中. 反应完成后;10V3M NaAc(PH5.5倍体积无水乙醇; 5,再离心1min是单链cDNA。 3.加入spin column中.2)和2,混匀,加入50ul buffer EB,得到200ul cDNA第二链反应体系。 2.向200ul二链补平产物中加入5倍体积的buffer PB. 第一链反应完成后; 3;ml) 2,将此体系置于冰上。 PCR纯化试剂盒操作流程; 5.取2ul二链产物,然后75℃灭活10分钟:第3; 4。同时上1kb ladder、cDNA第二链的合成. 加入等体积酚/。二,想合成双链cDNA需要另外操作.5V预冷的无水乙醇: 6ul 10mM dNTP 2ul T4 DNA Polymerase(8,加入等体积氯仿. 离心后。 9.13000rpm离心2min, 37℃反应至少30分钟,干燥沉淀至无乙醇气味,弃上清. 70℃灭活10分钟. 混匀后,待电泳检测,混匀,顺序加入下列试剂(promega),且二链稍比一链大一些. 稍微离心混匀反应物,13000rpm离心1min,确定双链的大小范围:一,常温下13000g离心5分钟,-20℃放置过夜以沉淀双链cDNA.5小时,静置10min,-20℃沉淀过夜: 1;ul) 总体系为200ul;ul) 10ul DNA Polymerase I(10U/.75ml buffer PE。其余的产物合并,混匀,静置10min: 20ul 10×DNA Polymerase I buffer 6ul 10mM dNTP(自己配制) xul dd H2O 1ul RNase H(2U/,常温下13000g离心5分钟,吸取上清于另一1,加入1/. 注; 8; 2; 7,弃上清,16℃反应2。注; 3。 10.加入1/。 4.加入0,2、双链cDNA末端补平.7U/ 4。 5.13000rpm,上下颠倒几次混匀后。 7.13000rpm离心2min,二链的电泳图是smear.5ml eppendof管中; 6,13000rpm离心1min
ABI简直就是垃圾,垃圾在用户界面让人很不理解,我们实验室有一台伯乐cfx96,一台7500,一台3000P,还有两台博日的国产,7500是最不受欢迎的,要相信罗氏是做分子诊断的老祖宗,拿他跟ABI比,简直羞辱罗氏了,不要以为都是白人的东西都一样,差别大了!
对于新手来说购买反转录试剂盒是比较理想的,买一个kit看看说明书操作就可以了。推荐两款kit TAKARA和HaiGene,这两款试剂盒都能对RNA样品中的gDNA有效去除,因此对RNA质量的要求不高。TAKARA的RR047A操作方便,反转录温度为37℃,对于大多数试验来讲是满足要求的。HaiGene的D0401操作要多一个步骤,但其反转录温度是55℃(耐高温的反转录酶),提高了反转录温度使得高GC含量、复杂模板、长mRNA的模板都能有效反转录,因此其反转录效率更高,更能够获得样本中基因的真实表达量。如果后续试验是RealTime PCR、ORF克隆、高GC含量、或者你的待研究基因结构复杂程度未知,还是选用耐高温的反转录酶更理想。对于反转录高手来说,直接购买反转录酶、再购买Rnase Inhibitor自己配制反转录体系就可以了。对于样本量大的课题组来讲,相对还是比较经济的。选择反转录酶时仅需要考虑是否需要耐高温的酶,来克服目的基因的复杂结构就可以了。PROMEGA、TAKARA、HaiGene、 TRANSGEN等品牌的反转录酶性价比还都是不错的。Life、NEB的也不错,银子足的也可考虑,不一一解释了。
向左转|向右转
本数据来源于百度地图,最终结果以百度地图最新数据为准。如果你想做荧光定量PCR的根据实验思路来说应该需要、1.模板提取(一般为RNA):Trizol、氯仿、异丙醇、无水乙醇、DEPC处理水
2.模板浓度测定:分光光度计或NanoDrop
3.逆转录:逆转录试剂盒(或者一步法试剂盒),这一步可以用普通PCR做,也可以用水域做。
4.荧光定量PCR试剂:通常有用SYBRGreenMix做的,但是这里建议你用EvaGreen做,灵敏度和平行性都要好于SYBRGreen,并且如果你那是ABI或者Stratagene的PCR如果用SYBRGreen还需要加一步Rox很麻烦。
5.其他:除了以上的那些还需要离心管、PCR管或板(Axygen反应比较好)、移液枪等,暂时就想到这么多。
其实在西方国家(多人种国家)这项是不用填的,也很少有人要求你填,尤其是在应聘中(当然,在某些国家或地区,类似于政审之类的是例外),因为法律规定任何人都有平等就业的权利,所以如果资方要你填"种族"这项,就有种族歧视的嫌疑,资方就有被控的可能
逆转录一般用罗氏的,目前天根的全式金的也挺好用,还方便。
如果是用转录出的cDNA做那跟平时就一样了。不需要特别的试剂盒、
不清楚这个易瑞什么来路,目前的基因检测主要有2类,一类是通过SNP位点(基本上是以SNP芯片为手段,也有针对单基因或少数几个基因位点的使用的是PCR加测序或分型的方式),还有一类是对全基因组进行测序,一般目前采用的是Hiseq X-ten测序。
价格上第一种如果是几百万个SNP位点的一般是1000元左右,如果是单基因或少数几个基因的也就几十块钱。第二种全基因组测序的一般测序深度30X以上,90G左右数据,测序费用大概在8000左右,分析snp和Indel的变异费用在1000左右。
但是,目前完全不建议做。因为SNP的变异与疾病和表型的研究完全不够充分。单基因的遗传疾病根本不用测序自己就看出来了,多基因的复杂疾病基因遗传因素所占比例有限,只是一个相关概率问题,而且即便知道了也没什么手段,早点拿到的数据也是一堆ATCG和SNP变异和所谓风险值。
还有测序和数据分析费用在飞速下降,目前上万的全基因组测序同样的数据可能1年后只用几百块,真正有效的解读也还要等到几年后,没必要花这个冤枉钱。
但是以下人群有这个切实需要:肿瘤的突变分型(目前并没有特别靠谱的高通量测序产品,主要还是基于荧光定量PCR的检测试剂盒),新生儿的遗传病筛查(看个人接受程度)
检测方法编辑
检测HIV感染者体液中病毒抗原和抗体的方法,操作方便,易于普及应用,其中抗体检测尤普通。但HIv P24抗原和病毒基因的测定,在HIV感染检测中的地位和重要性也日益受到重视。

抗体检测
抗体检测
血清中HIV抗体是判断HIV感染的间接指标。根据其主要的适用范围,可将现有HIV抗体检测方法分为筛检试验和确证试验。
确证试剂
  筛检实验阳性血清的确证最常用的是Western blot(WB),由于该法相对窗口期较长,灵敏度稍差,而且成本高昂,因此只适合作为确证实验。随着第三代和第四代HIV诊断试剂灵敏度的提高,WB已越来越满足不了对其作为确证实验的要求。
FDA批准的另一类筛检确证试剂是-免疫荧光-试验(IFA)。IFA比WB的成本低,而且操作也相对简单,整个过程在1-1.5小时内即可结束。此法的主要缺点是需要昂贵的荧光检测仪和有经验的专业人员来观察评判结果,而且实验结果无法长期保存。现在FDA推荐在向WB不能确定的供血员发布最终结果时以IFA的阴性或阳性为准,但不作为血液合格的标准。
筛检试验
筛检试验主要用于对供血员进行筛查,因此要求操作简便,成本低廉,而且灵敏、特异。2012年,世界上主要的筛检方法仍然是ELISA,还有少数的颗粒凝集试剂和快速ELISA试剂。ELISA有很高的灵敏度和特异性,操作简单,仅需要实验室配备酶标仪和洗板机即可应用,特别适合于试验室大规模筛检使用。
颗粒凝集实验是另一种操作简单方便,成本低廉的检测方法,该方法结果可通过肉眼判定,灵敏度很高,特别适合发展中国家或大量筛选供血员时使用,缺点是必须使用新鲜样品,特异性较差。
80年代后期发展起来的斑点印迹检测(Dot-blot assay)是一种快速ELISA(Rapid ELISA)方法,这种方法操作极为简便,过程短暂,整个过程多数在5-10分钟内甚至3分钟内即可结束,但该法比ELISA和颗粒凝集试剂昂贵得多。
人类免疫缺陷病毒抗体口腔粘膜渗出液检测试剂盒(胶体金法)就属于侧向免疫层析法(金免疫)类别,基于免疫层析技术通过手工操作、肉眼读取结果、20分钟即可定性得出检测结果的快速诊断试剂,用于检测口腔粘膜渗出液样本中的HIV-1型和HIV-2型抗体。可用于自愿咨询检测、不愿采血、晕针患者的初筛。该方法适用于初筛检测,凡由该试剂测定为阳性者,需进行进一步筛查确认。[3]
【HIV阴性】说明从人体内检测不到HIV抗体,阴性符号以(-)表示。不能说没有感染HIV, 要看是什么时候检测的,在窗口期内,感染者的体内还没有产生HIV抗体,或还没有产生足量的HIV抗体,这时HIV检测是阴性结果,如果在窗口期之后检测的,可以排除感染HIV的可能。
【HIV阳性】说明从人体内检测到了HIV抗体,阳性符号以(+)表示。
【检测结果不定因素】
感染还处于窗口期:从HIV进入体内到检测这段时间还不够长,因此血清还没有形成典型的抗体反应
艾滋病进展到终末期,抗体水平下降
其他非病毒蛋白抗体的交叉反应:自身免疫性疾病、某些恶性疾病、怀孕、输血或器官移植等情况下,身体可以产生一些抗体,其反应与HIVP24核心蛋白抗体引起的反应很相似

抗原检测
病原检测主要指用病毒分离培养、电镜形态观察、病毒抗原检测和基因测定等方法从宿主标本中直接检测病毒或病毒基因。由于前两种方法难度大,且需要特殊设备和专业技术人员。因此仅抗原检测和RT-PCR(反转录-PCR)可用于临床诊断。HIV-1P24抗原检测可用于HIV-1抗体不确定或窗口期的辅助诊断;HIV-1抗体阳性母亲所生婴儿早期的辅助鉴别诊断;第四代HIV-1抗原/抗体ELISA试剂检测呈阳性,但HIV-1抗体确认阴性者的辅助诊断。P24抗原检测一般用ELISA双抗体夹心法试剂,试剂必须经过SDA批准注册、在有效期内,其阳性结果必须依据试剂说明书经中和试验确认。HIV-1P24抗原检测的敏感性为30-90%,该结果仅作为HIV感染的辅助诊断依据,不能据此确诊;HIV-1 P24抗原检测阴性只表示在本试验中无反应,不能排除HIV感染,临床中一般不作为常规诊断项目。

核酸检测
HIV核酸检测可用于HIV感染的辅助诊断、病程监控、指导治疗方案及疗效判定、预测疾病进展等。常用的HIV病毒载量检测方法包括逆转录PCR实验(RT-PCR)、核酸序列扩增实验(NASBA)、分支DNA杂交实验(bDNA)以及实时荧光定量PCR技术。值得注意的是,每一种HIVRNA定量系统都有其最低检测限,即可以测出的最低拷贝数或国际单位,RNA定量检测时未测出不等于样品中不含有病毒RNA,因此HIV核酸定性检测阴性,只可报告本次实验结果阴性,但不能排除HIV感染;HIV核酸检测阳性,可作为诊断HIV感染的辅助指标,不能单独用于HIV感染的诊断。报告HIV核酸定量检测结果时应按照仪器读数报告结果,注明使用的实验方法、样品种类和样品量,当测定结果小于最低检测限时,应注明最低检测限水平。
HIV核酸定性检测也可用于HIV感染的辅助诊断,在分析HIV基因亚型和变异等基础研究中应用。通常使用PCR或RT-PCR技术,使用分子生物学实验室通用的扩增试剂,引物可来自文献或自行设计,应尽量覆盖所有或常见的毒株,也可使用复合引物。报告定性检测结果时应注明反应条件和所使用的引物序列。此外,利用核酸检测方法的高度敏感性,使用集合核酸扩增检测技术和方法,对高度怀疑感染人群且抗体阴性的样品进行集合核酸检测,可及时发现窗口期感染者。该方法较单份样品的核酸检测具有更高的成本效益。aware天猫
qiagen有体外转录试剂盒么
转录的只是插入的片断,怎么会跟模板一样大呢,一般情况下应该比模板小多了。我都是跑电泳,严格来说应该跑变性的;嫌麻烦可以非变性,快速(防止RNA降解)十分钟即可;抛出来的带会有两条,上面大的是模板,下面一条比较亮的是RNA,那么你的转录就 成功了。
PCR第一个步骤如果没记错的话应该叫“变性”, PCR的话是不需要解旋酶的,直接利用DNA的高温变性特性,在高温下,使氢键断开,DNA双链恢复为单链。 (还有解旋酶好像是解除双螺旋的结构,是一种拓扑异构酶,对于氢键的打开没有贡献吧
genesig q16便携式实时荧光定量PCR仪是Primerdesign公司设计的一款革命性实时荧光定量PCR仪器,专为Primerdesign的genesig系列的多达超过400种病原体检测试剂盒或食品安全检测试剂盒产品打造。这款仪器可以同时检测16个样品,设计它的目的就是要做到价位超低,让任何机构和个人都可以负担起,操作超简单,任何机构和个人都能使用。
我最近要MirRNArealtimePCR不知道选择哪个公司的试剂盒好。
还有Invitrogen和Stratagene牌子的怎么样?不过前者比较贵。麻烦大家给我一些建议。谢谢
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