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改进生命科学应用中样品制备过程的产品开发商 Sage Science 和 Universal Sequencing Technology 今天宣布了一项分销协议,以改善科学家获得长期从短读长测序平台产生的范围基因组信息。通过该协议,Sage Science 将向美国的生物学家分发 Universal Sequencing Technology 的 TELL-Seq 试剂盒,包括其 HLS-CATCH™ 技术用于靶向和分析大型基因组元素的用户。
HLS-CATCH 方法使用 Cas9 酶学和 SageHLS 仪器直接从细胞中纯化大型遗传目标。该过程产生了长达 500 千碱基的完整基因组区域,保留它们以进行靶向测序分析。TELL-Seq 试剂盒可用于对分子进行条形码链接读取分析,从而可以表征来自短读长测序平台的长距离信息。总之,这些方法使科学家们能够提取高分子量 DNA——例如整个基因——并生成有关结构变异和单倍型的数据,而这些数据很难通过传统的短读长测序技术获得。
Sage Science 首席科学官 Chris Boles 博士说:“我们致力于通过改进样品制备工作流程,帮助科学家从现有的 DNA 分析技术中获得更好、更具成本效益的结果。” “通过向我们的 SageHLS 用户和其他研究人员分发 TELL-Seq 试剂盒,我们可以利用短读长测序仪的庞大安装基础,并让基因组科学家能够产生远程基因组数据。”
TELL-Seq 试剂盒可用于从头 DNA 测序的极低样本输入。整个过程可以在 PCR 管中轻松进行,无需昂贵的仪器。
“与 Sage Science 的合作不仅为我们的 TELL-Seq WGS 文库制备试剂盒创造了另一个销售渠道,而且还将通过为特定基因组目标定制的链接读取试剂盒扩大产品路线图,”Tom Chen 博士说,Universal Sequencing Technology 的首席科学官。
Sage Science 将在即将于 10 月 27 日至 30 日举行的美国人类遗传学学会年会上,在其虚拟展位上展示使用 HLS-CATCH 方法和 TELL-Seq 试剂盒对 BRCA1 和 BRCA2 基因进行分析的结果。
SageHLS HMW图书馆系统

直接从细胞中提取多达 1MB 的 DNA
SageHLS 系统提供了一种新的 DNA 提取方法。用户在 Sage Science 凝胶盒上加载细胞悬液,以在电泳条件下进行裂解。这去除了降解和溶解的蛋白质,但留下了完整的 DNA,结合在琼脂糖中。然后使用裂解酶小心地将 DNA 片段化成电泳可移动的大小。自动 DNA 大小选择将 DNA 收集到 6 个大小的容器中。了解有关该技术的更多信息。
使用 CRISPR/Cas9 进行靶向纯化:CATCH*
CRISPR/Cas9 可用于设计大基因组区域或基因的靶向纯化。这种 Cas9 的体外应用称为 CATCH,可以加强对结构变异的研究并提供有价值的定相信息。
* Cas9-Assisted Targeting of Chromosome Segments
Jiang 等。al., 2015, Nature Communications, doi:10.1038/ncomm9101
关键下游技术
光学映射
长读测序
条形码链接读取

Sage Science SageELF 技术启动蛋白质组学早期访问计划。SageELF 是一种蛋白质样品制备工具,可用于生物标志物发现、蛋白质分析、鸟枪蛋白质组学、生物治疗药物的质量控制等。
通过这个抢先体验计划,Sage Science 将 SageELF 仪器的应用从全样本 DNA 分离扩展到蛋白质组学工作流程的蛋白质分离。SageELF 在全自动过程中从蛋白质样品中生成 12 个连续组分,该过程比手动 1D 凝胶更灵敏且可重现。该工具可用于降低样品复杂性、富集稀有蛋白质并提高样品中所有蛋白质的回收率。
Sage Science 首席执行官 Todd Barbera 表示:“SageELF 一直受到基因组学社区用户的好评,现在我们渴望看到蛋白质组学社区的用户将用它完成什么。” “我们已经通过抗体实验和生物标志物发现研究看到了显着的成果,我们预计我们的早期研究人员将利用这种独特的技术展示许多其他创造性用途和高质量数据。”
SageELF 是 Electrophoretic Lateral Fractionator 的缩写,可自动对样品进行电泳并将蛋白质从整个凝胶泳道洗脱到 12 个洗脱模块中。用户只需加载他们的样品,开始运行,然后移出馏分。与某些肽永远不会离开凝胶的凝胶内消化不同,整个蛋白质样品通过电泳进入洗脱模块。
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