出版物 |元系统公司 metasystems
核型分析对血液肿瘤的诊断、治疗和预后有很大影响。染色体的识别和表征是一个具有挑战性的过程，需要经验丰富的人员。人工智能提供了新颖的支持工具。然而，其在诊断中的安全可靠应用需要评估。在这里，我们提出了一种利用卷积神经网络（CNN）识别癌细胞中染色体的新实验室方法。CNN识别了98.8%的染色体的正确染色体类别，从而节省了时间42%用于核型分析工作流程。这些结果表明CNN在血液肿瘤染色体分类方面具有潜在的应用价值。本研究有助于自动核型分析平台的开发。
数字对象标识符（DOI）：https://doi.org/10.1016/j.cancergen.2021.11.005
关键字：临床细胞遗传学、癌症遗传学和细胞生物学 | Ikaros
更多 ...更少 ...欧洲临床微生物学和传染病杂志：欧洲临床微生物学会官方出版物，2021 年 2171--2176 年 10 月 40 日革兰氏染色玻片自动数字成像与手动显微镜屏幕读数的性能。Fischer、Adrien、Azam , Nouria, Rasga, Lara, Barras, Valérie, Tangomo, Manuela, Renzi, Gesuele, Vuilleumier, Nicolas, Schrenzel, Jacques, Cherkaoui, Abdessalam本研究的目的是评估革兰氏染色载玻片自动数字成像与手动显微镜的性能。本研究纳入了 443 个已鉴定的革兰氏染色载玻片。当两种方法都一致时，我们认为结果是正确的，没有进行进一步的检查。每当方法得出不同的结果时，我们都会审查数字图像通过手动显微镜检查和载玻片以避免错误读取涂片。最终结果是多个独立读者解读的共识。在本研究分析的 443 张载玻片中，101 张（22.8%）显示比较方法之间的结果存在差异。不同标本类型的结果差异率为：血培养阳性为5.7%（9/157），呼吸道标本为42%（60/142），无菌部位标本为22%（32/144）。经过对差异幻灯片的后续审查，最终差异率降至 7.0% (31/443)。对于手动显微镜和自动数字成像，比较方法与培养结果之间的总体一致性分别达到 78% (345/443) 和 79% (349/443)。根据培养结果，自动数字成像和手动显微镜的特异性分别为90.8%和87.7%。相比之下，两种比较方法的灵敏度为 84.1%。不一致的结果主要是遇到罕见的微生物形态。本研究报告的结果强调，屏幕阅读具有挑战性，因为屏幕上形态的识别与常规手动显微镜相比可能会有所不同。自动数字成像有助于监测革兰氏染色错误，这对于报告的革兰氏染色结果的质量控制仍然至关重要。
数字对象标识符 (DOI)：10.1007/s10096-021-04233-2
关键字：微生物学 |梅塔弗 |革兰氏染色分析|自动幻灯片扫描和成像
更多...更少...辐射研究2021 年 9 月CytoRADx：基于细胞分裂微核分析的高通量标准化生物剂量诊断系统。Capaccio、Chris、Perrier、Jay R.、Cunha、Lídia、Mahnke、Ryan C.、Lörch、Thomas、Porter、Michael、Smith、Chris L.、Damer、肯·伯兰·J·丹尼尔·弗里泽尔·巴特·Torelli、Jennifer、Vasquez、Marie、Brower、Jeremy B.、Doyle-Eisele、Melanie、Taveras、Maria、Turner、Helen、Brenner、David J.、Kowalski、Richard在大规模灾难中，例如大城市发生核爆炸，准确诊断大量人员，将稀缺的医疗资源分配给最需要的人至关重要。目前还没有 FDA 批准的测试可用于诊断辐射暴露，辐射暴露可能导致复杂的、危及生命的伤害。为了弥补这一差距，我们通过改进和改进胞质分裂阻断微核 (CBMN) 测定作为高通量定量诊断测试，在辐射生物剂量测定方面取得了实质性进展。经典的 CBMN 方法对 DNA 损伤产生的微核 (MN) 进行定量，除了缺乏跨实验室的通用方法外，还需要大量的时间和专家劳动力。我们开发了 CytoRADx™ Sy通过实施标准化试剂盒、优化的检测方案、全自动显微镜和图像分析以及集成剂量预测来解决这些缺点。这些增强功能使 CytoRADx 系统无需专门的人工或实验室特定的校准曲线即可获得高通量、标准化的结果。 CytoRADx 系统已经过优化，可用于人类和非人类灵长类动物 (NHP)，以量化淋巴细胞中辐射剂量依赖性微核的形成，并使用全血样本进行观察。使用套件中提供的材料对细胞核和产生的 MN 进行荧光染色并保存在耐用的显微镜载玻片上。随后使用带有定制软件的商用 RADxScan™ 成像仪每天扫描多达 1,000 张载玻片，该软件可自动量化细胞特征并计算辐射剂量。使用少于 1 mL 的血液，经过离体辐照，我们的系统已经证明了准确和精确的测量确保 0 至 8 Gy 的暴露（90% 的结果在 1 Gy 的交付剂量内）。这些结果来自 636 个人类样本（24 个不同的捐赠者）和 445 个 NHP 样本（30 个不同的受试者）。该系统在体内研究中表现出类似的结果，包括对 43 名 NHP 接受单剂量全身照射的研究。系统性能在实验室、操作员和仪器中是可重复的。考虑到不同的人口统计数据、常见药物、医疗状况以及与放射灾难相关的急性损伤，不同人群的结果在统计上也相似。剂量计算也随着时间的推移保持稳定，提供辐射后至少 28 天的可重复结果，以及收集并在室温下保存至少 72 小时的血液样本。 CytoRADx 系统在生物剂量测定领域取得了重大进展，将能够在大规模紧急情况下对不同人群进行准确诊断代理场景。此外，我们对成熟的 CBMN 检测的技术改进为未来的诊断应用（例如毒理学和肿瘤学）提供了途径。
数字对象标识符 (DOI)：10.1667/RADE-20-00030.1
关键词：毒理学和辐射生物学 | Metafer
更多...更少...英国皮肤病学杂志，2021 年 1 月，2019 年 11 月出现与新冠肺炎 (COVID-19) 相关的皮肤病。该病例是否是意大利的零号病人？Gianotti, R.、Barberis, M.、Fellegara, G.、Galván-Casas, C.、Gianotti, E.米兰是意大利北部最大的城市之一，第一个受到 COVID-19 大流行影响的欧洲大都市区。我们分析了来自米兰的皮肤病患者的皮肤活检和 SARS-CoV-2 感染不同阶段的 PCR 拭子阳性 (1,2)。结果与 20 名未确诊的 COVID-19 患者的皮肤活检结果进行了比较患有皮肤病的鼻子患者，他们是感染 COVID-19 的高危人群。
数字对象标识符 (DOI)：10.1111/bjd.19804
关键词：微生物学 | Metafer
更多...更少...儿科报告，2020年12月13日--14日检测具有一致 ALL 和不一致结果的婴儿双胞胎中的新易位。Bahoush、Golamreza、Vafapour、Maryam、Kariminejad、Roxana约 2-5% 的急性淋巴细胞白血病 (儿童患者中的 ALL）病例是婴儿，由于复发概率高，预后不良。因此，早期发现该疾病非常重要。尽管双胞胎中的白血病很少发生，但它在遗传学研究中受到了更多的关注。在本研究中，通过细胞遗传学检测，呈现了同卵双胞胎中一致 ALL 的特殊病例，但结果却不同。尽管可以接受在双胞胎的另一个兄弟（双胞胎 B）中，观察到了早期复发的结果。在细胞遗传学研究中，双胞胎均表达，而双胞胎A则表达这种突变，此前尚无病例报告。这种易位是否对混合谱系白血病（MLL）基因重排的白血病具有保护作用尚不清楚。同卵双胞胎中发现的易位差异也有待进一步研究。
数字对象标识符（DOI）：10.3390/pediatric13010002
关键词：临床细胞遗传学、癌症遗传学和细胞生物学 |梅塔弗 |中期成像
更多...更少...基因，2020年12月12日塞内加尔鳎鱼完整核型的综合遗传图谱（Kaup 1858）。Merlo, Manuel A., Portela-Bens, Silvia, Rodríguez, María E., García-Angulo, Aglaya, Cross, Ismael, Arias-Pérez, Alberto, Garc伊亚·埃米利奥·雷布ordinos, Laureana水产养殖产量在过去十年中经历了大幅增长，因此，该物种的基因组知识正在引起人们的关注。从这个意义上说，获得该物种的高密度基因组图谱可以为迄今为止尚未解决的那些方面的水产养殖改进提供线索。在本文中，回顾和新处理的数据除了分析此类 BAC 克隆的序列以获得综合数据外，还可以获得基于 BAC 的高密度细胞遗传学图谱。总共使用93个BAC克隆来定位该物种的染色体补体，注释了588个基因，几乎达到了基因组序列的2.5%。结果，获得了有关其基因组组织和进化的重要数据，例如与其他定着丝粒染色体相比，大定着丝粒对的基因密度较小，这支持了性原染色体配对的理论。IR。此外，还检测到具有大量保守连锁基因的染色体，即使在遥远的物种中也是如此。这种结果拓宽了对该物种染色体动力学和进化的认识。
数字对象标识符（DOI）：10.3390/genes12010049
关键词：更多应用 | Ikaros Karyo C (Isis)
更多...更少...个性化医学杂志，2020 年 10 月 10 日大规模人类健康影响研究中的辐射生物标志物。Moquet, Jayne, Rothkamm, Kai, Barnard, Stephen, Ainsbury, Elizabeth根据最近的发展，RENEB 网络（运行欧洲生物剂量测定和物理回顾剂量测定网络） ）在开展电离辐射效应的大规模分子流行病学研究方面处于有利地位，在双着丝粒荧光杂交（FISH）易位方面拥有经过验证的专业知识，微核、过早染色体凝聚、gamma-H2AX 焦点和基因表达测定。大规模人类健康影响研究提出了复杂的挑战，例如样本物流、检测成本、工作量、效果调节剂和质量控制/保证措施的实际方面。在英格兰公共卫生部门，双着丝粒、自动化微核和 γ-H2AX 辐射诱导病灶测定已经过测试，可用于大型健康影响研究。研究结果和进行如此大规模调查所获得的经验提供了宝贵的信息，有助于最大限度地减少未来健康监测分析的生物标志物数据集中的随机和系统错误。
数字对象标识符 (DOI)：10.3390/jpm10040155
关键词：毒理学和辐射生物学 | Metafer
更多...更少...国际放射生物学杂志, 96, 1263--1273October, 2020比较缺乏经验的操作员和专家在大规模伤亡事件中采用高通量生物剂量测定方法进行 γH2A.X 和 53BP1 病灶测定。Bucher、Martin、Duchrow、Lukas、Endesfelder、David、Roessler、Ute、Gomolka、Maria在人群受到电离辐射照射的情况下，对暴露和非暴露个体进行快速可靠的剂量评估至关重要。在最初的分诊中，医生必须快速决定对谁进行适当的医疗护理治疗。此外，可以消除数百至数千非或低暴露个体对严重暴露的担忧。研究表明，γH2A.X 辐射诱导病灶测定是一种有前途的快速分类决策测试。然而，在大规模情况下，大多数生物剂量测定实验室将很快达到其容量极限。本研究的目的是评估缺乏经验的实验者加速病灶测定和手动病灶评分的好处。该党两次培训课程的参加者在专家的指导下进行了辐射诱导病灶测定（γH2A.X），并对假辐射和辐照血样（0.05-1.5 Gy）的病灶（γH2A.X和53BP1）进行了评分。对26名具有基本实验室工作经验的操作人员进行的实验室实验和手动焦点评分的结果进行统计分析，并与专家的结果进行比较。经验不足的操作员制备具有显着剂量效应（0、0.1 和 1.0Gy）的载玻片用于半自动显微分析。由缺乏经验的评分员进行的手动病灶评分得出了 γH2A.X、53BP1 和共定位病灶的剂量效应曲线。此外，缺乏经验的记分员能够区分低照射剂量和未照射的细胞。虽然 53BP1 病灶评分与专家计数一致，但对于 γH2A.X 或共定位病灶，初学者和专家之间的差异有所增加。如果发生大规模辐射事件，缺乏经验的工作人员可以为实验室提供支持用于半自动病灶计数的载玻片准备以及用于分类模式生物剂量测定的 γH2A.X 和 53BP1 手动病灶评分。幻灯片可以清楚地分为非暴露、低暴露或高暴露类别。
数字对象标识符 (DOI)：10.1080/09553002.2020.1793024
关键字：毒理学和辐射生物学 |梅塔弗 |彗星测定/焦点
更多...更少...结核病（苏格兰爱丁堡），125, 1019932020 年 9 月金胺染色的机器辅助解读大大提高了显微结核病诊断的通量和灵敏度。Horvath, L.、Hänselmann, S.、Mannsperger, H.、Degenhardt, S.、Last, K.、Zimmermann, S. , Burckhardt, I.在所有细菌传染病中，结核分枝杆菌感染是全世界人类发病率和死亡率最高的疾病之一。由于其速度和成本效益，金胺染色痰涂片的手动显微镜检查仍然是重要的一线检测方法。然而，它给实验室工作人员带来了相当大的工作量，并且灵敏度有限。在这里，我们验证了一个扫描和分析系统，该系统将全自动显微镜与基于深度学习的图像分析相结合。自动扫描后，系统汇总与诊断相关的图像信息并将其呈现给微生物学家以协助诊断。我们使用常规工作流程中的 531 张载玻片测试了自动扫描和分析系统的优势，其中 56 张来自培养阳性标本。扫描和分析系统的协助可实现比手动显微镜检查（检测到 34/56 个阳性载玻片）更高的灵敏度（检测到 40/56 个阳性载玻片），同时大大缩短手动载玻片分析时间，从建议的每张载玻片 5-15 分钟缩短到平均 10 秒左右。
数字对象标识符 (DOI)：10.1016/j.tube.2020.101993
关键词：微生物学 | 10.1016/j.tube.2020.101993梅塔弗 |结核痰涂片显微镜
更多...更少...应用和环境微生物学，20203 年 8 月 86 日 - 聚 3-羟基丁酸衍生的羟基丁酸动员可减轻热应激 Herbaspirillum seropedicae SmR1 中的蛋白质聚集。Alves，Luis Paulo Silveira，Santana-Filho，Arquimedes Paixão，Sass aki、Guilherme Lanzi、de Oliveira Pedrosa、Fabio、Maltempi de Souza、Emanuel、Chubatsu、Leda Satie、Müller-Santos、Marcelo在碳饥饿或热、渗透或氧化休克的条件下，已知聚 3-羟基丁酸酯 (PHB) 的合成或动员受到影响的突变体的生存状况较差。目前尚不清楚 PHB 的合成和积累是否足以保护细菌免受应激条件的影响，或者是否必须动员储存的 PHB。在这里，我们证明了 SmR1 中 PHB 的动员是热休克的k 在 45°C 下激活。质子（H）核磁共振波谱（即H-核磁共振）表明，热激仅在能够合成和动员PHB的菌株中增加3-羟基丁酸（3HB）的量。无法合成或动员 PHB 的 SmR1 突变体更容易受到热休克的影响，并且比亲本菌株的存活率较差。当向培养基中添加 100 mM 3-羟基丁酸时，Δ菌株（无法合成 PHB 的突变体）和同时删除 和 （即 Δ ）（无法动员 PHB）的双突变体显示出部分热适应性的恢复（从没有 3HB 的 0% 存活率到初始存活群体的 40%）。在施加热激之前添加200mM 3HB将Δ突变体中的蛋白质聚集减少至15%，将Δ突变体中的蛋白质聚集减少至12%。我们得出的结论是，SmR1 自然受到 PHB 动员释放的 3HB 的保护，而在热激条件下无法产生大量 3HB 的突变体应对热坝的能力较差年龄。细菌容易受到影响其生长的环境条件的突然变化，需要快速适应。增加某些代谢物的浓度可以保护细菌免受导致蛋白质变性和沉淀以及质膜损伤的不利条件的影响。在这项工作中，我们证明，在热冲击下，细菌解聚其称为聚 3-羟基丁酸酯 (PHB) 的细胞内储备聚合物，迅速增加 3-羟基丁酸酯 (3HB) 的浓度，并通过热变性减少蛋白质沉淀。无法产生或解聚 PHB 的突变菌株在热冲击过程中遭受了不可挽回的损害，导致在 45°C 孵育时快速死亡。我们的研究结果将有助于更好地适应自然条件或工业过程中高温的细菌的发展。对于与植物有益相互作用的其他细菌，对 PHB me 的理解代谢对于开发更具竞争力的菌株及其在农业中作为生物肥料的应用具有决定性作用。
数字对象标识符 (DOI)：10.1128/AEM.01265-20
关键字：微生物学 |梅塔弗 |自动幻灯片扫描和成像
更多...更少...体外毒理学：与 BIBRA 联合出版的国际期刊，66, 104866August, 2020A 对电子烟产品电子液体和烟草烟雾气溶胶的体外毒性比较评估。Wieczorek, R., Phillips, G., Czekala, L., Trelles Sticken, E., O\'Con nell, G.、Simms, L.、Rudd, K.、Stevenson, M.、Walele, T.全球范围内成年吸烟者对电子烟产品 (EVP) 的使用持续增加，与此同时，有关电子烟产品相对于烟草烟雾的潜在毒性和相对安全性的信息也在不断积累。此时，m的体外评估任何广泛可用的 EVP 都是有限的。在本研究中，使用一组已建立的体外测定法来检查两种商业 EVP（blu GO™ 一次性和 blu PLUS+™ 可充电）与参考卷烟 (3R4F) 烟雾相比的细胞毒性（中性红吸收）、基因毒性（体外微核）和诱变（细菌回复突变）反应。总共有 12 种商业产品作为电子液体和气雾剂进行了测试。此外，还评估了含有 1.2% 和 2.4% 尼古丁的两种实验基础液体，以确定风味和尼古丁对所有三种测定的影响。在细菌回复突变 (Ames) 和体外微核 (IVM) 测定中，与烟草烟雾相比，暴露于含有或不含尼古丁以及一系列调味剂的电子液体和 EVP 气雾剂中，没有显示出致突变或基因毒性作用。中性红吸收 (NRU) 测定显示，与烟草相比，整个未稀释的 EVP 气溶胶的细胞毒性显着降低 (P<.05)相比之下，即使稀释后，烟雾也具有明显的细胞毒性。 EVP 体外毒理学反应的降低增加了越来越多的科学证据量，支持高质量 EVP 作为成年吸烟者减少危害的工具。
数字对象标识符 (DOI)：10.1016/j.tiv.2020.104866
关键词：毒理学和辐射 Bi学 |梅塔弗 |微核评分更多...更少...分子生态学2020年7月远洋硅藻 Fragilariopsis kerguelensis 中南大洋梯度的适应性分歧。Postel, Ute, Glemser, Barbara, Salazar Alekseyeva, Katherine, Eggers, Sarah Lena, Groth, Marco, Glöckner, Gernot, John, Uwe, Mock, Thomas, Klemm, Kerstin, Valentin、Klaus、Beszteri、Bánk
南大洋的特点是纵向水循环与强烈的纬度梯度交叉。这个海洋背景是如何形成的尽管该区域对于全球生物地球化学循环具有重要意义，但浮游生物种群在很大程度上仍是未知的。在这里，我们根据基因组、形态测量、生态生理和交配相容性数据展示了特有远洋居民硅藻 Fragilariopsis kerguelensis 内生态型分化和物种形成的一个例子。我们发现了三种基因型变异，一种存在于整个采样的纬度样带中，其他则分别局限于北部和南部。后两者在所有三个基因组中显示出相互的单系性，以及与局部适应一致的显着的生态生理差异，但在实验室杂交中产生了可存活的后代。第三组也与后两组进行生殖隔离。我们假设这种模式起源于适应性扩张，伴随着生态型分歧，然后是同域物种形成。
数字对象标识符 (DOI)：10.1111/mec.15554
关键字：更多应用 | Metafer
更多...更少...基因，2020 年 7 月 11 日用荧光标记系破译细菌感染对拟南芥减数分裂重组的影响。Gratias、Ariane、Geffroy、Valérie植物面临着强大的进化压力，需要维持对病原体的监视。一种主要的抗病机制是基于特异性识别病原体效应子的 NB-LRR (NLR) 蛋白。 NLR 基因家族的簇组织可能有利于 NLR 基因之间通过重组进行序列交换，从而有利于它们的进化动态。基于后代分析的越来越多的数据表明，生物胁迫的感知与后代遗传多样性的产生之间存在联系。这可能是由于受感染植物中减数分裂重组率增加所致，但这从未得到严格证明。为了测试如果病原体感染可以增加花粉减数分裂细胞中的DNA重组，我们就用强毒细菌感染荧光标记系（FTL）。我们测量了 5 号染色体两个区域（包含或不包含 NLR 基因簇）的减数分裂重组率。在所有测试间隔中，受感染植物和对照植物之间的基因重组频率没有观察到显着差异。尽管据报道，病原体暴露有时会增加植物中重组后代的频率，但我们的研究结果表明，减数分裂重组率可能至少能抵抗某些病原体的攻击。讨论了替代机制。
数字对象标识符 (DOI)：10.3390/genes11070832
关键字：更多应用 | Metafer
更多...更少...健康物理学, 119, 52--58七月, 2020用于分类剂量评估的自动双心像差评分：60Co 伽马射线剂量响应Subramanian、Uma、O\'Brien、Brett、McNamara、Maureen、Romanyukha、Lyudmila、Bolduc、David L.、Olsen、Cara、Blakely、William F.本研究的目的是使用自动双着丝粒评分建立辐射剂量反应校准曲线，以支持快速、准确的细胞遗传学分类剂量评估。从健康人类志愿者身上抽取血液，并暴露于几种剂量率（即 1.0、0.6 和 0.1 Gy/min）的 Co 伽马射线中。放射后，将血液置于37℃培养箱中2小时进行修复。然后将血液在添加有丝分裂原（即植物凝集素，浓度 4%）的完全培养基中培养 48 小时。 24小时后将秋水仙胺以终浓度0.2μg/mL添加到培养物中，以阻止第一次分裂中期有丝分裂。 48小时结束时收获细胞。使用自动中期收获机和自动显微镜处理样品etaphase finder 配备了一套软件，包括专门的自动化双着丝粒评分应用程序。获得的数据用于创建双着丝粒产量的剂量反应表。使用 Shiny R Studio 应用程序（泊松拟合优度）的结果，无法在 α = 0.05 的显着性水平上拒绝数据服从泊松分布的原假设。使用这些数据生成了基于三种不同剂量率下钴伽马射线的线性二次拟合的校准曲线。校准曲线用于检测盲测试用例。总之，使用自动采集器和自动显微镜中期发现器以及相关的自动双着丝粒评分软件，可以实现高通量和适当精度的分类辐射剂量评估。
数字对象标识符 (DOI)：10.1097/HP.0000000000001285
关键词：毒理学和辐射 B生物学 |梅塔弗 |评分畸变
更多...更少...科学进展，6，eabb3446六月，2020成年小鼠大脑的分子图谱。Ortiz、Cantin、Navarro、Jose Fernandez、Jurek、Aleksandra、Märtin、Antje、Lundeberg、Joakim、Meletis、Konstantinos脑图对于整合信息和解释电路和行为的结构-功能关系。我们的目标是通过采用全脑空间转录组学，纯粹基于空间定义特征的公正识别，对成年小鼠大脑进行系统分类。我们发现分子信息足以推断出大脑复杂而详细的神经解剖组织。无监督（非专家、数据驱动）分类揭示了新的特定区域和特定层的子区域，例如等皮质和海马体，以及纹状体的新细分。分子图谱进一步支持了水疗中心的表征从单细胞 RNA 谱中识别神经元的真实身份，并提供使用最小基因集（大脑调色板）注释大脑的资源。总之，我们建立了一个分子图谱来正式定义大脑区域的空间组织，包括用于映射和定位离散神经解剖域的分子代码。
数字对象标识符（DOI）：10.1126/sciadv.abb3446
关键词：病理学和组织成像 |梅塔弗 |组织成像更多...更少...基因，2020年6月11日间质端粒重复在海龟中罕见。Clemente、Lorenzo、Mazzoleni、Sofia、Pensabene Bellavia、Eleonora、Augstenová、Barbora、Auer、Markus、Praschag、Peter、Protiva、Tomáš、Velenský、Petr、Wagner、Philipp、Fritz、U我们，Kratochvíl，Lukáš，Rovatsos，Michail
端粒是大多数真核生物中保护染色体末端的核蛋白复合物。我除了染色体末端之外，端粒样基序还可以积累在着丝粒、着丝粒周围和中间（即着丝粒和端粒之间）位置，作为所谓的间质端粒重复序列（ITR）。我们利用荧光原位杂交绘制了 9 个龟科 30 个物种的核型中 (TTAGGG) 重复的分布。所有检查的物种都显示出染色体边缘端粒基序的预期末端拓扑结构。我们仅在三个科的五个物种中检测到 ITR。结合我们的数据和文献数据，我们推断出海龟中 ITR 的七个独立起源。 ITR 发生在特定物种的海龟着丝粒位置，通常发生在几对染色体上。它们的分布并不直接对应于染色体间重排。我们的研究结果支持着丝粒和性染色体的非重组部分是非常动态的基因组区域，即使在海龟中也是如此，这个群体通常被认为是缓慢的正在不断发展。然而，与有鳞爬行动物（蜥蜴和蛇）（超过一半的受检物种和鸟类中都发现了 ITR）相比，ITR 在海龟中的存在通常很少见，这与该群体中染色体重排率较低和核型进化相当缓慢的预期相符。
数字对象标识符 (DOI)：10.3390/genes1 1060657
关键字：更多应用 |梅塔弗 |中期成像| Ikaros
更多...更少...mSystems，2020 年 6 月 5 日在手术过程中，包括隔夜禁食和接触抗生素，小鼠盲肠中管腔和隐窝之间微生物组的空间划分会丢失。Zaborin、Alexander、Penalver Bernabe、Beatriz、Keskey、Robert、Sangwan、Naseer、Hyoju、Sanjiv、Gotel、Neil， Gilbert, Jack A., Zaborina, Olga, Alverdy, John C.盲肠是一种独特的器官哺乳动物肠道中的gion，其中微生物组位于两个区室：腔和隐窝。隐窝内的微生物组特别重要，因为它与包括干细胞在内的内层上皮细胞直接接触。在这里，我们使用包括宏基因组学在内的多种技术分析了小鼠盲肠中的微生物组。管腔微生物群由 和 组成，而隐窝则以 和 为主，粘液由这 4 个门的混合物组成。管腔微生物功能潜力主要包括碳代谢，而隐窝微生物组富含编码抗逆性的基因。为了确定这种结构、组装和功能在刺激条件下如何改变，我们将小鼠置于过夜饥饿 (S)、抗生素 (A) 和重大手术损伤（部分肝切除术 [H]）中，就像人类重大手术中发生的情况一样。我们之前已经证明了这种\"SAH”治疗的综合作用这是对隐窝底部盲肠微生物群的重大干扰，破坏了隐窝细胞的稳态。在这里，我们应用 SAH 条件，观察到盲肠微生物组的组成和功能的区室化丧失与局部理化线索的重大变化相关，包括缺氧减少、pH 值增加和丁酸盐产量减少。总而言之，这些研究证明了盲肠微生物组的明确顺序、结构和功能，这些微生物组在大手术及其随之而来的暴露等挑衅条件下可能会被破坏。近端结肠和盲肠是两个肠道区域，其中微生物组定位于两个空间上不同的区室，即管腔和隐窝。盲肠中管腔和隐窝微生物组的组成和功能的差异以及生理应激对其区室化的影响仍然知之甚少。在这里，我们表征了组成和功能小鼠盲肠中管腔、粘液和隐窝相关微生物组的研究。我们观察到盲肠内高度有序的微生物结构，当受到手术及其伴随的术前治疗（即过夜禁食和抗生素）等生理应激引起时，其组装和功能会明显受到破坏。局部理化线索的重大变化，包括缺氧水平降低、pH 值升高和丁酸盐产量减少，与盲肠微生物群组成和功能区划的丧失有关。
数字对象标识符 (DOI)：10.1128/mSystems.00377-20
关键词：微生物学|梅塔弗 |直接多重成像
更多...更少...科学报告, 10, 6682April, 2020 α-突触核蛋白内含物在帕金森病嗅球前嗅核的非神经元细胞中含量丰富。Stevenson,Taylor J.、Murray、Helen C.、Turner、Clinton、Faull、Richard L.M.、Dieriks、Birger V.、Curtis、Maurice A.嗅觉功能下降（嗅觉减退）是帕金森病 (PD) 患者最常见的非运动症状之一，然而，该功能障碍的潜在病理学尚不清楚。最近的证据表明，α-突触核蛋白 (α-syn) 病理学在运动症状出现前数年就在嗅球的前嗅核中积累。众所周知，嗅球中的神经元细胞受到 α-syn 的影响，但其他非神经元细胞类型的参与尚不清楚。对四种非神经元细胞类型（小胶质细胞、周细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞）以及死后人类 PD 嗅球 (n = 11) 和正常嗅球 (n = 11) 的前嗅核神经元中的细胞内 α-syn 包涵体的发生进行了定量。位于前嗅核我们发现，α-syn 内含物被证实存在于四种非神经元细胞类型中的三种细胞内，其中 7.78% 的小胶质细胞、3.14% 的周细胞和 1.97% 的星形胶质细胞受到影响。含有 α-syn 内含物的神经元占神经元总数的 8.60%。少突胶质细胞不含α-syn。数据提供证据表明，PD 嗅球中的非神经元细胞含有 α-syn 内含物，表明它们可能在 PD 的进展中发挥重要作用。
数字对象标识符 (DOI)：10.1038/s41598-020-63412-x
关键词：病理学和组织成像 |梅塔弗 |组织成像
更多...更少...国际放射生物学杂志，96, 214--219二月，2020使用有丝分裂 Akodon 细胞诱导人外周血淋巴细胞过早染色体凝聚的替代方法。Selvan Gnana Sekaran, Tamizh, Ricoul, Michelle, Brochard, Patricia, Herate,Cecile、Sabatier、Laure早熟染色体浓缩 (PCC) 技术用于通过测定间期细胞中观察到的染色体片段来研究外部辐射暴露情况。 CHO 细胞中大端粒信号的存在会干扰 PCC 片段的检测和双着丝粒染色体的识别。我们提出了一种改进的方法，将 G0 淋巴细胞与有丝分裂细胞（少量染色体和弱染色端粒序列）融合，结合双着丝粒染色体和着心环的快速定量来诱导 PCC，作为经典 CHO 细胞融合技术的替代方法。来自三名健康志愿者的全血接受 0、2 或 4 Gy 的 γ 射线照射。暴露后在 37°C 下孵育 24 小时后，使用有丝分裂细胞通过标准 PCC 程序制备分离淋巴细胞的染色体扩散。可评分融合的百分比，通过端粒/着丝粒 (T/C) sta 测量无论辐射暴露如何，α-诱导的 PCC 均高于 CHO 诱导的 PCC。重要的是，两种技术的生物剂量测定评估结果相同。有丝分裂细胞诱导的 PCC 融合测定，结合 G0 淋巴细胞 T/C 染色对双着丝粒染色体和环进行评分，是意外辐射暴露后快速可靠剂量估计的合适替代方案。
数字对象标识符 (DOI)：10.1080/09553002.2019.1625493
关键词：毒理学和放射生物学| Metafer
更多...更少...科学报告，2020 年 2 月 2899 年 10 月基于个体重建部分体和中子辐射暴露的高通量方法。Shuryak, Igor, Turner, Helen C., Perrier, Jay R., Cunha, Lydia, Canadell, Monica Pujol, Durrani, Mohammad H., Harken, Andrew, Bertucci 、安东内拉、塔维拉斯、玛丽亚、加蒂、盖伊、布伦纳、大卫 J.基于生物剂量学的复杂辐照场景（部分身体屏蔽和/或中子 + 光子混合物）的个体化重建可以改善大规模伤亡辐射相关事件后的治疗决策。我们对离体辐照的人类淋巴细胞使用带有自动扫描和成像软件的高通量微核测定来：a）重建部分身体和/或中子暴露，b）分别估计光子和中子剂量混合照射。其机制背景是，与全身光子照射相比，中子会产生更多具有多个微核/双核细胞的严重受损淋巴细胞，而局部照射产生的此类淋巴细胞较少。为了利用这些差异进行生物剂量测定，我们开发了描述双核细胞中微核分布的指标，并作为以下情况的机器学习或参数分析中的预测因子：(A) 均质伽马照射，模拟全身暴露，与辐照血液与未辐照血液的混合物，模拟部分身体暴露。 (B) X 射线与各种中子 + 光子混合物。结果显示场景和剂量重建的准确性很高。具体而言，在场景 A 和 B 中，按暴露类型对样本进行分类的受试者工作特征曲线面积 (AUC) 分别达到 0.931 和 0.916。在这些情况下，实际剂量与重建剂量的 R 值分别达到 0.87 和 0.77。这些令人鼓舞的发现证明了所提出的临床相关复杂辐射暴露场景高通量重建方法的原理验证。
数字对象标识符 (DOI)：10.1038/s41598-020-59695-9
关键词：毒理学和放射生物学 |梅塔弗 |评分偏差|中期成像
更多 ...更少 ...123456…24本文链接： https://www.ebiomall.cn/b580-amsystem/info-1500725474.html
