虚拟筛选依赖分子模拟技术，从大量的有机化合物中遴选出可能有效的候选化合物，避免了对化合物的盲目筛选，从而大大降低了发现活性先导化合物的成本。虚拟筛选作为计算机辅助药物设计中的一项实用化技术，在当代的创新药物研发中发挥着重要的作用。

近些年来，国内外针对一些重大疾病药物靶标均有许多成功使用虚拟筛选的实例。在这些成功的实例中，多种不同类型的小分子化合物数据库（通常包括100,000~1000,000个化合物）被用于虚拟筛选，从中获得了生物活性达到μM甚至nM级别的结构新颖的活性先导化合物。

在此基础上，选择合适的小分子化合物库不仅能极大的提升工作效率同时能节省工作时间、购买费用等。本文简单介绍一些虚拟筛选的小分子化合物库。

常用数据库：

ZINC、PubChem、DrugBank、ChEMBL、ChemDB、HMDB、BindingDB、SMPDB。

常用化合物库介绍：

1）筛选化合物库分类：多样性化合物库、上市药物分子库、已知活性库、靶点化合物库，天然产物库，片段库等等；

2）常用化合物库品牌：Chemdiv、Enamine、Lifechemicals、Specs、Chembridge、Maybridge、Microsource 、Vitas-M、Interbioscreen等；

3） 各品牌化合物的优劣势介绍：

a.ChemDiv：140万库存分子，多样性被认为是商业库中最好的，每年新增20万以上的分子，每年新增的量就和Specs全部的分子数一样多了，而且有很多虚拟筛选的针对各靶点的子库，被大量的高通量筛选的客户选用。到货很快，快的时候1周就可以到货了;

b.Enamine：100万以上，乌克兰的公司，多样性也不错，但价格要高于chemdiv；

c.Lifechemicals：60多万种分子，库存量充足，如部分产品库存不足可很快完成合成及补充工作，进入中国市场较晚，价格中等；

d.SPEC：20多万种分子，价格最便宜，最早进入中国市场，已经被各大研究单位无数次的反复筛选过。近年有些研究单位实验结果显示：没有新的化合物已经有将近10年未更新化合物，溶解性，多样性都相对比较差；

e.Chembridge：有70万种小分子，将化合物分成1，2，3 或4类，价格都不一样，是依赖于化合物合成的难易来分的。相对价格较贵;

f.Maybridge：只有6万种小分子，杂环化合物比较多，但因为定价最高，选择的人相对较少，同时到货周期也比较慢；

因为各化合物库供应商的定价政策是：单次购买化合物数量越多价格越便宜。所以直接使用各化合物库公司自己的电子数据并在单次筛选中尽量选用一个公司的分子库最好。这样既可以避免找不到实体化合物的情况,还能降低化合物单价及运费操作费。

使用大部分虚拟筛选软件的过程中，我们经常会遇到一个重复操作的步骤，添加化合物数据库！第一次虚筛结果不好，重新添加；参数选错了，重新添加。。。麻烦哈！

有时候，我们想同时筛选多个化合物数据库，包括自己的化合物数据库。我们得提前把所有数据整合在一起，或者，筛选多次。。。麻烦哈！

没关系！没关系！

小编现在隆重为大家介绍一款药物筛选管理系统——既提供化合物库资源管理，可以同时选择商业数据库和自己得私有化合物库，又提供虚拟筛选及实体筛选数据管理，可以整合筛选过程所涉及到的多样化数据。

药物筛选管理系统（DSMS）是一款综合虚拟筛选与实体筛选的药物筛选数据管理系统，内置化合物资源库，为大规模化合物高通量筛选提供数据管理一站式解决方案，加速药物发现。该系统整合虚拟筛选、实体筛选及化合物资源三大模块，数据相互关联。

基于相似性原理，从化合物资源库中查找相似化合物，从而进行生物实验验证，并将筛选数据通过实体筛选模块管理，一个活性化合物发现多个活性化合物，实现一站式科研数据管理。

药物筛选管理系统功能介绍

可筛选库

DSMS 可筛选库分为组织库和系统库。系统内置化合物资源库，包括药物库，天然产物库，合成化合物库等，无缝对接化合物供应商，为用户购买化合物提供便捷服务；也支持管理本地化合物资源库。

内嵌结构编辑器

内嵌自主研发的impDraw化学结构编辑器，可在系统内绘制及编辑化合物的结构或反应式。

查询功能

支持子结构查询、精确结构查询和相似度查询，每秒可检索20 万个化学结构。

虚拟筛选管理

系统提供分子拓扑相似和三维形状相似两种方法，用户可以根据自己需求灵活选择。DSMS筛选化合物是非常快速的，筛选数百万化合物只需几分钟。系统提供筛选报告下载功能，在筛选结果的分子库信息中数据可批量保存和导出。

实体筛选管理管理

对化合物及其生物活性筛选数据进行管理，支持分子水平、细胞水平、动物水平等不同层次药物筛选的数据管理；提供药物实体筛选信息批量存储与查询模块，可灵活配置相关模块的字段信息，进行实体筛选信息的便捷存储与快速查询。还可批量添加分子和导入虚拟筛选分子及实体筛选分子，而且导入记录可查询。

虚拟筛选作为新药研发的加速器，其筛选化合物库的选择也是重中之重。药物筛选管理系统作为一款专业的筛选管理系统，融合虚拟筛选和实体筛选数据系统化管理，提供化合物库，实现一站式科研数据管理，是新药研发的一大利器。