【汉恒干货·CRISPR protocol】Cas9敲除系统操作方法(一)
前言lentiCRISPR v2载体是张锋实验室发布的一个慢病毒载体,cas9和sgRNA表达框在同一个载体上,而且Cas9的C端带有FLAG融合标签,载体包含Puromycin抗性基因,适合建系。验证sgRNA活性的时候也适合瞬转;包装成慢病毒适合常规细胞系的建系,构建非常方便。 一、lentiCRISPR v2应用指南网址:https://www.addgene.org/52961/
1、克隆gDNA使用BsmBI位点,载体可以切出一个~1.9 kb的filler片段,便于confirm酶切成功并利于载体回收;2、BsmBI的位点是
,酶切之后不需要CIP脱磷也不会自连!3、Cas9的COOH 端带有FLAG tag,可以WB或者Immunostaining4、EFS promoter被优化的小而强,极大提高了慢病毒包装的效率5、载体带有Puromycin抗性,可以富集转染/感染成功的细胞。二、如何设计gDNA1、gDNA设计方法和原则请参考上第一步\"lentiCRISPR v2应用指南”,链接如下: https://www.addgene.org/52961/2、对于lentiCRISPR v2克隆,其合成的oligo末端和pX330不同,请注意设计;
举个例子说明(克隆小白千万注意oligo的方向)
三、如何克隆载体1、Backbone的酶切体系同上方步骤\" 如何设计gDNA\"(说明:不脱磷处理参考黑框,脱磷参考红框内操作)2、Oligo的退火条件也参考上方步骤(说明:如果载体不脱磷,oligo不需要磷酸化;载体脱磷参考红框内操作,oligo就需要加磷处理
图1
图2四、病毒包装体系1、包装病毒使用的包装体系如下(for 100 mm dish,6x106 293T)
2、转染条件:用细胞转染试剂 LipoFiterTM(超便宜且好用)(汉恒生物LipoFiterTM官方页面, http://www.hanbio.net/cn/products/item/36)3、收集48hr和72hr病毒上清,待用。病毒包装的protocol非常多,小编只列了基本的信息。后续会出详细写慢病毒包装步骤的干货!
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