

Highlights
- Easy purification of high-quality DNA from whole blood, buffy coat, swabs, or cultured cells.
- Protocol excludes the use of Proteinase K and organic denaturants for biofluid and cell samples.
- Eluted, inhibitor-free DNA is ideal for PCR, endonuclease digestion, bisulfite conversion/methylation detection, sequencing, genotyping, etc.
Description
Elution Volume | ≥ 25 µl |
---|---|
Equipment | Microcentrifuge, vortex, centrifuge w/ microplate carriers |
Purity | High-quality DNA is eluted with DNA Elution Buffer or water. DNA is especially well suited for PCR and other downstream applications. A260/A280>1.8 |
Sample Source | Whole blood, plasma, serumcultured cells, buccal cells, tissue already digested with Proteinase K or mechanically homogenized from human, mouse, rat, etc. are effectively processed using this kit. |
Size Range | Capable of recovering genomic DNA up to and above 40 kb. In most instances, mitochondrial DNA and viral DNA (if present) will also be recovered |
Workflow | Unique lysis buffer system omits the need for Proteinase K digestion for biological fluids and cell culture samples. |
Yield | Up to 5 µg/well total DNA is eluted into ≥30 µl DNA Elution Buffer or water. Human whole blood yields 3-7 µg DNA per 100 µl blood sampled. Mammalian tissues already homogenized will yield 1-3 µg DNA per mg. |
Q1: What is the difference between Quick-DNA and Quick-DNA Plus kits?
The Quick-DNA is optimized for cells, soft tissues, and homogenized/digested samples using a single lysis/binding buffer. The Quick-DNA Plus kits contain an optimized Proteinase K for processing a wider variety of sample inputs, such as cells, blood, tissues, etc. The upgraded Quick-DNA Plus typically recovers more DNA.
Q2: I’m seeing some yield inconsistencies with my blood samples, what’s happening?
White blood cells, which are the major source of genomic DNA in blood, easily and quickly settles. Mix the blood sample well prior to taking an aliquot for purification.
Q3: Can the Quick-DNA kit be used with bacterial samples?
E. coli cells are easy-to-lyse and can be processed directly. For other microbes, additional pretreatment (e.g. enzymatic digestion or mechanical lysis) can be implemented and then processed with the Quick-DNA Kit. Alternatively, for an all-inclusive kit to process all microbes, use any of Zymo Research’s Environmental Kits (e.g. Quick-DNA Fungal/Bacterial, Quick-DNA Fecal/Soil, ZymoBIOMICS DNA, etc.) for DNA isolation.
Q4: Can I use the Quick-DNA kit to clean-up previously isolated DNA?
No, the kit is designed for direct use with biological samples. For clean-up of isolated DNA, please use the Genomic DNA Clean & Concentrator or the DNA Clean & Concentrator kits.
Q5: Can Quick-DNA process crude lysates?
Yes, add 4 volumes of Genomic Lysis Buffer to 1 volume of crude lysate, homogenized, or digested sample (see Cell Suspensions and Proteinase K Digested Samples) and proceed with the remainder of the protocol.
Q6: What is the purpose of adding beta-mercaptoethanol? Can this step be substituted or omitted?
Beta-mercaptoethanol is a reducing agent that helps break down proteins and improves DNA recovery and purity. Addition of beta-mercaptoethanol is recommended to enhance sample lysis, but can be substituted with dithiothreitol (DTT, final concentration of 10 mM) or omitted.
Q7: Is it possible to add an RNase A treatment to the protocol?
The Quick-DNA kits recover RNA-free genomic DNA. The selective chemistry allows for binding of double stranded DNA to the column and for RNA to flow through. No RNase A treatment is required when processing samples within kit specifications.
Q8: What are the expected yields for each sample type?
Keep in mind that there is sample to sample variability.
Sample Type | Input Amount | Expected Yield |
---|---|---|
Eukaryotic Cells | 1x106 Cells | 5-6 µg |
Skeletal, Heart, Lung, Brain Tissue | 1 mg | 1-3 µg |
Liver and Kidney Tissue | 1 mg | 3-5 µg |
Human Whole Blood | 100 µl | 5-7 µg |
Cat # | Name | Size | Price | |
---|---|---|---|---|
D3004-4-50 | DNA Elution Buffer | 50 ml | $32.00 | |
D3004-5-50 | DNA Pre-Wash Buffer | 50 ml | $26.00 | |
D3004-1-100 | Genomic Lysis Buffer | 100 ml | $60.00 | |
D3004-2-100 | g-DNA Wash Buffer | 100 ml | $30.00 | |
D3004-4-10 | DNA Elution Buffer | 10 ml | $14.00 | |
C2003 | Elution Plate | 2 Plates | $19.00 | |
C2002 | Collection Plate | 2 Plates | $22.00 | |
C2001 | Silicon-A Plate | 2 Plates | $129.00 |
ebiomall.com






>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
研究人员将多效生长因子注入骨髓生长因受到辐射而被抑制的实验鼠体内,后者的骨髓干细胞生长速度与未注射多效生长因子的实验鼠相比提高了10倍。在实验室培养皿中,多效生长因子还被确认可促进人类脐带血干细胞的生长。研究人员还证实,多效生长因子不会导致实验鼠出现癌变。
研究人员说,这项成果将来有望使更广泛的人群受益于脐带血移植,更重要的是,对正在接受化疗或放疗的患者而言,利用多效生长因子进行的治疗或许具有加速患者血液和免疫系统恢复的潜力。
【原文见附件】
ellsNatureMedicineNaturePublishingGroup.pdf(1020.57k)
1.淋巴因子(lymphokine) 于命名,主要由淋巴细胞产生,包括T淋巴细胞、B淋巴细胞和NK细胞等。重要的淋巴因子有IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-9、IL-10、IL-12、IL-13、IL-14、IFN-γ、TNF-β、GM-CSF和神经白细胞素等。
2.单核因子(monokine) 主要由单核细胞或巨噬细胞产生,如IL-1、IL-6、IL-8、TNF-α、G-CSF和M-CSF等。
3.非淋巴细胞、非单核-巨噬细胞产生的细胞因子 主要由骨髓和胸腺中的基质细胞、血管内皮细胞、成纤维细胞等细胞产生,如EPO、IL-7、IL-11、SCF、内皮细胞源性IL-8和IFN-β等。
(二)根据细胞因子主要的功能不同分类
1.白细胞介素(interleukin, IL) 1979年开始命名。由淋巴细胞、单核细胞或其它非单个核细胞产生的细胞因子,在细胞间相互作用、免疫调节、造血以及炎症过程中起重要调节作用,凡命名的白细胞介素的cDNA基因克隆和表达均已成功,已报道有三十余种(IL-1―IL-38)。
2.集落刺激因子(colony stimulating factor, CSF) 根据不同细胞因子刺激造血干细胞或分化不同阶段的造血细胞在半固体培养基中形成不同的细胞集落,分别命名为G(粒细胞)-CSF、M(巨噬细胞)-CSF、GM(粒细胞、巨噬细胞)-CSF、Multi(多重)-CSF(IL-3)、SCF、EPO等。不同CSF不仅可刺激不同发育阶段的造血干细胞和祖细胞增殖的分化,还可促进成熟细胞的功能。
3.干扰素(interferon, IFN) 1957年发现的细胞因子,最初发现某一种病毒感染的细胞能产生一种物质可干扰另一种病毒的感染和复制,因此而得名。根据干扰素产生的来源和结构不同,可分为IFN-α、IFN-β和IFN-γ,他们分别由白细胞、成纤维细胞和活化T细胞所产生。各种不同的IFN生物学活性基本相同,具有抗病毒、抗肿瘤和免疫调节等作用。
4.肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor, TNF) 最初发现这种物质能造成肿瘤组织坏死而得名。根据其产生来源和结构不同,可分为TNF-α和TNF-β两类,前者由单核-巨噬细胞产生,后者由活化T细胞产生,又名淋巴毒素(lymphotoxin, LT)。两类TNF基本的生物学活性相似,除具有杀伤肿瘤细胞外,还有免疫调节、参与发热和炎症的发生。大剂量TNF-α可引起恶液质,因而TNF-α又称恶液质素(cachectin)。
5.转化生长因子-β家族(transforming growth factor-β family, TGF-β family) 由多种细胞产生,主要包括TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3、TGFβ1β2以及骨形成蛋白(BMP)等。
6.生长因子(growth factor,GF)如表皮生长因子(EGF)、血小板衍生的生长因子(PDGF)、成纤维细胞生长因子(FGF)、肝细胞生长因子(HGF)、胰岛素样生长因子-I(IGF-1)、IGF-Ⅱ、白血病抑制因子(LIF)、神经生长因子(NGF)、抑瘤素M(OSM)、血小板衍生的内皮细胞生长因子(PDECGF)、转化生长因子-α(TGF-α)、血管内皮细胞生长因子(VEGF)等。
7.趋化因子家族(chemokinefamily) 包括四个亚族:(1)C-X-C/α亚族,主要趋化中性粒细胞,主要的成员有IL-8、黑素瘤细胞生长刺激活性(GRO/MGSA)、血小板因子-4(PF-4)、血小板碱性蛋白、蛋白水解来源的产物CTAP-Ⅲ和β-thromboglobulin、炎症蛋白10(IP-10)、ENA-78;(2)C-C/β亚族,主要趋化单核细胞,这个亚族的成员包括巨噬细胞炎症蛋白1α(MIP-1α)、MIP-1β、RANTES、单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1/MCAF)、MCP-2、MCP-3和I-309。(3)C型亚家族的代表有淋巴细胞趋化蛋白。(4)CX3C亚家族,Fractalkine是CX3C型趋化因子,对单核-巨噬细胞、T细胞及NK细胞有趋化作用。向左转|向右转
并指出确定细胞因子的基本指标,
对于一些特殊物质打开思路,
进行反传统定义。
请大家积极发言。
对有用资源做一简单整理
细胞因子PPT之HTML版本
主要的细胞因子
细胞因子
细胞因子
书
网络资源
而对于大多数革兰阳性细菌,喹诺酮类药物主要抑制细菌的拓扑异构酶Ⅳ,拓扑异构酶Ⅳ为解链酶,可在DNA复制时将缠绕的子代染色体释放。向左转|向右转
我的细胞复苏的时候染菌了,还能不能用来测胞内细胞因子IFN-γ,谢谢大家,帮帮忙。
干扰素(Interferon,IFN),是由英国科学家Isaacs于1957年利用鸡胚绒毛尿囊膜研究流感病毒干扰现象时首先发现的,是一种细胞因子,具有抑制细胞分裂、调节免疫、抗病毒、抗肿瘤等多种作用。其本质是蛋白质,类型可分为α、β、γ、ω等几种。IFN能诱导细胞对病毒感染产生抗性,它通过干扰病毒基因转录或病毒蛋白组分的翻译,从而阻止或限制病毒感染,是目前最主要的抗病毒感染和抗肿瘤生物制品。
«生命的化学»2001年21卷1期
熊安琪陈松森
(中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所,北京100005)
关键词:干细胞因子;c-Kit受体;细胞内信号转导
中图分类号:Q507
干细胞因子(stemcellfactor,SCF)是一种重要的造血因子,对正常造血细胞、肥大细胞、黑色素细胞、生殖细胞的增殖和分化以及肿瘤细胞的增殖和恶性演进等起着重要的调节作用。其受体是由原癌基因c-kit编码的一种具有酪氨酸激酶活性的跨膜蛋白c-Kit,分子量为117~145kD[1]。c-Kit受体由胞外结构域、单一的短跨膜区和胞内结构域三部分组成。SCF与c-Kit之间的特异性结合可触发c-Kit的同源二聚体化和其细胞膜内酪氨酸残基的磷酸化,产生停泊位点,捕获含有SH2结构域的信号分子、还能直接激活蛋白激酶C、MAP激酶、Rac1、JNK、Raf-1、JAK2等,通过多种信号因子的参与将细胞外的信号转导到细胞内部,引发某些基因的特异性表达。越来越多的研究表明:SCF/c-Kit下游的信号转录情况是非常复杂的,它是各种底物激酶的酪氨酸磷酸化和丝/苏氨酸激酶磷酸化的共同参与和整合,并且存在着许多信号转导途径之间的串话作用(cross-talking),从而精确地调控细胞的分化和增殖,其具体机制是近年来信号转导研究中的热点问题。本文对SCF/c-Kit介导的细胞内信号转导途径的研究进展作一综述(图1)。
图1SCF激活多种信号转导途径示意图(引自DianaLinnekin,1999)[2]
1.Jak/STAT信号转导途径
Jak激酶是一种非跨膜酪氨酸激酶,可以与细胞因子受体胞内区偶联,在细胞因子与受体结合后能被迅速活化,激活信号蛋白STATs,使之进核,并诱导目的基因的表达。JAK激酶家族共有4个成员:JAK1、JAK2、JAK3和TYK2。研究表明SCF可以诱导JAK2与c-Kit偶联,激活JAK2,诱导最大的细胞增殖反应。而JAK2缺陷型小鼠在子宫中死亡的胚胎发育阶段与c-Kit或SCF缺陷型小鼠相一致,进一步证明JAK2对SCF诱导的正常造血细胞的增殖、分化具有重要的影响[3]。STAT分子除了通过JAK激酶被激活外,还可以被c-Kit受体直接激活。当SCF刺激表面表达有c-Kit受体的骨髓细胞和成纤维细胞时,c-Kit胞内的不同结构域分别诱导STAT1α、STAT5A和STAT5B与之发生偶联磷酸化,而其他的STAT蛋白在SCF刺激下不能被募集活化。其中STAT1α以同源二聚体形式与c-Sis可诱导DNA元件(SIE)结合,STAT5蛋白以STAT5A/STAT5B或STAT5/STAT1α异源二聚体形式与β-酪蛋白启动子的催乳素诱导元件结合。实验研究还表明缺失激酶插入区的c-Kit缺失突变体不能激活STAT信号转导,进一步证实了c-Kit受体酪氨酸激酶活性对STAT激活的重要性[4]。
2.PI3K途径
SCF等细胞因子在刺激某些靶细胞时,可以通过c-Kit直接快速激活磷脂酰肌醇3激酶(PI3K),也能通过Shc、Rac、Ras和Rho激酶激活或增加PI3K的活性。PI3K是一种由调控亚基p85和催化亚基p110组成的异源二聚体,属多基因家族。在造血细胞中有3种p110的异构体(α、β、δ)表达,其中δ只在造血细胞中表达。当SCF与c-Kit结合时,c-Kit受体酪氨酸激酶磷酸化,在其激酶插入区第719位酪氨酸处于PI3K的p85亚基结合,使之磷酸化,激活p110催化亚基。大量的研究发现,当c-Kit第719位酪氨酸(Y)突变为苯丙氨酸(F)时,既失去了与PI3Kp85亚基偶联的能力,又丧失了SCF介导的使PI3K活性增加的能力,但Y719Fc-Kit自动磷酸化的活性没有损伤[5]。激活的PI3K又能激活下游的信号分子p70核糖体S6激酶(p70ribosomalS6kinase,p70S6K)、蛋白激酶B(PKB也叫Akt)和NF-κB[6]。Hunter等人通过构建c-KitTyr719→Phe突变的纯合体小鼠,完全阻断了c-Kit介导的PI3K信号转导途径,并且使Akt活性降低了90%。虽然该型小鼠在造血作用和黑色素生成中未表现出缺陷,但随着精原干细胞增殖减少和随后精原细胞凋亡增加,雄性小鼠精子细胞生成受阻导致不育,而该型的雌性小鼠生殖功能正常[7]。提示SCF/c-Kit信号转导途径在精子生成的生理和病理过程中起着非常重要的作用。
3.Src家族激酶
目前已发现的酪氨酸蛋白激酶Src家族的成员有:Src、Yes、Fgr、Fyn、Lck、Lyn、Blk和Hck。研究发现对SCF反应的细胞系和正常的祖细胞中都存在Lyn的高表达。用GST融合蛋白进行体外研究证明:Lyn通过SH2结构域与人c-Kit的近膜区序列568Y*VY*磷酸化酪氨酸特异性偶联磷酸化,并使其激酶活性增加,在SCF介导的细胞增殖中发挥作用。另外,Fyn也能结合相当于人c-Kit568Y*VY*磷酸化酪氨酸的多肽序列。
一种广泛表达的酪氨酸激酶Csk和与其有相似酶活性的激酶CHK(Cskhomologouskinase)可以通过磷酸化Src家族成员高度保守的C-末端酪氨酸残基而下调其活性,但对c-Kit自动磷酸化却没有明显的作用。CHK在巨核细胞、自然杀伤细胞和脑中组成型表达,SCF能够诱导CHK表达,但对Csk的表达没有影响。磷酸多肽研究提示CHK与人c-Kit第568和570位磷酸化酪氨酸发生偶联,而该位点也能与Lyn和Fyn偶联,这可能是下调SCF/c-Kit激酶活性的一种机制[8]。
另外,最新的研究发现Src家族激酶还在SCF诱导的c-Kit运输中发挥作用。正常情况下,当c-Kit与SCF结合后,该复合物快速内化,以减少细胞对SCF的反应。这种内化以及细胞受体的运输可能还是全面激活与受体偶联的信号转导通路所必需的。而Src家族激酶抑制剂PP1可以阻断SCF诱导的造血细胞表面受体c-Kit的成帽和c-Kit的内化,而c-Kit仍能与网格蛋白偶联,说明c-Kit在进入网络蛋白包被小凹过种中不依赖于Src家族激酶的作用[9]。具体的作用机制还不清楚,尚需进一步的研究。
4.Ras/Raf/MEK/ERK信号转导途径
在SCF与c-Kit结合而诱导的增殖反应中,Ras蛋白的激活是其中的一个重要环节。由SCF介导的c-Kit受体自动磷酸化能捕获多种含有SH2结构的信号分子与受体形成复合物,其中含SH2蛋白酪氨酸磷酸酶2(SHP2)和Shc的酪氨酸残基首先被磷酸化,然后偶联Grb2和Grap。Grb家族成员又与一种鸟苷转换因子Sos偶联,使Sos和Ras共定位,从而增加Ras的活性。SCF还能诱导含有SH2结构域的磷酸化酪氨酸蛋白SHIP与Shc偶联。SHIP具有5磷酸酶活性,是一种造血的负调控因子。研究还发现一种GTPase激活蛋白核因子(NF1)也参与调节SCF激活的Ras活性。
许多实验室的研究证明Raf-1这种丝/苏氨酸激酶也参与了SCF引发的磷酸酪氨酸激酶信号转导事件,在SCF的作用下其活性明显增加。SCF还能增加MEK1、MEK2和MAPK的酪氨酸磷酸化和激酶活性,再依次磷酸化并激活ERK1和ERK2[10],最后激活转录因子从而激活相应的基因,提供了一条由SCF诱导c-Kit激活引发的“级联”效应信号转导途径:Ras→Raf→MEK→ERK→其它激酶或转录因子,并且该途径的激活可以通过多种机制进行调节。
5.SCF信号转导中的负调控因子
SHP1是一种广泛表达在造血细胞内的酪氨酸磷酸酶(PTPase),对多种生长因子和细胞因子引发的有丝分裂信号进行负调控,尤其是在调节造血细胞的生长和发育过程中起着关键的作用。研究表明c-Kit与SCF结合后与SHP-1偶联发生了去磷酸化的细胞内反应[11]。鼠c-Kit受体近膜区磷酸化的569位酪氨酸是SHP-1选择性结合的主要位点,567位酪氨酸也可与之结合。对真性红细胞增多症的病因研究发现:真性红细胞增多症患者的红系祖细胞尽管在细胞因子的量和与受体的亲和力都没有增加的情况下,对几种生长因子的促有丝分裂作用却高度敏感。实验表明,近60%的患者在红细胞克隆形成单位中SHP1的表达减弱[12]。
另一种蛋白酪氨酸磷酸酶SHP2也能负调控c-Kit介导的信号转导。SCF刺激使SHP2通过567位磷酸化酪氨酸残基与c-Kit受体偶联。分别将转染的小鼠pro-B细胞系Ba/F3中c-Kit受体的567和569位酪氨酸突变为苯丙氨酸,SHP1和SHP2与c-Kit的偶联能力都显示降,细胞在SHP的作用下出现过度增殖[11]。研究表明SHPO2对红系和髓系细胞的发育具有重要的作用,它在早期造血过程中是一种正向调控因子,在进一步分化的细胞中是一种负调控因子[13]。
蛋白激酶C(PKC)也能负调控SCF介导的细胞增殖。PKC在体内和体外均可磷酸化c-Kit第741位和746位丝氨酸,突变这两个位点既提高了c-Kit的激酶活性,又促进了PI3K与c-Kit受体的偶联,从而使SCF介导的细胞增殖增加,同时降低了细胞的运动性。研究发现PKC介导的c-Kit受体丝氨酸磷酸化降低了捕获含有SH2结构域的信号分子与c-Kit偶联的能力,但不影响SCF诱导的Raf-1和ERK2的激活。
6.小结
近年来的研究证明SCF/c-Kit能够激活多种信号转导途径,而且由于许多信号分子的细胞特异性,决定了细胞内环境的复杂性和特异性,也决定了不同的生物学结果(细胞的存在、分化、增殖或凋亡)。尤其是c-Kit受体在造血系统中不同细胞系之间和不同分化阶段之间分布的差异,以及SCF与其它生长因子的协调作用,使得该信号转导途径更为复杂。这方面的研究对于我们认识各种生长因子对静止干细胞的协同作用和造血过程的一些基本问题,为从阻断或激活某些信号转导途径入手设计新型药物,具有重要理论意义和广阔的应用价值。
参考文献
[1]YardenYetal.EMBOJ,1987,6:3341-3351
[2]DianaLinnekin.TheIntJBioch&CellBiol,1999,31:1053-1074
[3]ParganasEetal.Cell,1998,93:385
[4]MariaFBetal.JBiolChem,1999,274(24):16965-16972
[5]DuronioVetal.CellSignal,1998,10:233-239
[6]DownwardJetal.CurrOpinCellBiol,1998,10:262-267
[7]Blume-JensenPetal.NatGenet,2000,24(2):157-162
[8]PriceDJetal.BiochemBiophysResCommun,1999,259(3):611-616
[9]VirginiaCetal.Blood,1999,94(6):1979-1986
[10]SuiXetal.Blood,1998,92:1142
[11]KozlowskiMetal.MolCelBiol,1998,18:2089-2099
[12]WickremaAetal.ExpHematol,1999,27(7):1124-1132
[13]QuCKetal.MolCelBiol,1998,18:6075
CristinaAlberini教授的个人主页:http://www.mountsinai.org/profiles/cristina-alberini
全文下载:
nature09667.pdf(558.65k)

