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实验——物理因素对微生物的影响
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1.1核酸序列的检索http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide1.2核酸序列的同源性分析1.2.1基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi1.2.2核酸序列的两两比较http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/bl2.html1.2.3核酸序列的批量联网同源性分析(方案)1.3核酸序列的电子延伸1.3.1利用UniGene数据库进行电子延伸(方案)1.3.2利用Tigem的ESTMachine进行电子延伸ESTExtractor:http://gcg.tigem.it/blastextract/estextract.htmlESTAssembly:http://www.tigem/ESTmachine.html1.3.3利用THC数据库对核酸序列进行电子延伸http://gcg.tigem.it/UNIBLAST/uniblast.html1.4核酸序列的开放阅读框架分析1.4.1基于NCBI/ORFfinder的ORF分析http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html1.5基因的电子表达谱分析1.5.1利用UniGene数据库进行电子表达谱分析(方案)1.5.2利用Tigem的电子原位杂交服务器进行电子表达谱分析http://gcg.tigem.it/INSITU/insitublast.html1.6核酸序列的电子基因定位分析1.6.1利用STS数据库进行电子基因定位http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/sts/epcr.cgi1.6.2利用UniGene数据库进行电子基因定位(方案)1.7CDNA的基因组序列分析1.7.1通过从NCBI查询部分基因组数据库进行基因组序列的分析(方案)1.7.2通过从NCBI查询全部基因组数据库进行基因组序列的分析http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geno...tml&&ORG=Hs1.7.3通过从SangerCentre查询基因组数据库进行基因组序列的分析http://www.sanger.ac.uk/HGP/blast_server.shtml1.8基因组序列的初步分析1.8.1基因组序列的内含子/外显子分析http://www.bioscience.org/urllists/genefind.htm1.8.2基因组序列的启动子分析http://www-hgc.lbl.gov/projects/promoter.html1.9核酸序列的注册1.9.1EST序列的注册(方案)1.9.2较长或全长cDNA序列的注册(方案)1.10待分析序列所对应的已知克隆的获取http://image.llnl.gov

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