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DNA提取试剂盒是根据氯化芐法构建的,能够从样本中提取基因组DNA的试剂盒。氯化苄具有能将含有纤维素等的细胞壁中的羟基苄基化,从而破坏细胞壁的特性。本制品利用了氯化苄的这一特性,将植物样品冻结融解后,再使用Pipet Tip的尖端将植物样品在Microtube壁上数次按压即可破坏细胞壁。本法与传统方法相比,省去了液氮研磨等烦琐步骤,有利于一次性处理大量样品。而且,本制品经过了改良,热处理时间只需15分钟,使用本制品从实验开始至水相回收只需30分钟时间。得到的基因组DNA可以进行PCR扩增及限制酶处理等。
1、DNA提取问题:现在核算提取试剂盒大部分都是吸附柱法,相信你应该不会操作错误,如果提取之后进行核酸定量结果很低的话,试着再最后一步溶解核算的时候把水稍微加温(37℃就可以了),溶解时间稍微长一些,然后再离心的时候采用分次离心,比如开始你用200ul溶解的话,你可以分两次用100ul水溶解离心,这样可以提高DNA的产率.
2、电泳问题:如果你核酸定量浓度不低的话就考虑电泳问题,电泳的时候加上1kb的marker,如果marker跑不出来说明你凝胶有问题,一般只要marker跑出来了,DNA浓度又比较高,而没有条带这样的现象很少见,DNA提取比较简单而且相当稳定,本人当时做甲基化提取的DNA有一次拿出来电泳忘了放回冰箱了,结果大夏天的在外面放了一天,心怀忐忑的进行了一次电泳,结果条带依然给力,一点都没有降解.
DNA提取方法的选择:全血提取试剂盒一般有离心柱和溶液型两种(比如Qiagen、Promega、Bioteke;摒弃酚氯仿手提的方法,时间长毒性大),原理及步骤基本相同。虽然各公司推出了N多型号,让人不知如何去选择,但从原理和操作步骤看,基本就是离心柱和溶液型两种。一般来说,离心柱(DP1801)的提取纯度高一些,但是处理量小(0.1-1ml)、得率略低;溶液型(DP2101或DP2201)的提取量大(1-10ml)得率也高于离心柱。医院的血液标本一般在2ml以上,一般选择溶液型的方法提取.在说到国产和进口差别的时候,很多人以为进口一定比国产的好,我们觉得没有最好,只有更好!在不断的进行试验优化之后,全血基因组DNA提取试剂盒DP2101或DP2201开创了第三代技术,不需要蛋白酶K消化,进口的都是要借助蛋白酶K的啊!DP2101或DP2201减少了蛋白酶K现配现用的麻烦和消化的时间,而且提取量和稳定性更好。
是单链cDNA,想合成双链cDNA需要另外操作:一、cDNA第二链的合成:1. 第一链反应完成后,取2ul一链产物-20℃冰箱中保存,待电泳检测。其余的产物合并,混匀,然后顺序加入下列试剂(promega):20ul 10×DNA Polymerase I buffer6ul10mM dNTP(自己配制)xuldd H2O1ulRNase H(2U/ul)10ul DNA Polymerase I(10U/ul)总体系为200ul;2. 混匀后,16℃反应2.5小时;3. 70℃灭活10分钟;4. 反应完成后,得到200ul cDNA第二链反应体系,将此体系置于冰上;5.取2ul二链产物,同保存的一链产物一起电泳鉴定。同时上1kb ladder,确定双链的大小范围。注:一链,二链的电泳图是smear,且二链稍比一链大一些。二、双链cDNA末端补平:1. 在第二链反应体系中,顺序加入下列试剂(promega):6ul 10mM dNTP2ul T4 DNA Polymerase(8.7U/ul) 2ul BSA(10mg/ml)2. 稍微离心混匀反应物, 37℃反应至少30分钟,然后75℃灭活10分钟;3. 加入等体积酚/氯仿/异戊醇,剧烈振荡后,常温下13000g离心5分钟;4. 离心后,吸取上清于另一1.5ml eppendof管中,加入等体积氯仿,上下颠倒几次混匀后,常温下13000g离心5分钟;5. 吸取上清至另一eppendof管,加入1/10V3M NaAc(PH5.2)和2.5V预冷的无水乙醇,混匀,-20℃放置过夜以沉淀双链cDNA;6. 第二日,将昨日沉淀物在4℃,13000g离心60分钟以充分沉淀双链cDNA;7.离心完毕,弃上清,加入1ml 70%乙醇洗涤沉淀,常温下13000g离心5分钟;8.离心完毕,弃上清,干燥沉淀至无乙醇气味.注:第3,第4步可以用PCR 纯化试剂盒代替。PCR纯化试剂盒操作流程:1.溶液PE使用前应加入适量体积95%-100%的乙醇,混匀。2.向200ul二链补平产物中加入5倍体积的buffer PB,混匀。3.加入spin column中,13000rpm离心1min。4.加入0.75ml buffer PE,13000rpm离心1min。5.13000rpm,再离心1min。6.将spin column放入一新的离心管中,加入50ul buffer EB,静置10min。7.13000rpm离心2min。8.加入30ul buffer EB,静置10min。9.13000rpm离心2min。10.加入1/10体积3M的NaAc,2.5倍体积无水乙醇,混匀,-20℃沉淀过夜。
作为何种用途啊,还有材料的种类呢?动植物方面差别很大,我个人只了解植物、细菌、藻类、土壤DNA的提取,植物总DNA的哪里的都差不多,价格0.5-2.5元每个样品,关键在研磨和酚类、多糖的去除(抽提),细菌核基因组DNA和土壤宏基因组冻融1.5*CTAB法足以,也没有太好的盒子。volume62提到的磁珠法绝对是非常好的方法,而且十分高效,适合高通量,就是贵啊,对样品的要求也较严格。其实大多数DNA试剂盒都是基于CTAB或SDS法制作的,其优点一般是简单快速,外加药品的来源稳定(自己配药的话这方面可以考虑西格玛分装或者国药,其实真的国药的是很不错的,只是不好搞),再就是配方好了,毕竟试剂公司的研发部门也不是白饭的。
要看你做什么用途了,血浆中的游离DNA本身就很少的,我用过天根和杭州昊鑫生物这两家的血浆游离DNA提取试剂盒,总的来说,两家的性能,杭州昊鑫生物的纯度和提取量要略好一点,后续检测的PCR结果也好一点,CT值比天根的要早3个循环左右,而且,杭州昊鑫生物的试剂盒提取耗时短,比较适合样本多的用户。
各位战友:
样本:从沸水煮过的中药上清
目的:提取DNA并进行PCR检测
问题:
(1)这样的样本中DNA应该会大部分降解,仅有痕量保留,能否推荐一些痕量DNA提取或检测的
试剂盒?
(2)
Qiagen的法医级别试剂盒有人用过吗?效果如何?
(3)这样的实验战友们有成功的案例吗?
非常感谢!
求助大神:有人提过柔嫩**尔球虫的DNA吗?要求是能构建出
文库的,一般文献记载的都是跑PCR就可以了,质量不够。我需要能构建文库的。
不要RNA,不要
CDNA文库,就要DNA文库!
好人一生平安,大神帮帮忙!
全血基因组DNA提取试剂盒(离心柱型)作用原来具体是这样的:独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱. 试剂盒特点: 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤. 快速,简捷,单个样品操作一般可在20分钟内完成. 多次柱漂洗确保高纯度,典型的产量200μl全血可提取出3-6μg,纯度达1.1.9,长度可达30Kb-50kb,可直接用于PCR,Southern-blot和各种酶切反应. 从十几个配方中优选出的红细胞裂解液配方,裂解快速完全,客户可根据需要选择购买. 说明书中针对实验过程出现的疑难做出了详细的解答,帮助你解决实验过程中遇到的问题(如标本中含有血凝块、红细胞裂解不完全、DNA产量低、DNA下游酶切不能切开或者酶切不完全、DNA长度小于15kb、A260吸光值异常偏高、洗脱下来的DNA溶液还带有轻微的颜色等).
我用的是华美生物工程公司全血基因组DNA纯化系统
试剂盒,说明书上说利用A260光吸测定浓度对该方法制备的基因组DNA是不适用的,产量可达1ug/20ul全血,5-10ul上清液可以直接用于PCR扩增。
我分别用3ul、5ul、8ul都试过了,没有任何条带,用别人别的方法提好的DNA做,却能出现结果,不知道是自己提取的DNA浓度不够,还是根本没有提取出来。
不知道谁用过,或者有更好的全血提取NDA的试剂盒推荐呢?
本人刚刚开始做PCR,谢谢各位高手!
规格50T售价300,规格100T售价560。以下为试剂盒使用方法及介绍。保存:室温(15℃-25℃) 干燥保存,复检期12个月,2℃-8℃保存时间更长。试剂盒内容: 向左转|向右转产品简介:本试剂盒采用可以特异性结合DNA的离心吸附柱和独特的缓冲液系统,提取细菌基因组DNA。离心吸附柱中采用的硅基质材料为本公司特有新型材料,能够高效专一吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。提取的基因组DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠。使用本试剂盒提取的基因组DNA可用于各种常规操作,包括酶切、PCR、文库构建、Southern杂交等实验。操作步骤:使用前请先在漂洗液中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶体上的标签。 所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。1、取细菌培养液1ml,12000rpm离心1min.,尽量吸除上清。2、向菌体中加入200ul溶液A,振荡或用移液器吹打使菌体充分悬浮(如果是革兰氏阳性菌,可在此步骤加入终浓度为20mg/ml的溶菌酶),向悬浮液中加入20ul的RNase A (10mg/ml),充分颠倒混匀,室温放置15-30min。3、向管中加入20ul的蛋白酶K(10mg/ml),充分混匀,55℃消化30-60min,消化期间可颠倒离心管混匀数次,直至样品消化完全为止,此时可见菌液呈清亮粘稠状。4、向管中加入200ul溶液B,充分颠倒混匀,如出现白色沉淀,可于75℃放置15-30min,沉淀即会消失,不影响后续实验。如果溶液未变清亮,说明样品消化不彻底,可能会导致DNA的提取量以及纯度降低,还可能堵塞吸附柱。5、向管中加入200ul无水乙醇,充分混匀,此时还可能会出现絮状沉淀,不影响DNA的提取,可将溶液和絮状沉淀都加入到吸附柱中,静置2min。6、12000rpm离心2min.弃废液,将吸附柱放入收集管中。7、向吸附柱中加入600ul漂洗液(使用前请先检查是否己加入无水乙醇)。12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。8、向吸附柱中加入600ul漂洗液,12000rpm离心l min, 弃废液,将吸附柱放入收集管中。9、12000rpm离心2min,将吸附柱敞口置于室温或50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,否则漂洗液中的乙醇会影响后续实验如酶切、PCR等。10、将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中央悬空滴加50-200ul经65℃水浴预热的洗脱液,室温放置5min,12000rpm离心1min。11、离心所得洗脱液再加入吸附柱中,室温放置2min,12000rpm离心2 min,即可得到高质量的细菌基因组DNA。注意事项:1、样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。2、若试剂盒中的溶液出现沉淀,可在65℃水浴中重新溶解后再使用,不影响提取效果。3、如果实验中的离心步骤出现柱子堵塞的情况,可适当延长离心时间。4、洗脱缓冲液的体积最好不少于50ul,体积过小会影响回收效率;洗脱液的pH值对洗脱效率也有影响,若需要用水做洗脱液应保证其pH值在8.0左右(可用NaOH将水的pH值调至此范围),pH值低于7. 0会降低洗脱效率。DNA产物应保存在-20℃,以防DNA降解。5、DNA浓度及纯度检测:得到的基因组DNA片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。 回收得到的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。DNA应在OD260处有显著吸收峰,OD260值为1.0相当于大约50μg/ml双链DNA、40μg/ml单链DNA。OD260/0D280比值应为1.7-1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水,比值会偏低,因为pH值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。
我正在准备制备细胞样品用于检测凋亡的DNAladder,不知道DNAladder的DNA提取与普通的DNA提取有无不同之处,可否用tripure或者一般的DNA提取
试剂盒提取细胞的DNA用于凋亡的DNAladder检测吗?也就是可不可以不用专用的用于凋亡检测的DNAladder提取试剂盒?