DNA测序和大数据为寻找新病毒开辟了新的前沿
下一代基因组测序（NGMS）可能具有发现血液中新的病毒感染的广泛潜力，如人类hepegivirus-1（HHpgV-1），目前无法通过常规方法发现。HHpgV-1是否导致人类疾病仍有待观察。研究结果发表在“内科学杂志”上。
人类正在培养有助于健康和疾病的微生物。NGMS已经用于临床实践中以检测未预期的病原体，并且还描述了识别的病毒如HIV-1和丙型肝炎病毒（HCV）的复杂群体的组成。虽然NGMS可以发现新的序列，但检测的极限没有明确定义。了解NGMS与定量临床标准相比的敏感性和准确性对于确定其临床应用至关重要。
约翰霍普金斯医学院的研究人员研究了注射艾滋病毒和丙型肝炎病毒感染艾滋病毒和丙型肝炎病毒的人的血浆样本，他们参与了聚乙二醇化干扰素-2b（IFN）给药后和抗逆转录病毒治疗（ART）前后HCV动力学的前瞻性研究。这是很重要的，因为注射毒品的人群血液感染的风险较高，因此可能是出现血液传播疾病的“哨兵”。研究人员通过NGMS和定量聚合酶链反应（PCR）比较了血浆中的病毒核酸。
研究人员发现，NGMS对于检测相对较低血浆核酸浓度的病毒不敏感，但能够在人类病毒基因HHpgV-1中发现一种意想不到的新型hepegivirus。此外，研究人员在肝组织中发现HHpgV-1序列。这一发现的意义尚不清楚，但它揭示了NGMS检测血液中病毒的灵敏度和准确性。
来源“基因测序产业网”
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发布于 ： 2017-06-08
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