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Kapa biosystems/KAPA hgDNA Quantification and QC Kit/KK4960/300 x 20 µL reactions
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Kapa biosystems/KAPA hgDNA Quantification and QC Kit/KK4960/300 x 20 µL reactions
品牌 / 
kapabiosystems
货号 / 
KK4960
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Description:

qPCRMasterMix(Universal)

KAPAhgDNAQuantificationandQCKit

Qualitymatters.

KAPAhgDNAQuantificationandQCKitscontainallthereagentsneededfortheqPCR-basedquantificationandqualityassessmentofhumangenomicDNAsamplespriortoNGSlibraryconstruction.

KitscontainKAPASYBR®FASTqPCRMasterMix,optimizedforhigh-performanceSYBRGreenI-basedqPCR,aswellasapre-dilutedsetofDNAstandardsandprimerpremixestargetingdifferentportionsofahighlyconservedsingle-copyhumanlocus.Absolutequantificationisachievedwiththeprimerpairdefiningtheshortestfragment,whereastheadditionalprimersareusedtoderiveinformationabouttheamountofamplifiabletemplateintheDNAsample.Qualityscores(orQ-ratios)generatedwiththekitmaybeusedtopredicttheoutcomeoflibraryconstruction,ortailorworkflowsforsamplesofvariablequality,particularlyFFPEDNA.

ThemethodiseasytoautomateandcanbeappliedtoanyprocessorworkflowthatrequiresaccuratequantificationofdiluteDNAsamples,orsamplesthatmaycontainahighproportionofDNAthatisrecalcitranttoPCRamplification.

Downloadour KAPAhgDNAQuantificationandQCDataAnalysisTemplate.

ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.

ProductHighlights

Principle of the hgDNA Quantification and QC assay. A single set of DNA standards is used to generate up to three standard curves using three different primer pairs that amplify targets of 41 bp, 129 bp or 305 bp within a conserved, single-copy human locus. The 41 bp assay is used for absolute quantification of DNA samples. For an assessment of DNA quality, standard curves are generated and samples assayed with the 129 bp and/or 305 bp primer premix(es). Since poor DNA quality has a greater impact on the amplification of longer targets, the relative quality of a DNA sample can be inferred by normalizing the concentration obtained using the 129 bp or 305 bp assay against the concentration obtained from the 41 bp assay. This normalization generates a Q-ratio (with a value between 0 and 1) that is indicative of DNA quality, or the amount of amplifiable material in a DNA sample. Data on file.

Obtainconcentrationandqualityinformationwithasingleassay

  • AllowsforaccuratequantificationofdiluteDNAsamples
  • QuantificationwithanadditionalprimerpairprovidesaQ-ratiothatisindicativeofsamplequality
Conversion rates (% input DNA converted to adapter-ligated library) for libraries prepared for targeted re-sequencing on the Illumina platform. Libraries were prepared in duplicate from 80 – 100 ng FFPE DNA of variable quality (orange) or a commercial hgDNA preparation (grey), using the KAPA LTP Library Preparation Kit. FFPE DNA samples were assessed with the KAPA hgDNA Quantification and QC assay prior to Covaris shearing. Q-ratios were as indicated. The amount of fragmented DNA (average size ~180 bp) used for library construction was determined using the Qubit HS dsDNA assay (Life Technologies), whereas adapter-ligated libraries were quantified using the qPCR-based KAPA Library Quantification Kit. Results indicated that conversion rates for FFPE samples were significantly lower than for high-quality DNA. This limits the diversity of FFPE libraries, and necessitates more cycles of library amplification to generate sufficient material for target capture. This results in higher duplication rates and lower target coverage for FFPE libraries. Data on file.

Employqualityscores intheanalysisofNGSlibraryconstructionworkflows

  • Q-ratioscanprovidevaluableinsightsintothebottlenecksinNGSlibraryconstructionworkflows
  • ForFFPEsamples,libraryandsequencequalityisprimarilylimitedbyinefficientconversionofinputDNAtoadapter-ligatedlibrary

Obtainactionabledataforsamplepreparation

  • Q-ratioscorrelatewithkeysequencingmetricssuchasduplicationratesandmeantargetcoverage
  • FFPEsampleswithaQscore>0.4yieldlibrariesofacceptablequalitywhenprocessedinstandardsamplepreparationsfortargetcapture

Applications:

Applications
  • FFPEsamples
  • Free-circulatingDNAfromplasmaorserum
  • Samplesobtainedbylaser-capturemicrodissectionoffresh,frozenorFFPEtissue
  • Forensicsamples
  • Cellscollectedbyflowcytometry
  • Anyotherlimitingorpreciousclinicalsample

KitSpecificationsandContents/Storage:

KitSpecificationsandContents/Storage

Kitscanbestoredforupto12months at-20˚C.

Complete(MasterMix)kitsincludeKAPASYBRFASTqPCRMasterMix(2X),PrimerPremix(41bp,129bpand305bp,10X)andasetof5DNAStandards.PrimerPremixesandDNAStandardsarealsosoldseparately.

Components

Specifications

Spec
Description
CompatIBLePlatform
AllNGSplatforms
CompatibleSamples
HumangenomicDNA
Samplesources
FFPEtissueCellscollectedbylaser-capturemicrodissectionFlow-sortedcellsFree-circulatingDNAfromplasmaorserumForensicsamplesClinicalsamples
Standardcurveconcentrationrange
2.5ng/µL–10pg/µLor3,080–12copies
SequencingApplications
WholeGenomeSequencingWholeExomeSequencingTargetedSequencing(custompanels)AmpliconSequencing
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公司介绍
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Paragon Genomics是一家位于美国硅谷的生命科技初创公司。我们致力于开发具有突破性且易于使用的超高多重PCR技术, 用于基因组分析和临床诊断市场。我们的核心技术将首先应用于下一代基因测序文库制备市场,从而实现更准确, 更快, 并且更便宜的DNA测序样品制备和个体化医疗。货号产品种类产品名称(英文原名/中文名称)包装 (反应数)816001测序文库制备试剂盒CleanPlex™ Targeted Library Kit ... 查看更多>
提供商:Acebiox 查看更多>
克劳宁(北京)生物科技有限公司在发布的BrightDye® Terminator循环测序试剂盒供应信息,浏览与BrightDye® Terminator循环测序试剂盒相关的产品或在搜索更多与BrightDye® Terminator循环测序试剂盒相关的内容。 查看更多>
High Efficency Yeast Plasmid Rescue(by Trey Powers, Fields Lab) Grow yeast overnight.Spin down 1.5 ml of culture in microfuge tubes.DecantAdd 250 µl of Q 查看更多>
For amplification of cognate sequences from different organisms, or for "evolutionary PCR", one may increase the chances of getting product by designing 查看更多>
  Paragon Genomics是一家位于美国硅谷的生命科技初创公司。我们致力于开发具有突破性且易于使用的超高多重PCR技术, 用于基因组分析和临床诊断市场。我们的核心技术将首先应用于下一代基因测序文库制备市场,从而实现更准确, 更快, 并且更便宜的DNA测序样品制备和个体化医疗 查看更多>
Yeast Miniprepfrom Robzyk and Kassir, Nucleic Acid Res. (1992) 20:3790Materials:• 10 ml overnight culture yeast in drop out media (must be very dense) 查看更多>
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Yeast Cell LysatesModified from the Rine LabGrow cells to 0.3 to 0.5 O.D.(600) (~1E7 cells/ml). Use about 1.0 to 5.0 OD of cells per lysate; if your cells are 查看更多>
【正品直销,售后保障】(可构建适用于Ion Torrent平台的多样品靶向测序DNA文库)VAHTS AmpSeq Adapters 1-12 for Ion Torrent是由南京诺唯赞生物科技有限公司代理或销售的Vazyme品牌的试剂,产品来源于江苏南京。南京诺唯赞生物科技有限公司是中国最权威的【正品直销,售后保障】(可构建适用于Ion Torrent平台的多样品靶向测序DNA文库)VAHTS AmpSeq Adapters 1-12 for Ion Torrent试剂销售服务商之一,在南京等地方销售 查看更多>
近年来,结直肠癌的发病率在我国呈现快速增长趋势,其中很多新发患者为转移性结直肠癌。瑞戈非尼是治疗转移性结直肠癌的首个口服靶向药物,为广大的结直肠癌患者带来了福音。蚂蚁淘近期采访了院肿瘤医学部专家教授,给我们详细介绍了瑞戈非尼的作用机制、研究数据解读以及结直肠癌治疗研究进展,并认为免疫治疗、抗血管靶向药物和化疗的相互联合将在未来使结 查看更多>
上海海科生物技术有限公司在发布的ABI BigDye® Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kits(测序试剂盒)供应信息,浏览与ABI BigDye® Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kits(测序试剂盒)相关的产品或在搜索更多与ABI BigDye® Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kits(测序试剂盒)相关的内容。 查看更多>
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肺癌患者,想做一下基因检测,好知道用什么靶向治疗药物。另求告知一稳妥可信检测机构。谢谢
微生物16S测序解决方案—样品提取篇123
一男一女丶燲掛2017-11-26
离心都要4度离心。 离心管是否需要灭菌看你样品下游应用和整个实验目的。对于你这个似乎是检测肉储藏时间和其上细菌分布的实验,离心管是要灭菌的。根据塑料材质,离心管有可高压灭菌不可高压灭菌。
三博基因检测技术成熟,仪器准确
三博基因检测方法是一代Sanger测序法。公司暂未开展芯片业务。Sanger测序法准确度大大高于芯片和二代测序。三博基因所用仪器是法医和亲子鉴定专用仪器。Sanger测序法是目前基因检测的国际金标准,检测准确率高达99.9999%。三博基因拥有美国ABI公司的最新3730型全自动遗传分析仪,是经过国际和国家认证的仪器,可重复性达到100%。
Sanger测序法优点是准确,不会出现假阳性假阴性,而且可进行个性化基因检测,是疾病确诊和大夫用药的唯一指定方法。

三博基因检测的实力雄厚,基因检测集科研、生产、销售、实验、报告一条龙服务
北京三博远志生物技术有限责任公司,2000年成立,是北京市中关村高新技术企业。公司实体部门有五个:DNA合成部、DNA测序部、基因体检部、基因工程课题服务部、分子生物学试剂盒生产部。北京三博远志是国内基因合成、测序知名企业,16年科研服务为国内基因研究作出了巨大贡献。
多年为医院临床大夫提供癌症疾病诊断和临床治疗用药指导服务,为科研单位新药研发提供服务等。做基因体检我们有更多的发言权。

Sanger测序法不仅准确,而且适合小套餐检测
二代测序和芯片适合多基因、多位点、高通量、大数据的检测,新一代测序除了准确度不够以外,样品数量小数据量少价格也不具备优势,Sanger测序不仅准确,小规模测序Sanger测序有价格优势。我公司研发的基因检测服务,在全球科学家研究的基础上,我们选择热点靠谱的基因,精确定位,靶向精准测序,是我们多年协同医院及科研单位反复验证总结出来的,已经相当成熟、完善。我们的检测结果最大特点就是,与实际情况非常吻合,经得起实践和时间的考验,有非常好的健康管理价值和临床意义。
Sanger测序是指定目标的靶向检测没有臃冗的检测所以有价格优势,我们能够提供准确、实用、物美价廉的服务,小套餐和个性化靶向基因检测服务我们相当成熟、完善。

有用的、可信的、真实可见的检测,详实的有数据支撑的报告,具体的医疗保健指导建议
三博基因只做癌症、心脑血管、遗传病、代谢、儿童天赋、用药指导、疾病诊断等有用的,研究透彻的基因检测。多年科研和临床检测积累值得信赖,不炒作基因概念,很实在。
三博基因不使用芯片检测,杜绝假阳性、假阴性,检测报告真实可见(附带:基因检测峰图),
详实的《人体基因检测健康管理说明书》,健康管理很实用。
三博基因开展的基因检测位点是经过科学家和临床医生2万个以上验证案例作为数据支撑,主效的,而且也是经过我公司几年上万个临床案例验证,经过多次筛选得出的,很靠谱。

检测速度快
7-10个工作日可以完成基因检测项目。由于是单独检测所以不需要凑板等时间,即使只有几个样本,也可以随时检测。
检测报告制作完成后可以发送到指定邮箱或者网站在线查阅。
在2个工作日内安排专家进行一对一的电话解读或者来我公司现场讲解。

周到的服务、完善的客服平台和培训体系
公司具有完善的客户服务系统,不论是电话、QQ、QQ群、微信、网站留言、还是邮箱咨询,均有专业的人员予以第一时间解答和支持。对于顾客投诉,均在1小时之内给予回复解决。
我公司可以配合合作单位的业务需求,定期的对内部人员进行基因检测服务专业培训以及面对大众的基因检测讲座服务。
用QuikChange试剂盒做单点突变,对照质粒都能正常的出结果,但是目的质粒测序3次都没有突变。

说明书上写的可以扩14000bp以内的质粒,我的质粒长度7800bp,引物是32bp,说明书上要求tm值大于78,CG值大于40,按说明书上的算法我的算出来是tm81,CG值是59。


请问是不是我的质粒太大啦?要不我先把目的片段切下来连到T载体(加目的片段有4500bp)上?和我CG值太高也有关系吗?

做了两个月都没成功,急死我了,拜托大家给点意见谢谢啦!!!
1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。
2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。
3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序列捕获、文库制备、上机测序、数据分析。
4、单细胞的分离--DNA/RNA的提取和扩增(全基因组扩增和全转录组扩增)---测序以及后续的分析和应用。
相同:使用二代测序
不同:样本处理,文库构建,检测的区域,数据分析流程
不可以,测序用的酶和Taq酶是有区别的。
求助做蓝白斑筛选后小提质粒用于测序试剂盒

时间:2016-7-1518:51  来源:测序中国

新药研发是场艰难、昂贵的持久战。以美国的流程为例,3-6年的时间从约5,000-10,000个化合物中海选出250个选手进入临床前研究:基于细胞水平的体外实验检测化合物的毒性、致癌性和致突变的作用,经过筛选的化合物化学改性,以提高靶向特异性、效力、化学和代谢稳定性、水溶性等药理学参数;此外,先导化合物还需在实验室内开展动物实验,对化合物在动物体内的吸收、分布、代谢和排泄进行药代动力学试验。层层筛选后,需获得监管机构的新药临床研究申请批复方可开展人体试验。

通常会有5个种子选手进入临床研究,在20-100名不等的健康志愿者和患者小样本人群中确定最大耐受剂量、药代动力学和药效学的1期,约50-60%的试验药物可进入100-500人的2期研究。接下来,约30-35%的试验药物进入1,000-5,000的大规模3期证明疗效。顺利的话,整个临床研究将耗时6-7年。临床研究完成之后需将相关数据材料交给政府部门予以审核,最终只有1个幸运儿跨过独木桥获得国家级别的批准,进入规模生产。

利用BRCA1或BRCA2作为靶点的研究也毫无疑问地经历了上述过程。FarmerH等在05年使用BRCA1或BRCA2缺陷的胚胎干细胞研究细胞的生存情况,首次证实BRCA1或BRCA2功能异常的胚胎干细胞对PARP酶抑制剂非常敏感,导致染色体不稳定、细胞周期停滞和凋亡;证实BRCA和PARP两条不同的通路合作修复DNA损伤。这意味着靶向抑制特定的DNA修复通路可能可以设计特定的肿瘤治疗靶点。同年,BryantHE等利用PARP1-/-小鼠和BRCA2缺陷的细胞株,得出与FarmerH类似的结论,一个新概念的肿瘤治疗方案由此产生。

08年,EversB等首次在BRCA2缺陷的小鼠乳腺肿瘤细胞系评估AZD2281、顺铂单药以及联合使用的协同效果,发现无论AZD2281单药还是两种药物的组合,对BRCA2缺陷型细胞显示出增效的细胞毒性。

正是在这些强烈的临床前证据下,利用DNA修复的合成致死机制,第一款靶向药物AZD2281启动了一系列临床研究,逐步夯实了奥拉帕利作为卵巢癌领域第一个口服靶向药的基石地位。

奥拉帕利临床研究一览表

多篇高影响因子文献反复验证了奥拉帕利作为第一个使用合成致死机制的口服靶向药,逐步摸索锁定有效人群、最佳治疗阶段、用药方式。2014年12月奥拉帕利迎来美国适应症,紧接着2015年2月获得欧盟适应症,亚洲地区澳门2015年9月获批。

美国适应症:奥拉帕利可单药治疗携带致病或疑似致病的胚系BRCA突变(根据FDA批准的检测方法)、经三线或更多化疗的晚期卵巢癌患者。

欧盟/澳门适应症:对含铂化疗敏感(完全缓解或部分缓解),铂敏感复发、BRCA突变的(胚系和/或体细胞)高级别上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌的成年患者,奥拉帕利可作为其维持治疗阶段的单药治疗。

其它PARP抑制剂的研发进度在今年也不断刷屏,希望为癌症患者带来新曙光。

时间:2016-7-1518:51  来源:测序中国

试剂盒提DNA的原理123
孙叔▲豆司312021-07-24
碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其原理为:染色体DNA比质粒DNA分子大得多,且染色体DNA为线状分子,而质粒DNA为共价闭合环状分子;当用碱处理DNA溶液时,线状染色体DNA容易发生变性,共价闭环的质粒DNA在回到中性时即恢复其天然构象;变性染色体DNA片段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀,而复性的超螺旋质粒DNA分子则以溶解状态存在液相中,离心去除沉淀后,就可从上清中回收质粒DNA。
目前,市面上质粒提取试剂盒大多数都是采取上述的碱裂解方法,不同之处在于纯化方式。目前比较常用的纯化系统是硅基质吸附材料,其原理为在高盐环境下质粒DNA能够结合到硅基质上,然后用低盐缓冲液或水将质粒DNA从硅基质上洗脱下来。得到的质粒可以用于酶切、PCR、测序、细菌转化、转染等分子生物学实验。
生物试剂盒采用经典的SDS碱裂解法结合二氧化硅磁球特异性吸附核酸的优点快速纯化质粒DNA,该试剂盒适合从1-4mL的大肠杆菌菌液中提取多至25μg的高纯度质粒DNA,可用于测序、酶切、转化等具体的可以查询药智网,回答满意请您采纳,谢谢。
看下neb的二代测序试剂盒的试剂盒说明书 上面一般针对这块都会有详细解答的 是在不行也可以找厂家寻求技术支持!