Highlights
- Extract high-quality DNA easily and reliably from any biological fluids, cultured/monolayer cells, or solid tissues.
- Zymo-Spin Technology ensures DNA is ready for all sensitive downstream applications such as qPCR, DNA-sequencing, arrays, and methylation analysis.
Description
| Elution Volume | ≤ 15 µl |
|---|---|
| Equipment | Water bath or heat block (55°C), microcentrifuge, and vortex. |
| Purity | High quality DNA is ready for all sensitive downstream applications such as PCR, endonuclease digestion, Southern blotting, genotyping, Next-Gen sequencing, bisulfite conversion, etc. (A260/A230≥ 2.0). |
| Size Range | Capable of recovering genomic and mitochondrial DNA sized fragments > 50 kb. If present, parasitic, microbial, and viral DNA will also be recovered. |
| Workflow | Utilize a Proteinase K Digestion and Zymo-Spin Column for effective recovery of DNA. |
| Yield | The DNA binding capacity of the well is 5 µg. Typically, mammalian tissues yield: 1-3 µg DNA per mg skeletal, heart, lung, and brain tissues and 3-5 µg DNA per mg liver and kidney. Human whole blood will yield 3-7 µg DNA per 100 µl blood sampled. |
Q1: Can I use Quick-DNA Plus to clean-up previously isolated DNA?
No, the kit is designed for direct use with biological samples. For clean-up of previously isolated DNA, please use the Genomic DNA Clean & Concentrator or the DNA Clean & Concentrator kits.
Q2: What are the expected yields for each sample type?
Keep in mind that there is sample to sample variability.
| Sample Type | Input Amount | Expected Yield |
|---|---|---|
| Eukaryotic Cells | 1x106 Cells | 5-6 µg |
| Skeletal, Heart, Lung, Brain Tissue | 1 mg | 1-3 µg |
| Liver and Kidney Tissue | 1 mg | 3-5 µg |
| Human Whole Blood | 100 µl | 5-7 µg |
Q3: I’m seeing some yield inconsistencies with my blood samples, what’s happening?
White blood cells, which are the major source of genomic DNA in blood, easily and quickly settles. Mix the blood sample well prior to aliquoting for purification.
Q4: Can Proteinase K digestion be performed overnight in DNA/RNA Shield?
Yes, samples can be digested overnight. Make sure to follow the appendix (page 8 appendix B) for processing liquids samples in DNA/RNA Shield and incubate at room temperature.
Q5: What is the difference between Quick-DNA and Quick-DNA Plus kits?
The Quick-DNA is optimized for cells, soft tissues, and homogenized/digested samples using a single lysis/binding buffer. The Quick-DNA Plus kits contain an optimized Proteinase K for processing a wider variety of sample inputs, such as cells, blood, tissues, etc. The upgraded Quick-DNA Plus recovers more DNA with higher purity compared to the Quick-DNA Kits.
Q6: Can the Quick-DNA Plus kit be used with bacterial samples?
E.coli cells are easy-to-lyse and can be processed directly with the Biological Fluids & Cells protocol. For an all-inclusive kit with any type of microbes (including tough-to-lyse), use any of Zymo Research’s Environmental Kits (e.g. Quick-DNA Fungal/Bacterial, Quick-DNA Fecal/Soil, ZymoBIOMICS DNA, etc.).
Q7: What is the difference between the digestion buffers? Can one buffer be used for all sample types?
The BioFluid & Cell Buffer (Red) is designed to allow for rapid Proteinase K digestion with easy-to-lyse samples (e.g. mammalian cells and biological fluids).The Solid Tissue buffer (Blue) can be used for any sample type and requires a longer PK digestion time compared to using the BioFluid & Cell Buffer (Red).
Q8: Can Quick-DNA process crude lysates?
Yes, add 4 volumes of Genomic Lysis Buffer to 1 volume of crude lysate, homogenized, or digested sample (see Cell Suspensions and Proteinase K Digested Samples) and proceed with the remainder of the protocol.
Q9: What is the purpose of adding beta-mercaptoethanol? Can this step be substituted or omitted?
Beta-mercaptoethanol is a reducing agent that helps break down proteins and improves DNA recovery and purity. Addition of beta-mercaptoethanol is recommended to enhance sample lysis, but can be substituted with dithiothreitol (DTT, final concentration of 10 mM) or omitted.
| Cat # | Name | Size | Price | |
|---|---|---|---|---|
| P1002-2 | 96-Well Block w/ Cover Foil | 2 Blocks/foils | $28.00 | |
| C2010 | Zymo-Spin I-96-XL Plates | 2 Plates | $257.00 | |
| C2007-4 | 96-Well Plate Cover Foil | 4 Foils | $10.00 | |
| C2007-2 | 96-Well Plate Cover Foil | 2 Foils | $10.00 | |
| C2003 | Elution Plate | 2 Plates | $19.00 | |
| C2002 | Collection Plate | 2 Plates | $22.00 | |
| D4068-3-85 | Genomic Binding Buffer | 85 ml | $95.00 | |
| D4068-2-10 | Solid Tissue Buffer (Blue) | 10 ml | $24.00 | |
| D4068-3-45 | Genomic Binding Buffer | 45 ml | $49.00 | |
| D4068-2-22 | Solid Tissue Buffer (Blue) | 22 ml | $38.00 | |
| D4068-1-12 | BioFluid & Cell Buffer (Red) | 12 ml | $24.00 | |
| D4068-1-25 | BioFluid & Cell Buffer (Red) | 25 ml | $38.00 | |
| D3004-5-50 | DNA Pre-Wash Buffer | 50 ml | $26.00 | |
| D3004-4-10 | DNA Elution Buffer | 10 ml | $14.00 | |
| D3004-2-50 | g-DNA Wash Buffer | 50 ml | $18.00 | |
| D3004-2-100 | g-DNA Wash Buffer | 100 ml | $30.00 |
ebiomall.com
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
发展起各种双杂交系统Fields等建立系统基础些新系统主要报道基、诱饵表达载体及猎物表达载体等做些改进其重要改进引入额外报道基广泛采用HIS3基经改造带HIS3报道基酵母细胞HIS3启表达才能缺乏组氨酸选择性培养基HIS3报道基转录表达由诱饵猎物相互作用所启数双杂交系统往往同使用两甚至三报道基其 LacZ些改造基启区相同转录激结合位点相同转录激(述Gal4蛋白)激通种双重或重选择既提高检测灵敏度减少假阳性现象其针诱饵或猎物表达载体等所作改进详述
双杂交鉴定程要经两转化工作量相特别寻找新作用蛋白质候尤其且酵母细胞转化效率比细菌要低约4数量级转化步骤双杂交技术瓶颈Bendixen等通酵母接合型引用避免两转化操作同提高双杂交效率酵母性殖程涉及两种配合类型:a接合型α接合型两种单倍体间接合(mating)能形二倍体a接合型细胞间或α接合型细胞间能接合形二倍体根据酵母性殖特点文库质粒转化α接合型酵母细胞诱饵表达载体转化a接合型细胞别铺筛选平板使细胞菌苔(lawn)再两种菌苔复印同三重筛选平板原则诱饵靶蛋白发相互作用二倍体细胞才能平板单倍体细胞或虽二倍体细胞BD融合蛋白AD融合蛋白相互作用都淘汰克隆进步通β-半乳糖苷酶力进行鉴定项改进仅简化实验操作且提高双杂交筛选效率
发展起各种双杂交系统Fields等建立系统基础些新系统主要报道基、诱饵表达载体及猎物表达载体等做些改进其重要改进引入额外报道基广泛采用HIS3基经改造带HIS3报道基酵母细胞HIS3启表达才能缺乏组氨酸选择性培养基HIS3报道基转录表达由诱饵猎物相互作用所启数双杂交系统往往同使用两甚至三报道基其 LacZ些改造基启区相同转录激结合位点相同转录激(述Gal4蛋白)激通种双重或重选择既提高检测灵敏度减少假阳性现象其针诱饵或猎物表达载体等所作改进详述
双杂交鉴定程要经两转化工作量相特别寻找新作用蛋白质候尤其且酵母细胞转化效率比细菌要低约4数量级转化步骤双杂交技术瓶颈Bendixen等通酵母接合型引用避免两转化操作同提高双杂交效率酵母性殖程涉及两种配合类型:a接合型α接合型两种单倍体间接合(mating)能形二倍体a接合型细胞间或α接合型细胞间能接合形二倍体根据酵母性殖特点文库质粒转化α接合型酵母细胞诱饵表达载体转化a接合型细胞别铺筛选平板使细胞菌苔(lawn)再两种菌苔复印同三重筛选平板原则诱饵靶蛋白发相互作用二倍体细胞才能平板单倍体细胞或虽二倍体细胞BD融合蛋白AD融合蛋白相互作用都淘汰克隆进步通β-半乳糖苷酶力进行鉴定项改进仅简化实验操作且提高双杂交筛选效率
谢了
1、发帖请归入相应子版(选择SubBoard)!
2、请在帖子前面注明帖子性质,如【求助】、【原创】、【分享】、【讨论】、【申请上传】、【下载】、【转帖】、【转载】、【信息】、【求购】、【公告】、【建议】等,以方便战友应助及版面管理!
3、不规范的发帖及应助帖将不加分!
【】可以这样输入,智能ABC,输入“v1”,后翻3页,就可以看见了,或用紫光拼音中文输入法,输入方括号就是粗体的中括号,实在不行请复制本公告中【】
THEGFPTWO--HHYBRIDYBRIDSYSTEM.pdf(126.79k)
用酵母双杂交或是细菌双杂交?
许研究者双杂交系统进行改进发展例采用假阳性显示析双筛选系统减少假阳性发;发展哺乳物双杂交系统更研究蛋白间相互作用其双筛选系统用二种同报告基(用lacZHIS3)优势vii:⑴ 用同启表达位于酵母二染色体报告基 明显减少假阳性⑵ 通营养型筛选增强筛选能力 尤其适用于较库容量选蛋白较少情况筛选
哺乳物双杂交系统Ⅷ种基水平重建转录功能基础体内析系统种兴趣蛋白与Gal4--DNA结合结构域构融合蛋白另种蛋白与单纯疱疹病毒VP16蛋白激结构域融合蛋白表达表达些融合蛋白载体与报道载体(CAT)共同转染哺乳物细胞系报道质粒含Gal4结合位点游cat基假两融合蛋白相互作用则cat报道基表达水平明显增高用系统证实P53蛋白与T抗原相互作用 酵母双杂交系统相同结且较酵母双杂交系统更快速转染48h内结并且哺乳物细胞能更模仿体内蛋白-蛋白相互作用哺乳物双杂交系统作酵母双杂交系统辅助手段图" class="ikqb_img_alink">
二、噬菌体展示技术:编码噬菌体外壳蛋白基连接单克隆抗体DNA序列噬菌体表面表达相应单抗再噬菌体柱柱若含目蛋白与相应抗体特异性结合称噬菌体展示技术技术主要用于研究蛋白质间相互作用仅高通量及简便特点具直接基、高选择性筛选复杂混合物、筛选程通适改变条件直接评价相互结合特异性等优点目前用优化噬菌体展示技术已经展示鼠两种特殊细胞系cdna文库并离皮信号传导途径信号
三、等离共振技术:表面等离共振技术(Surface Plasmon ResonanceSPR)已蛋白质相互作用研究新手段原理利用种纳米级薄膜吸附诱饵蛋白待测蛋白与诱饵蛋白结合薄膜共振性质发改变通检测便知两种蛋白结合情况SPR技术优点需标记物或染料反应程实监控测定快速且安全用于检测蛋白核酸及其物间相互作用
四、荧光能量转移技术:荧光共振能量转移(FRET )广泛用于研究间距离及其相互作用; 与荧光显微镜结合定量获取关物体内蛋白质、脂类、DNA RNA 空信息随着绿色荧光蛋白(GFP)发展FRET 荧光显微镜能实测量体细胞内态性质提种定量测量FRET效率及供体与受体间距离简单仅需使用组滤光片测量比值利用供体受体发射谱消除光谱间串扰该简单快速实定量测量FRET 效率供体与受体间距离尤其适用于基于GFP 供体受体
五、抗体与蛋白质阵列技术:蛋白芯片技术现给蛋白质组研究带新思路蛋白质组研究主要内容研究同理状态蛋白水平量变微型化集化高通量化抗体芯片非研究工具芯片发展快芯片且技术已经益熟些抗体芯片已经向临床应用发展比肿瘤标志物抗体芯片等已经应用再眼各领域
六、免疫共沉淀技术:免疫共沉淀主要用研究蛋白质与蛋白质相互作用种技术其基本原理细胞裂解液加入抗兴趣蛋白抗体孵育再加入与抗体特异结合结合于Pansobin珠金黄色葡萄球菌蛋白A(SPA)若细胞与兴趣蛋白结合目蛋白形种复合物:目蛋白—兴趣蛋白—抗兴趣蛋白抗体—SPAPansobinSPAPansobin比较复合物离离经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳复合物四组经Western blotting用抗体检测目蛋白否预测蛋白种目蛋白细胞内与兴趣蛋白结合符合体内实际情况蛋白信度高种两缺陷:两种蛋白质结合能直接结合能第三者间起桥梁作用;二必须实验前预测目蛋白选择检测抗体所若预测确实验结本身具冒险性
七、pull-down技术:蛋白质相互作用类型牢固型相互作用暂型相互作用两种牢固型相互作用亚基蛋白复合体见通免疫共沉淀(Co-IP) 、Pull-down技术或Far-western研究Pull-down技术用固相化、已标记饵蛋白或标签蛋白(物素-、PolyHis-或GST-)细胞裂解液钓与相互作用蛋白通Pull-down技术确定已知蛋白与钓蛋白或已纯化相关蛋白间相互作用关系体外传路或翻译体系检测蛋白相互作用关系
二、噬菌体展示技术:编码噬菌体外壳蛋白基连接单克隆抗体DNA序列噬菌体表面表达相应单抗再噬菌体柱柱若含目蛋白与相应抗体特异性结合称噬菌体展示技术技术主要用于研究蛋白质间相互作用仅高通量及简便特点具直接基、高选择性筛选复杂混合物、筛选程通适改变条件直接评价相互结合特异性等优点目前用优化噬菌体展示技术已经展示鼠两种特殊细胞系cdna文库并离皮信号传导途径信号
三、等离共振技术:表面等离共振技术(Surface Plasmon ResonanceSPR)已蛋白质相互作用研究新手段原理利用种纳米级薄膜吸附诱饵蛋白待测蛋白与诱饵蛋白结合薄膜共振性质发改变通检测便知两种蛋白结合情况SPR技术优点需标记物或染料反应程实监控测定快速且安全用于检测蛋白核酸及其物间相互作用
四、荧光能量转移技术:荧光共振能量转移(FRET )广泛用于研究间距离及其相互作用; 与荧光显微镜结合定量获取关物体内蛋白质、脂类、DNA RNA 空信息随着绿色荧光蛋白(GFP)发展FRET 荧光显微镜能实测量体细胞内态性质提种定量测量FRET效率及供体与受体间距离简单仅需使用组滤光片测量比值利用供体受体发射谱消除光谱间串扰该简单快速实定量测量FRET 效率供体与受体间距离尤其适用于基于GFP 供体受体
五、抗体与蛋白质阵列技术:蛋白芯片技术现给蛋白质组研究带新思路蛋白质组研究主要内容研究同理状态蛋白水平量变微型化集化高通量化抗体芯片非研究工具芯片发展快芯片且技术已经益熟些抗体芯片已经向临床应用发展比肿瘤标志物抗体芯片等已经应用再眼各领域
六、免疫共沉淀技术:免疫共沉淀主要用研究蛋白质与蛋白质相互作用种技术其基本原理细胞裂解液加入抗兴趣蛋白抗体孵育再加入与抗体特异结合结合于Pansobin珠金黄色葡萄球菌蛋白A(SPA)若细胞与兴趣蛋白结合目蛋白形种复合物:目蛋白—兴趣蛋白—抗兴趣蛋白抗体—SPA|PansobinSPA|Pansobin比较复合物离离经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳复合物四组经Western blotting用抗体检测目蛋白否预测蛋白种目蛋白细胞内与兴趣蛋白结合符合体内实际情况蛋白信度高种两缺陷:两种蛋白质结合能直接结合能第三者间起桥梁作用;二必须实验前预测目蛋白选择检测抗体所若预测确实验结本身具冒险性
七、pull-down技术:蛋白质相互作用类型牢固型相互作用暂型相互作用两种牢固型相互作用亚基蛋白复合体见通免疫共沉淀(Co-IP) 、Pull-down技术或Far-western研究Pull-down技术用固相化、已标记饵蛋白或标签蛋白(物素-、PolyHis-或GST-)细胞裂解液钓与相互作用蛋白通Pull-down技术确定已知蛋白与钓蛋白或已纯化相关蛋白间相互作用关系体外传路或翻译体系检测蛋白相互作用关系

