- Sato, T. et al. Biochem. 45, 5509 (2006).
ebiomall.com
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
像素组合(Binning),可以方便的用1×1,2×2,3×3,4×4,5×5等像素组合方式预览荧光图象,极大提高荧光图象预览速度。
Binning factor的用途解释是:“该参数决定每条光谱的数据点数目。信号强度正比于该值,但是数据点数目和光谱分辨率相应地要正比例减少。”
参考:www.opticres.com- 基于7个网页
H x V : 276 x 208, Binning Factor:5 x 5.
344 x 260 ,4 x 4.
460 x 344 ,3 x 3 ...(见下面所引用资料)
从中可以看出,H x V 选得越高,Binning Factor就相应地降低。
在激光拉曼光谱仪、红外光谱、圆二色光谱等成像显示器件中,每条谱峰,其实都是有很多个像素点组成,这些像素点就是数据点。Binning factor像素组合因子决定每幅光谱的数据点数目。仪器的显示像素数据点越多,显示分辨率设置就越高,谱峰描绘的就越精细精确,这一点和电视荧光屏显示器的特性是一致的。但Binning Factor像素组合因子与像素点数目是反变化的。
下面的数据是一个采购招标中的描述。其中,第39项“高分辨率数码冷CCD”有:
【Selectable Resolution:(选择分辨率)
H x V Binning Factor
276 x 208 5 x 5
344 x 260 4 x 4
460 x 344 3 x 3
692 x 520 2 x 2
1388 x 1040 1 x 1
Live帧频(取决于硬件和软件的配置)
H x V Binning Factor Frame Rate@20ms
1388 x 1040 1 11
692 x 520 2 21
460 x 344 3 31
连续时间记录在AxioVision 4 Module的最大帧频
"Fast Acquisition" (快捕取决于特殊的软件)
H x V Binning Factor Frame Rate
1388 x 1040 1 14
692 x 520 2 26
460 x 344 3 35
344 x 260 4 43
276 x 208 5 50 】
下面是这一段相关的资料:
Stereo Investigator and Neurolucida System (体视学细胞自动计数系统 ) 1套
三.显微成像系统
"Axio Imager.Z1" 显微镜(TFT控制)
"Axio Imager.Z1"电动驱动支持和TFT监控组件
1.-电动驱动调焦,行距10nm
- 显象管适配器
- 电动灯光控制,USB,RS232 和TCP/IP接口
-外部电源单位12V DC 100W,稳定的,240V AC/50...60Hz/230VA,
- USB电缆和针对中国的电缆线 数量 1
2.载物台与聚光镜架固定在一起构成"Axio Imager" 数量 1
3.Z轴驱动器的操纵台,扁平的,靠右
扁平的,符合人体工程学的控制旋钮,在右边
建议与光导或者载物台相连接,靠右 数量 1
4. 6位物镜转换器,HD DIC M27 cod. 数量 1
5.偏转相机在左边, 60N界面
2个转换位置与60N滑动器连接
pos. 1 = 100% vis,
pos. 2 for the optional mounting of path-deflecting mirror 100% =
100% doc or beam splitter 50% = 50% vis : 50% doc 数量 1
6.偏转相机的100%偏转镜,34x46x4 mm 数量 1
7. "Axio Imager"透射光源
包括带有滤光轮滤孔的的光视野光圈 数量 1
8.投射光源的快门
转换时间< 200 ms
最大转换频率. 2 Hz 数量 1
9.滤片轮
含有四个位置,每个位置都有中性密度滤光片和其他25mm滤光片;
用于投射光,并反映光设备形态。 数量 1
10 中性密度滤光器, D/A, d=25
含有6个中性密度的滤光器,变速器为50%,2×25%,12 和1.5%,整合在滤光轮,滤光器是分开的, 数量 1
11.照相镜座15°/25 (100:0/0:100),垂直翻转图像,可调停,相机端口有60N接口
数量 1
12, "Axio Imager"扫描台130x85 STEP (D)
-1mm锭距的马达驱动
-与驱动控制器相连
-扫描范围130 mm x 85 mm
-最大速度200 mm/s
-分辨率:0.1um
-重复性:<1um
-绝对精密度:+/-5um
-装备架:160 x 116 mm
数量 1
13.Ludl MAC 5000基本控制系统
周围单位的Ludl 控制模块
包含:
-230/110V供给电源的基本体系,自动开关
-与模块连接的RS-232电脑主机,串联电缆接口
数量 1
14.Lual MAC5000Xystage 步进控制器 incl. Joystick (D)
控制带有电动步进器的Maerzhaeuser XY-Stages 的外围单位
标准组件包括下面的零件:
-电源供给为230V/110V的基础体系,自动开关
-RS-232的电脑主机与模块相连。串联电缆接口
-X轴和Y轴的的2个电动步进控制器
-两轴操纵杆
-带有步进电机的Maerzhaeuser stages 的2个电动机电缆
数量 1
15.滑动联接架76 x 26 (D),-架子大小160x116 数量1
16 防尘器L,包含有防尘盖 (L670xW460xH775 mm),目镜盖和光源的视场光阑的保护帽 数量1
17."Axio Imager"的FL和HD反射光/荧光照明器, 带有手动停止滑轮和滤光轮的开关。透射范围为340nm-1000nm 包括340nm和1100nm~40%. 数量1
18.反射光照明的高速度的shutter,开关时间<20ms,开关最高频率:5 Hz 数量1
19.FLEC P&C反射组件,滤光反射器(避免倾斜安装),滤光器最大厚度:5mm. 数量3
20. Filter set 38 HE eGFP shift free,EX BP 470/40, BS FT 495, EM BP 525/50
(38 HE eGFP自由转换荧光滤色镜套) 数量1
21.Filter set 43 HE Cy 3 shift free,EX BP 550/25, BS FT 570, EM BP 605/70
(43 HE Cy 3自由转换荧光滤色镜套), 数量 1
22.Filter set 49 DAPI shift free,EX G 365, BS FT 395, EM BP 445/50
(49 DAPI自由转换荧光滤色镜套), 数量 1
23.HAL100带灯箱和加热反射滤色的光源, 数量 1
24.单端卤素灯12V 100W, 数量 2
25. HXP 120 (D)光源,包含内置光源模块和红外荧光光源综合带有trigg
capability (5V TTL)的开关,用于步进电动控制,快而且无震动, 数量 1
26.Lightguide HXP 120 with liquid fill, 2m (D),3mm x 2000mm,带有流体填充的HXP 120光导,2m (D) 3mm x 2000mm, 数量 1
27.带有HXP 120 和X-Cite 120光导的光源适配器, 数量 1
光学配置
28.物镜"Fluar" 2.5x/0.12 M27 (WD=6.3mm), 数量 1
29.增强反差型平场荧光物镜10x/0.3 M27(WD=5.2mm), 数量 1
30.增强反差型平场荧光物镜20x/0.50 M27(WD=2.0mm). 数量 1
31.增强反差型平场荧光物镜40x/0.75 M27(WD=0.71mm), 数量 1
32.物镜"Plan-Apochromat" 100x/1.40 Oil DIC M27 (WD=0.17mm), incl.,"Immersol" 518 F, oiler 20 ml, 数量 1
33.目镜PL 10x/23 Br. foc. 数量 2
34.目镜罩, 数量 2
35.电动多功能聚光器0.9 H D Ph DIC, mot,带有motorized前透镜,光圈和转动架,
带有中心Ph1, Ph2, Ph3 和 D 光圈,3头与油密度指示控制器连接,1个单独用于明场。目镜的扩大倍数1.0x-100x, WD=1.4mm, 数量 1
36 .适应器60N - T2 1.0x, 数量 2
37.转接镜头T2-C 1" 1.0x, 数量 1
38.转接镜头T2-C 1" 1.0x;可调整的(x,y,z 轴和旋转功能), 数量 1
39
高分辨率数码冷CCD
带有AxioVision驱动,火线/ IEEE1394 interface incl
电缆和IR barrier filter BG40(enclose)
画素数:1388 (H) x 1040 (V) = 1.4 Mega pixel
像素大小:6.45 um x 6.45 um
芯片大小:8.7 mm x 6.9 mm equivalent to 2/3"
光谱范围:保护玻璃制品的穿透范围 360-1000nm
IR barrier filter app. 350-700 nm
NIR-Mode: 增强IR最大敏感性
含有很好的容量:大约17.000 e
Selectable Resolution:(选择分辨率)
H x V Binning Factor
276 x 208 5 x 5
344 x 260 4 x 4
460 x 344 3 x 3
692 x 520 2 x 2
1388 x 1040 1 x 1
Live帧频(取决于硬件和软件的配置)
H x V Binning Factor Frame Rate@20ms
1388 x 1040 1 11
692 x 520 2 21
460 x 344 3 31
连续时间记录在AxioVision 4 Module的最大帧频
"Fast Acquisition" (快捕取决于特殊的软件)
H x V Binning Factor Frame Rate
1388 x 1040 1 14
692 x 520 2 26
460 x 344 3 35
344 x 260 4 43
276 x 208 5 50
微传感器读卡器("ROI"):可调适的
数字化:12 Bit / 24.57 MHz pixel clock
动力学范围:Typical >2200 : 1 (>66.8 dB) at < 7.7 e readout noise
暗电流:ca. 0.7 e/p/s
时间积分:1 ms to 60 s
冷却:One stage Peltier cooling
控制信号:TTL输出控制
接口: FireWire / IEEE1394 interface, 6 pin jack, cable 5 m,400MBit/s
光学接口: C-Mount
目镜螺纹深度: 最大 5 mm
每张图像最大文档大小: About 2.8 MB at 1388 x 1040 @ 1 x 12 Bit
尺寸/重量: App. 11 cm x 8 cm x 4.5 cm (2.3" x 3.2" x 1.7") / 370 g
机架: 蓝色阳性铝电镀,含有散热装置
1/4" photo thread for tripod mount
注册: CE, cUL
电源: 10-33 V, DC, 4W, power supply provided by FireWire bus
环境条件: 5-35℃,10-80%相对空气湿度,不冷凝,要求通风
数量 1
40
高分辨率显微摄像头AxioCam MRc Rev. 3 F
Mid Range Color
带有AxioVision驱动,火线/ IEEE1394 interface incl
电缆和IR barrier filter BG40
画素数: 1388 (H) x 1040 (V) = 1.4 Mega pixel
象素大小: 6.45 |m x 6.45 |ì
芯片大小: 8.9 mm x 6.7 mm equivalent to 2/3"
光谱范围: 含 IR barrier filter app. 400 nm to 700 nm Max.
容量: 大约. 17.000 e
Selectable Resolution(选择分辨率):
H x V Binning Factor
272 x 208 5 x 5, Color
344 x 260 4 x 4, Monochrome
460 x 344 3 x 3, Color
692 x 520 2 x 2, Monochrome
1388 x 1040 1 x 1, Single Shot
彩色插值: "High Speed Color" or "High Quality Color"selectable
Live帧频(取决于硬件和软件的配置)
H x V Binning Factor Frame Rate@20ms
1388 x 1040 1 11
460 x 344 3 26
276 x 208 5 38
Frame rates for time series recording in AxioVision 4 Module
"Fast Acquisition" (快捕取决于特殊的软件)
H x V Binning Factor Frame Rate
1388 x 1040 1 14
692 x 520 2 26
460 x 344 3 35
344 x 260 4 42
276 x 208 5 48
微传感器读卡器("ROI"):可调适的
数字化:12 Bit / 24.57 MHz pixel clock
动力学范围:Typical >2200 : 1 (>66.8 dB) at < 7.7 e readout noise
暗电流:ca. 0.7 e/p/s
时间积分:1 ms to 60 s
冷却:One stage Peltier cooling
控制信号:TTL输出控制
接口: FireWire / IEEE1394 interface, 6 pin jack, cable 5 m,400MBit/s
光学接口: C-Mount
目镜螺纹深度: 最大 5 mm
每张图像最大文档大小: About 8.6 MB at 1388 x 1040 @ 3 x 12 Bit
尺寸/重量: App. 11 cm x 8 cm x 4.5 cm (2.3" x 3.2" x 1.7") / 370 g
机架: 蓝色阳性铝电镀,含有散热装置
1/4" photo thread for tripod mount
注册: CE, cUL
电源: 10-33 V, DC, 4W, power supply provided by FireWire bus
环境条件: 5-35℃,10-80%相对空气湿度,不冷凝,要求通风
数量 1
41 .软件核站点: AxioVision Rel. 4.7, 数量 1
四、Virtual Slice Module
从显微镜创建你自己分析的材料的真实切片的图片,不同放大倍率相对应,真正的无缝拼接,快速而实用
五、Solid Modeling Module
1.显示特征:实体网格轮廓 ,实体或网格的分枝结构 ,OpenGL为基础 ,有层次的观看跟踪模型 ,复杂分枝结构 .
2.光照特征:背光 /直光/闪亮的表面
3.透明度特征:使用者定义透明度 /标记透明度 /分枝结构的透明度 /轮廓透明度
4.Navigation Features:放大缩小 /平移 /穿越 /自动旋转展开
纽约大学的研究团队在CRISPR-Cas9的基础上开发了一个定向检测基因组区域的活体成像系统。该系统能够精确观测基因组位点和细胞核结构,揭示细胞核改变在基因表达调控和其他细胞过程中的重要作用。
CRISPR-Cas9原本是细菌在漫长的进化史中演化出的重要防御机制。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在sgRNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统发展成了强大的基因组编辑工具。现在CRISPR-Cas9基因组编辑系统的应用延伸到了基因敲除、删除、染色体重排、RNA编辑、全基因组筛选等众多领域。
研究人员用病毒RNA和sgRNA生成了嵌合转录本。这种转录本与缺乏剪切活性的Cas9共表达,可以把荧光标记的病毒RNA结合蛋白招募到基因组指定位点。为了证实CRISPR成像技术的效率和灵活性,研究人员同时标记了小鼠染色体12的两种卫星序列,以及不同的基因组位点。他们在文章中指出,这是一种快速、稳定的低背景成像技术,可以用来追踪染色质互作动态和验证表观遗传学过程。
为了更好的研究非编码RNA,哈佛大学的科学家们以CRISPR为基础打造出了一个定向的RNA定位法——CRISPR-Display(CRISP-Disp)。他们利用失去催化活性的dCas9,将整合在sgRNA中的大片段RNA带到特定DNA位点。文章通讯作者是RNA领域的著名青年科学家JohnRinn博士,他曾被评为2009年美国国内撼动科学界的青年英才。
在CRISPR系统的基础上使用sgRNA文库进行遗传筛选,是鉴定基因调控子的一种有效方法。研究者们可以通过CRISPR筛选在基因组非编码区域中寻找功能性元件。不过这样的应用需要高度覆盖又简单实用的自定义sgRNA文库。耶鲁大学医学院的研究人员开发了一个名为MolecularChipper的新技术。该技术能够针对指定基因组区域生成密集覆盖的sgRNA文库。
酿脓链球菌的Cas9现在已经被广泛用于基因组编辑。那么,对Cas9进行基因工程改造将面临哪些限制呢?加州大学伯克利分校的研究团队通过随机插入突变对Cas9结构进行了全面分析,鉴定了这种蛋白的基因改造热点。这些位点可以耐受PDZ结构域的插入,不影响Cas9的结合和剪切功能。
根据人体不同部位吸收标记化合物能力的不同,同位素在人体内各部位的浓聚程度不同,湮灭反应产生光子的强度也不同。用环绕人体的Y光子检测器,可以检测到释放出光子的时间、位置、数量和方向,通过光电倍增管将光信号转变为时间脉冲信号,经过计算机系统对上述信息进行采集、存储、运算、数/模转换和影像重建,从而获得人体脏器的横断面、冠状断面和矢状断面图像。凡代谢率高的组织或病变,在PET上呈现明亮的高代谢亮信号,凡代谢率低的组织或病变在PET上呈现出低代谢暗信号。