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Molarity CalculatorDilution Calculator
| CBR-5884selective inhibitor of PHGDH |
Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
1. Sharif T, Martell E, et al. "Phosphoglycerate dehydrogenase inhibition induces p-mTOR-independent autophagy and promotes multilineage differentiation in embryonal carcinoma stem-like cells." Cell Death Dis. 2018 Sep 24;9(10):990.PMID:30250195
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- Purity = 97.39%
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Chemical structure
Related Biological Data
CBR-5884 Dilution Calculator
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CBR-5884 Molarity Calculator
calculate
| Cas No. | N/A | SDF | Download SDF |
| Synonyms | N/A | ||
| Chemical Name | ethyl 5-(furan-2-carboxamido)-3-methyl-4-thiocyanatothiophene-2-carboxylate | ||
| Canonical SMILES | O=C(NC1=C(SC#N)C(C)=C(C(OCC)=O)S1)C2=CC=CO2 | ||
| Formula | C14H12N2O4S2 | M.Wt | 336.39 |
| Solubility | ≥16.8mg/mL in DMSO | Storage | Store at -20°C |
| Physical Appearance | A solid | Shipping Condition | Evaluation sample solution : ship with blue ice.All other available size:ship with RT , or blue ice upon request |
| General tips | For obtaining a higher solubility , please warm the tube at 37 ℃ and shake it in the ultrasonic bath for a while.Stock solution can be stored below -20℃ for several months. | ||
CBR-5884 is a selective inhibitor of 3-phosphoglycerate dehydrogenase (PHGDH) with IC50 of 7 μM. PHGDH catalyzes the first committed step of serine biosynthesis, is overexpressed in tumors and cancer cell lines via focal amplification and nuclear factor erythroid-2-related factor 2 (NRF2)-mediated up-regulation. So CBR-5884 can inhibit de novo serine synthesis in cancer cells.
CBR5884 selectively inhibits the proliferation of breast and melanoma cancer lines that have a high propensity for serine synthesis but has no effect on lines that rely on extracellular serine uptake. CBR-5884 is a noncompetitive and time-dependent inhibitor of PHGDH and disrupts its oligomerization state. The dose at which CBR-5884 has an effect on serine labeling was consistent with the in vitro biochemical IC50 of 33 ± 12 μM for PHGDH. At such concentrations, CBR-5884 has no effect on two other NAD+-dependent dehydrogenases, lactate dehydrogenase (LDH) and MDH1. The Ki value are 50 ± 20 μM and 50 ± 3 μM for 3-PG and NAD+, respectively. CBR-5884 is not generally cytotoxic at concentrations up to 40 μM as determined by two independent cellular viability assays. Treating the breast lines with CBR-5884 in serine-replete media inhibited growth of the four lines that grew without extracellular serine in a dose-dependent manner, with growth inhibition ranging from 35% to 60% at 30 μM CBR-5884. Serine depletion increases the efficacy of CBR-5884 in lines already sensitive under serine-replete conditions as evidenced by an 80–90% decrease in proliferation with 30 μM CBR-5884. [1]
Reference:
1.Identification of a small molecule inhibitor of 3-phosphoglycerate dehydrogenase to target serine biosynthesis in cancers. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Feb 16;113(7):1778-83.
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2021-08-29
Y105425 µlubiquitin-proteasomebiotechnolUbiquitin-Proteasome Biotechnologies, LLCubpbio/Anti-beta-Actin (Rabbit mAb)/Y1054/25 µl 查看更多
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2019-03-07
Western Blot内参抗体选择原则 内参抗体 种类很多，比如beta-actin、beta-tubunlin、GAPDH、α-tubunlin等，那么针对自己的实验 查看更多
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2018-06-24
北京泰泽瑞达科技有限公司是一家专注于生命科学和生物医学领域集销售,技术咨询服务... Ultra-Lab授权代理商,经销:SIGMA、Invitrogen、Roche、Abcam等品牌产品。常用产品... 查看更多
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2021-08-26
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2018-06-29
BSB 58951 EacdiCancer diagnosticsCancer diagnostics/Prolactin, 5 + control slides/BSB 5895/1 Ea 查看更多
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2021-07-17
为了更好的方便客户使用，联科生物现推出40ul的小包装内参、标签抗体，全部现货供应。 为什么选择联科的内参、标签抗体： 查看更多
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2021-08-12
南京赛泓瑞生物科技有限公司在发布的Prl/Human Prolactin/重组人催乳素供应信息，浏览与Prl/Human Prolactin/重组人催乳素相关的产品或在搜索更多与Prl/Human Prolactin/重组人催乳素相关的内容。 查看更多
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2021-08-16
货号：ALX-804-405-C100 查看更多
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2021-08-06
Wako（和光纯药工业株式会社）在发布的Endotoxin Extracting Solution for LAL Test供应信息，浏览与Endotoxin Extracting Solution for LAL Test相关的产品或在搜索更多与Endotoxin Extracting Solution for LAL Test相关的内容。 查看更多
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[[100μg, ABP-MAB-BL002]]Recognizes native and denatured forms of β-Actin (~42kDa)Product Description Download/Print: 查看更多
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内参抗体限量抢购，套装更享劲爆优惠！有意者可添加QQ:2624126304在线咨询或官方邮箱：cn.market@abclonal.com进行留言.活动时间活动时间：2017年10月1日-2017年11月30日奖励机制 1活动仅限于ABclonal品牌货号AC026和AC033内参抗体。 2活动期间，凡任意购买50ul的内参产品，即可享受650元/50ul ；若购买内参套装AC026和AC033各50ul，即可享受1100元套餐优惠... 查看更多
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【新手福利】初识 外泌体 七 123
科研大人xiu2021-08-05
有用过Abbkine抗体帮忙回答一下哦
western blot目的蛋白和内参分子量差距太大怎么办? 123
mu18C2017-09-28
检测蛋白和内参分子量接近最好的办法就是更换内参
因为内参有好几种，分子量差别也比较大，更换分子量与检测蛋白差距更大的内参就可以避免这个问题
另外也可以先用一抗孵育显色和检测，再用Strip缓冲液洗掉膜上的抗体，重新进行内参的抗体孵育显色检测。这样也可以将检测蛋白和内参显色在同一张膜上
因为内参有好几种，分子量差别也比较大，更换分子量与检测蛋白差距更大的内参就可以避免这个问题
另外也可以先用一抗孵育显色和检测，再用Strip缓冲液洗掉膜上的抗体，重新进行内参的抗体孵育显色检测。这样也可以将检测蛋白和内参显色在同一张膜上
qRTPCR内参基因是不是每次都要做 分子生物 综合其他 ...123
蛋蛋lO22017-09-28
【GAPDH的作用】广泛用作Western blot蛋白质标准化的内参，即将每个样品测得的目的蛋白含量与本样品的GAPDH含量相除，得到每个样品目的蛋白的相对含量，然后才进行样品与样品之间的比较。
【GAPDH】或G3PDH是甘油醛-3-磷酸脱氢酶（ glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase ）的英文缩写。GAPDH是参与糖酵解的一种关键酶，由4个30-40kDa的亚基组成，分子量146kDa，检测条带大约在36kDa。GAPDH基因几乎在所有组织中都高水平表达，且GAPDH 作为管家基因在同种细胞或者组织中的蛋白质表达量一般是恒定的。
【Western Blot】蛋白质印迹法（免疫印迹试验）。它是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法。其基本原理是通过特异性抗体对凝胶电泳处理过的细胞或生物组织样品进行着色。通过分析着色的位置和着色深度获得特定蛋白质在所分析的细胞或组织中表达情况的信息。
【GAPDH】或G3PDH是甘油醛-3-磷酸脱氢酶（ glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase ）的英文缩写。GAPDH是参与糖酵解的一种关键酶，由4个30-40kDa的亚基组成，分子量146kDa，检测条带大约在36kDa。GAPDH基因几乎在所有组织中都高水平表达，且GAPDH 作为管家基因在同种细胞或者组织中的蛋白质表达量一般是恒定的。
【Western Blot】蛋白质印迹法（免疫印迹试验）。它是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法。其基本原理是通过特异性抗体对凝胶电泳处理过的细胞或生物组织样品进行着色。通过分析着色的位置和着色深度获得特定蛋白质在所分析的细胞或组织中表达情况的信息。
western blotting到底是测某种蛋白的量的还是细胞内总蛋白的量啊?...123
一抹纯粹wx2017-09-28
测的是某种特定蛋白的量。或者是说测定某种蛋白是否存在于样品中，因为WB只能做半定量。
因为这个实验用到了抗体，抗体是特异识别某一种蛋白的，所以只要能检测到信号，说明样品中有该蛋白存在，如果有相应的对照，也能半定量说明该蛋白的量如何。
因为这个实验用到了抗体，抗体是特异识别某一种蛋白的，所以只要能检测到信号，说明样品中有该蛋白存在，如果有相应的对照，也能半定量说明该蛋白的量如何。
用大肠杆菌跑western用什么做内参 蛋白质和糖学技术讨论版...123
SE0000002842021-07-28
百度了一下，推荐了解了解：大肠杆菌gapA基因转录翻译的GAPDH蛋白的高度保守性,为制备大肠杆菌专用内参蛋白抗体提供可能,
Western Blot内参抗体选择原则 实验方法123
他曾像风一样自由2021-07-30
Western Blot内参选择 123
逆枫军团_952017-09-28
内参bate－actin或GAPDH多为单抗,来源于小鼠，
一般可与大鼠、小鼠、人、兔均有交叉反应，即可作为上述任一来源蛋白的内参。
Actin分子量为42kD，为肌动蛋白
GAPDH分子量为36kD，为磷酸脱氢酶
一般可与大鼠、小鼠、人、兔均有交叉反应，即可作为上述任一来源蛋白的内参。
Actin分子量为42kD，为肌动蛋白
GAPDH分子量为36kD，为磷酸脱氢酶
...一直都没跑出来? 蛋白质免疫印迹(Western Blot,WB ) 经验交流...123
方君乾064782021-08-08
内参蛋白的表达量一般比较大，而且内参蛋白的抗体通常比较好用。你要杂的目的蛋白可能表达量要远小于内参蛋白，又可能是目的蛋白的抗体不好用。因此可以考虑浓缩你的蛋白样品（增加细胞量、减少裂解液等方法）、增加目的蛋白抗体浓度、更换目的蛋白抗体。另外，化学发光试剂也可以换用更好的，比如GE公司的，虽然价格贵，但是灵敏度要比国产的试剂高出很多，希望能够帮到你。
Western Blot为什么必须要用内参 123
舆论小雪95筧2017-11-05
Western Blot为什么必须要用内参
要检测一个基因的表达产物是否正确，或者比较表达产物量的相对变化，首选方法是Western Blot。因为WesternBlot操作相对简单方便，既可以定性分析表达产物，同时还可以指示目的蛋白量的相对变化。虽然，顺利的时候WesternBlot做起来很简单，可不顺的时候也很令人心烦――做不出结果啦、假阳性啦、结果出现多条带啦、到底是一抗有问题还是二抗有问题啦……毕竟，作为一种有活性的生物大分子，抗体和抗原的反应毕竟不象1+1那么明确，而用这种不确定的试剂来测定同样知之甚少的表达产物，确实是有一定的不确定性的。所以，严谨的WesternBlot实验设计中要求有良好的参照体系，对实验结果分析是非常有用。特别是当实验出现问题时，借助参照体系很容易就可以查出问题所在，而不必抓耳挠腮怨天尤人。良好的参照体系通常包括分子量Marker（用来确定蛋白条带对应的分子量大小），空白载体对照（如果是诱导表达体系还应该有诱导前的对照），已知量标准产物的正对照；另外还有内参。可是由于经费限制或者偷懒的原因，国内的不少人做Western Blot往往省略参照，导致结果出现问题时无法分析结果――即便有结果也可能影响结果的分析。
内参是最容易被忽略的一项。我们知道，要用Western Blot比较不同条件下或者不同组织中，目的蛋白表达量的相对多少，前提条件是等量的细胞上样，才有比较的基础。特别表达量不高时，上样量的差别就很可能影响结果的分析。所以你需要内参。
内参即是内部参照（InternalControl），对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白(HousekeepingProteins)，它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。在Western Blotting 实验中，除了需要进行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上样电泳、转膜、靶蛋白抗体孵育、显色等步骤以外，还需要进行内参的检测，以校正蛋白质定量、上样过程中存在的实验误差，保证实验结果的准确性。
在国外发表的文章中，Western Blotting实验结果须进行内参校正已成为一种惯例。但是，国内仍有不少科研人员在WesternBlotting实验中忽略了内参的使用，将蛋白浓度测定作为规范需相互比较的各种样品间上样量等同的唯一方法。然而各种蛋白质浓度定量方法，都存在局限性，不能完全准确的确定各种样品的准确蛋白浓度。如UV法直接定量，适合测试较纯净、成分相对单一的蛋白质，相对于比色法来说，操作简单，但是容易受到平行物质的干扰，如DNA的干扰；且敏感度低，要求蛋白的浓度较高。比色法测定蛋白浓度一般有BCA，Bradford，Lowry等几种方法。BCA法与Lowry法都容易受到蛋白质之间以及去污剂的干扰。Bradford 法敏感度最高，且与一系列干扰Lowry，BCA反应的还原剂（如DTT，巯基乙醇）相容。但是对于去污剂依然是敏感的，其最主要的缺点是不同的标准品会导致同一样品的结果差异较大，无可比性。另外，蛋白质定量以后进行电泳时需要等量上样，此步骤也存在操作误差。在Western blotting实验时使用内参，即可简便地对定量和上样步骤产生的误差进行校正。
在WesternBlotting中使用内参其实就是在WB过程中的另外用内参对应的抗体检测内参，这样在检测目的产物的同时可以检测内参的表达，由于内参在各组织和细胞中的表达相对恒定，借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差，这样半定量的结果才更为可信。此外使用内参可以作为空白对照，检测蛋白转膜情况是否完全、整个Western Blot显色或者发光体系是否正常。
实验结果分析其实很简单：如果样品蛋白量有限，只够进行一次电泳转膜实验时，分别检测样品的内参量和目的蛋白量。将各样品目的蛋白量分别除以其内参含量，得到的数值即为内参校正后的各样品中目的蛋白相对含量，再用此数值进行样品间的比较和分析，得到目的蛋白含量在不同样品间的实际变化结果。如果样品量充分，可以先检测内参，观测样品间内参显色条带是否一致，根据差异大小调整各样品的上样量重新进行Western Blotting实验，至内参量一致为止；若内参一致，即可进行不同样品间目的蛋白表达变化分析。这样虽然麻烦一点，但是可以保证结果更有说服力，更可信。毕竟我们的实验是一种严谨的工作。
附：在Western Blotting实验过程中使用内参的方法有：
一、 超级简便的标记内参使用法：只要在二抗孵育时加入HRP标记内参抗体，按照正常操作即可。
二、普通内参：当目的蛋白的分子量大小与选用的内参蛋白分子量相差不大时，可以先进行目的蛋白的抗体温育显色和检测。然后使用Strip缓冲液洗掉膜上的抗体，重新进行内参蛋白的抗体温育、显色检测。
三、当目的蛋白的分子量大小与选用的内参蛋白分子量大小相差比较明显情况下，可以在转膜后预染，根据蛋白质Marker的大小将膜剪为大分子量和小分子量两部分，使内参蛋白与目的蛋白分开。然后两块膜分别与内参蛋白抗体以及目的蛋白抗体进行温育，二抗温育以及显色。
【摘自网络】展开
要检测一个基因的表达产物是否正确，或者比较表达产物量的相对变化，首选方法是Western Blot。因为WesternBlot操作相对简单方便，既可以定性分析表达产物，同时还可以指示目的蛋白量的相对变化。虽然，顺利的时候WesternBlot做起来很简单，可不顺的时候也很令人心烦――做不出结果啦、假阳性啦、结果出现多条带啦、到底是一抗有问题还是二抗有问题啦……毕竟，作为一种有活性的生物大分子，抗体和抗原的反应毕竟不象1+1那么明确，而用这种不确定的试剂来测定同样知之甚少的表达产物，确实是有一定的不确定性的。所以，严谨的WesternBlot实验设计中要求有良好的参照体系，对实验结果分析是非常有用。特别是当实验出现问题时，借助参照体系很容易就可以查出问题所在，而不必抓耳挠腮怨天尤人。良好的参照体系通常包括分子量Marker（用来确定蛋白条带对应的分子量大小），空白载体对照（如果是诱导表达体系还应该有诱导前的对照），已知量标准产物的正对照；另外还有内参。可是由于经费限制或者偷懒的原因，国内的不少人做Western Blot往往省略参照，导致结果出现问题时无法分析结果――即便有结果也可能影响结果的分析。
内参是最容易被忽略的一项。我们知道，要用Western Blot比较不同条件下或者不同组织中，目的蛋白表达量的相对多少，前提条件是等量的细胞上样，才有比较的基础。特别表达量不高时，上样量的差别就很可能影响结果的分析。所以你需要内参。
内参即是内部参照（InternalControl），对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白(HousekeepingProteins)，它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。在Western Blotting 实验中，除了需要进行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上样电泳、转膜、靶蛋白抗体孵育、显色等步骤以外，还需要进行内参的检测，以校正蛋白质定量、上样过程中存在的实验误差，保证实验结果的准确性。
在国外发表的文章中，Western Blotting实验结果须进行内参校正已成为一种惯例。但是，国内仍有不少科研人员在WesternBlotting实验中忽略了内参的使用，将蛋白浓度测定作为规范需相互比较的各种样品间上样量等同的唯一方法。然而各种蛋白质浓度定量方法，都存在局限性，不能完全准确的确定各种样品的准确蛋白浓度。如UV法直接定量，适合测试较纯净、成分相对单一的蛋白质，相对于比色法来说，操作简单，但是容易受到平行物质的干扰，如DNA的干扰；且敏感度低，要求蛋白的浓度较高。比色法测定蛋白浓度一般有BCA，Bradford，Lowry等几种方法。BCA法与Lowry法都容易受到蛋白质之间以及去污剂的干扰。Bradford 法敏感度最高，且与一系列干扰Lowry，BCA反应的还原剂（如DTT，巯基乙醇）相容。但是对于去污剂依然是敏感的，其最主要的缺点是不同的标准品会导致同一样品的结果差异较大，无可比性。另外，蛋白质定量以后进行电泳时需要等量上样，此步骤也存在操作误差。在Western blotting实验时使用内参，即可简便地对定量和上样步骤产生的误差进行校正。
在WesternBlotting中使用内参其实就是在WB过程中的另外用内参对应的抗体检测内参，这样在检测目的产物的同时可以检测内参的表达，由于内参在各组织和细胞中的表达相对恒定，借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差，这样半定量的结果才更为可信。此外使用内参可以作为空白对照，检测蛋白转膜情况是否完全、整个Western Blot显色或者发光体系是否正常。
实验结果分析其实很简单：如果样品蛋白量有限，只够进行一次电泳转膜实验时，分别检测样品的内参量和目的蛋白量。将各样品目的蛋白量分别除以其内参含量，得到的数值即为内参校正后的各样品中目的蛋白相对含量，再用此数值进行样品间的比较和分析，得到目的蛋白含量在不同样品间的实际变化结果。如果样品量充分，可以先检测内参，观测样品间内参显色条带是否一致，根据差异大小调整各样品的上样量重新进行Western Blotting实验，至内参量一致为止；若内参一致，即可进行不同样品间目的蛋白表达变化分析。这样虽然麻烦一点，但是可以保证结果更有说服力，更可信。毕竟我们的实验是一种严谨的工作。
附：在Western Blotting实验过程中使用内参的方法有：
一、 超级简便的标记内参使用法：只要在二抗孵育时加入HRP标记内参抗体，按照正常操作即可。
二、普通内参：当目的蛋白的分子量大小与选用的内参蛋白分子量相差不大时，可以先进行目的蛋白的抗体温育显色和检测。然后使用Strip缓冲液洗掉膜上的抗体，重新进行内参蛋白的抗体温育、显色检测。
三、当目的蛋白的分子量大小与选用的内参蛋白分子量大小相差比较明显情况下，可以在转膜后预染，根据蛋白质Marker的大小将膜剪为大分子量和小分子量两部分，使内参蛋白与目的蛋白分开。然后两块膜分别与内参蛋白抗体以及目的蛋白抗体进行温育，二抗温育以及显色。
【摘自网络】展开
βActin 和GAPDH简介 123
张凯6962021-07-25
β-Actin是PCR常用的内参，β-Actin抗体是Western Blot很好的内参指数。内参即是内部参照（Internal Control），对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白。它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。常用的蛋白质内参有细胞骨架蛋白beta-actin或beta-tubulin和GAPDH（glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase）等。因此β-Actin抗体、β-Tubulin抗体以及GAPDH抗体成为最常见的三个动物细胞内参抗体。
β-Actin作为内参是得到了公认的，这是针对大多数组织和细胞来说的，它广泛分布于细胞浆内，表达量非常丰富。Beta-actin由375个氨基酸组成，分子量大小为42-43kDa左右。
β-actin的蛋白水平通常不会发生改变，因此被广泛用于Western时上样量是否一致的参照，也常被用于免疫染色观察细胞的微丝结构。在用作Western的参照时，Actin抗体和Tubulin抗体的主要不同之处在于两者所识别蛋白的分子量不同，这样可以选择合适的参照在同一块胶同一张膜上实现同时检测目标蛋白和参照蛋白。向左转|向右转
β-Actin作为内参是得到了公认的，这是针对大多数组织和细胞来说的，它广泛分布于细胞浆内，表达量非常丰富。Beta-actin由375个氨基酸组成，分子量大小为42-43kDa左右。
β-actin的蛋白水平通常不会发生改变，因此被广泛用于Western时上样量是否一致的参照，也常被用于免疫染色观察细胞的微丝结构。在用作Western的参照时，Actin抗体和Tubulin抗体的主要不同之处在于两者所识别蛋白的分子量不同，这样可以选择合适的参照在同一块胶同一张膜上实现同时检测目标蛋白和参照蛋白。向左转|向右转
【讨论】买抗体应该怎么选择公司? 实验室建设与采购论坛123
黑白世界丿塹e2017-09-28
本数据来源于百度地图，最终结果以百度地图最新数据为准。嘿嘿。可以这么说吧。比如什么内参之类的，或者是表达丰度高的蛋白其实。具体到目的蛋白了就各见春秋了。
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