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Lucigen/T4 Polynucleotide Kinase/30061-1/1,000 U
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Lucigen/T4 Polynucleotide Kinase/30061-1/1,000 U
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Lucigen
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  • RecombinantT4PolynucleotideKinase(T4PNK).
  • Applicationsincludeend-labelingandinsertpreparationforcloning.

T4PolynucleotideKinasecatalyzesthetransferandexchangeofgamma-phosphateofATPtothe5´-hydroxylterminusofpolynucleotides(double-andsingle-strandedDNAandRNA)andnucleoside3´-monophosphates.

Source:
PurifiedfromastrainofE.colithatcarriesaT4PolynucleotideKinaseexpressionplasmid.

Applications:

  • End-labelingDNAforprobesandDNAsequencing(1)
  • Additionof5´-phosphatestooligonucleotidestoallowsubsequentligation(2)

Heatinactivation:70°Cfor15minutes.

Storage:
Enzymeandbuffershouldbestoredat-20°C.Enzymeisstablefor12monthsifhandledproperly.

AdditionalInformation:

  • AmmoniumionsarepotentinhibitorsofT4PolynucleotideKinase. DNAshouldnotbeprecipitatedfromordissolvedinbufferscontainingammoniumsalts.
  • Protruding5’-overhangsaremoreefficientlyphosphorylatedthanblunt-orrecessed5’overhangs.

References:

  1. Sambrook,J.andRussell,W.(2001)MolecularCloning:ALaboratoryManual,(3rded.),9.55-9.56,9.68-9.69.
  2. Sambrook,J.andRussell,W.(2001)MolecularCloning:ALaboratoryManual,(3rded.),13.16-13.17.
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基因工程的关键技术是脱氧核糖核酸的连接和重组,在此过程中一些酶起着至关重要的作用,这些酶统称为基因工程工具酶。工具酶种类繁多、功能各异,主要包括限制酶、聚合酶、连接酶、修饰酶和核酸酶五大类。其中,以限制性核酸内切酶和DNA连接酶在分子克隆中的作用最为突出。这些酶具有特异... 查看更多>
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核酶是指 A.核内的DNA酶 B.核内的RNA酶 C.核内的蛋白酶 D.一种逆转录酶 E.具有催化功能的RNA分子 请帮忙给出正确答案和分析,谢谢!... 查看更多>
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一. 实验目的: 1、 掌握质粒 DNA 分离,纯化的原理 2、 学习煮沸法快速提取质粒 DNA 的方法 3、 学习 DNA的限制性酶切的基本技术 4 、 学习利用琼脂糖电泳测定 DNA片段的长度 二、 实验原理 在基因工程中, DNA 分子的切割是由限制性内切酶来完成的。限制性内切酶能识别特定的 DNA 序列,在一 查看更多>
一个国际科学家小组已经发现了化合物如何阻断皮瓣核酸内切酶1(FEN1) - DNA损伤反应中的关键酶类和癌症治疗的潜在靶点。在健康的人DNA复制和DNA修复期间形成具有单链末端的分支或拍打的DNA。这些单链皮瓣可以通过酶如皮瓣内切核酸酶1(FEN1)除去,以将DNA的完整性恢复到其双链状态。在癌细胞中已经观察到更高水平的FEN1,具有临床上更差的预后3并且这些细胞更依赖于该修复酶,尤其是在没有其他支持性DNA损伤应答蛋白的情况下。当FEN1被阻断时,这些后面的细胞对敏感和死亡 - 这个 查看更多>
2021-09-17
分子生物 查看更多>
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限制性核酸内切酶是可以识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶,简称限制酶。
自身dna没有这个特异序列
核酸酶发展历史123
TSˊ控白2021-07-21
20世纪70年代,在细菌中陆续发现了一类核酸内切酶,能专一性地识别并水解双链DNA上的特异核苷酸顺序,称为限制性核酸内切酶(restriction endonuclease,简称限制酶)。当外源DNA侵入细菌后,限制性内切酶可将其水解切成片段,从而限制了外源DNA在细菌细胞内的表达,而细菌本身的DNA由于在该特异核苷酸顺序处被甲基化酶修饰,不被水解,从而得到保护。
限制性核酸内切酶的研究和应用发展很快,已提纯的限制性核酸内切酶有100多种,许多已成为基因工程研究中必不可少的工具酶。
限制性核酸内切酶可被分成三种类型。Ⅰ型和Ⅲ型限制酶水解DNA需要消耗ATP,全酶中的部分亚基有通过在特殊碱基上补加甲基基团对DNA进行化学修饰的活性。
Ⅰ型和Ⅲ型酶具有限制和修饰两种作用,而特异性弱,切割位点的序列不固定,不已知,不宜用于基因克隆中。
Ⅱ型限制酶水解DNA不需要ATP也不以甲基化或其它方式修饰DNA,能在所识别的特殊核苷酸顺序内或附近切割DNA。因此,被广泛用于DNA分子克隆和序列测定。
‘控制’这个说法其实是个广泛的表述。实际上,DNA只不过是一个模板,通俗说是没有化学活性意义的母本,要转录翻译成为蛋白质,就要先转录成mRNA,然后mRNA作为最后的模板,翻译出想要得到的蛋白质,这之后,通常对得到的蛋白质进行进一步修饰才会得到最后由化学活性意义的蛋白质产物。当然这个步骤很复杂,远远不是说得这么简单,讨论他们都是化学分子组成的同类这一点没有意义的,就像你的手的行为有大脑控制的,而你的手和大脑都是蛋白质组成的。。。这个逻辑关系实际是宏观和微观的关系,朋友千万不要把这些混淆了去钻牛角尖。如果有兴趣和能力学量子物理,你就都明白了。。。祝学习愉快。
目前已知有三种方法可以用来在体外连接DNA片段:
第一种方法是,用DNA连接酶连接具有互补粘性末端的DNA片段;
第二种方法是,用T4DNA连接酶直接将平末端的DNA片段连接起来,或是用末端脱氧核苷酸转移酶给具平末端的DNA片段加上poly(dA)-poly(dT)尾巴之后,再用DNA连接酶将它们连接起来;
第三种方法是,先在DNA片段末端加上化学合成的衔接物或接头,使之形成粘性末端之后,再用DNA连接酶将它们连接起来。这三种方法虽然互有差异,但共同的一点都是利用DNA连接酶所具有的连接和封闭单链DNA的功能。
粘性末端DNA片段的连接
DNA连接酶最突出的特点是,它能够催化外源DNA和载体分子之间发生连接作用,形成重组的DNA分子。
平末端DNA片段的连接
常用的平末端DNA片段连接法,主要有同聚物加尾法、衔接物连接法及接头连接法。
同聚物加尾法
这种方法的核心部分是,利用末端脱氧核苷酸转移酶转移核苷酸的特殊功能。末端脱氧核苷酸转移酶是从动物组织中分离出来的一种异常的DNA聚合酶,它能够将核苷酸(通过脱氧核苷三磷酸前体)加到DNA分子单链延伸末端的3′-OH基团上。由核酸外切酶处理过的DNA,以及dATP和末端脱氧核苷酸转移酶组成的反应混合物中,DNA分子的3′-OH末端将会出现单纯由腺嘌呤核苷酸组成的DNA单链延伸。这样的延伸片段,称之为poly(dA)尾巴(图2-7)。反过来,如果在反应混合物中加入的是dTTP,那么DNA分子的3′-OH末端将会形成poly(dT)尾巴。因此任何两条DNA分子,只要分别获得poly(dA)和poly(dT)尾巴,就会彼此连接起来。这种连接DNA分子的方法叫做同聚物尾巴连接法(homopolymertail-joining),简称同聚物加尾法。
衔接物连接法
所谓衔接物(linker),是指用化学方法合成的一段由10~12个核苷酸组成、具有一个或数个限制酶识别位点的平末端的双链寡核苷酸短片段。衔接物的5′-末端和待克隆的DNA片段的5′-末端,用多核苷酸激酶处理使之磷酸化,然后再通过T4DNA连接酶的作用使两者连接起来。接着用适当的限制酶消化具衔接物的DNA分子和克隆载体分子,这样的结果使二者都产生出了彼此互补的粘性末端。于是我们便可以按照常规的粘性末端连接法,将待克隆的DNA片段同载体分子连接起来。
DNA接头连接法
DNA接头,是一类人工合成的一头具某种限制酶粘性末端另一头为平末端的特殊的双链寡核苷酸短片段。当它的平末端与平末端的外源DNA片段连接之后,便会使后者成为具粘性末端的新的DNA分子,而易于连接重组。实际使用时对DNA接头末端的化学结构进行必要的修饰与改造,可避免处在同一反应体系中的各个DNA接头分子的粘性末端之间发生彼此间的配对连接。
然后如何去除DNA中的RNA酶 123
怪叔叔82MT2017-11-27
(一)从源头控制污染:
(1)玻璃制品、塑料制品和电泳槽 灭菌的一次性使用的塑料制品基本上无RNA酶,可以不经预处理直接用于制备和贮存RNA。实验室用的普通玻璃器皿和塑料制品经常有RNA酶法染,使用前必须于180 ℃干烤8小时或更长时间(玻璃器皿)或用氯仿冲洗(塑料制品)。另一种方法是用0.1 %焦碳酸二乙酯(DEPC)的水溶液浸泡用于制备RNA的烧杯,试管和其他用品。DEPC是RNA酶的强烈抑制剂,但其作用并不是绝对的(Fedorcsak和Ehrenberg,1966)。灌满DEPC的玻璃或塑料器皿在37℃放置2小时,然后用灭菌水淋洗数次, 并于100℃干烤15分钟(Kumar和Lindberg,1972)。在15 lbf/in2(1.034x105Pa)高压蒸氯灭菌15分钟。上述处理可以除去器甲上痕量的DEPC,以防DEPC通过羧甲基化作用对RNA的嘌呤碱基进行修饰。
  用于RNA电泳的电泳槽应用去污剂洗干净,再用水冲洗,用乙醇干燥,然后灌满3%的H2O2溶液,于室温放置10分钟,然后用0.1 %DEPC处理过的水彻底冲洗电泳槽。最好能留出一些玻璃器皿、塑料制品和电泳槽作上特殊标记,存放在指定地点,为RNA实验专用。
(2)研究人员造成的污染 RNA酶最主要的潜在污染源是研究人员的手。因此,在准备分离的和分析RNA的材料和溶液时,主有涉及RNA的一切操作过程中,都应戴一次性手套,接触“胖的”玻璃器皿和其他物品以后,手套就可能沾染上RNA酶,因此进行RNA实验时应勤换手套。
(3)污染的溶液 用高压灭菌的水和RNA研究专用的化学试剂配制溶液,用干烤过的药匙称取试剂,将溶液装入无RNA酶的玻璃器皿。可能的话溶液均应用0.1%DEPC于37℃至少处理12小时,然后于100℃加热15分钟或在15lbf/in2(1.034x105Pa)的高压下蒸气灭菌15分钟。注:DEPC可与胺类迅速发生化学反应,因些不能用来处理含有Tris 一类的缓冲液。可存几瓶新的未开封的Tris晶体以制备无RNA酶的溶液。
(二)已经污染,可以加入RNA酶的抑制剂
(1)RNA酶的蛋白质抑制剂是 从人胎盘分离的一种蛋白质可与多种RNA酶紧密结合(KI≈3x1010)形成非共价结合的等摩尔复合物,使RNA酶失活。此蛋白质体内可能是血管生成素的抑制剂,血管生成素是氨基酸序列和推测的三级结构与胰RNA酶类似的一种血管生成因子, 几个厂家以不同的商品名出售这种抑制剂,该蛋白质应置于含5mmol/L二硫苏糖醇(DTT)的50%甘油中,贮存于-20℃。抑制剂制品冻融数次后或放置在氧化条件下即应弃之不用,因为上述处理会使蛋白质变性从而释放出所结合的RNA酶。因此,在使用变性剂裂解哺乳动物(mammal;mammalian)细胞这一提取RNA的初始步聚中不应使用这种蛋白抑制剂。然而职用更温和的裂解方法时应使用这种抑制剂,并且在后续的所有RNA纯化步骤中均应有此蛋白质存在。由于酚抽提可以除蛋白质抑制剂,故应在纯化过程中补加几次抑制剂。其最大活性的发挥要求巯基试剂,而且它并不干扰反转录或mRNA在无细胞体系中的翻译。
(2)氧钒核糖核苷复合物 这种由氧钒(1V)离子和4种核糖核苷之中的任意一种所形成的复合物,是量种过渡态类似物,它能与多种RNA酶结合并几科能百分之百地抑制RNA酶的活性。这4种氧钒核糖核苷复合物可加入完整细胞中,在RNA提取和纯化的所有过程中,其使用浓度都是10mmol/L。所得到的mRNA可直接在硅卵母细胞中进行翻译, 并能作为某些外酶促反应(如mRNA反转录)的模板。然而氧钒核糖核苷复合物强烈抑制mRNA在无细胞体系中的翻译,因此必须用含0.1 %羟基喹淋的苯酚[ 用0. 01mol/LTris.Cl(pH7.8)平衡]多次抽提以去除之。有几家公司出售氧钒核糖核苷复合物。
(3)Macaloid(硅藻上)Macaloid是一咱粘土,很多年前就发现它能吸附RNA酶,用缓冲液将其制成浆液,以0.015%(W/V)的终浓度溶解细胞。 这种粘土随同它所吸附的RNA酶可在后续的RNA纯化过程中(如酚抽提后)经离心去除。
(三)提取核酸时可以加入盐酸胍或硫氰酸胍溶液。盐酸胍或硫氰酸胍溶液能迅速溶解蛋白质,从而免受RNA酶的干扰。
分子克隆常用工具酶 123
掏心专用03602017-11-27
分子克隆中常用的工具酶连接酶、T4 多核苷酸激酶、碱性磷酸酶、核酸酶、琼脂糖酶、蛋白酶、溶菌酶以及一些DNA 结合蛋白。
  分子克隆在分子水平上提供一种纯化和扩增特定DNA片段的方法。常含有目的基因,用体外重组方法将它们插入克隆载体,形成重组克隆载体,通过转化与转导的方式,引入适合的寄主体内得到复制与扩增,然后再从筛选的寄主细胞内分离提纯所需的克隆载体,可以得到插入DNA的许多拷贝,从而获得目的基因的扩增。
  工具酶:基因工程涉及众多的工具酶可粗略的分为限制酶,连接酶,聚合酶,核酸酶和修饰酶五大类。其中,以限制性核酸内切酶和DNA连接酶在分子克隆中的作用最为突出。
不存在不能被DNA水解酶水解的DNA。
  DNA水解酶,用于切断磷酸二酯键的酶,这些酶使糖-磷酸酯主链上的磷酸二酯键水解.一般分为两种:外切核酸酶和内切核酸酶。
  简介:
  原理

  DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解链成单链,在DNA聚合酶与启动子的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子挎贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,并设计引物做启动子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
  但是,DNA聚合酶在高温时会失活,因此,每次循环都得加入新的DNA聚合酶,不仅操作烦琐,而且价格昂贵,制约了PCR技术的应用和发展。发现耐热DNA聚合同酶--Taq酶对于PCR的应用有里程碑的意义,该酶可以耐受90℃以上的高温而不失活,不需要每个循环加酶,使PCR技术变得非常简捷、同时也大大降低了成本,PCR技术得以大量应用,并逐步应用于临床。
研究称DNA修饰可控制个体恐惧感来自昆士兰大学昆士兰脑研究所的神经学家或许发现了控制个体产生恐惧感的方法
对许多人来说,类似乘坐飞机或看到蜘蛛在地板上爬过这样的经历,并不只是简单地导致心跳加速和手心出汗,而是已经成为严重的恐惧症,能带来沉重的焦虑。近日,一个国际研究团队的论文指出,他们或许发现了通过DNA修饰来控制个体恐惧感的方法。
昆士兰大学昆士兰大脑研究所(QBI)的高级研究员、神经科学家TimothyBredy博士称,研究团队阐明了如何缓解与恐惧相关的记忆,特别是在恐惧症或创伤后精神压力障碍的病例中。
TimothyBredy博士称,他们已经发现了与消除恐惧有关的基因调控新机制。这种机制是一种抑制性的学习过程,当无需做出反应的时候,这一过程对于控制个体的恐惧至关重要。Bredy说:“基因运作的方式并不是静态的,而是动态变化的,能随着我们每天的生活经验而改变,与情绪有关的事件会产生显著的影响。”
通过了解在不改变内在序列的前提下改变DNA功能的机理,可以为未来开发与恐惧相关的焦虑症靶向疗法提供依据。Bredy说:“通过新型的表观遗传学调控模式对基因实施靶向作用,选择性地加强消除恐惧的记忆,从而达到想要的效果。”
研究团队中的博士生XiangLi说,恐惧消除是个体快速行为适应的一个明显例子。恐惧消除过程中的障碍与焦虑症(恐惧相关的)的出现具有密切联系。Bredy博士称,该研究首次综合分析了DNA修饰如何影响恐惧的消除。参与这项研究的还有来自加州大学欧文分校和哈佛大学的学者。相关研究结果发表在近期的《美国科学院院刊》(PNAS)上。
原文检索:
XiangLi,WeiWei,Qiong-YiZhao,JocelynWidagdo,DanayBaker-Andresen,CharlotteR.Flavell,AnaD’Alessio,YiZhang,andTimothyW.Bredy.NeocorticalTet3-mediatedaccumulationof5-hydroxymethylcytosinepromotesrapidbehavioraladaptation.PNAS,April22,2014;doi:10.1073/pnas.1318906111
【求助】DNA的甲基化修饰123
萝莉控听说1234562021-07-24
今天晚上开始做甲基化修饰DNA实验,由于没有试剂盒,需要自己配置所有容易来进行修饰。晚上溶解亚硫酸氢钠时,由于太晚了,着急走,就在管子底部还有少许结晶沉淀的情况下,就加入到EP管中了。这样对于整个甲基化修饰影响大吗??担心啊。
各位大神们,小妹最近才做关于甲基化方面的实验,由于涉及到MSP(甲基化特异性PCR),想请教前辈们是买的什么DNA提取试剂盒(公司是什么?)和DNA纯化修饰试剂盒呢(公司是什么?)因为不想手工提取,所以希望多多听取前辈意见,大家的试剂盒买后做的效果好吗??请大家不吝赐教!!谢谢啦。。
这种问题只能问佳学基因解码专家。

本人是DNA跑变性PAGE的小白,现在正在设计实验,DNA单链上带有Biotin修饰,跑变性PAGE后,转膜敷抗体,要用什么抗体显biotin呢?是直接用biotin的二抗吗?求教各位大神~~~~