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NEB/Quick Dephosphorylation Kit/M0508S/100 reactions
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4000-520-616
Description:
TheQuickDephosphorylationKitcontainsQuickCIP,aheat-lABIlerecombinantversionofcalfintestinalalkalinephosphatase(CIP)purifiedfromarecombinantsource.QuickCIPnonspecificallycatalyzesthedephosphorylationof5´and3´endsofDNAandRNAphosphomonoesters.Italsohydrolysesribo-anddeoxyribonucleosidetriphosphates(NTPsanddNTPs).QuickCIPisusefulinmanyapplicationsthatrequirethedephosphorylationofDNAorRNAends.Incloning,dephosphorylationpreventsre-ligationoflinearizedplasmidDNA.Theenzymecanquicklydephosphorylate5´protruding,5´recessed,andbluntendsinjust10minutes.QuickCIPmayalsobeusedtodegradeunincorporateddNTPsinPCRreactionstopreparetemplatesforDNAsequencingorSNPanalysis.QuickCIPiscompletelyandirreversIBLyinactivatedbyheatingitat80°Cfor2minutes,unlikewildtypeCIP,whichisheat-inactivatable.ThismakesremovalofQuickCIPpriortoligationorend-labelingunnecessary.
1XCutSmartBuffer:
50mMPotassiumAcetate
20mMTris-acetate
10mMMagnesiumAcetate
100µg/mlBSA
pH7.9@25°C
KitComponents
Thefollowingreagentsaresuppliedwiththisproduct:
| Storeat(°C) | Concentration | |
| CutSmart®Buffer | -20 | 10X |
| QuickCIP | -20 |
Notes:
QuickCIP,asaremostalkalinephosphatases,isaZn2+andMg2+-dependentenzyme.Ourformulationhastightlyboundzincatomsintheactivecenteranddoesnotrequiresupplementalzincorotheradditives.QuickCIPisalsoactivein1XNEBuffers1.1,2.1,3.1aswellasNEBuffers1,2,3and4.QuickCIPactivityisenhancedinthepresenceofmonovalentsalts.QuickCIPisinhibitedbymetalchelators(e.g.EDTA),inorganicphosphateandphosphateanalogs.TheQuickCIPactivityisdecreasedinthepresenceofreducingagents(DTT,β-mercaptoethanol).ThesourceforQuickCIPisaPichiapastorisclonethatcarriesthecalfintestinalalkalinephosphatasegenefromcalfintestinalmucosa.ThestorageconditionsforQuickCIPare25mMTris-HCl,1mMMgCl2,0.1mMZnCl2,50%Glycerol,pH7.5@25°C.QuickCIPcanbeheatinactivatedfor2minutesat80°C.QuickCIPisahomodimer.Themolecularweightofthemonomeris56kDa.蚂蚁淘电商平台
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蚂蚁淘（www.ebiomall.cn）是中国大陆目前唯一的生物医疗科研用品B2B跨境交易平台，
该平台由多位经验丰富的生物人和IT人负责运营。蚂蚁淘B2B模式是指客户有采购意向后在蚂蚁
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运输到中国口岸，最后由蚂蚁淘国内团队报关运输给客户...
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2021-09-06
合成服务介绍： DNA修饰标记探针是分子生物学实验中常用的工具型产品，广泛应用于基因分型、疾病分子诊断、基因表达检测、食品安全DNA检验等实验项目。目前我们可以提供包括：LNA、稀有碱基、磷酸、巯基、硫代、氨基、间臂Spacer、生物素、di高辛、荧光标记、淬灭基团等修饰。可根据客户的个性化需求在引物5’端、3’端或特别指定的任一位置标记不同的荧光基团，如FAM、HEX、CY3、CY5、VIC、ROX等。除了单荧光基团修饰，我们也提供MGB、BHQ、Dabcyl、TAMRA、ecl 查看更多
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2021-09-22
埃默里大学的科学家们发现了一个函数,一个神秘的DNA修饰在果蝇的大脑发育,这可能为它的作用在人类提供线索。研究结果将发表在分子细胞。表观遗传学可能意味着“以上基因”,但很多领域的焦点是DNA甲基化,DNA本身的化学改性。DNA甲基化并不改变实际的字母(A、C、G和T),但它确实改变细胞DNA是如何处理的。一般来说,基因关闭,对细胞分化至关重要。最常见形式的DNA甲基化的研究出现在DNA字母C(胞嘧啶)。果蝇,尽管是一个有用的遗传模型的发展,很少有这种形式的DNA 查看更多
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2021-09-13
RNA加工修饰，主要加工方式是切断和碱基修饰，真核生物tRNA前体一般无生物学特性，需要进行加工修饰。... 查看更多
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2021-09-07
一种新型测序技术或能高效检测癌症相关的DNA修饰 近日，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中，来自美国路德维希癌症研究所的科学家们通过研究开发了一种新方法来检 查看更多
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2021-09-08
消除恐惧记忆的灵活度来自DNA修饰 昆士兰大学脑研究所的Timothy Bredy教授说，恐惧是一种重要的生存机制，利用环境中的暗示来激发某些身体反应，反过来，在不再需要它时，这种能力 查看更多
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2021-09-12
RNA加工修饰，主要加工方式是切断和碱基修饰，真核生物tRNA前体一般无生物学特性，需要进行加工修饰。... 查看更多
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2021-09-21
埃默里大学的科学家们发现了一个函数,一个神秘的DNA修饰在果蝇的大脑发育,这可能为它的作用在人类提供线索。研究结果将发表在分子细胞。表观遗传学可能意味着“以上基因”,但很多领域的焦点是DNA甲基化,DNA本身的化学改性。DNA甲基化并不改变实际的字母(A、C、G和T),但它确实改变细胞DNA是如何处理的。一般来说,基因关闭,对细胞分化至关重要。最常见形式的DNA甲基化的研究出现在DNA字母C(胞嘧啶)。果蝇,尽管是一个有用的遗传模型的发展,很少有这种形式的DNA 查看更多
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2021-09-11
RNA加工修饰，主要加工方式是切断和碱基修饰，真核生物tRNA前体一般无生物学特性，需要进行加工修饰。... 查看更多
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2021-09-04
路德维希癌症研究科学家在当前的Nature Biotechnology杂志上报道了一种新的改进方法，用于检测DNA的化学修饰。这些修饰或“表观遗传”标记有助于控制基因表达及其在基因组中的异常分布。在牛津大学路德维希癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler的带领下，该研究表明他们的方法，称为TET辅助吡啶硼烷测序，或TAPS，是一种损害较小，效率更高的替代品。亚硫酸氢盐测序，目前用于绘制DNA 表观遗传修饰 查看更多
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2021-09-20
埃默里科学家已经确定了果蝇大脑发育中神秘DNA修饰的功能，这可能会提示其在人类中的作用。结果计划在Molecular Cell上发表。表观遗传学可能意味着“高于基因”，但该领域的许多重点是DNA甲基化，DNA本身的化学修饰。甲基化不会改变实际的DNA字母(A，C，G和T)，但它确实改变了细胞处理DNA的方式。通常，它关闭基因并且对于细胞分化是必需的。最常研究的DNA甲基化形式出现在DNA字母C(胞嘧啶)上。果蝇尽管是一种有用的遗传发育模型，却几乎没有这种形式的DNA甲基化 查看更多
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2021-09-09
埃默里科学家已经确定了果蝇大脑发育中神秘DNA修饰的功能，这可能会提示其在人类中的作用。结果计划在Molecular Cell上发表。表观遗传学可能意味着“高于基因”，但该领域的许多重点是DNA甲基化，DNA本身的化学修饰。甲基化不会改变实际的DNA字母(A，C，G和T)，但它确实改变了细胞处理DNA的方式。通常，它会关闭基因并对细胞分化至关重要。
最常研究的DNA甲基化形式出现在DNA字母C(胞嘧啶)上。果蝇尽管是一种有用的遗传发育模型，却几乎没有这种形式的D 查看更多
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2021-09-16
8 月 10 日，来自耶鲁大学医学院，暨南大学，斯坦福大学的研究人员发表了题为「m6A mRNA methylation controls T cell homeostasis by targeting the IL-7/STAT5/SOCS pathways」的文章，首次报道了 m6A mRNA 修饰在哺乳动物免疫细胞中的生理功能。该项研究发现，m6A 通过靶向 Naive CD4 T 细胞中 IL-7/STAT5/SOCS 信号通路中的信号分子 mRNA 来调控 Naive CD4 T 细胞的分化，从 查看更多
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一种修饰RNA疗法更有助治疗心力衰竭123
work0372014-01-06
相关疾病：心力衰竭与传统的提供较长时间蛋白表达的传统DNA投递方法相比，一种采用修饰RNA的治疗方法通过限制治疗蛋白表...
提取RNA,氢氧化钠到底能不能去除RNA酶 核酸基因技术123
mingrikeji102017-04-17
大家都知道，提取RNA的时候，去除RNA酶污染，有时候是非常关键的。好多情况下，我们都是在用DEPC，但是DEPC有毒，又容易和Tris试剂中的巯基反应，没办法配制Tris试剂。
我看到过一些资料好像是说氢氧化钠配制的溶液也可以去除RNA酶，按照道理来讲，高浓度的碱可以使得蛋白变性，自然也可以使得RNA酶变性。
然后我试了试，我配制1Mol/L的氢氧化钠,这个浓度已经很高了，用配制的氢氧化钠去处理了一些吸管，烧杯，提取过程中要用到的东西。然后我又用无RNA酶水（这个实验室以前配制了不少）泡了泡这些氢氧化钠处理过的吸管烧杯之类的东西。自然，我也提取RNA试了试，似乎却没有成功。我发现最后提取的RNA浓度低，仅仅为20纳克/微升。虽然A260/A280，比值能到1.98，还不错。但是浓度很低。我跑电泳就能够猜到，没有看出来有条带。自然我后面做pcr的actin也没有结果。
虽然我这次用到的组织样，可能很少，只有小指甲的三分之一，但对于是否提取出来了RNA，我依然产生了怀疑。
幸亏我是做一个植物标本，我还有无限制的样本可以让我折腾。因此我想问的是，NaOH到底能不能去除RNA酶污染。
如果可以，该怎么用。该怎么用，该怎么用。
流式细胞周期分析 生物科学 细胞科学论坛学术科研互动平台123
欲醉0001272017-11-27
这是因为做细胞周期的时候要用荧光染料染DNA，一次判断细胞DNA的相对含量。这些荧光染料，比如PI，可以染核酸，无法特异性的分别DNA和RNA。只有用RNA酶消化掉RNA后，才能消除RNA的干扰。不然DNA和RNA都会被染色。
剪切RNA的酶是什么?剪切RNA的酶是什么– 手机爱问123
2017-11-27
(1)核酸酶
有DNase、RNase、核酸酶S1等，可水解相应的DNA和RNA，核酸酶S1可降解单链DNA和RNA，用量增大也可降解双链核酸。它可用于切去ds-cDNA合成中产生的发夹环。
(2)修饰酶
有些酶可在其他酶的作用下,将酶的结构进行共价修饰，使该酶活性发生改变，
核酶的催化功能与其空间结构有密切关系。
不同的核酶可分为两类：
1 剪切型核酶：只剪不接，如M1 RNA。
2 剪接型核酶：该酶具有序列特异的内切核酸酶、RNA连接酶等多种酶活性。
加工场所在生物体细胞质（或相关实验设备中）。
有DNase、RNase、核酸酶S1等，可水解相应的DNA和RNA，核酸酶S1可降解单链DNA和RNA，用量增大也可降解双链核酸。它可用于切去ds-cDNA合成中产生的发夹环。
(2)修饰酶
有些酶可在其他酶的作用下,将酶的结构进行共价修饰，使该酶活性发生改变，
核酶的催化功能与其空间结构有密切关系。
不同的核酶可分为两类：
1 剪切型核酶：只剪不接，如M1 RNA。
2 剪接型核酶：该酶具有序列特异的内切核酸酶、RNA连接酶等多种酶活性。
加工场所在生物体细胞质（或相关实验设备中）。
【求助】RNA提取后有必要用DNA酶处理吗？ 经验共享 分析测试百...123
狸爱窝吧03362017-11-27
RNA提取后有没有必要用DNA酶处理主要和你的用途有关。如果仅仅是扩某个基因，那就无所谓。如果是定量RT-PCR，则最好DNA酶处理一下，或者引物需跨exon.
比如用QIAGEN的RNase-free的DNase处理的，不是加了DNase就结束了，为了去除DNase（蛋白）和buffer等可能影响到后期操作的因素，所以酶解了DNA后必须纯化RNA（QIAGEN的纯化柱），这样得到的RNA才用于定量实验。即使这样，在做real-time PCR时都要加一管仅加RNA的作为阴性对照（排除DNA的污染）。
比如用QIAGEN的RNase-free的DNase处理的，不是加了DNase就结束了，为了去除DNase（蛋白）和buffer等可能影响到后期操作的因素，所以酶解了DNA后必须纯化RNA（QIAGEN的纯化柱），这样得到的RNA才用于定量实验。即使这样，在做real-time PCR时都要加一管仅加RNA的作为阴性对照（排除DNA的污染）。
DNA合成需要有一段RNA为引物,合成该引物的酶是() 123
超迁2017-11-27
DNA合成RNA需要转录酶，RNA合成DNA需要逆转录酶
RNA聚合酶作用的部位。, 123
2017-11-27
DNA聚合酶的作用位点:3'-5'-磷酸二酯键
RNA聚合酶的作用位点:3'-5'-磷酸二酯键
DNA解旋酶的作用位点:DNA中互补碱基之间的氢键
RNA聚合酶的作用位点:3'-5'-磷酸二酯键
DNA解旋酶的作用位点:DNA中互补碱基之间的氢键
伊成器研究组在Nature Chemical Biology上报道全转录组假尿嘧啶...123
wangyy19902015-08-08
2015年6月15日，北京大学生命科学学院伊成器研究组在《NatureChemicalBIOLOGy》杂志在线发表题为“Chemicalpulldownrevealsdynamicpseudouridylationofthemammaliantranscriptome”的研究论文（DOI:10.1038/nchembio.1836）。文章报道了一种通过化学标记和富集手段实现全转录组水平上假尿嘧啶RNA修饰的单碱基分辨率测序技术CeU-Seq，并绘制了人和小鼠细胞转录组中假尿嘧啶RNA修饰的谱图。
CeU-Seq绘制人及小鼠全转录组假尿嘧啶RNA修饰谱图。 （a）CeU-seq流程图；（b）人细胞系及小鼠大脑和肝脏组织全转录组水平假尿嘧啶修饰分布；（c）转录组中假尿嘧啶修饰呈现出“刺激条件特异性”的特点。
转录后修饰在生命体中广泛存在（已发现100多种），而假尿嘧啶RNA修饰就是其中最主要的一种。假尿嘧啶在多种非编码RNA（tRNA、rRNA、snRNA等）上的功能与机制已有较多研究；然而，对于信使RNA（messengerRNA，mRNA）上假尿嘧啶的分布和潜在生物学功能，目前知之甚少。最主要的难题，就是如何实现假尿嘧啶在mRNA上的精准定位。
为了研究哺乳动物转录组中的假尿嘧啶修饰，伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的假尿嘧啶修饰进行定量，发现其广泛存在于各种细胞系及小鼠的组织当中，并且在哺乳动物mRNA中丰度相当高。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段，发展了“CeU-Seq”—一种利用小分子化合物实现特异性标记与富集的假尿嘧啶高通量测序技术。利用这一技术，该研究成功实现了人细胞系以及小鼠（大脑与肝脏组织）全转录组水平的单碱基分辨率假尿嘧啶检测，发现在数千个mRNA与长非编码RNA（lncRNA）上都含有假尿嘧啶修饰。该研究进一步确定了多个可以作用于mRNA上的假尿嘧啶合成酶（其中PUS1、DKC1两种酶之前被发现与线粒体肌病、先天性角化不良等人类疾病相关），并且发现转录组中假尿嘧啶的含量与分布均会受到各种环境刺激的调控，呈现出“刺激条件特异性”的诱导修饰。因此，该研究不但揭示了假尿嘧啶的广泛存在、绘制了转录组中假尿嘧啶RNA修饰的高清谱图，也为这一转录后修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具、为近年来兴起的“RNA表观遗传学”领域提供了崭新的研究方向。
北京大学生科院博士生李笑雨（PTN-BBS联合培养项目）、生命中心博士生朱平、博士生马士清是这篇论文的并列第一作者，生命科学学院伊成器研究员是该论文的通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、科技部973计划和北大清华生命科学联合中心的资助。
原文链接:http://www.nature.com/nchembio/journal/vaop/ncurrent/full/nchembio.1836.html
转录后修饰在生命体中广泛存在（已发现100多种），而假尿嘧啶RNA修饰就是其中最主要的一种。假尿嘧啶在多种非编码RNA（tRNA、rRNA、snRNA等）上的功能与机制已有较多研究；然而，对于信使RNA（messengerRNA，mRNA）上假尿嘧啶的分布和潜在生物学功能，目前知之甚少。最主要的难题，就是如何实现假尿嘧啶在mRNA上的精准定位。
为了研究哺乳动物转录组中的假尿嘧啶修饰，伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的假尿嘧啶修饰进行定量，发现其广泛存在于各种细胞系及小鼠的组织当中，并且在哺乳动物mRNA中丰度相当高。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段，发展了“CeU-Seq”—一种利用小分子化合物实现特异性标记与富集的假尿嘧啶高通量测序技术。利用这一技术，该研究成功实现了人细胞系以及小鼠（大脑与肝脏组织）全转录组水平的单碱基分辨率假尿嘧啶检测，发现在数千个mRNA与长非编码RNA（lncRNA）上都含有假尿嘧啶修饰。该研究进一步确定了多个可以作用于mRNA上的假尿嘧啶合成酶（其中PUS1、DKC1两种酶之前被发现与线粒体肌病、先天性角化不良等人类疾病相关），并且发现转录组中假尿嘧啶的含量与分布均会受到各种环境刺激的调控，呈现出“刺激条件特异性”的诱导修饰。因此，该研究不但揭示了假尿嘧啶的广泛存在、绘制了转录组中假尿嘧啶RNA修饰的高清谱图，也为这一转录后修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具、为近年来兴起的“RNA表观遗传学”领域提供了崭新的研究方向。
北京大学生科院博士生李笑雨（PTN-BBS联合培养项目）、生命中心博士生朱平、博士生马士清是这篇论文的并列第一作者，生命科学学院伊成器研究员是该论文的通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、科技部973计划和北大清华生命科学联合中心的资助。
原文链接:http://www.nature.com/nchembio/journal/vaop/ncurrent/full/nchembio.1836.html
做mRNA用的血清保存时用的管子要用无RNA酶的吗? 核酸基因技术...123
pwqbq2021-07-22
要收集临床病人的血清做mRNA，每天收集然后集中检测，问题来了：保存的EP管要用DEPC处理过的吗，就算保存时用的无RNA酶的管子，可是抽血的真空管也没处理过啊。我现在就用普通的管子冻在-70了，请教大家这样行不行啊？
冷诱导RNA结合蛋白的生物学功能研究进展123
kwcswgs2012-12-03
来自瑞士日内瓦大学的J?rgMorf及其同事发现冷诱导的RNA结合蛋白（CIRP）的周期性积累会受到体温的调控，他们还发现CIRP赋予了昼夜节律振荡器的健壮性。
详情：http://www.bioku.cn/201212/science-cirp-circADIan-gene-clip-posttranscriptional-modification-fibroblast/
在哺乳动物组织中，节律基因的表达受到局部的振荡器或视交叉上核中生物钟主钟控制的系统信号的调控。本研究发现是受刺激的体温循环而不是外周振荡器，控制纤维母细胞中的冷诱导RNA结合蛋白（CIRP）的节律性表达。反过来，功能缺失性实验表明CIRP是高振幅的节奏基因表达所需的。利用基于生物素-链亲和素的交联和免疫沉淀反应（CLIP），本研究对CIRP结合的RNA进行了全转录组分析，发现了一些编码昼夜节律振荡器蛋白的转录物，包括CLOCK蛋白。此外，在CIRP缺失的纤维母细胞中，CLOCK的含量大大减少。因为在这些细胞中，CLOCK的异位表达提高了节律基因的表达水平，因此我们猜测CIRP通过调节CLOCK的表达水平赋予了昼夜节奏振荡器的健壮性。
详情：http://www.bioku.cn/201212/science-cirp-circADIan-gene-clip-posttranscriptional-modification-fibroblast/
在哺乳动物组织中，节律基因的表达受到局部的振荡器或视交叉上核中生物钟主钟控制的系统信号的调控。本研究发现是受刺激的体温循环而不是外周振荡器，控制纤维母细胞中的冷诱导RNA结合蛋白（CIRP）的节律性表达。反过来，功能缺失性实验表明CIRP是高振幅的节奏基因表达所需的。利用基于生物素-链亲和素的交联和免疫沉淀反应（CLIP），本研究对CIRP结合的RNA进行了全转录组分析，发现了一些编码昼夜节律振荡器蛋白的转录物，包括CLOCK蛋白。此外，在CIRP缺失的纤维母细胞中，CLOCK的含量大大减少。因为在这些细胞中，CLOCK的异位表达提高了节律基因的表达水平，因此我们猜测CIRP通过调节CLOCK的表达水平赋予了昼夜节奏振荡器的健壮性。
植物中依赖RNA 的RNA 聚合酶6(RDR6)研究进展123
牧极利2017-11-27
解旋酶解旋DNA，然后由RNA聚合酶根据DNA序列来造出相应的mRna链，在蛋白质合成中起作用
固相RNaseAway能清除溶液里面的RNA酶吗?123
█花仔20382021-07-20
般来讲是可以的.
不过这种类似的RNA酶清除剂是一种广泛的蛋白灭活剂,如果你配置处理的溶液要用于类似一些酶蛋白的溶液体系,那就不可以用RNA酶清除剂来处理了,否则会影响需要用到的酶的活性
不过这种类似的RNA酶清除剂是一种广泛的蛋白灭活剂,如果你配置处理的溶液要用于类似一些酶蛋白的溶液体系,那就不可以用RNA酶清除剂来处理了,否则会影响需要用到的酶的活性
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