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GloboZymes/Cdc42/50μg/GLO128-050
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Cdc42

Cdc42 Source: GST-tagged recombinant human produced in E. coli

Purity: > 90% by SDS-PAGE, apparent Mr ~ 48-kDa.

Supplied: In 50 mM Tris-HCl pH 7.0 buffer containing 14 mM β-mercaptoethanol, 1 mM benzamidine, 0.1 mM phenylmethanesulfonyl fluoride, 1 mM EDTA, 0.03% Brij-35 and 10% glycerol.  5 μg of the purified protein are supplied in 50 μl of the buffer; 25 μg or 50 μg of the purified protein are supplied in 100 μl  of the buffer. Maintain preparations in aliquots at -70° C. Avoid repeated thawing.

Synonym: GST-Cdc42

GloboZymes GST-tagged Cdc42 preparations are effective for binding and pull-down affinity studies.

Background: Cdc42 is a Rho-like GTP-binding protein. It is involved in signal transduction regulation and cytoskeleton reorganization in response to growth factor stimulation. Cdc42 activates members of the PAK protein kinase family by binding to their regulatory domain. The catalytic domain is then able to undergo autophosphorylation and concomitant activation.

Figure: Purified preparation of recombinant human GST-tagged cdc42 was subjected to SDS-PAGE. The gel was stained with Coomassie Blue.

References: Nature 367: 40   J Biol Chem 270: 21695

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解离/非解离native缓冲液系统很多应用蛋白质聚丙烯酰胺凝胶区带电泳(zone electrophoresis)的研究使用一种缓冲液系统,该系统的设计把所有的蛋白质分解成单一多肽亚单位。最常用的解离试剂是十二烷基硫酸钠(SDS),一种离子型去污剂,它通过包围在多肽骨架的周围变性蛋白质。在包含有过量的SDS和巯基 查看更多>
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1。根据序列比对,相似性分析,初步估计蛋白质可能的功能2。查阅文献,看有否相关研究3。如果用血清,在未知功能情况下,很难有所作为,建议等初步知道功能后,用血清是验证抉具体作用的4。比较常用的未知基因分析方法,是从基因水平入手:将该基因敲除(现在可以考虑RNAi),看看在功能组、蛋白 查看更多>
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1.什么是western blot?答:WB又称免疫印记法.是将生物大分子物质通过不同途径转移到固相载体的过程。2. western blot有什么优点?答:灵敏,可达ng级,用Ecl显色法理论上可达pg级。方便,特异性高。3. western blot的具体步骤是什么?答:一.制样(以提动物组织总蛋白为例),1) 组织洗涤后加入3倍体积PBS,0℃研磨。2) 加入5×STOP buffer3)180W, 6mins,0℃超声波破碎4)5000rpm,5mins离心 查看更多>
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血清免疫蛋白的纯化为什么要检测柱子流出的液体是否有铵根
请教各位达人
最好能说得具体点,小弟对此几乎一窍不通
谢谢
问个小小白的问题:
样本是经过磁珠纯化过的血清蛋白,用MALDI-TOF-MS仪器得到质谱图。请教下:
1.每个峰都是一个纯的蛋白?
2.根据m/z能匹配蛋白的名称不?
各位朋友,我最近在做一植物病毒的外壳蛋白的表达;
蛋白已经表达出来了,接下来要去做抗血清
想要请公司做;
我看了论坛里很多帖子,做抗体的对蛋白的要求好像很低啊。
我想问我菌煮沸SDS-PAGE割胶回收的蛋白能不能用于抗血清的试验?(如果这样能用,可以省很多事情啊,不用去超声波,过柱子等纯化步骤)
量大概需要多少啊?
血清中蛋白质按电泳法一般可分为五类:清蛋白、α1-球蛋白、α2-球蛋白、β-球蛋白和γ-球蛋白,其中γ-球蛋白含量约占16%,100 mL血清中约含1.2 g左右。不同种类的蛋白质其分子量、溶解度,以及在一定条件下带电荷的情况有所不同,可根据这些性质的差别,分离及提纯蛋白质。首先利用清蛋白和球蛋白在高浓度中性盐溶液中(常用硫酸铵)溶解度的差异而进行沉淀分离,此为盐析法。半饱和硫酸铵溶液可使球蛋白沉淀析出,清蛋白则仍溶解在溶液中,经离心分离,沉淀部分即为含有γ-球蛋白的粗制品。用盐析法分离而得的蛋白质中含有大量的中性盐,会妨碍蛋白质进一步纯化,因此首先必须去除。常用的方法有透析法、凝胶层析法等。本实验采用凝胶层析法,其目的是利用蛋白质与无机盐类之间分子量的差异。当溶液通过SephadexG-25凝胶柱时,溶液中分子直径大的蛋白质不能进入凝胶颗粒的网孔,而分子直径小的无机盐能进入凝胶颗粒的网孔之中.因此在洗脱过程中,小分子的盐会被阻滞而后洗脱出来,从而可达到去盐的目的。纯化后的γ-球蛋白可利用醋酸纤维素薄膜电泳法鉴定其纯度。
人血清白蛋白是由585个氨基酸组成的单链蛋白质,分子量为67kDa。成熟的人血清白蛋白是一个心形分子,由3个结构相似的α-螺旋结构域组成。向左转|向右转
甲醇高氯酸沉淀蛋白区别
盐析 ——用于各种蛋白质酶离纯化;
蛋白质溶液加入量性盐破坏蛋白质胶体稳定性使其析种称盐析用性盐硫酸铵、硫酸钠、氯化钠等各种蛋白质盐析所需盐浓度及pH同故用于混蛋白质组离例用半饱硫酸铵沉淀血清球蛋白饱硫酸铵使血清白蛋白、球蛋白都沉淀盐析沉淀蛋白质经透析除盐仍保证蛋白质性调节蛋白质溶液pH至等电点再用盐析则蛋白质沉淀效更盐析两类第类叫Ks段盐析定PH温度通改变离强度实现用于早期粗提液;第二种叫b段盐析定离强度通改变PH温度实现用于期进步离纯化结晶影响盐析素包括:蛋白质浓度、离强度类型、PH值、温度等针温度条需要强调:低离强度或纯水蛋白质溶解度定范围内随温度增加增加高浓度蛋白质、酶肽类物质溶解度随温度升降般情况蛋白质盐析温度特殊要求室温进行某些温度比较敏酶要求0-4℃进行
使用硫酸铵沉淀蛋白需要注意:硫酸铵含少量重金属离蛋白质巯基敏作用使用前必须用H2S处理:硫酸铵配浓溶液通入H2S饱放置夜用滤纸除重金属离浓缩结晶100℃烘干使用另外高浓度硫酸铵溶液般呈酸性(PH=5.0左右)使用前需要用氨水或硫酸调节至所需PH
机溶剂沉淀 ——用于物、糖及核酸产品离纯化;
机溶剂沉淀机理降低水介电数导致具表面水层物脱水相互聚集析该优点于:1)辨能力比盐析高即蛋白质或其溶剂比较窄机溶剂浓度沉淀;2)沉淀用脱盐滤较容易;3)化制备应用比盐析广泛温机溶剂沉淀蛋白质往往引起变性例酒精消毒灭菌操作要求低温进行机溶剂选择首先能水混溶使用较机溶剂乙醇、甲醇、丙酮二甲基甲酰胺、二甲基亚砜、乙腈2-甲基-2,4戊二醇等
等电点沉淀 ——单独应用较少与其结合使用;
两性电解质净电荷零溶解度低同两性电解质具同等电点基础进行离工业产胰岛素粗提液先调PH8.0除碱性蛋白质再调PH3.0除酸性蛋白质利用等电点除杂蛋白必须解制备物酸碱稳定性盲目使用十危险少蛋白质与金属离结合等电点发偏移故溶液含金属离必须注意调整PH值等电点与盐析、机溶剂沉淀或其沉淀联合使用提高其沉淀能力
重金属盐沉淀 ——用于抢救误服重金属盐毒病;
许机物质包括蛋白内碱性溶液带负电荷能与金属离形沉淀根据机物与间作用机制羧酸、胺及杂环等含氮化合物类铜锌镉;亲羧酸疏含氮化合物类钙镁铅;亲硫氢基化合物类汞银铅蛋白质-金属离复合物重要性质溶解度溶液介电数非敏调整水溶液介电数(加入机溶剂)即沉淀种蛋白沉淀条件pH稍于等电点宜重金属沉淀蛋白质变性若低温条件并控制重金属离浓度用于离制备变性蛋白质临床利用蛋白质能与重金属盐结合种性质抢救误服重金属盐毒病给病口服量蛋白质用催吐剂结合重金属盐呕吐解毒
【目的要求】1.掌握α1-AT分离纯化各步骤原理、操作及鉴定方法2.掌握基本技术操作及仪器使用3.熟悉人血清蛋白质的分类方法,α1-AT性质4.了解生物大分子制备技术,分离纯化类型5.学会利用学过的分离纯化方法进行基本的科研设计6.练习研究论文基本写作

【教学内容一】分段盐析法,凝胶过滤法(盐析法概念及原理,分段盐析概念,分子筛效应,柱层析基本技术)

【实验原理】1.盐析法是一种利用蛋白质在高盐溶液中溶解度不同而分离的方法。通过将硫酸铵加入蛋白质溶液中,使蛋白质表面电荷被中和,水化膜被破坏,导致蛋白质在水溶液中的稳定性因素去除而沉淀。2.通过分段改变盐类浓度达到分离目的的方法叫分段盐析法。3.凝胶过滤又称分子筛层析。混合物随流动相流经装有凝胶作为固定相的层析柱时,分子量大的物质因不能进入凝胶网孔而沿凝胶颗粒间的空隙先被洗脱(阻力小,流程短,流速大),分子量小的物质因能进入凝胶网孔而受阻滞,流速缓慢,流程长而后被洗脱,由于流速不同可以把大小不同的分子分开.

【仪器与试剂】1.离心机2.真空泵3.饱和硫酸铵溶液:称取767g固体硫酸铵,加入1000ml水中,加热使之溶解,室温冷却后4℃静置过夜,然后用氨水将pH调至中性。4.固体(NH4)2SO45.SephadexG—256.奈氏试剂7.双缩脲试剂8.pH7.4,0.05MPBS

【步骤】

一分段盐析

1.观看人血清抗胰蛋白酶(α1-AT)的分离及鉴定教学录像2.每组量取20ml血清,倒入一干净烧杯中,缓慢加入饱和硫酸铵20ml,边加边搅拌,放入4℃冰箱30分钟3.从冰箱中取出烧杯,将血清倒入离心管,3000rpm,离心20分钟4.将上清倒入一干净量筒中,记录体积后,倒入干净烧杯中,按17.6g/100ml量取固体硫酸铵,缓慢加入上清中,边加边搅拌。4℃冰箱放置30分钟5.将烧杯中液体倒入抽滤器中,负压抽滤6.刮下滤纸上的粗提蛋白,用4ml缓冲液溶解,准备加样

二凝胶过滤层析

1.凝胶柱准备:(1)连接层析柱(2)夹住出口,加入1/3体积的0.05MpH6.4PBS,灌胶,待凝胶自然沉降约1cm时,打开出口,控制流速,60滴/分(3)层析柱填装完成后,连接下口瓶,调节流速,使入口和出口流速相同。平衡至入口pH值与出口pH值相同(即pH试纸呈色相同),关闭出口,等待加样2.加样:用吸管吸去胶面以上的缓冲液,立即加入蛋白粗提液(沿管壁缓慢加入)3.打开出口,调流速15滴/分,待蛋白粗提液完全进入胶面,用少量缓冲液清洗管壁。连接下口瓶4.检测:用双缩脲试剂检测洗脱液。待试剂变红,开始收集,直到试剂不变色停止收集。测量并记录收集液的体积,留取1ml样品(标记为G—25样品),放入一冷冻管中冰箱冻存;剩余的液体收集入一大试管中,作好标记,下次实验用5.洗去铵盐:全速洗脱,用奈氏试剂检测洗脱液,直到橙色消失为止,回收凝胶

【注意事项】1.盐析所用器皿一定要干燥2.盐析时,应将饱和硫酸铵或固体硫酸铵加入到血清中,且边加边搅拌3.层析柱上方要留有少量液体,避免使凝胶暴露于空气中4.凝胶过滤上样时,使样品沿管壁缓缓流下,勿冲破胶面

(信息提供:探生网生物医药)
好难问题太笼统了
我想做关于血清铁蛋白的电泳,首先要分离和纯化铁蛋白。请各位老师和学长指点。
用大肠杆菌表达纯化的蛋白,和人血清中这种蛋白的分子量不同,western显示血清中这种蛋白的分子量高于纯化的蛋白,请问各位这是为什么呢?如何解释呢?
用镍柱镍柱分离纯化
固定金属离子亲和柱主要用于金属螯化离子。位于许多蛋白中的组氨酸残基将会和许多金属离子,例如锌。铜,镍,铁等形成复合物。因此,该柱料能选择性螯合一些具有组氨酸残基的蛋白质。但是半胱氨酸和咯氨酸残基也能和固定化金属螯和。但是亲和力比组氨酸要弱。所以,结合的强度是和缓冲液的PH和金属离子决定的。
金属螯和柱料主要是由亚氨基的乙酰乙酸成分耦联琼脂糖柱料,借助醚长生7个原子的空间。
全部容量:24-30um的含有zn的干胶
柱料结构:6%的高铰链的琼脂糖
柱料大小:45-165um
平均微粒:90um
直流速度:25度/0.1MPa/30倍柱床/5厘米高度/每小时可达700厘米
最大压强:0.3MPa
PH变化:长期3-13
短期2-14
化学稳定:通用含水缓冲液
0.01M盐酸,1.0M NAOH,20%乙醇(保存7天)
物理性质:可以忽略在PH或者离子变化下的体积变化
耐热性能:121度下0.1M乙酸钠作用半小时
金属螯和柱料保存于事先填充于20%乙醇。所以要搅拌驱除20%乙醇溶液。换成去离子水。比例是25%去离子水和75%处理胶。
处理金属螯和柱料:
1 平衡所有用到的材料于室温。
2 搅拌金属螯和柱料
3 倒水进柱子,驱除气体。用无离子水液封几厘米。
4 将金属螯和柱料连续倒进柱子,用玻璃棒支撑柱壁防止气泡形成。
5 然后立即用无离子水液封,装上柱盖,连接上泵。
6 打开柱子底部的开关,然后调节泵的流速。通常是不超过0.3MPa的。
7 经过一个稳定的柱床填鸭后,维持填压速度为3个柱床。
使用adaptor
1 经过上溯填鸭后,关闭柱床下面开关,移开上面的薄膜,小心的加上去离子水进行液封。
2 一定角度插入adaptor,确保没有气泡。
3 确保所有的连接都没有问题,柱子/泵/样品接受器
4 倾斜插入活塞确保没有气泡和管道充满液体。利用活泵正反向的流动确保没有气泡。
5 固定adaptor,打开柱子开关,开始缓冲液的流动。先以填鸭的速度直到柱床稳定后。

固定金属离子:
金属螯和柱料通过水来螯和金属的,避免发生沉淀在胶上。
1 确保柱子已经平衡好。如果有必要可以洗2个柱床(去离子水)
2 选择金属离子和0.1-0.3M中弱性酸。例如铁离子PH 3左右就好,避免形成沉淀和共沉。
3 加入一倍柱床的金属离子溶液
45倍柱床的去离子水洗涤
5至少2倍柱床的平衡缓冲液
结合:
发生于PH5.5-8.5之间.最强反映发生于最后
初始缓冲液的选择决定于金属离子和样品的结合性质。乙酸钠或者磷酸钠是比较好的缓冲液中不能使用EDTA或者柠檬酸盐
最通用缓冲液:
0.01-0.2M磷酸钠
0.05M乙酸钠
强烈推荐加入0.15-0.5M NaCl用于防止离子交换。
通常如果不知道一个蛋白的结合能力,最好的就是使用锌离子和中性的磷酸或者乙酸盐,同时含有0.15-0.5M NaCl
去垢剂不会影响蛋白质的结合能力
金属离子的取代意味着蛋白发生了结合。这种现象可以通过颜色来决定
洗脱蛋白:(3种方法)
1 降低PH(一步或者分步),大部分蛋白溶解于PH4-6最终3-4是可容的。可选择柠檬酸盐,磷酸或者乙酸盐。
2 逐步提高咪唑的浓度(0-0.5M),梯度变化最好是在初始缓冲液的PH范围。
3 加入EDTA或者EGTA可洗脱蛋白质。但是不是通用的。
利用离心或者重力作用纯化组氨酸位点蛋白
通过上镍进行选择性结合含有组氨酸位点蛋白,然后利用含有咪唑的缓冲液洗脱蛋白。

以下的实验是为了最大化将组氨酸位点蛋白结合到金属螯和柱料,然后确保能够洗脱下来。当结合和洗脱的条件尚未明了时,这些方法也是很好用的。
为了获得高纯度的蛋白,必须摸索咪唑的缓冲液在样品上柱和洗脱时的浓度。通常使用10mM-500mM范围的咪唑的缓冲液进行剃度洗脱,然后通过收集和SDS-PAGE 蛋白电泳确定洗脱浓度。
为了纯化不可容的含有his位点的蛋白质,(包含体),可以在变性条件下进行。利用8M尿素或者6M盐酸呱进行溶解蛋白。
样品处理:
样品要经可能溶解,避免出现堵塞现象,所以可以利用0.45uM虑膜过滤杂志
如果样品时溶解于20mM磷酸缓冲液中(含有0.5M Nacl,PH7.4),必须调整PH到7-8。
上柱前准备:
洗柱料:
1 亲柔震动胶瓶充旋胶料
2 利用吸管吸出足量柱料用以纯化目的。每毫升柱料可以吸纳5毫克蛋白
3 500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
4 小心去除上清
5 加入5倍体积去离子水,充分振荡柱料。可以倒置来回5分钟,不要机械搅拌。
6 再次500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
7 再次小心去除上清
挂镍:
1 加入0.5倍柱床体积0.1M硫酸镍,充分振荡柱料。可以倒置来回5分钟,不要机械搅拌。
2500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
3小心去除上清
洗柱:
1加入5倍体积去离子水,充分振荡柱料,来回倒置5分钟
2500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
3小心去除上清
4 再洗两次柱料(一共3×5柱床去离子水)
5 最后用一倍体积起始缓冲液充旋柱料(20mM Na2HPO4 /0.5MnaCl/10mM咪唑/PH7.4)

利用离心来纯化:
上样:
1 在起始缓冲液中加入样品,然后使整体胶浓度达到50%
2 亲柔搅拌,室温离心5-30分钟,结合能力取决于蛋白和样品浓度。
3 500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
4 取出上清。部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳
洗胶:
1 加入5倍体积起始缓冲液,搅拌5分钟
2 500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
3取出上清。部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳
4再洗两次柱料(一共3×5柱床起始缓冲液)。记得取出上清,部分用于SDS-PAGE 蛋白
电泳
洗柱:
1 加入2倍体积洗脱缓冲液(20mM Na2HPO4 /0.5MnaCl/10mM咪唑/PH7.4)搅拌5分钟
2再次500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
3再洗四次柱料(一共5×2柱床洗脱缓冲液)。记得取出上清,部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳,280nM吸光值,ELISA,WESTERN
利用流速和重力纯化:
1 在柱子底部加上滤器
2 加水排气
3 加柱帽,去除残余水。推荐是最多2 Ml柱料就可以了
样品结合:
1 倒胶进入柱子
2 小心上样,用波棒室温搅拌5-30分钟
3 打开柱帽,收集流出峰用于分析
洗胶:
1 加入5倍体积起始缓冲液,收集流出液用于SDS-PAGE 蛋白电泳
2再洗两次柱料(一共3×5柱床起始缓冲液)。记得取出上清,部分用于SDS-PAGE 蛋白
电泳
洗柱:
1 加上柱帽,加入2倍体积洗脱缓冲液(20mM Na2HPO4 /0.5MnaCl/10mM咪唑/PH7.4)搅拌5分钟。打开柱帽,收集流出峰
2再洗四次柱料(一共5×2柱床洗脱缓冲液)。记得取出上清,部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳,280nM吸光值,ELISA,WESTERN
注意:0.5M咪唑的280nM吸光值=0.5
常见问题:
1 样品太粘稠
答:核酸存在影响,可以继续超声,加入RNA酶至10ug/mlDNA酶至5ug/ml。然后冰浴1
0-15分钟。或者也可以用注射器来回充旋。这样可以防止堵塞柱料。
2 平衡时样品洗脱了下来
答: 检查PH和缓冲液成分,如果缓冲液成分不正确,EDTA加入,强还原剂加入,都会导致这个现象出现。
加大胶的量,如果胶料承载能力过头,也绘出出现这现象。
准备新鲜的柱料,如果柱料断裂,也挂不上蛋白。
3 在洗脱液中不含有组氨酸蛋白
答:如果SDS-PAGE 蛋白电泳已经发现蛋白存在于超声液中
超声可能不完全。可以用显微镜观察超声情况。AD260/280比值。(通常是超声前将10mg/ml溶菌酶加入25mM Tris-HCL,PH6-8),避免发泡以降解融合蛋白。
蛋白可能是是包含体,可以使用4-6M盐酸呱或者4-8 M尿素溶解。
尿素溶解的可以进行SDS-PAGE 蛋白电泳,盐酸呱溶解的不可以进行SDS-PAGE 蛋白电泳,必须换缓冲液。
洗脱液浓度太稀,可以加大咪唑浓度或者降低PH 来决定最佳洗脱条件如果在平衡前的洗柱发现了目的蛋白,证明起始缓冲液中的咪唑浓度太高,可适当降低。
4 考马氏亮蓝或者银染发现多条带
答:加入蛋白激酶抑制剂。可能是蛋白降解。用凝血酶切割前必须去除丝氨酸蛋白酶抑制剂采用梯度咪唑来洗脱蛋白。在平衡洗脱液中加入10mM咪唑可以洗脱大量杂质而不会洗脱融合蛋白。低于500mM咪唑可以洗掉绝大部分杂质。
在洗脱步奏往起始缓冲液加入去垢剂(2%TRITON x-100或者2%Tween20)50% 葡萄糖,20mM B-巯基乙醇。记得杂质通常没有特意结合能力,可以改变缓冲液来洗脱。
如果杂志和目的蛋白有相同结合能力,那就不能用于纯化。因此可以使用别的纯化系统,例如含有GST尾巴就用谷胱甘肽琼脂糖4B
柱料再生,清洁和保存
柱料再生:
1 使用0.05M EDTA,0.5M NaCl来洗脱镍离子。然后用3柱床的0.5M NaCl来洗干净EDTA
2如果是铁离子可以用0.05M EDTA泡过夜
3 这一步可以洗脱上面未能洗脱的残余结合蛋白
清洗柱料:
1 0.5倍柱床2M NaCl,反向洗脱10-15分钟
2 1M NaOH洗1小时去除残余蛋白
3 每一步都要用3倍柱床起始缓冲液清洗
4 4倍柱床70%乙醇洗脱强亲水蛋白和脂类蛋白。
也可以使用2倍柱床去垢剂。0.1-0.5%非离子去垢剂溶于0.1M乙酸。浸泡1-2小时。最后用5个柱床的70%乙醇去除去垢剂。
清洁:
1 尽可能去除微生物
2 0.5-1M NaOH反向流动半小时
3 再用3-5倍柱床消毒的起始缓冲液平衡
4 这个清洁步奏不一定能够提高纯化能力
保存:
长期保存于20%乙醇或者0.01M NaOH 于4度