DNA聚合反应需要的原料及操作的方法步骤
在PCR技术中的DNA聚合酶要进行DNA聚合反应时一定要有引子(primer),因为它只能以引子所提供的3-OH为起始点进行延伸(extension)的工作,而不能就地重新合成新的DNA(Denovosynthesis)。一般实验常以人工合成的寡核苷酸为引子进行DNA聚合反应,这时固然可以根据已知序列设计核酸引子,但也可以采用逢机引子(randomprimers)。所谓逢机引子即其序列为逢机序列,不经特别设计,目前应用最广者是以自动化机器所合成的、六到八个核苷酸长的寡核苷酸混合物;反应进行中若有任何一条逢机引子结合到模版DNA,即可引导DNA聚合反应的进行。以randompriming方法进行核酸标定,是以逢机引子引导Klenowfragment(largefragmentofE.coliDNApolymeraseI)进行DNA聚合反应,并在反应过程中添加[α-32P]dNTP或DIG-11-dUTP等标定物质。而为了避免randompriming也发生于载体部份的DNA,最好不要直接以质体DNA为模版进行标定反应,而应预先将目标DNA自载体切除出来。
仪器用具:微量离心机;沸水浴及冰浴
药品试剂:
模版DNA(pBlueGus的BamHI-HindIIIDNA片段,将由助教提供)
0.2MEDTA,pH8.0
4MLiCl
Randomprimingkit(Roche):
Hexanucleotidemix(randomprimer)
dNTPmixture(1mMdATP,1mMdCTP,1mMdGTP,0.65mMdTTP,0.35
mMDIG-11-dUTP,pH7.5)
Klenowenzyme(2U/μL)
绝对酒精
70%酒精
TE(10mMTris-Cl,pH8.0;1mMEDTA)
方法步骤:
◆以下反应条件与步骤主要参照randomprimingkit制造厂商所提供的产品说明书。
1)取100ng模版DNA,加入适量去离子水,把体积补足为15μL.
2)于沸水中加热10min.
◆请记得以夹子固定微量离心管的管盖部份,以免离心管在加热过程中盖子爆开、进水!
3)加热后,迅速把微量离心管移至冰浴中,静置数分钟。
4)离心数秒后,依序加入下列三种试剂:
2μLhexanucleotidemix
2μLdNTPmixture
1μLKlenowenzyme
5)以指头轻弹离心管,以便混合均匀。
6)短暂离心后,置于37℃恒温水槽中作用2h.
◆反应时间至少须要1h,最长可反应过夜。
7)作用完毕的后,加入2μL的0.2MEDTA,以便终止DNA聚合反应。
8)加入2.5μL4MLiCl及75μL纯酒精,混合均匀,置-20℃过夜。
隔天:
1)于13,000rpm,4℃离心15min.
2)倒出上清液,加入50μL的70%酒精,再离心5min.
3)倒出上清液并风干DNA.
4)最后以50μLTE溶解DNA.
PCR技术DNA聚合反应DNA聚合反应的方法步骤
