
Biological Activity
Reversible, competitive inhibitor of sterol regulatory element-binding protein (SREBP) site 1 protease (IC50 = 0.175 μM). Selective for site 1 protease against a panel of serine proteases. Inhibits rate of cholesterol synthesis in CHO cells (IC50 = 0.53 μM). Also displays antiviral activity. Cell permeable.
Licensing Information
Sold for research purposes under agreement from Pfizer Inc.
Compound Libraries
PF 429242 is also offered as part of the Tocriscreen Plus. Find out more about compound libraries available from Tocris.
Technical Data
M. Wt | 482.49 |
Formula | C25H35N3O2.2HCl |
Storage | Desiccate at RT |
Purity | ≥97% (HPLC) |
CAS Number | 947303-87-9 |
PubChem ID | 90488837 |
InChI Key | GSUZWFZKTIOWTI-MQWQBNKOSA-N |
Smiles | O=C(C2=CC=C(CN(CC)CC)C=C2)N(CCC3=CC=CC=C3OC)[C@@H]1CCNC1.Cl.Cl |
The technical data provided above is for guidance only. For batch specific data refer to the Certificate of Analysis.
All Tocris products are intended for laboratory research use only.
Solubility Data
Solvent | Max Conc. mg/mL | Max Conc. mM | |
---|---|---|---|
Solubility | |||
DMSO | 24.12 | 50 | |
ethanol | 48.25 | 100 | |
water | 24.12 | 50 |
Preparing Stock Solutions
The following data is based on the product molecular weight 482.49. Batch specific molecular weights may vary from batch to batch due to solvent of hydration, which will affect the solvent volumes required to prepare stock solutions.
Concentration / Solvent Volume / Mass | 1 mg | 5 mg | 10 mg |
---|---|---|---|
1 mM | 2.07 mL | 10.36 mL | 20.73 mL |
5 mM | 0.41 mL | 2.07 mL | 4.15 mL |
10 mM | 0.21 mL | 1.04 mL | 2.07 mL |
50 mM | 0.04 mL | 0.21 mL | 0.41 mL |
Molarity Calculator
Reconstitution Calculator
Dilution Calculator
Product Datasheets
References
References are publications that support the products' biological activity.
Hay et al (2007) Aminopyrrolidineamide inhibitors of site-1 protease. Bioorg.Med.Chem.Lett. 17 4411 PMID: 17583500
Hawkins et al (2008) Pharmacologic inhibition of site 1 protease activity inhibits sterol regulatory element-binding protein processing and reduces lipogenic enzyme gene expression and lipid synthesis in cultured cells and experimental animals. J.Pharmacol.Exp.Ther. 326 801 PMID: 18577702
Urata et al (2011) Antiviral activity of a small-molecule inhibitor of arenavirus glycoprotein processing by the cellular site 1 protease. J.Virol. 85 795 PMID: 21068251
Olmstead (2012) Human subtilase SKI-1/S1P is a master regulator of the HCV lifecycle and a potential host cell target for developing indirect-acting antiviral agents. PLoS.Pathog. 8 e1002468 PMID: 22241994
Keywords: PF 429242, supplier, SREBP, sterol, regulatory, element, binding, proteins, inhibitors, inhibits, site, 1, proteases, S1P, serine, antivirals, PF429242, Other, Proteases, Antivirals, SREBP, SREBP, Tocris Bioscience
TocrisBioscience是一家专卖生命科学研究chemicals,peptidesandantibodies的知名品牌,其产品也广为各大药厂、大学、研究机构,超过五万名科学研究者所采用。目前,產品內容已超過一千六百種以上,並每年持續不斷的增加新的產品。目前,产品内容已超过一千六百种以上,并每年持续不断的增加新的产品。 Tocrisbioscience是位于英国布里斯托尔(Bristol)的高品质试剂提供商,共有2000多种产品,主要集中在神经科学和信号传导领域,产品类型包括小分子、多肽、抗体、配体和化合物筛选文库等,主要产品包括GPCRligands,神经传递素,离子通道调控剂,信号通路抑制剂等,这些产品被广泛选择性地用于阻断或激活生物学通路。Tocris是世界上神经科学研究领域无可争议的领导者,其生产的影响神经系统的化学物质被多次引用,这些物质很多都来自JeffWatkins(Tocris的创立人)在Bristol大学原创性的研究工作。 TocrisBioscience的主要产品包括:SmallMoleculesPeptidesAptamersControlledSubstancesCompoundLibrariesDREADDLigandsFluorescentImagingLigandSetsOptopharmacologyReagentsToxins 按照研究领域细分:CancerCardiovascularSystemEndocrinologyImmunologyNeurosciencePain&InflammationRespiratorySystem
关于Tocris高品质生命科学试剂的领先供应商超过三十年来,TocrisBioscience一直与科学家携手合作,致力于为生命科学研究提供最尖端和最具创新性的研究工具。我们了解,对于研究人员,试剂的可靠性是至关重要的,从这一点出发,我们为客户提供最高品质的产品,让您在发表研究成果时倍感自信。要了解关于Tocris的更多信息,请点击下方的图块。Tocris是Bio-Techne的分支机构,专精于生命科学领域,旗下包含多个著名品牌,如 R&DSystems、NovusBIOLOGicals、ProteinSimple 和 AdvancedCellDiagnostics。Bio-Techne汇聚众多品牌的力量,为研究人员提供全方位的产品,包括研究试剂、定量分析和蛋白质分析平台。要了解关于Bio-Techne及其旗下品牌的更多信息,请访问 bio-techne.com。Tocris职业发展环境保护活动和会议授权我们的理念我们的历史Tocris新闻
TocrisBioscience主要产品分类 1、小分子在生物科学中,小分子作为研究材料具有许多优点,它们可设计成是选择性的、有效的、水溶性的或细胞可渗透的。应用作为激动剂和GPCR的拮抗剂,以及酶抑制剂,核受体配体和离子通道调节剂。许多常用药物是小分子,不像肽和蛋白质,它们可被设计为代谢稳定和口服活性。2、肽肽是由酰胺键连接的α-氨基酸形成的链。肽通常由20种天然存在氨基酸与非天然氨基酸组成。3、对照底物对照底物包含药物或化合物,来自于英国药物生产商的前沿技术。4、毒素毒素是由活细胞或组织产生的有毒物质。5、复合笼利用光解技术,使邻近的受体配体释放,防止扩撒效应。6、光控开关配体光控开关配体是光敏感的化合物,不同波长的光应于神经元的离子通道和受体的调节,能控制神经信号的强度。7、荧光探针结合到受体或蛋白质的荧光探针使研究人员能够检测的复杂生物分子的组件,如活细胞,具有高灵敏度和选择性。Tocris也提供荧光染料、标签等。8、筛选文库9、其他试剂
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基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。即表达=转录+翻译
转录量和拷贝数是相等的(产生的RNA),但和表达量(蛋白质,最终产物)不同意思,只是表达的第一步,只有转录的也都同样顺利翻译成蛋白质才有同时满足的可能。
转录增加 不等于 表达增加表达增加 也不等于 转录增加成功转录 不代表 成功表达成功表达 说明 成功转录
遗传物质的表达的产物是:蛋白质
DNA转录的产物是:mRNA
希望对你有帮助~
生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类信号通路研究无法绕过的部分。
当面对某个基因表达调控研究时,第一个想到的研究对象是什么?没错,就是基因的启动子。通过启动子区域对基因表达进行调控是最直接有效的手段,所以也是研究基因表达调控的重点。现在的基因数据库信息丰富,拿到基因及其启动子序列非常简单。那么问题又来了,拿到启动子序列以后,下一步怎么找相关的调控蛋白/转录因子呢?生物信息学方法预测?你会得到很多可能的目标调控蛋白/转录因子,还要做实验一个一个验证。凝胶迁移(EMSA),染色质免疫共沉淀(ChIP)?只能针对已知能与启动子结合的调控蛋白/转录因子,而且还需要相应探针/抗体,对于大量筛选无能为力。
美国Signosis的转录因子(结合启动子)微孔板芯片检测试剂可以方便、高效地解决这一问题。该方法专门用于筛查与特定DNA序列(通常是含有转录因子结合位点的启动子序列)相互作用的调控蛋白/转录因子,获得目的基因的启动子序列后,使用该方法可以筛查48/96种常见的调控蛋白/转录因子与启动子序列结合情况。该方法利用转录因子与特定DNA序列结合的特点,针对每一种转录因子设计相应的生物素标记探针;当混合探针与核蛋白样本共同孵育时,探针与相应的转录因子结合形成转录因子/探针复合物;除去游离的探针,收集转录因子/探针复合物;分离复合物中的DNA探针,探针的量与转录因子含量呈正相关。在探针混合物中同时加入启动子片段,如果DNA序列中含有转录因子结合位点,就会与生物素标记的探针竞争性结合转录因子,转录因子与相应探针形成的复合物减少。通过比较有无目的基因启动子片段中转录因子探针检测差异,可以分析出与无目的基因启动子片段相互作用的转录因子种类。
这种方法可以简单、快速地在48/96种常见转录因子筛选出与目的启动子片段相互作用的调控蛋白/转录因子,从而进一步探索目的基因的表达调控。待筛选的调控蛋白/转录因子都是在生命活动中起重要通的调控蛋白/转录因子,大大方便了后续的基因表调控、信号通路及其它方面的研究。
但严格来说,还是有区别的。因为基因的表达产物包括蛋白质和RNA(rRNA和tRNA)。如果产物是蛋白质,就是转录翻译;如果产物是RNA,就只是转录过程,没有翻译过程。
这个词表示“将思想文字化”或是“用本国语言将外语抄写、誊录”
基因表达谱测序是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,可以用来研究基因的表达差异情况。该技术结合了转录组测序建库的实验方法,与转录组测序相比,基因表达谱测序要求的读长更短,测序通量更小,但仅可用于基因表达差异的研究。
转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的基因组测序,是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。
转录组测序和表达谱测序其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的物种,侧重于获得你材料的全部转录组信息;而表达谱则侧重于检测各个基因的表达量。
如题,我现在做出了一个蛋白相对于正常组织,在肿瘤里表达升高。想做某转录因子调控它的表达。查了转录因子预测的网站,每个预测的都很不一样,而且参与其调控的转录因子有几十个。我该怎么办呢?用什么实验技术或者方法能找到一个能做的呢?
转录是遗传信息由DNA转换到RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,转录是mRNA以及非编码RNA(tRNA、rRNA等)的合成步骤。是遗传信息从DNA流向RNA的过程。即以双链DNA中的确定的一条链(模板链用于转录,编码链不用于转录)为模板,以ATP、CTP、GTP、UTP四种核苷三磷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。

