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Tocris/PF 429242/3354/50/50 mg
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Tocris/PF 429242/3354/50/50 mg
品牌 / 
Tocris
货号 / 
3354/50
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4000-520-616
Description: Competitive inhibitor of SREBP site 1 protease
Chemical Name: 4-[(Diethylamino)methyl]-N-[2-(2-methoxyphenyl)ethyl]-N-(3R)-3-pyrrolidinylbenzamide
Purity: ≥97% (HPLC)
Biological Activity Technical Data Solubility Calculators Datasheets References

Biological Activity

Reversible, competitive inhibitor of sterol regulatory element-binding protein (SREBP) site 1 protease (IC50 = 0.175 μM). Selective for site 1 protease against a panel of serine proteases. Inhibits rate of cholesterol synthesis in CHO cells (IC50 = 0.53 μM). Also displays antiviral activity. Cell permeable.

Licensing Information

Sold for research purposes under agreement from Pfizer Inc.

Compound Libraries

PF 429242 is also offered as part of the Tocriscreen Plus. Find out more about compound libraries available from Tocris.

Technical Data

M. Wt 482.49
Formula C25H35N3O2.2HCl
Storage Desiccate at RT
Purity ≥97% (HPLC)
CAS Number 947303-87-9
PubChem ID 90488837
InChI Key GSUZWFZKTIOWTI-MQWQBNKOSA-N
Smiles O=C(C2=CC=C(CN(CC)CC)C=C2)N(CCC3=CC=CC=C3OC)[C@@H]1CCNC1.Cl.Cl

The technical data provided above is for guidance only. For batch specific data refer to the Certificate of Analysis.

All Tocris products are intended for laboratory research use only.

Solubility Data

Solvent Max Conc. mg/mL Max Conc. mM
Solubility
DMSO 24.12 50
ethanol 48.25 100
water 24.12 50

Preparing Stock Solutions

The following data is based on the product molecular weight 482.49. Batch specific molecular weights may vary from batch to batch due to solvent of hydration, which will affect the solvent volumes required to prepare stock solutions.

Concentration / Solvent Volume / Mass 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.07 mL 10.36 mL 20.73 mL
5 mM 0.41 mL 2.07 mL 4.15 mL
10 mM 0.21 mL 1.04 mL 2.07 mL
50 mM 0.04 mL 0.21 mL 0.41 mL

Product Datasheets

Certificate of Analysis / Product Datasheet
Safety Datasheet

References

References are publications that support the products' biological activity.

Hay et al (2007) Aminopyrrolidineamide inhibitors of site-1 protease. Bioorg.Med.Chem.Lett. 17 4411 PMID: 17583500

Hawkins et al (2008) Pharmacologic inhibition of site 1 protease activity inhibits sterol regulatory element-binding protein processing and reduces lipogenic enzyme gene expression and lipid synthesis in cultured cells and experimental animals. J.Pharmacol.Exp.Ther. 326 801 PMID: 18577702

Urata et al (2011) Antiviral activity of a small-molecule inhibitor of arenavirus glycoprotein processing by the cellular site 1 protease. J.Virol. 85 795 PMID: 21068251

Olmstead (2012) Human subtilase SKI-1/S1P is a master regulator of the HCV lifecycle and a potential host cell target for developing indirect-acting antiviral agents. PLoS.Pathog. 8 e1002468 PMID: 22241994


Keywords: PF 429242, supplier, SREBP, sterol, regulatory, element, binding, proteins, inhibitors, inhibits, site, 1, proteases, S1P, serine, antivirals, PF429242, Other, Proteases, Antivirals, SREBP, SREBP, Tocris Bioscience

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都说熬夜对身体的损害很大,但是仍然有很多“夜猫子”不顾自己的身体健康继续熬夜。大部分人以为偶尔熬夜一次,第二天多休息会儿对健康的影响不大,可事实真的是这样吗?科学证明,“夜猫子”付出的代价远比我们所认知的还要多。Uppsala 大学的 Cedernaes 教授率领他的中国、德国和悉尼同事们对所谓“偶尔一次”的熬夜进行了深入研究,试图阐明熬夜对身体伤害的根本机制。这个研究团队的研究表明,仅仅熬夜一晚就会引发组织特异性的表观遗传、基因表达定... 查看更多>
【摘要】目的:探讨BAI1mRNA表达水平与不同级别胶质瘤间的关系。方法:选取病理分级为WHOⅡ、Ⅲ、Ⅳ级脑胶质瘤标本依次为12例、12例、14例,正常脑组织标本6例;提取总RNA,用半定量RT-PCR法检测BAI1基因的转录表达情况。结果:BAI1mRNA在所有正常脑组织和26例(68.4%)胶质瘤中表达。正常脑组织的BAI1基因转录表达水平高于胶质瘤组,P<0.05;各级胶质瘤间BAI1基因转录表达水平差异没有统计学意义。结论:BA... 查看更多>
细菌引起许多严重疾病,如食物中毒和肺炎。科学家们面临的挑战是,引起疾病的细菌是非常有弹性的。比如,当诸如大肠杆菌之类的细菌经历饥饿时,它们会大规模地重新组装它们的DNA,从而使得它们能够在应激条件下存活下来。 为了实现这一壮举及提高存活机会,大肠杆菌菌株显著增加一种被称作Dps的蛋白的数量。这种蛋白将细菌DNA压缩成致密的水晶状复合物并保护其免受损伤。虽然之前的研究已表明Dps保护细菌免受饥饿和其他的应激因素,但是科学家们并不知道这种... 查看更多>
营养压力(即限制乙酰辅酶A从葡萄糖转化或乙酸酯获取),引起ACSS2在S659位点磷酸化并向核内转移。与TFEB结合的ACSS2会在溶酶体和自噬相关基因启动子区域与染色体结合,促进吸收、利用组蛋白乙酰化循环释放的乙酸脂合成乙酰辅酶A,后者驱动H3组蛋白乙酰化并活化上述基因表达。上述过程促进溶酶体生长,自噬以及脑肿瘤生长。Figure 1. ACSS2 S659 Phosphorylation by AMPK Induces Nucl... 查看更多>
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  基因表达调控如何参与生物体发育,影响人体健康?这是各国科学家竞相研究的课题。近日,南开大学生命科学学院、药物化学生物学国家重点实验室龙加福教授团队的一项研究,揭示了一种影响基因表达调控的重要蛋白质复合物——Paf1复合物组装及功能调节的奥秘。这一发现为相关肿瘤的治疗和药物开发奠定了分子基础。近日,相关论文在线发表于国际知名学术期刊 《自然·通讯》上。  酵母发酵、植物开花结果、受精卵发育成熟及人的一生过程中,细胞中的基因表达在时间、... 查看更多>
上海杏园瑞民生物工程有限公司在发布的Inflammasomes PCR Array 炎性小体基因表达PCR芯片供应信息,浏览与Inflammasomes PCR Array 炎性小体基因表达PCR芯片相关的产品或在搜索更多与Inflammasomes PCR Array 炎性小体基因表达PCR芯片相关的内容。 查看更多>
转录 - 将DNA片段读入蛋白质合成的RNA模板 - 是几乎所有细胞过程的基础,包括生长,响应刺激和繁殖。现在,怀特黑德研究所的研究人员已经完全理解了转录是如何被控制的以及转录因子在这个过程中的作用。该模式的转变,在一篇文章中在线12月7日在该杂志描述的细胞,铰链上起着关键作用的小蛋白质的基因组结构,给了我们新的见解在转录和基因表达的变化控制如何导致疾病。转录有几个重要的参与者,必须在正确的时间在正确的地方:转录机制,转录因子,启动子和增强子。根据现有模型,转录因子是与基因组的增强子区 查看更多>
大约15亿年前,小小的游客来到细胞内,后来演变成所有的植物和动物 - 包括人类。.这些访客是线粒体,小细胞器,其突出的作用是产生90%的化学能细胞需要存活。从进化的角度来说,人类,动物和植物因此是两种生物的组合。线粒体有自己的DNA,但人类线粒体中的13个基因 - 以及tRNA,rRNA和一些小肽的DNA序列 - 大大超过人类核中的20,000个基因。然而,根据伯明翰阿拉巴马大学病理学教授斯科特巴林格博士的初步研究,这些细小的线粒体可能对细胞代谢和对心力衰竭或肥胖等代谢性疾病的易感性产生强烈影响 查看更多>
RT2 PCR Profiler Arrays可用于生物学和医学研究的各个领域,包括:癌症研究、炎症和细胞因子分析、干细胞研究、神经生物学、信号转导通路研究、细胞黏附和细胞迁移、生物标记分子筛选和验证, 查看更多>
小鼠被广泛用于模拟人类代谢、疾病和药物应答,是医学研究中的一个基本工具。然而斯坦福大学的研究团队指出,人类和小鼠的基因表达存在着惊人的差异,不论是蛋白编码基因还是非编码基因。这项研究发表在十一月十七日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。Michael Snyder及其同事在15种组织中比较了人类和小鼠的基因表达情况,包括大脑、心脏、肝脏、肾脏等等。他们发现,物种间的基因表达差异要大于组织间的差异。举例来说,小鼠肝脏与人类肝脏基因表达的相... 查看更多>
转录(transcription) 也称为RNA 的生物合成,是以DNA 的一条链为模板,在DNA依赖的R NA 聚合酶( RNA polymerase) 催化下,以4 种NTP( ATP、CTP、GTP 和UTP)为原料,按碱基配对的方式合成一条RNA 分子的过程。对于有些RNA 病毒,RNA 也可以指导合成RNA。... 查看更多>
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比较转录和复制的异同点_123
栤葑惡魔2018-02-27
表达包括转录和翻译
蛋白质在细胞中的丰度变化很大程度上决定了不同组织如脑和肌肉,以及健康和不健康人类细胞之间的差异。长期以来人们都认为转录,这一控制遗传信息从DNA流向RNA的过程,对决定细胞内蛋白质的数量起主导作用。但在过去的十年里,有许多的研究则提出RNA翻译为蛋白质的速度差异是一个更为重要的因素。
近期发表在《科学》(Science)以及其他杂志上的一些新研究证实,转录实际上是决定蛋白质丰度中最具影响力的步骤。
例如,近期来自哈佛-麻省理工Broad研究所的Marko Jovanovic等在Science杂志上发表文章,称检测了处于稳定状态和响应细菌脂多糖(LPS)时的小鼠骨髓树突细胞。他们发现在稳定状态时,mRNA水平、翻译速度和蛋白质降解速度可分别解释68%、26%和8%的蛋白质表达差异。当用LPS刺激细胞时,mRNA水平似乎可以解释90%的蛋白质表达差异,而翻译和蛋白质降解只能解释4%和6%的差异。Jovanovic等发现,在LPS处理的情况下,核糖体、线粒体以及其他一些高表达管家蛋白的翻译和蛋白质降解速度发生了更多改变,表明这两个步骤在控制一些过程中发挥了重要的作用。
来自加州大学洛杉矶分校统计学和人类遗传学助理教授Jingyi Jessica Li,和劳伦斯伯克利国家实验室的Mark Biggin,则在PeerJ杂志的一篇论文中用两种方法重新分析了2011年一项Nature研究的数据,说明了一些检测错误。他们证实采用第一种方法结果表明mRNA水平差异可以解释最小56%的蛋白质水平差异,而第二种方法表明mRNA水平可以解释84%的蛋白质表达差异,其中转录占73%,RNA降解占11%,而翻译和蛋白质降解各自仅占8%。
在3月6日,发表在Science杂志上的一篇题为“Statistics requantitates the central dogma”的文章中,Li和Biggin综述了上述这些近期的研究,得出了转录是蛋白质丰度最大贡献者这一结论。他们认为,他们自身以及近期其他一些研究工作都采用了更细致的统计学方法,来评估或是减少了实验性检测错误。Li和Biggin认为,早期的一些研究得到的有关翻译影响的结果实际上是由于实验错误所导致。
研究人员提出,科学家们精确地模拟基因表达需要采用更准确的测量和分析方法。他们的研究对于鉴别出可以有效治疗各种疾病的药物具有重要的影响。
原文链接:Statistics requantitates the central dogma
Dynamic profiling of the protein life cycle in response to pathogens
翻译,基因表达调控123
爪机粉丝008B22021-07-30
这句话翻译成英文是:Genes are expressed by transcription and translation, and what controls transcription
本人最近在用双向电泳技术研究一种细菌(H)不同血清型的两个菌株(H1和H2)的分泌蛋白差异,结果经双向电泳筛选出一些差异蛋白。之后挑取其中二个差异蛋白利用实时荧光定量PCR相对定量方法分析其转录水平。结果发现这两个蛋白在菌株H1的表达量远低于在菌株H2的表达,但是荧光定量PCR分析发现这两个蛋白的转录水平菌株H1是菌株H2的五十倍,现在正为此事烦恼,哪位高人能给些指点呢?

生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类信号通路研究无法绕过的部分。

当面对某个基因表达调控研究时,第一个想到的研究对象是什么?没错,就是基因的启动子。通过启动子区域对基因表达进行调控是最直接有效的手段,所以也是研究基因表达调控的重点。现在的基因数据库信息丰富,拿到基因及其启动子序列非常简单。那么问题又来了,拿到启动子序列以后,下一步怎么找相关的调控蛋白/转录因子呢?生物信息学方法预测?你会得到很多可能的目标调控蛋白/转录因子,还要做实验一个一个验证。凝胶迁移(EMSA),染色质免疫共沉淀(ChIP)?只能针对已知能与启动子结合的调控蛋白/转录因子,而且还需要相应探针/抗体,对于大量筛选无能为力。

美国Signosis的转录因子(结合启动子)微孔板芯片检测试剂可以方便、高效地解决这一问题。该方法专门用于筛查与特定DNA序列(通常是含有转录因子结合位点的启动子序列)相互作用的调控蛋白/转录因子,获得目的基因的启动子序列后,使用该方法可以筛查48/96种常见的调控蛋白/转录因子与启动子序列结合情况。该方法利用转录因子与特定DNA序列结合的特点,针对每一种转录因子设计相应的生物素标记探针;当混合探针与核蛋白样本共同孵育时,探针与相应的转录因子结合形成转录因子/探针复合物;除去游离的探针,收集转录因子/探针复合物;分离复合物中的DNA探针,探针的量与转录因子含量呈正相关。在探针混合物中同时加入启动子片段,如果DNA序列中含有转录因子结合位点,就会与生物素标记的探针竞争性结合转录因子,转录因子与相应探针形成的复合物减少。通过比较有无目的基因启动子片段中转录因子探针检测差异,可以分析出与无目的基因启动子片段相互作用的转录因子种类。

这种方法可以简单、快速地在48/96种常见转录因子筛选出与目的启动子片段相互作用的调控蛋白/转录因子,从而进一步探索目的基因的表达调控。待筛选的调控蛋白/转录因子都是在生命活动中起重要通的调控蛋白/转录因子,大大方便了后续的基因表调控、信号通路及其它方面的研究。



请教各位,我是做在体实验,在体给予刺激30分钟后观察蛋白的表达变化,结果是蛋白表达升高,但有人质疑30分钟这么短的时间能否真的引起蛋白表达的明显变化,所以请教各位,一般蛋白从转录到表达需要多长时间?

遗传物质的表达过程包括:转录和翻译两个过程
遗传物质的表达的产物是:蛋白质
DNA转录的产物是:mRNA
希望对你有帮助~
我想研究转录因子A对B物质表达有无影响,先构建转录因子A的真核表达载体和含B物质全长启动子区的荧光素酶报告质粒,那么转染时细胞是否加1.A表达载体 2.B荧光素酶报告质粒 3.作为reference的内参质粒?请教有哪位高手做过?可以这么做吗?
转录组分析概述123
杀生丸EIO2018-02-26
转录组是指某个物种或特定细胞在某一生理功能状态下,细胞内所有转录的mRNA产物的集合,包含了时间和空间的限定,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带。转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。
  应用高通量技术进行转录组测序是一种快捷可靠的获取转录组信息的方法。mRNA的转录本表达分析,通过获得研究对象基因组转录区域的信息,鉴定转录发生位点,可变剪切等,其精确的计数方法更可对基因进行精确的定量分析。
transcribe
这个词表示“将思想文字化”或是“用本国语言将外语抄写、誊录”
转录组数据中,RPKM是Reads Per Kilo bases per Million reads的缩写,代表每百万reads中来自于某基因每千碱基长度的reads数。

转录是遗传信息由DNA转换到RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,转录是mRNA以及非编码RNA(tRNA、rRNA等)的合成步骤。是遗传信息从DNA流向RNA的过程。即以双链DNA中的确定的一条链(模板链用于转录,编码链不用于转录)为模板,以ATP、CTP、GTP、UTP四种核苷三磷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。
某种转录因子有四种不同的亚型(N1N2N3N4),我想检测它们在某种细胞内的表达情况,能不能提取这种细胞的蛋白,然后跑western,通过敷育四种对应的抗体最后来确认哪种亚型表达得多,哪种亚型表达得少呀?我做了三次western,结果在对应的分子量区域都没有呈现条带出来!有前辈说这样做是无意义的,因为细胞可能对不同抗体的敏感性不同,所以跑western时用一种样本分别敷四种抗体的话是没有可比性的。真的是这样吗?我看文献里也有人做不同蛋白亚型在组织中的表达,他们能做出来条带。求各路大神指点啊!(抱拳)
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