WNT信号通路基因表达PCR芯片可用于研究与WNT介导的信号转导相关的84个基因的表达，同时测定实验组样本中经典的WNT/β-catenin信号通路活性是被激活，抑制还是没有变化。该芯片同时包含了16个通过实验验证得到的显著标志基因，通过分级运算程序可计算得到活性分值。每块芯片上都设定了一组对照通过ΔΔCT方法分别对反转效率，基因组DNA含量和PCR效率进行评估。使用该芯片研究者即能够利用该芯片简单可靠地测定经典WNT/β-catenin信号通路活性并同时检测WNT介导的信号转导相关基因的表达。
WNTSignalingPathways:Canonical:APC,AXIN1,AXIN2,CSNK1A1,CTBP1,CTNNB1,CTNNBIP1(ICAT),DKK1,DKK3,DVL1,DVL2,EP300,F1,FZD1,FZD2,FZD3,FZD4,FZD5,FZD6,FZD7,FZD8,FZD9,GSK3B,LEF1,LRP5,LRP6,NKD1,PORCN,RUVBL1,SFRP1,SFRP4,SKP2,SOX17,TCF7,TCF7L1,WIF1,WNT1,WNT10A,WNT2,WNT2B,WNT3,WNT3A,WNT4,WNT6,WNT7A,WNT7B,WNT8A.
PlanarCellPolarity(PCP):DAAM1,DVL1,DVL2,MAPK8(JNK1),NKD1,PRICKLE1,RHOA,VANGL2,WNT9A.
WNT/Ca+2:FZD2,NFATC1,WNT1,WNT10A,WNT11,WNT2,WNT2B,WNT3,WNT3A,WNT4,WNT5A,WNT5B,WNT6,WNT7A,WNT7B,WNT8A,WNT9A.
WNTSignalingNegativeRegulation:APC,AXIN1,AXIN2,BTRC(bTrCP),CCND1,CTBP1,CTNNBIP1(ICAT),DKK1,DKK3,FBXW11,FRZB(FRP-3),KREMEN1,LRP6,NLK,NKD1,SFRP1,SFRP4,SOX17,WIF1.
WNTSignalingTargetGenes:AXIN2,BTRC(bTrCP),CCND1,CCND2,DAB2,FOSL1(FRA-1),JUN,MMP7,MYC,PITX2,PPARD,WISP1.
DevelopmentalProcesses:CellFate:CTNNB1,
DKK1,WNT1,WNT3,WNT3A.
TissuePolarity:AXIN2,FZD2,FZD3,FZD5,FZD6,VANGL2.
CellGrowth&Prolifeion:APC,CCND1,CCND2,CTBP1,CTNNB1,CTNNBIP1(ICAT),DAB2,EP300,FGF4,FOSL1,FZD3,JUN,LRP5,MMP7,MYC,PPARD,WISP1,WNT3A.
CellMigion:APC,DKK1,LRP5,LRP6,RHOA,WNT1.
CellCycle:APC,BTRC(bTrCP),CCND1,CCND2,CTNNB1,EP300,FOSL1,JUN,MYC,RHOA,RUVBL1,TCF7L1.
CellularHomeostasis:APC,FZD2,JUN,MYC.
PathwayActivitySignatureGenes:BOD1,CALM1,CCND1,CCND2,CHSY1,CXADR,CYP4V2,HSPA12A,LEF1,MT1A,MTFP1,MTSS1,MYC,NAV2,PRMT6,SKP2.