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实验材料 | 核酸酶 试剂、试剂盒 | ATPCTPGTPMUTPEDTANaCl甲酰胺Tris-HClRNaseARNaseT1RNasinDTTUTPT7RNA聚合酶DNaseⅠ饱和酚氯仿酵母tRNANaAc无水乙醇SDS蛋白酶K异丙醇丙烯酰胺亚甲双丙烯酰胺TBE尿素过硫酸胺TEMED 仪器、耗材 | 低温离心机恒温培养箱恒温水浴锅电泳仪保鲜膜 实验步骤 | 1. 在一个高压过的微量离心管中建立20μl的反应复合物如下: (1)4μl 5×转录缓冲液 (2)1μl 200mmol/的3NTP混合液 (3)10μl [α-32P]CTP (4)1μl 胎盘核酸酶抑制剂 (5)1μl 1mg/ml模板DNA (6)1μl 噬菌体RNA聚合酶 (7)SP6RNA聚合酶反应时在40℃保温30~60min。采用T7或T3RNA聚合酶则在37℃温育。 2. 加人5μg或10U无RNA酶的酶I,37℃温育15min。 3. 加入2μl10mg/ml的tRNA,补水至50μl,以酚/氯仿/异戊酵抽提。 4. 水相加入200μl,2.5mol/l 乙酸铵和750μl无水乙醇,混匀后在冰浴饭置15min,于4℃在微量离心机中离心15min。 5. 重溶于50μl水,按第4步操作所述重新沉淀两次,最后得到的沉淀以75%乙醇/25%0.1mol/lpH5.2的乙酸钠缓冲液洗涤,晾干沉淀并溶解于100μl杂交液,取1μl计数。 6. RNA以乙醇沉淀,并溶解于30μl含5×105cpmRNA探针的杂交液中,于85℃加热变性5min,移至设定的杂交温度(30~60℃),温育8h以上。 7. 加入350μl含40μg/ml的核酸酶A和2μg/ml核酸酶T1的核酸酶消化缓冲液,于30℃温育30~60min。 8. 加入10μl20%SDS和2.5μl20μg/ml的蛋白酶K,37℃温育30~60min。 9. 用400μl酚/氯仿/异戊醇抽提,水相移入含1μl10mg/mltRNA的离心管中,加入1ml乙醇沉淀,晾干后溶解于3~5μlRNA加样缓冲液中。 10. 于85℃加热变性3min,在变性的聚丙烯酰胺/尿素凝胶(序列胶)中电泳,用增感屏放射自显影过夜,分析结果。 |
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发布于 : 2018-08-10
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