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2021-07-27
Accuracy of manual counts with an hemacytometer depend on: accurate mixing of the sample (no bubbles!) number of chambers counted number of cells counted (prac 查看更多
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The estrogen-inducible RING finger protein Efp stimulates proliferation of breast cancer cells. 14-3-3 is p53-inducible protein that sequesters mitotic Cdks in 查看更多
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2021-08-01
CTCF is central to signaling pathways in immature B cells elicited by cross-linking the Ig BCR and stimulation with TGF?. Both stimuli result in induction of c 查看更多
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2021-07-28
This is a microscopy based application for definitive discrimination of live and dead cells. Trypan Blue exclusion notoriously over estimates the number of dea 查看更多
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2021-09-18
Activation of the MAPK kinase pathway has been identified as a mechanism that integrins use to regulate gene expression leading to cell shape changes during ce 查看更多
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Cdc25isaproteinphosphataseresponsIBLefordephosphorylatingandactivatingcdc2,acrucialstepinregulatingtheentryofalleukaryoticcellsintotheM-phaseofthecellcycle.Cdc25isphosphorylatedthroughoutinterphasebutnotinmitosis.Theprimarysiteforphosphorylationofcdc25isa 查看更多
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2021-07-22
A hemacytometer (also spelled hemocytometer) is an etched glass chamber with raised sides that will hold a quartz coverslip exactly 0.1 mm above the chamber fl 查看更多
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2018-12-26
IL-5 is an inflammatory signaling molecule that primarily stimulates eosinophil proliferation, maturation and activation. Eosinophils are leukocytes involved i 查看更多
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2021-09-06
The mammalian calpain gene family curently contains 13 distinct large subunit products most of which complex with one of two smaller 30kDa subunits. ( An exce 查看更多
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2018-12-26
Inflammation is a complex response involving many different cells and signaling molecules, including the secretion of the cytokine IL-17 by activated T cells. 查看更多
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2021-07-20
信号通路是指当细胞里要发生某种反应时，信号从细胞外到细胞内传递了一种信息，细胞要根据这种信息来做出反应的现象。信号通路（signal pathway）的提出最早可以追溯到1972年，不过那时被称为信号转换（signal transmission）。1980年，M. Rodbell在一篇综述中提到信号转导（signal transduction），此后这个概念... 查看更多
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2021-09-20
Interactions between cells responsible for cell to cell adhesion also can communicate signals into the cellular interior, often involving interactions with cyt 查看更多
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【求助】信号通路和信号转导有区别吗? 实验方法 123
zhengrp20102018-01-16
【1】信号转导更大一点，包括分子结构调节、活性调节、蛋白表达等等。信号通路是信号转导的具体过程，从上游到下游。
【2】信号：信号是数据的电磁编码或电子编码。和数据一样，信号也分为模拟信号和数字信号。模拟信号是指电信号的参量是连续取值的，其特点是幅度连续。常见的模拟信号有电话、传真和电视信号等。数字信号是离散的，从一个值到另一个值的改变是瞬时的，就像开启和关闭电源一样。数字信号的特点是幅度被限制在有限个数值之内。常见的数字信号有电报符号、数字数据等。信号是运载消息的工具，是消息的载体。从广义上讲，它包含光信号、声信号和电信号等。
【2】信号：信号是数据的电磁编码或电子编码。和数据一样，信号也分为模拟信号和数字信号。模拟信号是指电信号的参量是连续取值的，其特点是幅度连续。常见的模拟信号有电话、传真和电视信号等。数字信号是离散的，从一个值到另一个值的改变是瞬时的，就像开启和关闭电源一样。数字信号的特点是幅度被限制在有限个数值之内。常见的数字信号有电报符号、数字数据等。信号是运载消息的工具，是消息的载体。从广义上讲，它包含光信号、声信号和电信号等。
细胞信号通路图软件|信号通路绘图软件(Pathway Builder Tool)下载v...123
胡雅彬2018-02-09
http://www.proteinlounge.com/Default.aspx
pathwaybuild
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简述细胞信号转导的几条通路?123
炎岩夏日2018-02-08
学期考试复习题，哪位能帮助解答一下，条例清晰全面，内容精练。
【资源】"这边的战友看过来"很有价值的信号通路分析平台方法! ...123
kaige882021-07-20
偶然读到张新宇兄"生物信息学在肿瘤研究中的应用"PPT,发现其中对信号通路的论述很有启发,特奉献给细胞信号转导讨论版爱好者:
细胞信号转导分析的生物信息学方法:
a)选择关键词，从GO数据库中寻找相关基因，比如extracellular表示为分泌蛋白
b)通过GO,BioCarta和Kegg信号通路数据分析给定基因所属的信号通路，功能分类等
c)比较多组基因按功能，通路分组在统计学上的差异，从而得到各组基因的功能差异
d)新信号通路的分析
回复：【资源】很有价值的信号通路分析平台方法!-丁香园论坛
细胞信号转导分析的生物信息学方法:
a)选择关键词，从GO数据库中寻找相关基因，比如extracellular表示为分泌蛋白
b)通过GO,BioCarta和Kegg信号通路数据分析给定基因所属的信号通路，功能分类等
c)比较多组基因按功能，通路分组在统计学上的差异，从而得到各组基因的功能差异
d)新信号通路的分析
回复：【资源】很有价值的信号通路分析平台方法!-丁香园论坛
为什么信号通路的研究大部分都在癌细胞系上 大家是如何绕过 癌 来...123
一只实验室小猫2017-10-20
大家好,
我是今年刚毕业找到一份实验室研究工作的小猫,以前常作蛋白合成和分子克隆的,新实验室的老板想要研究些信号通路问题,具体就是研究一个病毒的致病途径是什么,定了大方向后我就扎到了文献的海洋中,可是越看就越有一个问题不明白.
就是我能找到的几乎所有文章,都是用的癌细胞做的模型,比如说hela,就是乳头瘤,293,就是肾瘤,还有SH5Y,就是神经瘤.我不太懂,就是病毒感染人的时候,不是感染的正常细胞吗,用病毒来感染癌细胞,然后在这些癌细胞中检测病毒的作用阿，信号通路之类的，要怎么绕过癌细胞其实和正常细胞不一样这个问题呢？
我看大部分文献都不在这方面作解释说明，仿佛都是约定俗成的用癌细胞，我对信号通路研究也是啥都不懂，两眼抹黑，求各路大神赐教ORZ
哪种神经细胞适合研究信号通路?PC12? HT22 ?SHSY5Y? 神经生物...123
一水之隔far2017-12-20
请问哪种神经细胞可以代替原代海马神经元培养细胞？PC12?HT-22?SH-SY5Y?BV-2一般都适用于什么模型，大家一般用哪个呢
信号通路中候选靶点的选择123
for52017-09-20
跑电泳NFkB信号通路,p65 和 IkBα 结果不一致 蛋白质和糖学...123
陌然浅笑0002021-07-23
我最近跑电泳NF-kB信号通路，跑了p65和IkB-α两个蛋白，p65显影的时候有结果，但是IkB-α显示的时候是没有条带，空白一片，我跑电泳的条件不变、蛋白样品也是相同的，但是一个有结果，一个没有结果，请问原因是什么，请大神帮忙解答一下，谢谢啦~~
wnt信号通路图 WNT信号通路123
dentist922017-11-22
如题，实验小白，但是导师给了这个课题，对于这通路不是很了解，园子里也没找到关于非经典通路的，希望各位战友帮忙下，谢谢了
求教nfkb信号通路方面的问题 细胞生物学和信号转导版论坛123
迷途中寻找归途2017-11-21
请问nf-kb被激活后其上游的TNRF,TAk1,RIP水平会升高吗？用什么方法测最好。有叮当奖励，求各位大神帮帮忙
细胞信号通路研究方法 信号通路研究思路123
2018-02-04
一种生物效应的出现往往存在多条信号通路的同步活化，可逆的磷酸化修饰反应则是细胞内部最为普遍和节能的信号蛋白活化调节方式。因此，找到激活的信号通路乃至发生磷酸化调变的通路蛋白，往往成生命科学研究的起点。
通常来说，整条信号通路上下游的关键信号蛋白很多，所以做信号通路变化的话，建议您用高通量的蛋白芯片技术对信号通路磷酸化水平进行检测。针对多条信号通路变化检测，可以选择信号通路磷酸化广谱筛选抗体芯片（PEX100），一次芯片实验即可实现多条信号通路的同步筛选和具体调变位点的清晰定位，为后续生物现象的深入探索提供明确的研究方向。针对单条信号通路，如MAPK，p53, mTOR等，同样有相对应的芯片产品，好像有个华盈生物，专门做蛋白芯片的，你可以咨询一下。 祝好。
通常来说，整条信号通路上下游的关键信号蛋白很多，所以做信号通路变化的话，建议您用高通量的蛋白芯片技术对信号通路磷酸化水平进行检测。针对多条信号通路变化检测，可以选择信号通路磷酸化广谱筛选抗体芯片（PEX100），一次芯片实验即可实现多条信号通路的同步筛选和具体调变位点的清晰定位，为后续生物现象的深入探索提供明确的研究方向。针对单条信号通路，如MAPK，p53, mTOR等，同样有相对应的芯片产品，好像有个华盈生物，专门做蛋白芯片的，你可以咨询一下。 祝好。
Nat Commun:北京大学陶伟课题组揭示表观遗传信号通路在细胞衰老和...123
顿官2018-02-04
1 JAK-STAT信号通路
1) JAK与STAT蛋白
JAK-STAT信号通路是近年来发现的一条由细胞因子刺激的信号转导通路，参与细胞的增殖、分化、凋亡以及免疫调节等许多重要的生物学过程。与其它信号通路相比，这条信号通路的传递过程相对简单，它主要由三个成分组成，即酪氨酸激酶相关受体、酪氨酸激酶JAK和转录因子STAT。
(1) 酪氨酸激酶相关受体（tyrosine kinase associated receptor）
许多细胞因子和生长因子通过JAK-STAT信号通路来传导信号，这包括白介素2?7（IL-2?7）、GM-CSF（粒细胞/巨噬细胞集落刺激因子）、GH（生长激素）、EGF（表皮生长因子）、PDGF （血小板衍生因子）以及IFN（干扰素）等等。这些细胞因子和生长因子在细胞膜上有相应的受体。这些受体的共同特点是受体本身不具有激酶活性，但胞内段具有酪氨酸激酶JAK的结合位点。受体与配体结合后，通过与之相结合的JAK的活化，来磷酸化各种靶蛋白的酪氨酸残基以实现信号从胞外到胞内的转递。
(2) 酪氨酸激酶JAK（Janus kinase）
很多酪氨酸激酶都是细胞膜受体，它们统称为酪氨酸激酶受体（receptor
tyrosine kinase, RTK），而JAK却是一类非跨膜型的酪氨酸激酶。JAK是英文Janus kinase的缩写，Janus在罗马神话中是掌管开始和终结的两面神。之所以称为两面神激酶，是因为JAK既能磷酸化与其相结合的细胞因子受体，又能磷酸化多个含特定SH2结构域的信号分子。JAK蛋白家族共包括4个成员：JAK1、JAK2、JAK3以及Tyk2，它们在结构上有7个JAK同源结构域（JAK homology domain, JH），其中JH1结构域为激酶区、JH2结构域是“假”激酶区、JH6和JH7是受体结合区域。
(3) 转录因子STAT（signal transducer and activator of transcription） STAT被称为“信号转导子和转录激活子”。顾名思义，STAT在信号转导和转录激活上发挥了关键性的作用。目前已发现STAT家族的六个成员，即STAT1-STAT6。STAT蛋白在结构上可分为以下几个功能区段：N-端保守序列、DNA结合区、SH3结构域、SH2结构域及C-端的转录激活区。其中，序列上最保守和功能上最重要的区段是SH2结构域，它具有与酪氨酸激酶Src的SH2结构域完全相同的核心序列“GTFLLRFSS”。
2) JAK-STAT信号通路
与其它信号通路相比，JAK-STAT信号通路的传递过程相对简单。信号传递过程如下：细胞因子与相应的受体结合后引起受体分子的二聚化，这使得与受体偶联的JAK激酶相互接近并通过交互的酪氨酸磷酸化作用而活化。JAK激活后催化受体上的酪氨酸残基发生磷酸化修饰，继而这些磷酸化的酪氨酸位点与周围的氨基酸序列形成“停泊位点”（docking site），同时含有SH2结构域的STAT蛋白被招募到这个“停泊位点”。最后，激酶JAK催化结合在受体上的STAT蛋白发生磷酸化修饰，活化的STAT蛋白以二聚体的形式进入细胞核内与靶基因结合，调控基因的转录。值得一提的是，一种JAK激酶可以参与多种细胞因子的信号转导过程，一种细胞因子的信号通路也可以激活多个JAK激酶，但细胞因子对激活的STAT分子却具有一定的选择性。例如IL-4激活STAT6，而IL-12却特异性激活STAT4。
2 p53信号
1) p53基因的发现
p53基因是迄今发现与肿瘤相关性最高的基因。1979年，Lane和Crawford在感染了SV40的小鼠细胞内分离获得一个与SV40大T抗原相互作用的蛋白，因其分子量为53 kDa，故而取名为p53（人的基因称为TP53）[3]。起初，p53被误认为是癌基因，直到上个世纪90年代，人们才认识到引起肿瘤形成或细胞癌变的p53蛋白是p53基因的突变产物。野生型p53基因是一种重要的抑癌基因，它是细胞生长周期中的负调节因子，在细胞周期调控、DNA损伤修复、细胞分化、凋亡和衰老等许多过程中发挥了重要的生物学功能，因而被誉为“细胞卫士”。随着研究的深入，人、猴、鸡、大鼠、非洲爪蟾和斑马鱼等多种模式动物的p53基因也相继被克隆。
其中，人类TP53基因定位于染色体17P13.1，小鼠p53基因被定位在11号染色体上，并在14号染色体上发现无功能的假基因。在这些进化程度迥异的动物中，它们的p53基因结构却异常保守，基因全长16-20kb，都由11个外显子和10个内含子组成。其中第1个外显子不编码结构域，外显子2、4、5、7、8则分别编码5个进化上高度保守的结构域，转录形成约2.5 kb的mRNA。之后，在基因同源性的基础上又陆续发现了p53家族的其它成员，分别是p73和p63，它们也因各自的分子量而得名，具有和p53相似的结构和功能。
2) p53信号通路
p53基因受多种信号因子的调控。例如：当细胞中的DNA损伤或细胞增殖异常时，p53基因被激活，导致细胞周期停滞并启动DNA修复机制，使损伤的DNA得以修复。然而，当DNA损伤过度而无法被修复时，作为转录因子的p53还可进一步激活下游促凋亡基因的转录，诱导细胞凋亡并杀死有DNA损伤的细胞。不然，这些DNA损伤的细胞就可能逐渐脱离正常的调控，有可能最终形成肿瘤。
虽然正常状态下p53的mRNA水平很高，而且有大量蛋白质合成，但p53蛋白容易降解，所以正常细胞内p53蛋白水平很低。蛋白的泛素化（ubiquitination）修饰是细胞内蛋白代谢过程中的最普通的降解方式，p53蛋白的降解也是通过泛素化来实现的。MDM2是一种特异性针对p53的泛素化E3连接酶，它可直接与p53蛋白结合来促进p53蛋白的泛素化降解，并在细胞内p53蛋白动态平衡中发挥关键的作用。MDM2本身也可被p53蛋白激活，因此MDM2是p53通路中重要的负反馈调节因子（negative feedback regulator）。
1) JAK与STAT蛋白
JAK-STAT信号通路是近年来发现的一条由细胞因子刺激的信号转导通路，参与细胞的增殖、分化、凋亡以及免疫调节等许多重要的生物学过程。与其它信号通路相比，这条信号通路的传递过程相对简单，它主要由三个成分组成，即酪氨酸激酶相关受体、酪氨酸激酶JAK和转录因子STAT。
(1) 酪氨酸激酶相关受体（tyrosine kinase associated receptor）
许多细胞因子和生长因子通过JAK-STAT信号通路来传导信号，这包括白介素2?7（IL-2?7）、GM-CSF（粒细胞/巨噬细胞集落刺激因子）、GH（生长激素）、EGF（表皮生长因子）、PDGF （血小板衍生因子）以及IFN（干扰素）等等。这些细胞因子和生长因子在细胞膜上有相应的受体。这些受体的共同特点是受体本身不具有激酶活性，但胞内段具有酪氨酸激酶JAK的结合位点。受体与配体结合后，通过与之相结合的JAK的活化，来磷酸化各种靶蛋白的酪氨酸残基以实现信号从胞外到胞内的转递。
(2) 酪氨酸激酶JAK（Janus kinase）
很多酪氨酸激酶都是细胞膜受体，它们统称为酪氨酸激酶受体（receptor
tyrosine kinase, RTK），而JAK却是一类非跨膜型的酪氨酸激酶。JAK是英文Janus kinase的缩写，Janus在罗马神话中是掌管开始和终结的两面神。之所以称为两面神激酶，是因为JAK既能磷酸化与其相结合的细胞因子受体，又能磷酸化多个含特定SH2结构域的信号分子。JAK蛋白家族共包括4个成员：JAK1、JAK2、JAK3以及Tyk2，它们在结构上有7个JAK同源结构域（JAK homology domain, JH），其中JH1结构域为激酶区、JH2结构域是“假”激酶区、JH6和JH7是受体结合区域。
(3) 转录因子STAT（signal transducer and activator of transcription） STAT被称为“信号转导子和转录激活子”。顾名思义，STAT在信号转导和转录激活上发挥了关键性的作用。目前已发现STAT家族的六个成员，即STAT1-STAT6。STAT蛋白在结构上可分为以下几个功能区段：N-端保守序列、DNA结合区、SH3结构域、SH2结构域及C-端的转录激活区。其中，序列上最保守和功能上最重要的区段是SH2结构域，它具有与酪氨酸激酶Src的SH2结构域完全相同的核心序列“GTFLLRFSS”。
2) JAK-STAT信号通路
与其它信号通路相比，JAK-STAT信号通路的传递过程相对简单。信号传递过程如下：细胞因子与相应的受体结合后引起受体分子的二聚化，这使得与受体偶联的JAK激酶相互接近并通过交互的酪氨酸磷酸化作用而活化。JAK激活后催化受体上的酪氨酸残基发生磷酸化修饰，继而这些磷酸化的酪氨酸位点与周围的氨基酸序列形成“停泊位点”（docking site），同时含有SH2结构域的STAT蛋白被招募到这个“停泊位点”。最后，激酶JAK催化结合在受体上的STAT蛋白发生磷酸化修饰，活化的STAT蛋白以二聚体的形式进入细胞核内与靶基因结合，调控基因的转录。值得一提的是，一种JAK激酶可以参与多种细胞因子的信号转导过程，一种细胞因子的信号通路也可以激活多个JAK激酶，但细胞因子对激活的STAT分子却具有一定的选择性。例如IL-4激活STAT6，而IL-12却特异性激活STAT4。
2 p53信号
1) p53基因的发现
p53基因是迄今发现与肿瘤相关性最高的基因。1979年，Lane和Crawford在感染了SV40的小鼠细胞内分离获得一个与SV40大T抗原相互作用的蛋白，因其分子量为53 kDa，故而取名为p53（人的基因称为TP53）[3]。起初，p53被误认为是癌基因，直到上个世纪90年代，人们才认识到引起肿瘤形成或细胞癌变的p53蛋白是p53基因的突变产物。野生型p53基因是一种重要的抑癌基因，它是细胞生长周期中的负调节因子，在细胞周期调控、DNA损伤修复、细胞分化、凋亡和衰老等许多过程中发挥了重要的生物学功能，因而被誉为“细胞卫士”。随着研究的深入，人、猴、鸡、大鼠、非洲爪蟾和斑马鱼等多种模式动物的p53基因也相继被克隆。
其中，人类TP53基因定位于染色体17P13.1，小鼠p53基因被定位在11号染色体上，并在14号染色体上发现无功能的假基因。在这些进化程度迥异的动物中，它们的p53基因结构却异常保守，基因全长16-20kb，都由11个外显子和10个内含子组成。其中第1个外显子不编码结构域，外显子2、4、5、7、8则分别编码5个进化上高度保守的结构域，转录形成约2.5 kb的mRNA。之后，在基因同源性的基础上又陆续发现了p53家族的其它成员，分别是p73和p63，它们也因各自的分子量而得名，具有和p53相似的结构和功能。
2) p53信号通路
p53基因受多种信号因子的调控。例如：当细胞中的DNA损伤或细胞增殖异常时，p53基因被激活，导致细胞周期停滞并启动DNA修复机制，使损伤的DNA得以修复。然而，当DNA损伤过度而无法被修复时，作为转录因子的p53还可进一步激活下游促凋亡基因的转录，诱导细胞凋亡并杀死有DNA损伤的细胞。不然，这些DNA损伤的细胞就可能逐渐脱离正常的调控，有可能最终形成肿瘤。
虽然正常状态下p53的mRNA水平很高，而且有大量蛋白质合成，但p53蛋白容易降解，所以正常细胞内p53蛋白水平很低。蛋白的泛素化（ubiquitination）修饰是细胞内蛋白代谢过程中的最普通的降解方式，p53蛋白的降解也是通过泛素化来实现的。MDM2是一种特异性针对p53的泛素化E3连接酶，它可直接与p53蛋白结合来促进p53蛋白的泛素化降解，并在细胞内p53蛋白动态平衡中发挥关键的作用。MDM2本身也可被p53蛋白激活，因此MDM2是p53通路中重要的负反馈调节因子（negative feedback regulator）。
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