Overview
Induce chromatin loop formation using the CLOuD9 Gene Expression Regulation System
Already included in SBI’s exclusive CLOuD9 Gene Expression Regulation Kit, CLOuD9 Inducer Reagent is also available separately from the kit. Learn more about the CLOuD9 Gene Expression Regulation Kit—introduced in a recent Nature Communications paper1—by visiting the product page.
CLOuD9 for Chromatin Loop Reorganization using CRISPR-dCas9:
- Innovative—leverage the simplicity of CRISPR/Cas9 targeting—free of DNA cleavage activity—for inducible and reversible chromatin loop formation anywhere in the genome
- Well-validated—chromatin loop formation and the resulting changes in gene expression across multiple loci and cell lines is amply demonstrated in Morgan, et al,1
- Broadly applicable—great for studying the role of chromatin in the control of gene expression in a range of areas, including:
- Developmental biology
- Cancer biology
- Chromatin structural biology
- Chromatin-based therapeutic strategies
- Unique—the innovative CLOuD9 System is only sold by SBI
References
- Morgan, SL, et al. Manipulation of nuclear architecture through CRISPR-mediated chromosomal looping. Nat Commun. 2017. Jul 13; 8:15993. PMCID: PMC5511349.
How It Works
Form chromatin loops with CLOuD9
Figure 1. The CLOuD9 System enables formation of inducible and reversible chromatin loops anywhere in the genome.
The CLOuD9 System consists of three components (Figure 1):
- A null mutant of the Cas9 protein from aureus fused to the plant ABI protein
- A null mutant of the Cas9 protein from pylogenes fused to the plant PYL1 protein
- Inducer reagent, the plant phytohormone S-(+)-abscisic acid (ABA)
The use of the Cas9 null mutants enables accurate binding to a specific region of the genome via the user-designed guide RNA (gRNA) without generating any breaks in the DNA. Because the gRNA scaffolds from the two species bind more efficiently to their same-species Cas9 partner, we can direct the saCas9-ABI fusion localizes to one region of the DNA and the spCas9-PYL1 fusion to a second region of DNA.
The dimerization partners—ABI and PYL1—are part of the plant ABA signaling pathway, and form heterodimers in the presence of ABA. Dimerization of ABI and PYL1 is reversible, enabling formation of chromatin loops in the presence of ABA, and disassembly of the chromatin loops upon ABA washout.
Supporting Data
Study the role of chromatin structure in gene expression
Figure 2. CLOuD9-induced chromatin loops increase gene expression in a context-dependent manner.1. A CLOuD9-induced chromatin loop at the β-globin locus leads to activation of gene expression in K562 cells but not in HEK293T cells, highlighting the importance of cellular context and the need for additional factors in gene expression. Inducer reagent (in DMSO) was added for either 24-hours or 72-hours. At the indicated time, cells in the “inducer only” treatment group were harvested and analyzed for gene expression, whereas cells in the “inducer + washout” treatment group were washed and then allowed to grow another 24- or 72-hours as indicated in the absence of inducer. Significance assessed relative to DMSO-treated control cells which were not transduced with the CLOuD9 System. * indicates P < 0.05, *** indicates P < 0.0001. 2. Unlike the β-globin locus, a CLOuD9-induced chromatin loop (treated with Inducer Reagent in DMSO) results in robust expression of the Oct4 gene in CLOud9/HEK293T cells compared to CLOuD9/HEK293T cells treated with DMSO only. The CLOuD9 System fusion proteins were targeted to the Oct4 promoter and the 5’ distal enhancer region upstream of the Oct4 promoter. *indicates P < 0.05.
Resources
SystemBiosciences，简称SBI，美国加利福尼亚湾区新成立的生技公司，致力于独特，创新生物技术之开发，以研发利于基因及蛋白质功能鉴定，研究之崭新方法和工具为宗旨。
美国SBI代理SystemBiosciences,简称SBI，美国加州湾区新成立的生技公司，致力于独特、创新生物技术之开发，以研发利于基因及蛋白质功能鉴定、研究之崭新方法和工具为宗旨。现阶段研发重心为RNA干扰（RNAi）研究之相关工具。
现阶段研发重心为RNA干扰（RNAi）的研究之相关工具。系统Biosciences公司（SBI）致力于开发独特，革新的技术，为客户研究蛋白组学和基因组学功能提供研究工具.SBI是专业的慢病毒产品公司，提供基于慢病毒的所有相关产品，质粒，试剂盒及相关配套试剂和慢病毒扩展产品，如IPS细胞多功能性诱导试剂盒和RNAi筛选文库。System Biosciences继续创造新的独特产品以及改善我们完善的产品线。我们对提供领先技术的承诺与我们所有研究试剂和研究项目服务的高质量制造和质量控制相匹配。 2009年要寻找的东西：以下是即将推出的新产品。新型miRZips™：基于慢病毒载体的新型技术可永久敲低MicroRNA。双标记shRNA表达载体：SBI将发布新的功能强大的shRNA表达慢病毒载体pGreenPuro™，以便为稳定的RNAi实验选择稳定转导的细胞的GFP和Puro标记。甾醇反应pGreenFire™慢病毒报告子：基于慢病毒载体的转录报告子，用于监测与固醇感应转录因子相关的转录网络活性-心血管疾病途径的关键。诱导型表达慢载体：新的构建体将允许CDNA，shRNA和microRNA的“按需”表达。2007–2008年的新产品新的miR-SNaRE：MicroRNA小型非编码RNA富集系统，该系统使用带有表位标签的microRNA加工因子来提取蛋白质及其相关RNA。识别驱动RISC复合体的信使RNA。新的GeneNet™聚焦的shRNA库：这些聚焦的shRNA库编码一组针对所有与人类激酶，磷酸酶或细胞凋亡相关基因有关的特定功能或类别基因设计的shRNA集合。这些文库可进行有针对性的高通量RNAi筛选。新的miRNomeMicroRNA分析仪：qPCR阵列在预先格式化的板中包括microRNA分析，可用于人类的完全互补或小鼠单个microRNA的完全互补，每块板上带有三个内源参考RNA对照。所有基于SangermiRBasemicroRNA数据库的microRNA分析均已注册。新的Lenti-miR™MicroRNA前体克隆：在基于HIV的慢病毒载体中可获得更多的microRNA前体集合。超过580个单独的microRNA前体克隆可用阵列形式或合并的慢病毒形式用于HT筛选。新的基于慢病毒的干细胞报道者：SBI越来越多的慢病毒载体已被开发为将基因构建体在体内外几乎传递给任何细胞类型的最有效方法。SBI已将我们的慢病毒构建体系列扩展为干细胞报道分子。使用连接到GFP报告基因的细胞和途径特异性启动子，轻松创建转基因细胞系以监测细胞分化。QuantiMir™RT试剂盒：这项流行的新技术可通过一次cDNA合成同时进行实时qPCR定量分析数百种microRNA。设计您自己的microRNA测定法以进行创新性实验。癌症microRNAqPCR分析小组（OncoMir系列）：预格式化的microRNA分析小组，用于评估95种已知与癌症有关的microRNA。干细胞microRNA分析小组：介绍了95种参与干细胞分化的microRNA，可同时监测干细胞的自我维持，造血途径和神经分化。SBI完善的产品线FullSpectrum™完整信使RNA扩增试剂盒：利用针对mRNA最常见基序的mRNA特异性引物提供完整的mRNA转录物（5"和3"末端）的无偏见，完整代表。GeneNet™siRNA库：全基因组，即用型，预包装的慢病毒库为筛选与生物学反应相关的基因功能提供了令人兴奋的机会。干扰素反应检测试剂盒：区分真正的RNA干扰和压力相关的细胞反应。PathNet™转录报告基因慢病毒载体：一种独特的方法，可创建各种稳定的报告基因细胞系，用于信号通路的研究。我们感谢您过去的支持，并期待为您提供最佳的新试剂，技术和服务，以加速您成功的研究目标。
ebiomall.com
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
goldbio活体成像技术：
早在1999年由美国哈佛大学Weissleder博士率先提出了分子影像学(molecular imaging，MI)的概念，即应用影像学的方法对活体状态下的生物过程进行细胞和分子水平的定性和定量研究。活体成像便是基于分子影像学孕育而生的，通过这个成像系统，可以观测活体动物体内肿瘤的生长及转移，感染性疾病的发展进程，特定基因的表达等生物学过程。
活体成像技术主要采用生物发光（bioluminescence）与荧光（fluorescence）两种技术。
★生物发光是用荧光素酶基因标记细胞或DNA。
★荧光技术则采用荧光报告基团（GFP、RFP, Cyt及dyes等）进行标记。
★这一技术对肿瘤微小转移灶的检测灵敏度极高，不涉及放射性物质和方法, 非常安全。操作极其简单、所得结果直观、灵敏度高。
苏州蚂蚁淘生物科技有限公司成立于2017年，是一家专业提供实验室整体采购方案的专业公司，为广大采购和实验室解决了大量问题，几年来已经成为所有合作伙伴最优秀的合作伙伴，我们一直秉承信誉第一的原则，坚持不卖假货，哪怕利润损失也要为客户提供最好的产品
我们已经和国外500多个品牌建立了贸易往来，并在国际上享有相当知名度，现已经成为国外近100多个品牌中国指定代理，并成为其中国最优秀的代理商
蚂蚁淘是生物试剂电商平台， 主营：海外试剂抗体，进口实验仪器，海外诊断原料等生物医学科研用品进口。我司希望借助互联网平等而开放的力量，矢志实现生命科学领域全球的信息同步与标准化，简化科学家的采购流程，节省科学家宝贵时间。如需商业合作，请联系info@ebiomall.com 。
Biosearch Technologies是一家致力于创新性研发新型核酸产品以促进新基因的发现与应用的高科技公司。从上世纪八十年代开始,一代一代的Biosearch创新者就专注于寡核苷酸化学合成技术， 在设计和生产荧光探针及引物中经过多次改良形成了公司特有的寡核苷酸修饰技术。目前 Biosearch开发的荧光粹灭技术Black Hole Quencher® (BHQ® dyes) 已成为高效荧光探针设计/合成的工业生产标准。以创新研发为原发动力的Biosearch Technologies公司已经通过英国ISO 9001:2008、ISO 13485:2003标准认证，获得加利福尼亚设备制造许可证以及GMP生产许可证。Biosearch拥有丰富的高品质产品线，不仅包括探针和引物产品，广泛应用于药物研发，DNA测序/SNP检测/基因表达分析等领域，也为其他寡核苷酸生产厂商提供原材料。公司在仪器生产领域的努力也使得我们能对公司产品的合成和纯化进一步深入和发展。
蚂蚁淘主营海外试剂抗体，进口科研仪器，海外试剂耗材等所有行业相关用品进口。蚂蚁淘全球直采，正品保障，为科研献力！如需商业合作，请联系cooperation@ebiomall.com 。
疾病控制与预防中心（CDC）已与Cerilliant签订合同，以制造和分销经阿片类药物认证的参考材料套件（阿片类CRM套件）和阿片类物质混合混合物套件（OPM套件）。这些试剂盒包含40多种基于溶液的认证参考物质，可用于实验室检测新兴的阿片类药物和相关物质。
苏州蚂蚁淘生物科技有限公司是一家经营医药标准品、化工环境标准品、高端试剂的专业公司，是全球领先科研方案的专业供应商。
自成立以来，公司坚持以“保障客户利益是我们的第一追求”为经营宗旨，发展成为全球多个高端标准品公司国内总代理和授权代理商，能提供超过100000种的有机和无机标准品或试剂，产品涉及药企，科研单位，检测机构，工厂实验室和高校等绝大部分科研单位；同时提供优质的咨询服务，实力雄厚。
公司以代理经营为主，代理20多个国外知名品牌的标准品、对照品，高端化学试剂，包括欧标EP,欧盟IRMM,日标JP,印度标IP,加拿大TRC,TLC,MC,英国BP,LGC,NIBSC,美国NIST,ChromaDex,美国Zyagen,挪威Chiron等。
Jackson总部位于美国宾夕法尼的兰卡斯特，距离费城大概有40英里。Jackson在1982年由科学家展开了包括在细胞生物学，蛋白质化 学，微生物学，免疫学及产品开发实验研究。我们的目标是为世界各地的研究者能最大选择的提供最高质量的科学试剂以及最棒的技术支持和售后服务。蚂蚁淘向您提醒的是， Jackson产品仅用于研究，不用于诊断或治疗用途。作为美国著名的各种二抗生产公司之一，Jackson在全世界各国设有几十家代理。由于其产品效价高、种类全、价格低廉，因而成为全球各大药厂、试剂盒生产厂、大型实验室采购此类试剂的首选。其产品主要包括：各种纯化的二抗、标记的二抗（AMCA、Cy2、FITC、Cy3、TRITC、RRX、TR、Cy5、长臂生物素、辣根酶和碱磷酶标记）、金标试剂等。
公司旨在为客户提供高质量的实验外包服务（CRO服务），包括实验方案设计，常规基因工程实验操作，重组蛋白表达与纯化，重组抗体制备，天然蛋白分离与纯化，病毒分离培养等免疫学相关技术服务；同时我们也为工业客户提供部分IVD级别抗体和抗原原料。核心平台：---噬菌体抗体展示技术平台苏州蚂蚁淘生物科技有限公司利用自有的噬菌体（M13，T7噬菌体）展示技术平台，能够为客户提供极具性价比的重组Vhh抗体（纳米抗体/驼类纳米抗体）制备方案，包括动物免疫，文库建立，文库筛选以及重组抗体的体外表达等。---抗体工程技术平台卡梅德生物科技的抗体工程平台包含单克隆抗体制备服务平台，多克隆抗体制备服务平台，抗体测序与改造平台。单克隆抗体制备平台：基于杂交瘤技术的小鼠单抗技术平台，最快能够在2-3个月获得高亲和力与高特异性的单克隆抗体，同时基于噬菌体展示技术，我司能够制备多物种的重组单克隆抗体，包括小鼠，兔子，骆驼，羊驼以及人单抗。多克隆抗体制备服务平台：能够为客户提供兔多抗，羊多抗，骆驼类多抗，牛多抗等多物种的抗体制备服务，根据不同的抗原类型，来自蚂蚁淘生物的资深抗体专家会为您量身定做适合您需求的方案，以满足您的项目要求并节省您的宝贵时间。抗体一级序列测序平台：为满足大量客户对抗体基因序列与氨基酸序列信息的需求，我们为客户提供De Novo抗体全长氨基酸序列解析和N端测序服务；同时我们设计积累多达80种杂交瘤抗体基因测序引物。抗体改造技术平台：蚂蚁淘生物技术的抗体改造平台包括嵌合抗体制备，抗体亲和力成熟以及抗体人源化服务。目前我们已经成功制备十几例嵌合抗体与人源化抗体，均成功交付。---蛋白表达与纯化服务技术平台蚂蚁淘生物科技目前拥有四大蛋白表达平台，能为客户提供全面且优质的蛋白表达技术服务。哺乳动物表达平台：目前公司拥有Freestyle CHO，Expi CHO，CHO-DG44，HEK293F，Vero等细胞系用于蛋白表达制备。公司秉承质量优先原则，全部统一采用Gibco细胞培养基和相关转染配套试剂，以保证每个批次的哺乳动物细胞蛋白表达产品高质量、高表达水平的交付。同时公司拥有的表达载体体系，远高于市面常用蛋白表达载体，能够为客户提供高纯度蛋白。昆虫细胞表达平台：目前公司常采用的昆虫表达细胞为SF9，配套使用的是来自Gibco的培养基，只...
苏州蚂蚁淘生物科技有限公司是一家经营医药标准品、化工环境标准品、高端试剂的专业公司，是全球领先科研方案的专业供应商。
自成立以来，公司坚持以“保障客户利益是我们的第一追求”为经营宗旨，发展成为全球多个高端标准品公司国内总代理和授权代理商，能提供超过100000种的有机和无机标准品或试剂，产品涉及药企，科研单位，检测机构，工厂实验室和高校等绝大部分科研单位；同时提供优质的咨询服务，实力雄厚。
公司以代理经营为主，代理20多个国外知名品牌的标准品、对照品，高端化学试剂，包括欧标EP,欧盟IRMM,日标JP,印度标IP,加拿大TRC,TLC,MC,英国BP,LGC,NIBSC,美国NIST,ChromaDex,美国Zyagen,挪威Chiron等。
Euriso-top的NMR光谱学已成为表征各种化合物结构的主要研究工具。为了帮助实验室团队进行这些分析，Euriso-top开发了多种消耗品，尤其是具有高同位素富集度和高化学纯度的氘代溶剂。
在初始纯化后，包装前和包装后，每批产品均常规进行化学和同位素纯度测试。为了避免同位素污染，我们所有的氘代溶剂均在惰性气氛（例如干燥的氮气或氩气）下处理。
我们的某些溶剂包装在隔垫小瓶中，以避免湿气污染。
质量控制实验室配备了多种仪器，包括气相色谱仪/质谱仪（GC / MS）和高场NMR。化学实验室配备了用于大规模（50升以上）和微型化学的设备，其中包括用于高压气体反应，pH和温度控制的酶化学，高分辨率蒸馏过程以及氢气催化还原的设备和氘。生产实验室还配备了用于过程中测试的分析设备。所有这些资源使我们能够始终如一地生产具有高化学和同位素纯度的产品。包装之前和之后，我们都会对所有产品进行评估。
我们的经验和技能使我们能够获得NMR氘化溶剂的化学纯度高于或等于99.9％；
对于氘化的NMR溶剂来说，水污染是一个普遍的问题。我们的溶剂的水含量由我们的质量控制部门通过KF滴定法进行测试。
有关如何减少/消除水峰的建议和技巧：
考虑使用一次性安瓿。我们的许多溶剂都可用于单次使用的封口安瓿瓶，大小从0.5 mL到1 mL不等。
在干燥的环境中处理溶剂。
用于样品制备的干燥NMR管和移液器在烤箱中过夜，并在使用前在干燥器中冷却。
通过用D2O冲洗来对NMR管进行预处理
用甲醇-d4或丙酮-d6冲洗，然后用选择的溶剂冲洗，除去残留的D2O。此过程不会除去水，但会将质子交换为氘，并使水峰最小化。
如果PCR产物不是很纯，或者PCR扩增条带比较小，PCR产物前面又有较多引物二聚体时，用胶回收，其余用PCR产物纯化试剂盒。
pcr纯化试剂盒和胶回收试剂盒的区别：
PCR纯化试剂盒：是直接水溶解的PAC产物就可以回收，回收效率高，但是只适合单一条带需要纯化测序的时候使用。
PCR凝胶试剂盒：是在PCR产物是混合物，有多条杂带的情况下，先跑胶将杂带分离，然后在将所要的条带位置的胶切下回收，后者的回收效率低，但是很纯净。
胶回收试剂盒操作步骤：
配制琼脂糖EB凝胶,电泳以分离DNA片段。任何类型或等级的琼脂糖都可以使用。
电泳足够时间后，在紫外灯下小心地把所需的DNA的片段切下来。并尽量去除多余的凝胶。
称取空离心管的重量，切下带目的片段的凝胶装在1.5ml离心管中并称其重量，求出凝胶块的重量，近似地确定其体积。一般情况下，凝胶的密度为1g/ml，于是凝胶的体积与重量的关系可按下面换算：凝胶薄片的重量为0.2g 则其体积为0.2ml；加入等倍凝胶体积的Binding Buffer，把混合物置于55℃~65℃水浴中温浴7min至凝胶完全融化，其间每隔2-3分钟混匀一次；
转移700μl的DNA-琼脂糖溶液到一个HiBindTM DNA柱子，并把柱子装在一个干净的2ml收集管内，室温下，10,000×g离心1min，弃去液体。
将柱子重新套回收集管中，加300μl Binding Buffer至HiBind DNA 柱子中；室温下，10,000×g离心 1分钟，去弃滤出液；这一步相当关键，不要忽略此步。
将柱子重新套回收集管中，加入700μl SPW Wash buffer至HiBind DNA柱子中，室温下，10,000×g离心1分钟，去弃滤出液；注：SPW Wash buffer在使用前必须按瓶子标鉴要求用无水乙醇进行稀释。
将柱子重新套回收集管中，重复加入700μl SPW Wash buffer至HiBind DNA柱子中，室温下，10,000×g离心1分钟，去弃滤出液；
弃去液体，将空柱子重新套回收集管中，10,000×g离心1min以甩干柱基质残余的液体。
这步可以去除柱子基质上残余的乙醇，不要省略此步―――对得到好的DNA产量是十分重要的。
把柱子装在一个干净的1.5ml离心管上，加入30~50μl洗脱液或灭菌水上柱子膜上，10,000×g离心1分钟，离心管中的溶液就是纯化的DNA产物，保存于-20度。
苏州蚂蚁淘生物科技有限公司成立于2009年，是一家专业提供实验室整体采购方案的专业公司，为广大采购和实验室解决了大量问题，几年来已经成为几乎所有合作伙伴最优秀的合作伙伴，我们一直秉承信誉第一的原则，坚持不卖假货，哪怕利润损失也要为客户提供最好的产品。
我们已经和国外500多个品牌建立了贸易往来，并在国际上享有相当知名度，现已经成为国外近100个品牌中国指定代理，并成为其中国最优秀的代理商。
我们部分客户
1：经销商代表---国药化试，飞世尔，SIGMA，等1000家左右的经销商
2：学校代表---北京大学，清华大学，上海交通大学，复旦大学，浙江大学，武汉大学，厦门大学.....等200所左右大学及100多家附属医院
3：制药公司代表：罗氏，阿斯利康，诺和诺德，和记黄埔，东阳光科......
4：CRO公司代表：睿智化学，药明康德，桑迪亚，美迪西......
我们现有代理品牌如下，还在不断增加中
美国Avanti Polar Lipids Inc www.avantilipids.com
Avanti Polar Lipids Inc, 是美国著名的磷脂类产品的生产商，该公司主要为各种制药厂和研究机构提供从毫克级到公斤级乃至吨级的磷脂类和甾体类中间体和试剂。
Avanti Polar Lipids.公司为世界范围内的研究机构和制药公司提供 1000 种以上脂类产品,由于其产品的高纯度而享誉全球,
For 40 years, Avanti Polar Lipids, Inc. has been supplying lipids to researchers and pharmaceutical companies around the world. Not only has the range of products grown every year but so has Avanti’s unique reputation for purity. This brings us the satisfaction of our clients and the envy of our competitors.
Avanti’s clients order from a stock of over 1,000 lipids at affordable prices. They enjoy working with our dedicated Customer Service representatives and benefit from our informed Technical Support team.
Research clients are encouraged to contact us about custom synthesis of products not listed in our catalog. We are pleased to offer our Pharmaceutical clients products which follow cGMP guidelines.
Avanti’s selection of chemicals and range of services for Research and Pharmaceutical applications include
• Analytical Services • Bioactive Lipids
• Biotinylated Lipids
• Cationic Lipids
• L-threo-Lac Cer (Caveolar Uptake Inhibitor)
• Cholesterol, Plant & Animal Derived
• Coenzyme A, Fluorescent & Fatty Acyl Derivatives
• Deuterium Labeled Phospholipids & Sphingolipids
• Eicosanoids (synthetic)
• Extrusion Equipment for Liposome Preparation
• Fluorescent Phospholipids & Sphingolipids
• Glycosylated & Phosphorylated Sphingolipids
• Kdo2 Lipid A (TLR 4 Agonist)
• PHAD™ Synthetic Vaccine Adjuvant
• Lipid Formulation
• LPA, Cyclic LPA & LPA Analogues
• LIPID MAPS Mass Spec Standards
• Oxidized Lipids
• Sterols, Oxysterols, Deuterated & Fluorescent Sterols
• PIP’s, Polyunsaturated PIP3, & Fluorescent PIP’s
• Phospholipids & Sphingolipids
• Polymerizable Lipids, PEG-Lipids & Functionalized PEG’s
• Prostaglandins (synthetic)
• S1P/LPA Receptor Selective Agonists & Antagonists
• Sphingosyl PE & PI
View Products
View Products
View Products
