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bioline/qPCR Extraction Control Orange/2000 Reactions/MDX027
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bioline/qPCR Extraction Control Orange/2000 Reactions/MDX027
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bioline
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MDX027
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Description

Formerly DNA Extraction Control 560.

DNA Extraction Control not only enables users of a diagnostic qPCR assay to determine if there are inhibitors in the PCR assay, but also to validate the success of the extraction step, reducing the chance of obtaining a false negative result in the sample DNA.

Product Highlights

  • Simple - streamlined protocol for straightforward validation of DNA extraction and determination of qPCR assay inhibition
  • Sensitive - control assay identifies even small effects on DNA extraction and inhibition of amplification
  • Optimized - control DNA has a sequence with no known homology to any organism thereby avoiding detection of sample DNA
  • Specific - probe-based assay designed specifically for real-time PCR assays
  • Flexible - ideal for use with a wide range of sample types, including inhibitor-rich samples like blood, urine and sputum samples

Product Description

A common practice in qPCR is to add a known amount of spiked control DNA after DNA extraction, this monitors PCR inhibition but has no value as an extraction control. The ideal situation is to have the test sample and internal control undergo the same processing prior to qPCR. Meridian has developed the qPCR Extraction Control, which more closely mimics the test sample, as compared to spike controls. Genetic material from the test sample and the qPCR Extraction Control is simultaneously extracted by common extraction methods, with the extraction control being as sensitive to inhibition and extraction failure as the test sample.

The qPCR Extraction Control cells are of a known concentration, containing the Internal Control DNA sequence. This sequence contains no known homology to any organism and, importantly, has minimal interference with detection of sample DNA. The qPCR Extraction Control cells are spiked into the lysis buffer with the target sample, prior to DNA extraction. Control Mix, which includes primers and probe, is then added to the reaction mix before amplification. Signal derived from the Internal Control DNA confirms the success of the extraction step. qPCR Extraction Control also monitors co-purification of PCR inhibitors that may cause biased or false amplification patterns.

Applications

  • Pathogen detection
  • Cancer risk assessment
  • Gene expression analysis
  • Copy number variation (CNV) analysis
  • Genotyping
  • Viral loading
Main

Real-Time PCR Selection Chart

Application Note

qPCR Extraction Control Orange
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公司介绍
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2020-07-15
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你好,我用过的试剂盒里,TAKARA的效果比较好,而且不算贵。如果你有钱,就买罗氏的、或者ABI(life)的。谢谢。
逆转录要-20°保存,荧光定量有的可以4°保存就可以不分装,如果要-20°保存的话就最好分装了,说明书上都写着呢,好好看看说明书!
是单链cDNA,想合成双链cDNA需要另外操作:一、cDNA第二链的合成:1. 第一链反应完成后,取2ul一链产物-20℃冰箱中保存,待电泳检测。其余的产物合并,混匀,然后顺序加入下列试剂(promega):20ul 10×DNA Polymerase I buffer6ul 10mM dNTP(自己配制)xul dd H2O1ul RNase H(2U/ul)10ul DNA Polymerase I(10U/ul)总体系为200ul;2. 混匀后,16℃反应2.5小时;3. 70℃灭活10分钟;4. 反应完成后,得到200ul cDNA第二链反应体系,将此体系置于冰上;5.取2ul二链产物,同保存的一链产物一起电泳鉴定。同时上1kb ladder,确定双链的大小范围。注:一链,二链的电泳图是smear,且二链稍比一链大一些。二、双链cDNA末端补平:1. 在第二链反应体系中,顺序加入下列试剂(promega):6ul 10mM dNTP2ul T4 DNA Polymerase(8.7U/ul) 2ul BSA(10mg/ml)2. 稍微离心混匀反应物, 37℃反应至少30分钟,然后75℃灭活10分钟;3. 加入等体积酚/氯仿/异戊醇,剧烈振荡后,常温下13000g离心5分钟;4. 离心后,吸取上清于另一1.5ml eppendof管中,加入等体积氯仿,上下颠倒几次混匀后,常温下13000g离心5分钟;5. 吸取上清至另一eppendof管,加入1/10V3M NaAc(PH5.2)和2.5V预冷的无水乙醇,混匀,-20℃放置过夜以沉淀双链cDNA;6. 第二日,将昨日沉淀物在4℃,13000g离心60分钟以充分沉淀双链cDNA;7.离心完毕,弃上清,加入1ml 70%乙醇洗涤沉淀,常温下13000g离心5分钟;8.离心完毕,弃上清,干燥沉淀至无乙醇气味.注:第3,第4步可以用PCR 纯化试剂盒代替。PCR纯化试剂盒操作流程:1.溶液PE使用前应加入适量体积95%-100%的乙醇,混匀。2.向200ul二链补平产物中加入5倍体积的buffer PB,混匀。3.加入spin column中,13000rpm离心1min。4.加入0.75ml buffer PE,13000rpm离心1min。5.13000rpm,再离心1min。6.将spin column放入一新的离心管中,加入50ul buffer EB,静置10min。7.13000rpm离心2min。8.加入30ul buffer EB,静置10min。9.13000rpm离心2min。10.加入1/10体积3M的NaAc,2.5倍体积无水乙醇,混匀,-20℃沉淀过夜。
我是菜鸟!!!请问各位站友:我在做RT的时候逆转录试剂盒放在室温下6个小时,忘记放回-20度了,请问还能用吗?主要担心酶会失活,试剂盒是TAKARA的PrimeScriptRTReagentKit。刚买的第一次用就这样了,着急啊,请各位大侠帮忙解答下,谢了
你可以看看OneShine的,感觉也是很好的
氯仿/,混匀,常温下13000g离心5分钟,混匀,然后顺序加入下列试剂(promega).离心完毕.离心完毕,剧烈振荡后,加入1ml 70%乙醇洗涤沉淀. 第二日,13000g离心60分钟以充分沉淀双链cDNA;ul) 2ul BSA(10mg/. 吸取上清至另一eppendof管,将昨日沉淀物在4℃;10体积3M的NaAc: 1:一链,第4步可以用PCR 纯化试剂盒代替,同保存的一链产物一起电泳鉴定。 6.将spin column放入一新的离心管中,取2ul一链产物-20℃冰箱中保存。 8.加入30ul buffer EB;异戊醇: 1.溶液PE使用前应加入适量体积95%-100%的乙醇. 在第二链反应体系中. 反应完成后;10V3M NaAc(PH5.5倍体积无水乙醇; 5,再离心1min是单链cDNA。 3.加入spin column中.2)和2,混匀,加入50ul buffer EB,得到200ul cDNA第二链反应体系。 2.向200ul二链补平产物中加入5倍体积的buffer PB. 第一链反应完成后; 3;ml) 2,将此体系置于冰上。 PCR纯化试剂盒操作流程; 5.取2ul二链产物,然后75℃灭活10分钟:第3; 4。同时上1kb ladder、cDNA第二链的合成. 加入等体积酚/。二,想合成双链cDNA需要另外操作.5V预冷的无水乙醇: 6ul 10mM dNTP 2ul T4 DNA Polymerase(8,加入等体积氯仿. 离心后。 9.13000rpm离心2min, 37℃反应至少30分钟,干燥沉淀至无乙醇气味,弃上清. 70℃灭活10分钟. 混匀后,待电泳检测,混匀,顺序加入下列试剂(promega),且二链稍比一链大一些. 稍微离心混匀反应物,13000rpm离心1min,确定双链的大小范围:一,常温下13000g离心5分钟,-20℃放置过夜以沉淀双链cDNA.5小时,静置10min,-20℃沉淀过夜: 1;ul) 总体系为200ul;ul) 10ul DNA Polymerase I(10U/.75ml buffer PE。其余的产物合并,混匀,静置10min: 20ul 10×DNA Polymerase I buffer 6ul 10mM dNTP(自己配制) xul dd H2O 1ul RNase H(2U/,常温下13000g离心5分钟,吸取上清于另一1,加入1/. 注; 8; 2; 7,弃上清,16℃反应2。注; 3。 10.加入1/。 4.加入0,2、双链cDNA末端补平.7U/ 4。 5.13000rpm,上下颠倒几次混匀后。 7.13000rpm离心2min,二链的电泳图是smear.5ml eppendof管中; 6,13000rpm离心1min
我用的是Fermentas公司的RevertAid First strand cdna synthesis kit,效果很好,逆转录效率也比较一致。100次打折也就1000多
各位大侠好:本人刚刚开始做pcr,购买了罗氏的逆转录试剂盒,试剂商说是做定量PCR用的但是我又想做普通的逆转录PCR(RT-PCR).因此我买的这个试剂盒可以同时做定量PCR和RT-PCR吗?谢谢大家了。。。

对于新手来说购买反转录试剂盒是比较理想的,买一个kit看看说明书操作就可以了。推荐两款kit TAKARA和HaiGene,这两款试剂盒都能对RNA样品中的gDNA有效去除,因此对RNA质量的要求不高。TAKARA的RR047A操作方便,反转录温度为37℃,对于大多数试验来讲是满足要求的。HaiGene的D0401操作要多一个步骤,但其反转录温度是55℃(耐高温的反转录酶),提高了反转录温度使得高GC含量、复杂模板、长mRNA的模板都能有效反转录,因此其反转录效率更高,更能够获得样本中基因的真实表达量。如果后续试验是RealTime PCR、ORF克隆、高GC含量、或者你的待研究基因结构复杂程度未知,还是选用耐高温的反转录酶更理想。对于反转录高手来说,直接购买反转录酶、再购买Rnase Inhibitor自己配制反转录体系就可以了。对于样本量大的课题组来讲,相对还是比较经济的。选择反转录酶时仅需要考虑是否需要耐高温的酶,来克服目的基因的复杂结构就可以了。PROMEGA、TAKARA、HaiGene、 TRANSGEN等品牌的反转录酶性价比还都是不错的。Life、NEB的也不错,不过性价比一般,不一一解释了。
trizol法提取大小RNA,trizol买invitrogen公司的。 逆转录用promega公司的M-MLV

之前一直用的Takara的试剂盒,现在突然换成Thermo的,实验的条件需要重新摸索~看了说明书还是有几点不明白的?请园子里的大神指导~想知道:1、需要特地去除基因组DNA么?试剂盒里并没有DNase和RNase。2、说明书上,上机反应的条件是42摄氏度60min;70摄氏度5min;一共需要1个多小时!?看他产品推广说只需要30min就可以了~所以大家上机条件是怎样的?求指导

一般都是用针对miRNA的试剂盒,普通的逆转录方法我这里也做过,但是结果不是很稳定,你懂得!