药物发现的早期投资带来红利 - OXGENE

2020 年 6 月 18 日,作者:Sophie Lutter
药物发现的早期投资带来红利我们的自动化 CRISPR 工作流程如何加速您的药物开发计划,迈向临床成功药物开发是这是一个漫长而昂贵的过程。大多数估计表明,完成从药物发现到监管批准的过程需要 10-15 年,对于一流的治疗方法甚至需要更长的时间。在此期间,候选分子库将从最初的 5,000-10,000 种可能性缩小到一种已获批准的治疗药物。这里没有任何捷径,但有大量的意见表明,一种理性的、系统的和生物学主导的方法来识别目标验证和验证,再加上疾病相关细胞模型中详细的作用机制研究,可以提高最终临床成功的机会(Lu et al. 2017, Plenge 2016, Scannell et al. 2012, Croston 2017)。
CRISPR/Cas技术提供了一种精确而有效的机制来重写细胞的遗传蓝图,并且随意删除、增强或以其他方式修改基因活性的能力可以证明作为药物发现和开发过程的一部分是无价的。但是,大型药物开发项目所需规模的强大而可靠的基因编辑很快就会变得如此费力和耗时,以至于它似乎不再是一个可行的解决方案。这就是 oxgene 的用武之地。从黄金标准 CRISPR 文库生产和筛选,到自动化、有质量保证且灵活的高通量基因编辑和疾病建模,我们可以帮助您更快地取得临床成功。
CRISPR 文库和筛选靶标识别CRISPR筛选– 针对整个基因组或特定基因家族进行 – 允许公正地发现对细胞生存至关重要或赋予特定表型(例如耐药性或敏感性)的基因。这使它们成为发现新药物靶点的理想工具;与通过文献或基因组数据集进行搜索相比,CRISPR 筛选提供了更加高效和可靠的目标识别。
文库设计OXGENE 拥有以混合和阵列形式创建高质量慢病毒和质粒 gRNA 文库的丰富经验。我们提供全基因组 KO 和 CRISPRa 文库,以及针对特定基因家族的快速生成文库,例如可药物基因组、激酶组、细胞凋亡、细胞周期或泛素蛋白酶体系统。或者,我们可以根据您的要求快速生成定制文库。
混合筛选除了创建定制试剂之外,OXGENE 还可以进行全基因组测序领导内部 CRISPR 筛选和生物信息学分析,为您提供与您的研究问题相关的命中列表。
OXGENE 的资深科学家之一迪伦·琼斯 (Dylan Jones) 表示:\"汇集的 CRISPR 筛选可以帮助您从将数千个候选基因的起点减少到少数。我们汇集的 CRISPR 筛选服务的真正优势之一是我们提供的生物信息学支持。我们的内部团队可以将大量筛选数据分析成相关潜在基因目标的简明列表。我们最近进行了一项筛选,以确定 PC9 细胞中的新型必需激酶,以确定治疗非小细胞肺癌 (NSCLC) 的潜在新治疗策略。在筛选结束时,生物信息学分析确定了一个非常易于管理的潜在目标列表,以供进一步验证。”
阵列筛选当基因列表较小时,阵列 CRISPR 筛选可以用作合并筛选的替代方案足够(例如数百个基因),or 作为验证来自池屏幕的相对大量点击的有效方法。在阵列筛选中,Cas9 被引入所有细胞中,但与混合筛选不同的是,含有单个 gRNA 的慢病毒被并行引入每个单独的细胞群中。这使得能够对所需表型进行精确和直接的定量。当用作命中验证的一种形式时,阵列筛选可以将数百个候选基因的长列表细化为候选列表,以供进一步实验和分析。
OXGENE 利用其在自动化 gRNA 设计、高通量克隆和分析方面的专业知识。慢病毒生产以提供定制阵列库。我们还可以在内部进行整个阵列筛选,为您提供与您所需表型相关的基因列表。
高通量基因编辑目标验证需要进一步进行大量实验验证才能从潜在的候选名单中取得进展药物开发的候选基因,这是一个CRISPR/Cas 技术有价值的另一种情况。根据您希望在每个阶段进行的研究,生成基因编辑的克隆细胞系是目标基因验证的下一步或替代方法。
我们的自动化基因编辑平台经过简化,优化且质量有保证。它可以扩大规模以满足大规模或高通量项目的需求——我们每年可以生成数百个定制编辑的细胞系——也可以缩小规模以满足更小、更专业的项目。这是一个本质上灵活的工作流程,可以适应任意数量的不同起始细胞类型和生物特征,包括贴壁细胞系和悬浮细胞系。它还经过改造,可对诱导型多能干细胞 (iPSC) 进行高通量编辑。
如果您在药物开发过程中取得进一步进展,并且已经拥有一种或多种感兴趣的分子,我们的高通量平台可以帮助您识别、验证和研究候选基因,这些基因的丢失可能会影响您对新疗法的敏感性,例如赋予耐药性或进一步增加敏感性。
我们的编辑质量以及我们平台的可靠性和功能已在之前的项目中得到验证,包括在与 Abcam 合作期间,我们成功生成了数百个用于抗体验证的 KO 细胞系。
领导 OXGENE 自动化基因编辑团队的 Pela Derizioti 分享了该平台成功的秘诀:\"团队合作,事实上,每个人都愿意投入并超越。整个公司齐心协力,使这个平台运转良好:生物学家、自动化团队、生物信息学团队和商业团队。”
研究作用机制新颖化合物有时会失败的原因之一临床试验中的问题是由于对药物机制背后的生物学了解不够。很多遗传病都是这是多个基因敲除或其他类型完全突变的结果,并且培养来自具有这些突变的患者的原代细胞可能非常困难。我们的自动化基因编辑平台不仅限于创建 CRISPR KO。我们还可以生成克隆细胞系来模拟复杂的疾病场景,例如双敲除、敲入、基因融合、染色体缺失或染色体重排,以帮助您全面研究假定化合物的作用机制,并提高最终临床成功的机会。
我们最近还优化了我们的自动化基因编辑平台,以适应诱导型多能干细胞 (iPSC) 的高通量编辑。这些是疾病建模和药物发现的特别强大的工具,因为它们保留了分化成其他细胞类型的能力。然而,它们可能是很难处理的细胞,因为它们很容易因细胞压力而分化,并且表现出不编辑效率极低。然而,在我们自动化基因编辑平台灵活性的另一个例子中,OXGENE 正在优化我们的基因编辑工作流程,以实现细胞稳定性和编辑效率之间的谨慎平衡。
Suzanne Snellenberg,OXGENE 复杂编辑小组组长筛选团队表示:\"自动化我们的基因编辑平台并将其与内部专业知识和生物信息学软件相结合,可以消除创建包含困难或罕见编辑的细胞系的很大风险。例如,当编辑效率较低时,我们可以针对这些罕见的编辑事件实施丰富策略。此外,我们还可以增加克隆数量,通过生物信息学分析进行扩展和筛选,以确定成功编辑的克隆细胞系。现在,我们已将生成其他复杂基因编辑所获得的经验转化为为客户提供有质量保证的基因编辑 iPSC。”
结论OXGENE 可以同时获得最新的 CRISPR 编辑技术以及丰富的内部专业知识和经验,无论您处于药物发现或开发过程的哪个阶段,都可以以无与伦比的质量和规模对哺乳动物细胞进行基因工程。
我们的基因编辑平台得到持续创新文化的支持。我们相信,提供市场领先的基因组工程技术并不是停止寻求改进的借口。无论是由我们内部研发渠道还是定制客户项目驱动,我们都在不断提高平台的效率和准确性。
我们非常重视与合作伙伴的沟通,因为我们要知道,为具有挑战性的科学项目选择合作伙伴不仅仅关乎最终产品。这就是为什么我们与合作伙伴的关系至关重要。从与我们的业务开发团队的第一次互动开始,我们的客户就在 OXGENE 内建立了明确的联系点。一旦项目提出ins,我们成立了一个专门的项目团队,由项目经理和科学主管带头。在整个项目过程中,客户将与项目经理和科学团队保持直接联系,并可以访问我们的内部科学数据管理门户,以便实时访问项目结果。
我们的目标始终是与客户建立牢固而持久的关系,帮助改变生命科学行业,并为有需要的患者加速新疗法的发现和开发。
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