2020 年 1 月 6 日，作者：Sophie Lutter

CRISPR，或者说\"成簇的规则间隔的短回文重复序列”，首先在 E 中发现1987 年在大肠杆菌中发现了它。但几年后，它与核酸内切酶 Cas9 相互作用，并认识到原核免疫系统的这种奇怪现象可以用来精确且永久地修改哺乳动物细胞中的遗传密码（Charpentier 等人，2012 年）马里等人，2012）。这是基因编辑革命的开始。

从那时起，基于 CRISPR/Cas9 的基因编辑已成为学术和商业实验室细胞基因操作的主要技术。这是一项具有巨大潜力并且已经启动的技术影响从药物发现到直接治疗应用的整个科学领域，但这并非没有问题。

从单细胞克隆中生成经过 CRISPR 修饰的细胞仍然耗时、低效，而且是常规方法手工执行，这给错误提供了很多机会。这些相同的限制使该技术的商业或临床规模变得复杂。

规模并不是唯一的问题。 CRISPR/Cas9 用于基因组编辑的精度和效率仍然存在问题。

尽管 CRISPR 对生物技术产生了深远的影响，但 CRISPR 系统相对简单：向导 RNA 将 Cas9 蛋白引导至 DNA 序列这是与 RNA 互补的。然后 Cas9 进行切割，产生双链断裂 (DSB)。然后，细胞通过非同源末端连接（通常导致敲除突变）或同源定向修复（可用于敲入突变）来修复切口s。然而，无论采用何种修复方法，这种传统的 CRISPR/Cas9 编辑方式在很大程度上依赖于指导 RNA 仅将 Cas9 引导至指定的目标位点。当 Cas9 非特异性结合时，可能会发生脱靶突变，从而导致不良的基因组修饰。

过去几年的新基因编辑创新旨在提高基因编辑的精度。碱基编辑采用 CRISPR/Cas9 系统的元素，但与其他酶一起工作，直接在非分裂细胞的 DNA 中插入单个点突变，而不会产生双链断裂 (Komor et al. 2016)。这大大减少了无意编辑的数量。

最近，优质编辑席卷了世界和世界媒体。这涉及到使用一种仅在 DNA 上产生切口的 Cas9，而不是造成完整的双链断裂。而不是提供引导 RNA 来靶向分子切割以及新的模板 DNA 来拼出新基因c 代码，prime 编辑中的引导 RNA 可以同时完成这两件事。然后，DNA 缺口触发编辑后的向导 RNA 逆转录到 DNA 靶位点，再次导致脱靶突变少得多（Anzalone 等人，2019）。

然而，这些创新都没有解决这个问题扩展这项技术的难度。这就是 oxgene™ 的领先地位。

我们高度优化且有质量保证的自动化 CRISPR 细胞系工程工作流程建立在强大的多学科框架的基础上。我们汇集了生物学、信息学和自动化方面的专业知识，创建了一个强大而高效的高通量基因工程平台，每年定期编辑数百个细胞系，并在基于基因型预测的蛋白质水平上具有令人印象深刻的 KO 成功率。< /p>

OXGENE 的平台可自动执行基因编辑的许多常规、重复或耗时的元素，这些部分是协议中最有可能出现人为错误的部分。

小组组长实验室自动化部门的 Simon Pollack 解释了 OXGENE 如何着手构建平台的基础设施：\"首先，我们自动化了高通量扫描板的过程。然后我们构建了 IT 基础设施和程序来处理克隆验证。下一个挑战是使克隆挑选正确自动化。但最好的一点是构建和优化用户界面，这样科学家就可以完全控制自己的工作，而不需要自动化团队的输入。”

OXGENE 基因组工程能力的成功显然没有”不要仅仅依靠他们的机器人。事实上，OXGENE 的自动化专家、设计高精度指南和引物的内部生物信息学团队、运行方案的生物学家以及与团队密切合作以确保严格的运营规划和资源的项目经理之间的密切合作都是关键要素OXGENE 平台的优势。

尽管他们目前取得了成功, OXGENE 尚未完成创新。

领导我们基因编辑​​团队的 Pela Derizioti 指出，\"我们目前正在优化更复杂细胞类型的条件，例如我们高通量细胞上的原代细胞和干细胞。吞吐量平台，也适用于更复杂的修改，例如敲入。”

Simon 总结了 OXGENE 的精神：\"在一年之内，我们的产能将再次翻倍。” \"我们永远不会完成创新。”佩拉总结道。