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WGBS 服务(全基因组亚硫酸氢盐测序)|成岩节点

  
  2024-04-28
  
Diagenode.comDNA 甲基化分析服务WGBS(全基因组亚硫酸氢盐测序)和 EM-seq(酶促甲基化)服务 WGBS(全基因组亚硫酸氢盐测序)和 EM-seq(酶促甲基化)服务\"defaultDescription DocumentsRelated获取报价

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全基因组亚硫酸氢盐测序 (WGBS) 和酶促甲基化 (EM-seq)获得全面 DNA 甲基化分析的首选方法,评估整个基因组几乎每个 CpG 位点的甲基化模式。通过比较同一位置未转化和转化胞嘧啶的比例,甲基化上的水平被准确地确定。全基因组甲基化测序(WGBS 和 EM-seq)提供了对基因调控的深入洞察,允许识别新的表观遗传标记和疾病靶标。

深入的 DNA 甲基化分析非常强大的全基因组生物标记发现解决方案与低输入兼容和高度片段化的 cfDNA 和 FFPE 样本单核苷酸分辨率评估整个基因组几乎每个 CpG 位点的甲基化状态检测全局甲基化模式,包括 CpG 岛外和低 CpG 密度区域识别区域甚至组间差异甲基化的位点使用生物信息学工具识别甲基化模式/签名预测并通过数据挖掘方法区分不同的群体提供对发展和疾病的更好理解全面的端到端服务从 DNA QC 到测序原始数据一位敬业的科学家以高水平推动您的项目touch communication高质量的生物信息学支持(应要求提供)以协助您进行数据分析

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服务工作流程WGBS 服务包括:

基因组 DNA 的质量控制

DNA 浓度的测量DNA 质量的评估

文库制备

WGBS

Bioruptor Pico 上的 gDNA 剪切(cfDNA 或 FFPE 不需要)亚硫酸氢盐转化WGBS 文库的文库制备 QC(DNA 浓度、图谱分析)EM -seqg Bioruptor Pico 上的 DNA 剪切(cfDNA 或 FFPE 不需要)使用酶促转化的文库制备 EM-seq 文库的 QC(DNA 浓缩,图谱分析)

深度测序

样品在 Illumina 平台上进行测序,150bp 长度的配对末端读数 (PE150) 每个样本平均有 400M 原始读数(当汇集 6 个样本/泳道时)理论覆盖率 >30X 人类、小鼠 and 大鼠样本检测超过 5000 万个 CpG,人类样本的平均 CpG 覆盖率为 6-9 倍) 分析注解基因组区域(外显子、内含子……)和 CpG 岛位置(岛、海岸、货架……)的 DMC 和 DMR 聚类分析

基因本体术语分析

与 DMC 相关的基因富集分析和 DMRs 获得功能见解

通路分析

识别与 DMC 和 DMRs 相关的基因可能被过度代表(或代表不足)的生物通路获得机制见解

数据挖掘

生物标志物发现确定可以预测的甲基化模式/签名激励和区分不同的组/条件文档表观基因组学分析服务传单染色质分析DNA甲基化服务RNA序列分析下载出版物如何在您的工作中正确引用此产品

Diagenode 强烈建议使用此:WGBS(全基因组亚硫酸氢盐测序)和 EM-seq(酶促甲基化)服务(Diagenode 目录号 G02040000)。单击此处复制到剪贴板。

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小鼠 Müller 神经胶质细胞的发育和表观遗传可塑性。 Dvoriantchikova G、Seemungal RJ、Ivanov D在某些物种中发现了在受伤后再生整个视网膜和恢复失明的能力,并且主要依赖于 Müller 神经胶质细胞的表观遗传可塑性。为了解哺乳动物 Müller 胶质细胞作为视网膜再生祖细胞来源的作用,我们调查了基因表达的变化...

e成年小鼠视网膜色素上皮细胞再生视网膜组织能力受损的遗传学基础。 Dvoriantchikova G、Seemungal RJ、Ivanov D两栖动物视网膜色素上皮细胞 (RPE) 的表观遗传可塑性使它们能够再生整个视网膜,这是哺乳动物已知不存在的特征。在这项研究中,我们研究了成年小鼠 RPE 的表观遗传可塑性,以确定阻止哺乳动物 RPE 再生视网膜的可能机制。

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全基因组亚硫酸氢盐测序 (WGBS) 和 酶促甲基化化 (EM-seq) 是获得全面的 DNA 甲基化分析、评估整个基因组几乎每个 CpG 位点的甲基化模式的首选方法。通过比较同一位置未转化和转化的胞嘧啶的比例,可以准确地确定甲基化水平。全基因组甲基化测序(WGBS 和 EM-seq)提供了对基因调控的深入洞察,允许识别新的表观遗传标记和疾病靶点。

深入DNA 甲基化分析

  • 非常强大的全基因组生物标志物发现解决方案,与低输入和高度片段化的 cfDNA 和 FFPE 样品兼容
  • 单核苷酸分辨率
  • 评估整个基因组几乎每个 CpG 位点的甲基化状态
  • 检测全局甲基化模式,包括 CpG 岛外和低 CpG 密度区域
  • 识别区域或使用生物信息学工具甚至在群体之间具有差异甲基化的位点
  • 使用数据挖掘方法预测和区分不同群体的甲基化模式/特征识别
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全面的端到端服务

  • 从 DNA QC 到测序原始数据
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    WGBS 服务包括:

    基因组 DNA 的 QC

    文库准备

    深度测序

    • DNA浓度测量
    • li >DNA 质量评估

    WGBS

    • Bioruptor Pico 上的 gDNA 剪切(cfDNA 或 FFPE 不需要)
    • 亚硫酸氢盐转化
    • 库准备
    • WGBS 文库的 QC(DNA 浓度、图谱分析)
    EM-seq
    • Bioruptor Pico 上的 gDNA 剪切(cfDNA 或 FFPE 不需要)
    • 使用酶促转化制备文库
    • EM-seq 库的 QCies(DNA浓度,剖面分析)
    • 样品在Illumina平台上测序, 150bp 长度的双端读取 (PE150)
    • 400M raw reads on average per sample (when pooling 6 samples/lane)
    • 人、小鼠和大鼠样品的理论覆盖率>30X
    • 检测超过 5000 万个 CpG,平均 CpG 覆盖率为人类样本的 6-9 倍State电子邮件 * div class=\"small-9 large-10 columns\">邮箱验证ion*Comment联系我State电子邮件 *邮箱验证*评论联系我State电子邮件 *邮箱验证*评论联系我状态 电子邮件* 邮箱验证* 项目 联系我 State电子邮件 *电子邮件验证* /span>评论 div class=\"small-9 large-10 columns\">联系我×
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