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抗生素是指的由微生物发酵而产生的具有抗病原体或其他活性的一类次级代谢产物，包括天然抗生素（比如青霉素）后期经过半合成的抗 生素（比如阿莫西林）。抗 生素绝大多数都属于抗菌药，但是有一小部分，如抗肿瘤作用抗生素（比如柔红霉素、正定霉素、博莱霉素等）和抗免疫作用的抗生素（比如环孢霉素）不属于抗菌药部分。当然抗菌药中也不全都是抗生素，还有一部分是人工合成抗菌药，比如磺胺类（如SMZ）、喹诺酮类（如氧氟沙星）、硝基呋喃类（如痢特灵）、硝基咪唑类（如替硝唑）、恶唑烷酮类（如利奈唑胺）抗菌药。
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