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gene mutation
由于DNA发碱基增添、缺失或改变,引起基结构改变,叫做基突变.
1基内部遗传结构改变 .称点突变,通引起定表型变化 .广义突变包括染色体畸变.狭义突变专指点突变.实际畸变点突变界限并明确,特别微细畸变更.野型基通突变突变型基.突变型词既指突变基,指具突变基体.
基突变通发DNA复制期,即细胞裂间期,包括丝裂间期减数裂间期;同基突变脱氧核糖核酸复制、DNA损伤修复、癌变衰都关系,基突变物进化重要素,所研究基突变除本身理论意义外广泛物意义.基突变遗传研究提供突变型,育种工作提供素材,所科研究产实际意义.
基变异 基变异指基组DNA发突遗传变异.水平看,基变异指基结构发碱基组或排列顺序改变.基虽十稳定,能细胞裂精确复制自,种隐定性相.
定条件基原存形式突改变另种新存形式,位点,突现新基,代替原基,基叫做变异基.于代表现突现祖先未新性状.
最近导师要求做一个关于PARP家族蛋白在肝癌和癌旁组织中转录以及表达情况的初步研究,以确定目前的课题是否有很大价值。我之前一直在做湿实验,没有生信背景,所以对这个工作比较头疼。我不会编程,所以直接上网查找有没有可以在网上直接进行分析的网站。我一开始是上cbioportal上对肝癌的mRNA转录谱进行分析,但网站里面提供的对照是一个所谓的标准正常人。我没查到这个所谓的标准正常人是什么,而且导师说肝癌可能存在个体差异,所以要求用肝癌及其对应的癌旁组织的转录谱和表达谱进行分析。我上GEO搜索癌旁组织(paracanceroustissue),根本什么想要的结果都没有。我现在完全是一头雾水,无从下手,希望有做相关领域工作的前辈们或是做与之类似的工作的前辈们提供指导,非常感谢!
1.形态突变:结构镰刀型细胞贫血症;体水平红眼突变白眼
2.化突变:镰刀型细胞贫血症血红蛋白结构突变原理
3.致死突变:比隐性纯合致死
二、噬菌体展示技术:编码噬菌体外壳蛋白基连接单克隆抗体DNA序列噬菌体表面表达相应单抗再噬菌体柱柱若含目蛋白与相应抗体特异性结合称噬菌体展示技术技术主要用于研究蛋白质间相互作用仅高通量及简便特点具直接基、高选择性筛选复杂混合物、筛选程通适改变条件直接评价相互结合特异性等优点目前用优化噬菌体展示技术已经展示鼠两种特殊细胞系cdna文库并离皮信号传导途径信号
三、等离共振技术:表面等离共振技术(Surface Plasmon ResonanceSPR)已蛋白质相互作用研究新手段原理利用种纳米级薄膜吸附诱饵蛋白待测蛋白与诱饵蛋白结合薄膜共振性质发改变通检测便知两种蛋白结合情况SPR技术优点需标记物或染料反应程实监控测定快速且安全用于检测蛋白核酸及其物间相互作用
四、荧光能量转移技术:荧光共振能量转移(FRET )广泛用于研究间距离及其相互作用; 与荧光显微镜结合定量获取关物体内蛋白质、脂类、DNA RNA 空信息随着绿色荧光蛋白(GFP)发展FRET 荧光显微镜能实测量体细胞内态性质提种定量测量FRET效率及供体与受体间距离简单仅需使用组滤光片测量比值利用供体受体发射谱消除光谱间串扰该简单快速实定量测量FRET 效率供体与受体间距离尤其适用于基于GFP 供体受体
五、抗体与蛋白质阵列技术:蛋白芯片技术现给蛋白质组研究带新思路蛋白质组研究主要内容研究同理状态蛋白水平量变微型化集化高通量化抗体芯片非研究工具芯片发展快芯片且技术已经益熟些抗体芯片已经向临床应用发展比肿瘤标志物抗体芯片等已经应用再眼各领域
六、免疫共沉淀技术:免疫共沉淀主要用研究蛋白质与蛋白质相互作用种技术其基本原理细胞裂解液加入抗兴趣蛋白抗体孵育再加入与抗体特异结合结合于Pansobin珠金黄色葡萄球菌蛋白A(SPA)若细胞与兴趣蛋白结合目蛋白形种复合物:目蛋白—兴趣蛋白—抗兴趣蛋白抗体—SPA|PansobinSPA|Pansobin比较复合物离离经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳复合物四组经Western blotting用抗体检测目蛋白否预测蛋白种目蛋白细胞内与兴趣蛋白结合符合体内实际情况蛋白信度高种两缺陷:两种蛋白质结合能直接结合能第三者间起桥梁作用;二必须实验前预测目蛋白选择检测抗体所若预测确实验结本身具冒险性
七、pull-down技术:蛋白质相互作用类型牢固型相互作用暂型相互作用两种牢固型相互作用亚基蛋白复合体见通免疫共沉淀(Co-IP) 、Pull-down技术或Far-western研究Pull-down技术用固相化、已标记饵蛋白或标签蛋白(物素-、PolyHis-或GST-)细胞裂解液钓与相互作用蛋白通Pull-down技术确定已知蛋白与钓蛋白或已纯化相关蛋白间相互作用关系体外传路或翻译体系检测蛋白相互作用关系
其突变性状可用生化的方法鉴别,与可见的形态突变型迥然有别。代表性的例子如与氨基酸、维生素、核酸碱基等合成代谢有关的酶失活的营养突变型,以及呼吸突变型、抗药突变型等。它们不仅广泛用于遗传学分析,而且还用于活体内代谢途径的研究和物质的生物测定等。还有许多未知用途。
基因突变可以是自发的也可以是诱发的。自发产生的基因突变型和诱发产生的基因突变型之间没有本质上的不同,基因突变诱变剂的作用也只是提高了基因的突变率。
按照表型效应,突变型可以区分为形态突变型、生化突变型以及致死突变型等。这样的区分并不涉及突变的本质,而且也不严格。因为形态的突变和致死的突变必然有它们的生物化学基础,所以严格地讲一切突变型都是生物化学突变型。根据碱基变化的情况,基因突变一般可分为碱基置换突变(base substitution和移码突变(frameshift mutation)两大类。
用酵母双杂交或是细菌双杂交?
白细胞介素10(IL-10)是一种由多种细胞亚群产生的重要免疫调节因子。
早期研究显示,其主要生物功能为限制炎症反应及调节多种免疫细胞的分化和增殖,例如:T细胞、B细胞、NK细胞、
抗原呈递细胞、肥大细胞、粒细胞等。近来研究结果提示,IL-10也可以介导免疫反应的激活,有助于清除感染及非感染
颗粒且只产生轻微的炎症反应。大量的研究,包括患者IL-10的表达分析、体外实验及动物实验表明,IL-10与自身免疫
性疾病、炎症、肿瘤等疾病的发生、发展关系密切。临床试验主要集中于RA、炎症性肠病、银屑病、器官移植和丙型肝
炎等。虽然试验结果各不相同,但是使我们对IL-10在免疫反应中的作用的认识更加深入,同时也预示IL-10可以成为一
种治疗药物。目前,我国还没有重组基因工程IL-10药物上市,而且在探索如何高效表达具有生物活性rhIL-10的研究尚
处于起步阶段。本研究建立在国内外IL-10重组基因工程研究基础上,拟克隆人IL-10基因,通过原核、真核两种表达系
统表达IL-10蛋白,奠定重组基因工程研制人IL-10的基础。主要研究结果如下:一、依据Genbank中人类IL-10序列设计
一对特异性引物,应用RT-PCR技术,从LPS刺激的外周血单个核细胞中成功地克隆出hIL-10成熟肽编码序列,并将之克
隆入pGEM-T载体,构建出中间载体<WP=91>pGEM-T-hIL-10,转化入大肠杆菌JM109中,经酶切鉴定及序列测定与
分析,与GenBank中发表的(NM000572.2)hIL-10成熟肽编码序列完全一致。为hIL-10基因的表达研究奠定了基
础。二、从中间载体pGEM-T-hIL-10中将hIL-10成熟肽编码序列酶切回收,定向克隆至原核表达载体pET-28a(+)的T7
启动子下游,成功地构建了原核表达载体pET-28a(+)-hIL-10,将表达载体转化入大肠杆菌BL21(DE3)pLyss中获得表达
菌株,经IPTG的诱导获得较高表达,表达蛋白以包涵体形式存在。经薄层扫描确定目的蛋白表达量占菌体总蛋白的
28.7%。Westernblotting分析结果显示,表达产物与抗hIL-10单克隆抗体呈特异性阳性反应。产物经固相金属离子亲
和层析方法初步纯化,并在柱上应用浓度递减的尿素缓冲液对产物进行复性。活性研究结果表明,复性产物具有抑制
LPS刺激的外周血单核细胞表达MHCⅡ分子的活性。三、为了进一步获得高活性、高表达、适用于产业化生产的rhIL-
10,本研究选择应用酵母表达系统对hIL-10进行表达。应用PCR方法从pGEM-T-hIL-10扩增出hIL-10成熟肽编码序
列,并在其上下游分别引入EcoRI和BaxⅠ两个酶切位点,通过定向克隆成功地构建出分泌型酵母表达载体pPICZαA-
rhIL-10。采用电穿孔技术将表达单位转化入酵母菌P.pastorisX-33中,通过提取酵母基因组进行PCR鉴定以及
MD/MM营养表型筛选,初步筛选出10株可表达具有hIL-10活性的酵母菌。小量发酵培养表达菌株,以0.5%甲醇诱导
96小时,培养上清中蛋白经硫酸铵沉淀后,经SDS-PAGE、薄层扫描显示rhIL-10约占样品蛋白总量的10%。产物经固
相金属离子亲和层析方法初步纯化,纯度达94%。活性研究结果显示酵母表达的分泌型rhIL-10具有较原核表达产物更高
的活性。
1、RNA干扰基因蛋白的表达的过程是瞬间的还是一步步的,需要一段时间才能使目的基因沉默。
2、关于siRNA的合成,有好多种,但文献报道的一般是化学合成的和通过构建质粒表达载体完成的,但据俺了解,体外转录和RNA酶III酶切从时间上和价格上都比这两种方法好,为何这么多研究者青睐这两种方法呢
3、俺打算用此方法研究某个基因的功能,想先进行体外实验,然后再进行在体实验,请教各位,用哪种方法比较好?
4、如果用质粒的话,究竟用哪种质粒好呢?听说质粒比较昂贵,看到好多文献所用质粒都是惠赠的,怎么才能通过惠赠的方式获得质粒载体呢
或许俺提的这些问题过于低级,恳切希望各位高手予以解答,不才万分感激!

