HA-P342 | |
Name | pBMH-H3 (ACS71642) |
Description | Codon optimized full-length cDNA clone of H3N2 hemagglutinin (aa1-566) (A/Perth/16/2009) |
Application | Optimized for mammalian cell expression |
eEnzyme是一家美国高质量生物学试剂及检测试剂盒品牌供应商,其与美国国立卫生研究院合作紧密,在全球范围内为广大科研客户提供高品质的产品与技术服务,其主要生产销售高质量的抗体和用于传染病研究的抗体/抗原,细胞因子蛋白,pcr产品等用于分子和细胞生物学研究的生物试剂,产品应用于生物技术研究,制药,药物发现,癌症研究,传染性疾病,微生物和分子诊断等众多生命科学技术领域
eENZYME为科学界生产和销售高质量的生物试剂盒和生物分析试剂盒。与NIH密切合作以保证产品在生命科学研究的多个领域成功地使用。努力提供新颖价廉且有效的工具,使实验更容易成功。产品在科研、生物技术、制药和政府的研究实验室中得到广泛的应用,包括药物发现、癌症研究、传染病研究、微生物学和分子诊断。
【简单介绍】eENZYME生产销售高质量的抗体和用于传染病研究的抗体/抗原,细胞因子蛋白,PCR产品等用于分子和细胞生物学研究的生物试剂,产品应用于生物技术研究,制药,药物发现,癌症研究,传染性疾病,微生物和分子诊断等众多生命科学技术领域。【详细说明】欢迎eENZYMEeENZYME生产销售高质量的抗体和用于传染病研究的抗体/抗原,细胞因子蛋白,PCR产品等用于分子和细胞生物学研究的生物试剂,产品应用于生物技术研究,制药,药物发现,癌症研究,传染性疾病,微生物和分子诊断等众多生命科学技术领域。 Ë ENZYMEis的高品质生物试剂及实验室设备科学界一个制造商和分销商。我们密切合作,与美国国立卫生研究院的社区,以保证我们的产品生命科学研究在广泛领域的成功表现。我们致力于提供创新和具有成本效益的工具,使您更容易取得成功。我们的产品用于在学术,生物技术,制药和政府研究实验室,包括药物发现,癌症研究,传染病研究,微生物学和分子诊断许多不同的应用。公司网站:www.eenzyme.com 目录号描述产品类型应用单位供应商IA-01SW-0100抗HA(A/California/06/09)(甲型H1N1流感)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-011-0100抗H1(H1N1/Pan)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-001-0100抗HA1(A/新喀里多尼亚)(甲型H1N1流感)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-023-0100抗-NP(A/新Caledonia/20/1999)(甲型H1N1流感兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-022-0100抗M2型(H1N1/A/新喀里多尼亚(H1N1))兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-004A-0100抗-H3(H3N2)(A/WIS/2005)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0100抗-M1(H3N2)[A/Wyoming/3/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-004-0100抗HA(H3N2)[A/Wyoming/3/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-020-0100抗-NA(H3N2)[A/Wyoming/3/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-005H-0100抗H5(A/香港Kong/483/97)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-005-0100抗HA1(H5N1)(A/Vietnam/1203/2004)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-006-0100抗HA1(H5N1,禽流感)(A/斑头雁/Qinghai/12/05)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-010-0100抗-HA2(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-012-0100抗-M1(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-021-0100抗-NA(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1,人)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-025-0100抗NS1(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0100抗HA1(A/Chicken/NY/29878/91)(H2N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-009-0100抗HA1(A/chicken/HongKong/NT366/03)(H9N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-027-0100抗-NA(A/Chicken/HongKong/NT366/03)(H9N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-007-0100抗HA1(A/duck/Hainan/6/2004)(H6N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-008-0100抗HA1(A/鸡/荷兰/2/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-028-0100抗-NA(A/Chicken/Netherlands/1/03)(H7N7)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-0015-0100抗-H11(A/duck/Yangzhou/906/02)(H11N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0031抗B型流感(NP)的多克隆兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0032抗B型流感(医管局)多克隆兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-013-0100抗-H12(A/pintail/Alaska/102/05)(H12N5)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-014-0100抗-H4(A/environment/Maryland/1101/06)(H4N6)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-018抗-H15(A/Australia/83/00(H15N8))兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-019抗-H16(A/Sweden/99(H16N3))兔多克隆抗体WB等100微克eENZYME目录号描述产品类型应用单位供应商IA-01SW-0100抗HA(A/California/06/09)(甲型H1N1流感)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-011-0100抗H1(H1N1/Pan)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-001-0100抗HA1(A/新喀里多尼亚)(甲型H1N1流感)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-023-0100抗-NP(A/新Caledonia/20/1999)(甲型H1N1流感兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-022-0100抗M2型(H1N1/A/新喀里多尼亚(H1N1))兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-004A-0100抗-H3(H3N2)(A/WIS/2005)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0100抗-M1(H3N2)[A/Wyoming/3/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-004-0100抗HA(H3N2)[A/Wyoming/3/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-020-0100抗-NA(H3N2)[A/Wyoming/3/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-005H-0100抗H5(A/香港Kong/483/97)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-005-0100抗HA1(H5N1)(A/Vietnam/1203/2004)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-006-0100抗HA1(H5N1,禽流感)(A/斑头雁/Qinghai/12/05)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-010-0100抗-HA2(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-012-0100抗-M1(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-021-0100抗-NA(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1,人)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-025-0100抗NS1(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0100抗HA1(A/Chicken/NY/29878/91)(H2N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-009-0100抗HA1(A/chicken/HongKong/NT366/03)(H9N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-027-0100抗-NA(A/Chicken/HongKong/NT366/03)(H9N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-007-0100抗HA1(A/duck/Hainan/6/2004)(H6N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-008-0100抗HA1(A/鸡/荷兰/2/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-028-0100抗-NA(A/Chicken/Netherlands/1/03)(H7N7)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-0015-0100抗-H11(A/duck/Yangzhou/906/02)(H11N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0031抗B型流感(NP)的多克隆兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0032抗B型流感(医管局)多克隆兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-013-0100抗-H12(A/pintail/Alaska/102/05)(H12N5)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-014-0100抗-H4(A/environment/Maryland/1101/06)(H4N6)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-018抗-H15(A/Australia/83/00(H15N8))兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-019抗-H16(A/Sweden/99(H16N3))兔多克隆抗体WB等100微克eENZYME目录号描述产品类型应用单位供应商IA-01SW-0100抗HA(A/California/06/09)(甲型H1N1流感)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-011-0100抗H1(H1N1/Pan)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-001-0100抗HA1(A/新喀里多尼亚)(甲型H1N1流感)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-023-0100抗-NP(A/新Caledonia/20/1999)(甲型H1N1流感兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-022-0100抗M2型(H1N1/A/新喀里多尼亚(H1N1))兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-004A-0100抗-H3(H3N2)(A/WIS/2005)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0100抗-M1(H3N2)[A/Wyoming/3/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-004-0100抗HA(H3N2)[A/Wyoming/3/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-020-0100抗-NA(H3N2)[A/Wyoming/3/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-005H-0100抗H5(A/香港Kong/483/97)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-005-0100抗HA1(H5N1)(A/Vietnam/1203/2004)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-006-0100抗HA1(H5N1,禽流感)(A/斑头雁/Qinghai/12/05)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-010-0100抗-HA2(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-012-0100抗-M1(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-021-0100抗-NA(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1,人)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-025-0100抗NS1(A/Vietnam/1203/2004)(H5N1)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-003-0100抗HA1(A/Chicken/NY/29878/91)(H2N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-009-0100抗HA1(A/chicken/HongKong/NT366/03)(H9N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-027-0100抗-NA(A/Chicken/HongKong/NT366/03)(H9N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-007-0100抗HA1(A/duck/Hainan/6/2004)(H6N2)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-008-0100抗HA1(A/鸡/荷兰/2/03)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-028-0100抗-NA(A/Chicken/Netherlands/1/03)(H7N7)兔多克隆抗体WB等100微克eENZYMEIA-0015-0100抗-H11(A/duck/Yangzhou/906/02)(H11N2)兔多克隆抗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cDNA文库含有一种生物的部分基因,cDNA本质就是外显子
基因组文库大,其中基因含有启动子和内含子
cDNA文库小,没有内含子和启动子
我用简并引物从鸡cDNA中扩增出一个片段,约250bp,测序后拿来BLAST时却发现,与之同源性最高的并不是其它的Mx基因,而是人的某一个基因,比对的结果中与该序列同源性较高的有人及鼠Mx基因,但是同源性并不是很高。该基因在同一种生物的不同品种中具有多态性,已经有其它的鸡的Mx基因被克隆,按道理如果该片段是Mx基因的一部分它应该与其它的鸡的Mx基因有很高的同源性才对呀,所以,我怀疑简并引物PCR扩增出来的该片段不是Mx基因,因为RACE试剂盒很贵,现在也不敢继续作下去,怕作下去得不到什么结果。现在贴上我BLAST结果中score排在最前面的部分,还请有经验的兄弟帮我分析分析。我不胜感激。
Sequencesproducingsignificantalignments:(bits)Value
gi|19807872|gb|AC087694.3|Homosapienschromosome8,clone...460.033
gi|19073805|gb|AC090733.7|Homosapienschromosome8,clone...460.033
gi|38081550|ref|XM_358891.1|MusmusculussimilartoMyxovi...440.13
gi|47026513|gb|AC024957.9|Musmusculuschromosome16,clon...440.13
gi|13435314|gb|AC090999.1|CaenorhaBDitiseleganscosmidY8...440.13
gi|21955645|emb|AL732599.5|MouseDNAsequencefromcloneR...440.13
gi|199921|gb|J03368.1|MUSMX2Mouseinterferon-inducedMx2m...440.13
gi|31442540|gb|AC138314.4|MusmusculusBACcloneRP23-218B...420.52
gi|21591808|gb|AC092491.6|Homosapiens12BACRP11-125G9(...420.52
gi|40949625|gb|AC127597.5|MusmusculusBACcloneRP23-71A1...420.52
gi|6996929|ref|NM_010846.1|Musmusculusmyxovirus(influen...402.1
gi|15029783|gb|BC011113.1|Musmusculusmyxovirus(influenz...402.1
gi|13938021|gb|BC007127.1|Musmusculusmyxovirus(influenz...402.1
gi|19705454|ref|NM_134350.1|Rattusnorvegicusmyxovirus(i...402.1
gi|16041423|gb|AC091589.8|Homosapienschromosome18,clon...402.1
gi|47104230|gb|BT012815.1|Lycopersiconesculentumclone11...402.1
gi|20270172|gb|AC114485.2|Homosapienschromosome1clone...402.1
gi|28372591|gb|AC008939.8|Homosapienschromosome5clone...402.1
gi|19310326|gb|AC105250.3|HomosapiensBACcloneRP11-39C1...402.1
gi|37537322|dbj|BS000055.1|Pantroglodyteschromosome22c...402.1
gi|37537321|dbj|BS000054.1|Pantroglodyteschromosome22c...402.1
gi|18464281|gb|AC104690.2|HomosapiensBACcloneRP11-183P...402.1
gi|15321560|gb|AC079232.7|HomosapiensBACcloneRP11-360H...402.1
gi|56724|emb|X52713.1|RNMX3RatmRNAforMx3protein402.1
gi|56722|emb|X52712.1|RNMX2RatmRNAforMx2protein402.1
gi|56720|emb|X52711.1|RNMX1RatmRNAforMx1protein402.1
基克隆利用体外重组技术,特定基其DNA顺序插入载体基克隆主要目标识别、离特异基并获基完整 全序列,确定染色体定位,阐明基化功能,明确其特定性状遗传控制关系通几十努力由于植物发育,理化,遗传等科迅速发展,使 掌握量关植物优良性状基物遗传知识,再运用先进酶物技术已经克隆与植物抗病、抗虫、抗除草剂、抗逆,育性、高蛋白质 及与植物发育关许基我实验室麻抗真菌蛋白基作功能克隆研究(舒群芳等,1995;舒群芳等,1997),克隆植物基探讨 其克隆,本文论述基克隆策略、及取些进展
1 功能克隆(functional Cloning)
功能克 隆根据性状基本化特性功能信息,鉴定已知基功能克隆(Collis,1995)其具体作:纯化相应编码蛋白构建 cDNA文库或基组文库,DNA文库基筛选根据情况主要用二种办进行,(1)纯化蛋白质进行氨基酸测序,据合寡核苷酸探针cDNA 库或基组文库筛选编码基,(2)相应编码蛋白制相应抗体探针,cDNA入载体表达库筛选相应克隆功能克隆种经典基克隆策略, 基离利用种策略
Hain等葡萄克隆两编码白藜芦醇合二苯乙烯合酶基(Vst1Vst2),葡萄抗菌化合 物白藜芦醇存,提高灰质葡萄孢(Botrytis cinerce)抗性,烟草其些植物二苯乙烯合酶,克隆该基经转基,些植物产灰质葡萄孢抗性意义(Hain 等,1985)Kondo等1989编码水稻巯基蛋白酶抑制剂基组DNA做克隆序列析(Kondo等,1989)周兆斓等构建水稻 cDNA文库,离编码水稻巯基蛋白酶抑制剂cDNA(周兆斓等,1996)植物蛋白酶抑制剂类抗虫物质,抑制摄食害虫蛋白质消 化,使害虫缺乏所需氨基酸导致非发育或死亡胡华等烟草离流行于我黄瓜花叶病毒(Cucumber Mosaic virus)(CMV),并克隆编码该病毒外壳蛋白cDNA基(胡华等,1989)王春香等病烟草叶片离纯化马铃薯x病毒 (potato virus X, pvx),克隆完整马铃薯x病毒外壳蛋白基,并外壳蛋白基转入马铃薯,期获抗pvx病毒栽培种马铃薯(王春香等,1991)病毒外壳 蛋白(Coat protein cp)基功克隆,使转基植物产病毒外壳蛋白基介导抗性(Coat Protein Mediated Resistance CPMR)或病毒CP-RNA介导抗性Van kan 报道真菌功克隆毒基Avr9,直接利用基介导广谱高效基工程植物(Van Kan等,1991)我1995构建麻cDNA文库,制备抗体探针功离编码麻抗真菌蛋白基cDNA克隆,抗真菌基农业、医 药等面应用打基础(舒群芳等,1995;舒群芳等,1997)功能克隆特点用基表达产物蛋白质克隆基、虽某性状编码基未 知其理化及代谢途径研究比较清楚,离纯化控制该性状蛋白质功能克隆关键离纯度高蛋白质要纯 蛋白质,十特异探针,策略行效采用功能克隆虽已经克隆基,由于绝数基产物目前知道所数基 难用经典克隆随着物技术发展,条新基克隆策略逐渐形,定位克隆
2 定位克隆(Positional cloning)
根据遗传连锁析,染色体步移基定位染色体具体位置断缩筛选区域进克隆该基,研究该基功能或抗性化机制,种策略 叫定位克隆(Monaco,1994)连锁析即通基与DNA标记间重组系数估计两者间距离,若某种性状基与DNA标记代 离,即连锁起趋势根据原理与已知某DNA标记连锁基染色体定位由于连锁析需要依赖特定基作连锁标记,即标记基 与待研基间存连锁关系,满足与待研基相连锁基实太少,所连锁析克隆数基存着定困难RFLP现使态性基标记存 于整基组内,解决连锁析难克服困难
1980Wyman等科家首建立限制酶切片段度态性RFLP (restriction fragment length polymorphism),使任何种表型相关基定位能限制酶切片段度态性用限制性内切酶切割产DNA片段度态性呈 孟德尔式遗传,存于全基组独特态标记,RFLP使基定位变易行(Wyman等,1980)目前定位克隆般用RFLP等标记制作 遗传图谱,寻找与待测基连锁RFLP标记,获基染色体定位克隆基所RFLP发展起RAPD技术建立,待测基相 准确定位,利用已知基离与连锁未知基其基本程序构建基组文库、用已知A基探针,基组文库筛选与其同源序列 a克隆,再用a克隆探针基组文库筛选与a克隆同源序列b克隆,类推筛选未知基并离目前已番茄、烟草、麦、 水稻、豆、玉米等植物发现与抗病基紧密连锁RFLP标记并构建遗传图谱(Figdore等,1988;Heun等,1991;Smith, 1991;Diers等,1992)用种已别克隆拟南芥菜、番茄、水稻等植物关抗病基(Martin等,1993;Bent等, 1994;Mindrinos等,1994;Wenyuan等,1995) Martin等1993早用定位克隆技术克隆番茄pto基,pto基负责带毒基Avrpto细菌,丁香假单胞菌 (pseudomonas syringae pv)菌株抗性,Pto基导入病番茄转基植株增强病原菌抗性(Martin等,1993)Wenyuan等1995用技术克隆 水稻Xa21基,Xa21基真菌Xanthomonas oryzae pv oryzae (Xoo)具抗性(Wenyuan等,1995)
现在已经把bac克隆的质粒DNA提取出来了,但是在标记探针前,有以下几个疑问:
1:提取出的质粒DNA是否需要通过测序等方法进行验证该克隆的准确性?
2:是否需要把bac克隆的DNA从载体上酶切下来?如果酶切,UCSC数据库中提供的两侧序列末端的酶切位点就是吗?如果不用酶切,那载体片断在探针标记时会不会一同标记上从而影响后续试验结果?
3:在探针标记前,酶切或不酶切得到的bac克隆DNA是否需要进一步纯化?用普通的琼脂糖电泳切胶回收纯化就可以吗?那所用的切胶回收试剂盒应该是哪种的呀?
4:像我这种自己标记好探针,在作fish时,有现成的试剂盒吗?
第一次做fish,有好多不是很清楚的地方,查阅大量文献中也只是提供其中几个关键步骤,希望有经验的朋友提供宝贵意见,给与指导。
非常感谢!!!
序列析:SnapGene ViewerSerialCloner 2-6-1