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제품특징
* 본 제품으로 합성한 cDNA는 Illumina와 Ion Torrent sequencing platform에 모두 적용 가능합니다.SMARTer Ultra Low Input RNAKit for Sequencing - v3는 매우 소량의 total RNA (10 pg-10 ng)나 single cell (1-1,000개의 cells)로부터 바로 RNA-Seq (Transcriptome analysis)에 이용할 수 있는cDNA를 제작할 수 있는 제품이다. 이전 버전의 SMARTer Ultra Low RNA Kit for Illumina Sequencing-HV 제품에 비하여 SMARTer Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing - v3는 보다 많은 유전자를 동정할 수 있고, 높은 transcript mapping율을 보일 뿐만 아니라 더 높은 exon 커버율을보인다 (greater number of genes, higher transcript mapping, andhigher exon coverage). 또한 본 제품은 Illumina와 Ion Torrent 등 다양한 회사의 library preparationkit 또는 sequencing 기기에 적용 가능하다. 본 제품의 핵심 기술인 SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template)법은 세포의splice junction과 alteranative splicing event를 포함한전반적인 전사체 연구 (full transcriptome analysis)에 있어 매우 유용한 기술이다. 또한, 본 제품은 high quality RNA (RIN > 8)나 intact cell로부터 특이적으로 mRNA를 증폭할 수 있다.
□ 특징
- Sample prep made easy - The single-tube protocol works directly on whole cells and preserves sample integrity
- Unparalleled sensitivity - Start with as little as 1 cell or 10 pg of total RNA (input range: 1-1,000 cells or 10 pg-10 ng of total RNA)
- Improved cDNA amplification - The SeqAmp DNA Polymerase included in the kit better amplifies high GC-content genes
- Suitable for multiple sequencing platforms - cDNA libraries are compatible with either Illumina® or Ion Torrent NGS platforms
- High-quality RNA-seq data - Get a higher number of genes identified, full length gene analysis, typically less than 2% rRNA reads, and improved representation of GC-rich genes
그림 1. Comparison of sequencing metricsgenerated with either the SMARTer Ultra Low Input RNA for Illumina Sequencingkit (UL-HV) or the SMARTer Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing - v3 (UL-v3). cDNA libraries were generatedfrom either 100 pg Human Brain Total RNA (HBR) or 10 pg Mouse Brain Total RNA(MBR) and were sequenced on an Illumina MiSeq platform. The increasedsensitivity gained using the UL-v3 protocol is most significant at the lowestRNA inputs.
그림 2. Individualcells or 1,000 cells (HeLa or Jurkat; Panel A and Panel B, respectively) wereused as input for the SMARTer Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing - v3. The cDNA samples were analyzedon an Agilent 2100 Bioanalyzer. The single main peak indicates the purity andyield of the cDNA (the additional peak at ~1 kb in the HeLa cell samples is thecontribution of a single highly expressed gene, FTH1).
그림 3. Sequencing results for librariesmade from 100 pg Human Brain Total RNA using either the SMARTer Ultra Low InputRNA for Illumina Sequencing kit (UL-HV) or the SMARTer Ultra Low Input RNA Kitfor Sequencing - v3 (UL-v3). Genes were binned by GC content and correlationplots were used to evaluate the two kits. The average gene counts were veryreproducible for replicate samples using UL-HV (Panel A) or UL-v3 (Panel B).When the two protocols were compared, genes with a high GC content (red) showedhigher expression with the UL-v3 protocol while genes with a median or low GCcontent (gray and blue, respectively) showed similar expression levels withboth protocols (Panel C).
그림 4. The gene body coverage of the cDNA libraries madefrom 1 or 1,000 HeLa cells (blue and red lines, respectively), or 1 or 1,000Jurkat cells (green and purple lines, respectively) using the SMARTer Ultra LowInput RNA Kit for Sequencing - v3 was determined using RSeQC. Read coverage wasnormalized using Excel.
그림 5. cDNA libraries were made from 1 or1,000 cells (HeLa or Jurkat) using the SMARTer Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing - v3 (UL-v3). Results of Illumina library preparation andsequencing. Table IIB. Results of Ion Torrent library preparation andsequencing.
□ 적용
● Transcriptome sequencing (RNA-Seq)을 위한 소량의 cell 또는 total RNA로부터 cDNA 합성
● 본 제품으로 합성한 cDNA는 Illumina sequencing platfomr에 적용하기 위하여, Clontech의 LowInput Library Prep Kit (code 634947) 또는 Nextra sample preparation kit을 이용할 수 있다. 또한 IonTorrent를 이용하기 위해서는 Ion Xpress Plus Fragment Library Kit을 사용 가능하다.
□ 구성품
* SMARTer Ultra Low Input RNAKit for Sequencing - v3 Components (Cat. No. 634854; not sold separately) * SeqAmp DNA Polymerase (Cat. No. 638504)
* SMARTer Ultra Low Input RNAKit for Sequencing - v3 (제품코드 634850) 종매 - 종매일 : 2017.11.27
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MPI是一种基于消息传递的并行编程技术，在不同节点计算机之间并行多进程执行程序（这种情况下，不同享内存），只是通过消息传递来进行通信，从而适用于分布式体系
谢谢！！！
测器和微处理器控制系统等组成.
光源灯发出的光线经过滤光片或单色器后,成为一束单色光.该单色光束经过酶标板中的待测标本,被标本吸收掉一部分后,到达光电检测器.光电检测器将投照到
上面的光信号的强弱转变成电信号的大小.此电信号经前置放大、对数放大、模数转换等处理后,送人微处理器进行数据处理和计算,最后通过显示器和打印机输出
测试结果.
3.1透过率、吸收度测量
a.暗电流调零：开启电源后，若试样室盖未打开，将显示提示符P.1（请做第一步骤操作），打开试样室盖直到接触检测开关，提示符P.1消失，显示暗电流值。如果它的绝对值小于5.0，则两秒内自动归零，否则可调节面板上之0%T旋钮。
b.调整参比讯号（100T/OA）：微机所显示的提示符为P.2（请做第二步操作）。将T—A—C旋钮开关置T/A，参比溶液放进1号试样槽并移入光路，关闭试样室盖，显示参比讯号强度，调整狭缝和光楔（试样槽拉手左面之100%T旋钮），使显示数在90.0—119.9%T或相应A值范围以内，2秒以内将自动调整为100%T/OA。
c.比色皿误差校正：为校正比色皿的系统误差，要求在同一次测量过程中，比色皿与槽位编号一一照应。将使用的比色皿盛参比溶液放进试样槽，移入光路，所显示的T（或A值）就反映了该与1号槽中比色皿之间的配对误差。按一下ADJ（Adjust）校正键，则误差数据存入微机并自动校正为100%T/OA。这项操作在每次开机后只需作一次，若所用的比色皿配对性很好，可免去这一步骤。开机时，校正系数初始值为1，即相当于不校正。
d.用同比色皿盛被测溶液放进同一试样槽，则显示校正后的透过率或吸光率。
3.2浓度测量
a.标准对照法
b.按3.1节（1）—（3）操作。
c.将标准浓度的样品放如光路。
d.旋钮开关至C，分别按三个浓度置数键，使显示数与已知浓度值一致，浓度值仅取其三为有效数字，小数点位置自定义。
e.将被测式样移入光路，则显示样品的浓度（比色皿误差已校正）。
3.2标准曲线法（标准曲线为直线）
a.按3.1节（1）—（3）操作。
b.旋钮至A， 调整光楔使A值变化至标准曲线高端某一点的坐标A0。
c.旋钮至C，按浓度置数键显示数与对应于A0的浓度值C0一致。
d.重新调整对比讯号后按（1）之（4）操作。
3.3测试完毕，依次关闭主机电源开关，电气箱开关，拔下电源插头，盖上护罩。
3.4认真填写使用操作记录。
最近想单位准备购买一台双荧光素酶报告基因检测仪，不知哪家公司有售，价格多少？谢谢！
