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HE染色主要是为通细胞及胞核形态、大小来区别各种细胞的，并不是直接通过颜色来区分的 苏木精染液为碱性 ，主要使细胞核内的染色质与胞质内的核糖体着紫蓝色 ；伊红为酸性染料 ，主要使细胞质和细胞外基质中的成分着红色 。
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