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Epigentek/ChromaFlash Chromatin Isolation & Shearing Kit/P-2023-100/100 preparations
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Epigentek/ChromaFlash Chromatin Isolation & Shearing Kit/P-2023-100/100 preparations
品牌 / 
Epigentek
货号 / 
P-2023-100
美元价:
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数    量:
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4000-520-616
InputType:UnisolatedSamples
ResearchArea:Chromatin&Transcription
TargetApplication:SampleIsolation
VesselFormat:Columns/Tubes
100%Guarantee:6months
ProductOverview

TheChromaFlash™ChromatinIsolation&ShearingKitisacompletesetofoptimizedbuffersandreagentsforisolatingchromatinorDNA-proteincomplexfrommammaliancellsortissuesinasimpleandrapidformat,followedbyashearingstepbysonication.Chromatinpreparedbythiskitcanbeusedinavarietyofchromatinimmunoprecipitationmethods.ItisalsotherecommendedmethodforobtainingchromatinrequiredbyEpigentek’sone-hourChIPmethodusingtheChromaFlash™One-StepChIPKit.Theisolatedchromatincanalsobeusedinotherchromatin-relatedapplicationssuchasinvitroprotein-DNAbindingassaysandnuclearenzymeassays.

WhenperformingChIP,chromatinorDNA-proteincomplexincellsortissuesshouldfirstbeisolatedandshearedtoadesiredsize.TheChromaFlash™ChromatinIsolation&ShearingKitaddressestheinconvenienceandtimeconsumingissuesofexistingchromatinpreparationmethodsbyintroducingthefollowingfeatures:

  • Fastprocedure:theentireprocedurefromcell/tissuesampletoready-to-useshearedchromatinislessthan2hours. 
  • ConvenientandflexIBLe:thekitissuitableforpreparingbothnativechromatinandcross-linkedchromatinfrommonolayerorsUSPensioncells,orfromtissues. 
  • Chromatinshearingstepispre-optimizedforsonicationwithvarioussonicationplatformsincludingwaterbath-based(EpiSonic,COVARIS,Bioruptor)sonicators,probe-basedsonicators(Branson,Misonix), andenzyme-basedmethods.

BackgroundInformation
Chromatinimmunoprecipitaton(ChIP)offersanadvantageoustoolforstudyingprotein-DNAinteraction.TheexperimentercandetermineifaspecificproteinbindstothespecificsequencesofageneinlivingcellsbycombiningChIPwithPCR(ChIP-PCR),microarray(ChIP-chip),orsequencing(ChIP-Seq)techniques.Forexample,themeasurementoftheamountofmethylatedhistoneH3atlysine9(meH3-K9)associatedwithaspecificgenepromoterregionundervariousconditionscanbeachievedthroughaChIP-PCRassay,whilerecruitmentofmeH3-K9tothepromotersonagenome-widescalecanbedetectedbyChIP-chip.Inparticular,aChIPmethodwithspecificantibodiesdirectlyagainstvarioustranscriptionalfactorsiswidelydemanded.

Principle&Procedure
TheChromaFlash™ChromatinIsolation&ShearingKitcontainsallreagentsrequiredforcarryingoutsuccessfulchromatinextractionandshearingdirectlyfrommammaliancellsortissues.Cellmembranesofthesample,withorwithoutcross-linking,arebrokendownusingtheprovidedlysisbuffer.ChromatinorDNA-proteincomplexisthenextractedwiththeextractionbuffer.Theextractedchromatinisthenshearedaccordingtotheprotocol"srecommendedprotocolsettingsforavarietyofsonicatorsoftheexperimenter"schoiceandstoredatanappropriatetemperatureafterbeingdilutedwithchromatinbuffer.

StartingMaterials&InputAmount
Startingmaterialscanincludevarioustissueorcellsamplessuchascellsfromflaskormicroplateculturedcells,freshandfrozentissues,etc.Theamountofcellsandtissuesforeachpreparationcanbe2 x10to 1x10cellsand10mgto400mg,respectively.Foroptimalpreparation,theinputamountshouldbe2to5 x10cellsor100to200mgtissues. Atotalof100standardextractions(using 2 x10cellsor100mgoftissueperextraction)canbeperformedwiththiskit.Theyieldofshearedchromatinisapproximately3µgper 10cellsorper50mgoftissue.


    Fig.1.SchematicprocedureoftheChromaFlash™ChromatinIsolation&ShearingKit.

     
    Fig.2. ChromatinwasextractedfromsixMDA-231cellsamples.40ul(8ug)ofchromatinwereshearedina0.2mltubeusingtheEpiSonic1100for20cycles(15secOnand30secOff).DNAwaspurifiedandthenrunonagel.

     
    Fig.3. TheshearedchromatinwasusedforChIP-qPCRanalysisofRNApolymeraseIIenrichmentinGAPDHandMLH1promotersbyusingtheChromaFlash One-StepChIPKit(P-2025)andtheMethylamp™MS-qPCRFastKit(P-1028).

      ProductComponents

      10XLysisBuffer
      ExtractionBuffer
      ChromatinBuffer
      ProteaseInhibitorCocktails(1000X)
      UserGuide 

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      如何选择缓冲溶液?_123
      sweetwater2021-07-21
      做试验的时候用到很多种缓冲液,Tris,triethanolamine,HEPES,还有磷酸缓冲液,不知道这些缓冲液之间有没有大的区别,选择缓冲液的依据是什么?

      如果只是为了缓冲酸碱度,是不是可以用一种缓冲液来代替所有其他的?这样做试验就方便多了。谢谢指教
      【1】酸碱缓冲溶液:其中的一般酸碱缓冲溶液是指控制溶液酸碱度的溶液.他的作用是在此溶液中,加入少量的强酸或强碱,或者将其稍加稀释时,溶液的ph值基本上保持不变.【2】可以维持溶液酸碱度稳定的原因:主要原因是因为构成一般酸碱缓冲溶液的组分是“一元共轭酸碱”.例如“醋酸-醋酸钠”酸碱缓冲溶液.由PH的计算式:pH = p Ka +log[C酸/C碱] ,可见C酸/C碱的微小改变,其PH值,基本不变.
      请问什么软件可以测蛋白质的酸碱性
      Whatman的网站上说DE52(货号4057-200)是预膨胀的(Preswollen),有的中文网站上说DE52是即用型。
      这就是说不用酸碱预处理吗?
      Whatman的网站上没有DE52最大耐受压力,请问又经验的战友应该是多少?

      Whatman的网站上:
      DE32DryMicrogranularDEAECellulose
      SimilarperformancecharacteristicsafterprecyclingasDE52.

      DE52PreswollenMicrogranularDEAECellulose
      ProbablythemostwidelyusedDEAEcelluloseintheworld;usedforbiopolymerswithlowtohighnegativecharges;exhibitsexcellentresolutionwithgoodflowrates.

      附件是一本图书(MethodsinMolecularMedicine,)的章节,上面说:
      WhatmanDEAE52comesalreadypreswollenandonlyneedstobetransferred
      totherunningbuffer50mMTE8.

      lAntibodiesUsingIonExchangeChromatography.pdf(87.06k)
      缓冲溶液为什么能够低抗外来酸碱对ph的改变
      【酸碱缓冲溶液的类型及选择】酸碱缓冲溶液有三种类型:
      1、弱酸和它的盐(如:HAc---NaAc)的水溶液组成;
      2、弱碱和它的盐(如:NH3·H2O---NH4Cl)的水溶液组成;
      3、多元弱酸的酸式盐及其对应的次级盐(如:NaH2PO4---Na2HPO4)的水溶液组成。
      酸碱缓冲溶液的选型一般应根据具体情况进行选择。缓冲酸性可选用碱性缓冲液,缓冲酸性可采用碱性缓冲液。常用作缓冲溶液的酸类由弱酸及其共轭酸盐组合成的溶液具有缓冲作用。生化实验室常用的缓冲系主要有磷酸、柠檬酸、碳酸、醋酸、巴比妥酸、Tris(三羟甲基氨基甲烷)等系统,生化实验或研究工作中要慎重地选择缓冲体系,因为有时影响实验结果的因素并不是缓冲液的pH值,而是缓冲液中的某种离子。如硼酸盐、柠檬酸盐、磷酸盐和三羟甲基甲烷等缓冲剂都可能产生不需要的化学反应。
      【酸碱缓冲溶液】由弱酸及其盐、弱碱及其盐组成的混合溶液,能在一定程度上抵消、减轻外加强酸或强碱对溶液酸碱度的影响,从而保持溶液的pH值相对稳定。这种溶液称为酸碱缓冲溶液。
      PH值在多少为碱性水?123
      wuzhixuan20032005-06-13
      25倍电转缓冲液的ph=8.3真的不能调吗?听师兄说一次配好液后它的ph值就必须是8.3,不能再进行加酸或加碱调节,可我配了一天也没达到这个要求,用的是18g甘氨酸和3.64g的trisbase加dd水到100ml,总是ph值到8.8左右,在配过程中可以加热吗,不然太难溶解了,
      我按下面方法配制电泳缓冲液
      Tris-base15.1g
      甘氨酸94g
      SDS5g
      H2O1000ml
      听人说就这样配制,PH值就会在8.3左右,都不要怎么调PH的,但不知我这样配制后PH值在6.4左右?迷惑,配制了几次还是这样。本人初次做sds-page,请前辈们指教。
      另外Tris是以前师兄留下的,几年了已经,SDS也是以前的,但是没有开封,密封的很好。甘氨酸是新买进口封装的。会不会试剂过期的原因?
      药典上说取本品10ml,加甲基红指示液(变色范围ph4.2-6.3,红~黄)2滴不得显红色;加溴麝香草酚蓝(变色范围ph6.0-7.6,黄~蓝)5滴不得显蓝色。
      是否可以理解为纯化水得PH范围为6.3-7.6?能否直接用pH计测量?谢谢!
      如题:
      两个CEX方法A和B测定同一单抗,结果碱性峰比例差不多,酸性峰比例相差约7%,相应主峰也差了7%左右。
      具体来说,A方法酸性峰高,主峰低,碱性峰稍微低点;B方法酸性峰低,主峰高,碱性峰稍微高点;另外也做了CIEF,结果呢和A方法更接近。
      仔细比较起来,AB两个方法的峰性和数量差不多,就不知道为什么会有这么大的差异。两个方法一个用的WCX柱-磷酸缓冲液,一个用SCX柱-MES缓冲液
      大家帮我分析下:
      1.两个方法哪个方法更准确,是以酸性峰高的为准还是什么?为什么?
      2.这显著差异是由方法造成,具体原因是什么?柱子?
      3.CIEF的结果和A方法更接近,是不是可以由此证明A方法更好或者CIEF的方法更好(因为CIEF更快更方便)?
      欢迎讨论~
      纠正下,A方法用的是Tosoh的柱子,B方法用的是SCX柱。TOSOH的柱子是7um的填料,10cm长。SCX是10um的填料。我本人TOSOH的阳离子柱子用的很少,这次信手用用,结果发现差异很大
      那我现在就考虑,在以后方法开发过程中,除了通过流动相pH和组成、梯度、柱子选择来获得样品主峰和酸碱性的最大分离,还要关注各峰比例。因为之前比较方法好坏都只看分离度,尤其是主峰和邻近峰的分离度,获得最大分离度,自然可以做到主峰尽可能纯,但从未认真比较过各峰比例。这是一个大疏忽吧!
      另外,CIEF和CEX方法原理还是有点差异的,所以分的是不同的异质体,原液放行两个方法肯定是都要做的。问题就是在早期细胞株筛选和工艺开发阶段,哪个方法才是又快又准。CIEF(iCE280)一般15分钟一个样,比CEX快多了。如果CIEF测得主峰要低于CEX结果,是不是真的完全可以取代CEX呢?CEX分离出的峰远比CIEF的多!
      欢迎大家继续讨论~

      :)
      我在做一细菌不同酸碱度生长状况时,发现这些奇怪现象:pH=3的培养基灭菌(TSB液体培养基)灭菌后pH上升到到9.2!而原来pH=9.0的降到8.7(基本没多少变化),请问各位大侠,这是什么原因?

      一般做不同酸碱度生长实验时,该如何才能防止pH在湿热灭菌后基本不变化?
      求助:我目前需用离子交换法进行蛋白质的分离和纯化,但是我不知道要纯化的蛋白质的等电点,怎么样选择柱料及洗脱缓冲液呢?如果必须知道,有没有什么简便的方法测定蛋白质的等电点呢?谢谢
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