
Source | M.W. | 311.36 | CAS No. | 1226056-71-8 | |
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Structural Info | ![]() | ||||
Formulation | Powder | ||||
Reconstitution | Before reconstitution, we recommend a brief spin todrive down any material dislodged from the bottom of the tube. The compound is soluble in DMSO. | ||||
Stability | The powder is stable for at least 1 year if stored at-20 °C.The dissolved compound isstable for at least 1 month at 4 °C, but should be stored in aliquots at-20 °C for longer term. Protectfrom light. | ||||
Purity | Greater than 99% as determined by LC/MS analysis.LC/MS and/or NMR data available upon request. | ||||
Biological Activity | Tested active for culturing human iPS cells in serum-free medium on Matrigel coated plates. | ||||
Country of Origin | USA |
Thiazovivin,N-benzyl-2-(pyrimidin-4-ylamino)thiazole-4-carboxamide, is a selectiveinhibitor of Rho-associated kinase (ROCK). It protects human ES cells from death in the absence of ECM byregulating E-cadherin mediated cell-cell interaction.Thiazovivin, in combination with inhibitorsof the TGF-beta receptor and the MEK kinases, improves reprogramming efficiencydramatically.Ref: Lin, T., et al. (2009) Achemical platform for improved induction of human iPSCs. Nature Methods. 6(11):805.
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准备RNA用的试剂:70%乙醇(用DEPC处理后的水稀释新开封的无水乙醇),DEPC处理后的水,新开封的三氯甲烷等,
容器:玻璃试剂瓶需要180度,8个小时以上烘烤
Eppendorf管和“枪头”:RNase-free的管子和“枪头”(可以直接买到);或者普通的ep管和“枪头”,但是需要DEPC水浸泡后,高温灭菌(121度,20-40分钟)。
如果需要使用研钵和药品匙,研钵和药品匙也是需要180度,8小时以上的烘烤。
还需要没开封的手套,提取RNA时,尽量勤换手套,少说话,尽量不要对着样品吹气。
在样品用液氮瞬间冻结之后,应该储存在-80°C,千万不能解冻。即使是置于含有胍盐的裂解液中作匀浆前的短暂解冻,也会导致RNA的降解和损失。瞬间冻结的组织应该首先在超低温条件下先研磨成粉,然后置于裂解液中进行匀浆。
RNAfixer使样品储存更为便利。储存在RNAfixer中的细胞或组织可在室温下稳定保存长达1个星期,在4°C可稳定保存长达1个月,或永久保存在-20°C。
2. 消除环境RNase的污染
为了得到完整的、高品质RNA,在整个RNA制备过程中,当RNA离开强蛋白变性剂(如离液裂解液或酚)的保护时,避免引入新的RNase污染就非常关键。由于RNase几乎是无所不在,所以必须确保与纯化的RNA接触的每一样东西都是无RNase污染的。所有的表面,包括移液器、工作台、玻璃器皿和制胶设备,都必须用表面去污净化溶液如RNase喷雾清除剂 来处理过,去除各种溶液或者反应缓冲液中可能存在的RNase污染,可以用RNAsafe。必须保证一直使用无RNase的枪头、试管和溶液,手套也应经常更换。
3.迅速灭活内源的RNA酶,以防止RNA降解。
以下3个方法均可有效使内源RNA酶失活:
1)、用含离液(如胍盐)的细胞裂解液收获样品,并立即匀浆。
2)、用液氮瞬间冻结样品。值得特别注意的是:组织块必须保证足够小,在浸入液氮的瞬间就能冻结,以确保瞬间令RNA酶失活。
3)、立即将样品置于RNAfixer无液氮RNA样品储存液中。它是一种水相、无毒的收集试剂,能立即稳定并保护完整、未冻结的组织和细胞样品中的RNA。关键要点是组织样品切片一定要够薄(<0.5 cm),这样RNAfixer才能在RNase破坏RNA之前迅速渗入组织块中。
4. 选择合适破壁方法
细胞或组织的彻底匀浆对RNA提取来说,是一个很关键的步骤,它能够防止RNA的损失和降解。匀浆的方法应根据细胞或组织的类型来选择。大部分培养的细胞可以置于细胞裂解液中,通过简单的涡旋震荡来匀浆;而动物组织、植物组织、酵母和细菌、真菌则常常需要更加剧烈的方法,通常用液氮研磨。比如说细菌(特别是革兰氏阳性菌)的细胞壁,就需要溶菌酶消化来实现彻底的细胞裂解和RNA的最大回收,酵母提取时加入破壁酶帮助破壁,再用TRIpure或RNApure进行提取。
5. RNA提取少走弯路——不同材料如何选择最适RNA提取试剂
现有众多的RNA分离方法也许令人难以取舍。目前最简单也是最安全的方法是柱式分离,如RNApure 因为操作简单,时间短,纯度高而受到大家的喜爱,RNApure不需要DNA酶消化DNA,节省了时间,避免RNA的降解,从而提高了产量;相对非柱式分离(如TRIzol),去除蛋白及其他杂质干净,提高了纯度,对于细胞、组织、一般植物均非常适合。植物RNA的提取比较难抉择,植物RNA提取受酚、多糖、蛋白杂质、次生代谢物含量的影响,一般用TRIzol提取纯度不高,而且很多植物用TRIzol提取不出来。
这时候可以选择多糖多酚植物总RNA提取试剂盒(水仙、辣椒、胡萝卜、玉米、百合、小麦、西红柿、花菜、油菜等)和通用植物RNA提取试剂盒(适合绝大多数植物提取,包括:各种中草药、植物种子、苹果、葡萄、草莓、香蕉、龙眼、荔枝、草坪植物、松树、杉树、白桦、紫松果、彩叶草、一品红、夹竹桃、垂叶榕、紫罗兰、月季、天竺蓝、牵牛花等);非常值得一提的是血液(包括血清、血浆、脑脊液、各种拭子或其他液体含量高的样本)RNA的提取用TRIzol和红细胞裂解的方法效果都不好,因为红细胞裂解液不含有RNA酶的抑制成分,这个过程RNA很容易降解,推荐使用TRIpure LS (RP1101)或者血液总RNA提取试剂盒(RP4001),该方法适用于表达谱芯片实验中RNA的提取。
6. 低浓度RNA的沉淀
纯化得到的RNA可能需要通过沉淀来浓缩,以满足一些下游应用的需要。醋酸铵(NH4OAc) 沉淀(加0.1体积的5M 醋酸铵、2-2.5体积的无水乙醇,-20°C放置25分钟以上)可以很好地回收RNA。如果需要定量回收低浓度的RNA(ng/ml),可以采用共沉淀(如linear acrylamide糖原glycogen,、酵母yeast RNA )的方法。核酸助沉剂是linear acrylamide,当RNA用于RT-PCR分析时,线性的丙烯酰胺和DNase处理的糖原都可以作为理想的共沉淀剂,因为它们都不含DNA污染,糖原含量高会抑制PCR反应,应注意控制浓度,核酸助沉剂对PCR无影响,成为病毒核酸提取的首选。酵母RNA和未处理的糖原会给样品带来核酸污染,有可能影响RT-PCR的结果。沉淀后,注意避免RNA沉淀过分干燥,因为这可能导致很难重新溶解。
7. 提取好的RNA如何储存
如果只是短期储存,重悬的RNA应放置于-20°C;如果是长期储存的话,就应该放置于-80°C。储存RNA时,可以加入少量的RNA酶抑制剂(RP5601),避免RNA的降解,RNA可以直接做下游实验。如果要长期保存RNA,可以加入RNAlong。我们推荐将RNA溶液分装在几支管中。这会避免反复冻融损伤RNA,并预防偶然的RNase污染。
能有效的处理土壤样品中一些很难处理的组分如: 真细菌孢子(eubacterial spores)、内芽孢(endospores)、格兰仕阳性菌(gram positive bacteria)、酵母(yeast)、线虫(nematodes)、海藻(algea)、真菌(fungi)等。2. 样品处理过程中使用的 MT Buffer和Sodium Phosphate Buffer可在整个提取过程中有效的保护核酸,并最大限度的降低RNA污染。3. 基于硅珠的纯化方法,可有效地去除腐植酸、多元酚等PCR抑制物4. 纯化所得的DNA可直接用于PCR、酶切都后续实验之中。5. 对腐植酸含量特别高的样品,附加额外的处理方法。注:对于去除腐植酸的方法在使用以下任何一种方法之前,请预先准备5.5M的异硫氰酸胍(Guanidine Thiocyanate)溶液方法A:1.当操作到土壤DNA提取试剂盒的第九步时,使用14,000 x g (~约5秒)的短时离心替代硅珠的自然沉降,移除上清。2.用1ml事先准备好的异硫氰酸胍溶液洗涤、重悬硅珠。3.14,000 x g (~约5秒)短时离心该离心管,除去上清。4.重复上述的洗涤步骤,直到硅珠恢复到原先的颜色。5.最后一次洗涤之后,用1ml的异硫氰酸胍溶液重悬硅珠,将600μl重悬液转移到SPIN filter里,14,000 x g离心1分钟。6.移除接液管中的废液,将剩余的重悬液转移至SPIN filter里,14,000 x g离心1分钟,弃去废液。7.从提取试剂盒操作说明的第十二步开始继续操作。方法B:1.将下列成分混合于1.5ml的离心管中,组成腐植酸洗涤液:978 μl Sodium Phosphate Buffer122 μl MT Buffer250 μl PPS2.充分混匀后,全速离心1分钟,将上清转移到一个新的离心管中(容量大于或等于2ml)3.加入等体积的5.5M的异硫氰酸胍溶液、混匀。4.完成了土壤试剂盒操作说明中的第九步后,将500μl的腐植酸洗涤液加入SPIN filter5.14,000 x g离心1分钟,弃去废液。6.重复上述的洗涤步骤,直到硅珠恢复到原先的颜色。7.从提取试剂盒操作说明的第十二步开始继续操作。
不懂得请别粘贴那些有的没的,浪费资源
采用的给全部分
buffer P1:除去RNA
buffer P2:裂解细胞
buffer P3:沉淀DNA
buffer WA、buffer WB:都是洗涤液(这两个之间有什么区别我也不清楚)
TE:溶解DNA.

