
DigestssDNA,butnotdsDNA,ina3´to5´direction
Specific:ProcessivelydigestssDNAina3´to5´directionwithoutharmingdsDNA-short3´overhangsinDNAarenotdigested
- FlexIBLe:Activeunderawidevarietyofbufferconditionsandcanbeaddeddirectlyintomostreactionmixes
- HeatInactivated:Destroytheenzymeactivitybyincubatingat80°Cfor15minutes
ExonucleaseIdigestsssDNAina3´to5´direction,1-3butdoesnotdigestdsDNA.Althoughitrequiresthepresenceofmagnesiumandafree3´-hydroxylterminusforactivity,itisactiveunderawidevarietyofbufferconditionsandcanbeaddeddirectlyintomostreactionmixes.ExonucleaseIcanbeheat-inactivatedbyincubationat80°Cfor15minutes.
Applications
- RemovalofresidualssDNA,includingoligos,fromreactionmixes.
- RemovalofssDNAfromnucleicacidmixtures.
UnitDefinition:OneunitofExonucleaseIcatalyzesthereleaseof10nmolofacid-solublenucleotidesfromheat-denaturedcalfthymusDNAin30minutesat37°Cunderstandardassayconditions.
StorageBuffer:50%glycerolcontaining50mMTris-HCl(pH7.5),0.1MNaCl,0.1mMEDTA,1mMDTT,and0.1%Triton®X-100.
QualityControl:ExonucleaseIistestedindegradationofssDNAandisfreeofdetectableRNase,endonuclease,anddouble-strandedexonucleaseactivities.
References
- Lehman,I.R.andNussbaum,A.L.(1964)J.Biol.Chem.239,2628.
- Kushner,S.R.etal.(1971)Proc.Natl.Acad.Sci.USA68,824.
- Kushner,S.R.etal.(1972)Proc.Natl.Acad.Sci.USA69,1366.
![]() | Figure1.SpecificityofExonucleaseIforssDNA.200ngofEcoRI-linearizedpUC19dsDNAand1µgofa100-merssDNAoligoweremixedin1XTABufferandincubatedat37°Cfor20minintheabsenceorpresenceof10unitsofExonuclease I.Asseenonthis1%agarosegel,ExonucleaseIcompletelydigestedthelinearssDNAoligo,butleftthelinearizedplasmiddsDNAintact.Lane1,sizeMarkers;Lane2,minusExoI;Lane3,plusExoI. |
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我用来扩增一个1.1kb的基因,用TAKARA的EXtaq和其他的总是出现突变不知道这个酶能不能完全保真,另外末端是否加A
DNA连接酶作用于基因工程,用于连接两个DNA片段间的磷酸二酯键。
最近,我看了很多这方面的资料,但是我对这个方面不是很了解,所以现在搞得头昏眼花的,不知道该选什么酶和载体,希望大家多多帮忙
在此十分感谢
下面是六种不同耐热聚合酶的比较:
Taq:扩增效率最高的耐热DNA聚合酶,能很好的扩增6kb以下的DNA片段。扩增碱基出错率为10-5左右。
Pfu:目前保真度最高的耐热DNA聚合酶,碱基出错率为10-6,但扩增效率低于Taq酶,一般能很好的扩增2kb以下的片段。
TaqPlus:集扩增效率高和保真度好于一身。扩增效率比Pfu高,保真度比Taq好。能有效的扩增10kb以下的片段。
HotstartTaq:经过化学修饰的耐热DNA聚合酶。此酶在常温下,活性被化学基团封闭,要在94℃-95℃加热数分钟才能回复正常活力开始反应,避免了起始循环较低温度下的非特异性扩增,提高了反应的灵敏度和特异性。
LongTaq:具有3’-5’外切酶活性的耐热DNA聚合酶,它不但扩增效率高而且错配率低,对于简单模板可扩增长达40kb的模板,对复杂模板也可扩增长达15kb的片段。
TaqPlatinum:热启动高保真耐热DNA聚合酶。如果对保真度要求很高,而用Pfu扩增有难度,可选用TaqPlatinum,一般扩增长度可达4kb。
根据不同的实验目的选择最合适的酶,
克隆普通长度的目的DNA片段:Taq、TaqPlus
保真度要求较高,片段比较短,如点突变、基因筛选等:Pfu、TaqPlatinum
高保真长片段扩增,如构建基因图谱及分子遗传学研究等:LongTaq、TaqPlus
扩增基因组模板,需要降低背景:HotstartTaq、TaqPlatinum
扩增GC含量较高或二级结构较复杂的模板:TaqPlus、LongTaq、TaqPlatinum
实时荧光定量PCR反应:Taq、HotstartTaq、TaqPlatinum
从菌株或质粒模板,筛选鉴定目的克隆,扩增6kb以下的片段:Taq、TaqPlus、2×TaqPCRMasterMix
模板比较复杂或目的片段丰度低,用普通Taq酶扩增不出条带:2×TaqPCRMasterMix、2×PfuPCRMasterMix
可分为以下几个类群:(1)依赖DNA的DNA聚合酶;(2)依赖RNA的DNA聚合酶;(3)依赖DNA的RNA聚合酶;(4)依赖RNA的RNA聚合酶。前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,PolⅡ和PolⅢ等);DNA聚合酶只能在有引物的基础上,即在DNA或RNA引物的3′-OH延伸,这DNA的合成方向记为5′→3′。换言之DNA聚合酶催化反应除底物(αNTP)外,还需要Mg2+ 、模板DNA和引物,迄今细胞内尚无发现可从单体起始DNA的合成。同样,上述(3)和(4)是催化RNA生物合成反应中最主要的RNA合成酶,它们以四种三磷酸核糖核苷(NTP)为底物,并需有DNA模板以及Mn2 及Mg2 的存在下,在前一个核苷酸3′-OH与下一个核苷酸的5′-P聚合形成3′,5′-磷酸二酯键,其新生链的方向也是5′→3′。RNA聚合酶也大量存在于原核和真核生物的细胞中。如大肠杆菌RNA聚合酶分子量4.8×105,由5条多肽链组成,分别命名为α,α,β,β′,和γ,全酶可用α2ββ′λ表示。真核生物RNA聚合酶分子大于5×105,由10~12个大小不等亚基组成。聚合酶除作为自然界生命活动中不可缺少的组分外,在实验室中大多用作生命科学研究的工具酶类之一。
解旋酶:在DNA复制、转录时,作用于DNA双链,将双链DNA解开形成单链。
RNA聚合酶:在转录过程中,作用于游离的核糖核苷酸,将它们连接形成mRNA链

