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Signalchem/RIPK1, Active/5 ug/R07M-11G-05
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Signalchem/RIPK1, Active/5 ug/R07M-11G-05
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Signalchem
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R07M-11G-05
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Overview:

RIPK1 or Receptor Interacting Protein Kinase 1 is a serine/threonine kinase that was originally identified as interacting with the cytoplasmic domain of FAS. RIPK1 has been deemed as an important element in the signal transduction machinery that mediates programmed cell death. RIPK1 has been shown to interact with TRADD, TRAF1 TRAF2 and TRAF3 and TRADD can act as an adaptor protein to recruit RIPK1 to the TNFR1 complex in a TNF-dependent process (1). TNFα is capable of activating the noncanonical NF-κB pathway, but this activation of this pathway is negatively regulated by RIPK1 (2).

Gene Aliases:

D330015H01Rik; Rinp; RIP; Rip1

Genbank Number:

NM_009068

References:

1. Hsu, H. et al: TNF-dependent recruitment of the protein kinase RIP to the TNF receptor-1 signaling complex. Immunity 4: 387-396, 1996.
2. Kim, J Y. et al: TNFα induced noncanonical NF-κB activation is attenuated by RIP1 through stabilization of TRAF2. J Cell Sci. 2011 Feb 15;124(Pt 4):647-56.

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耐热DNA聚合酶特点:合理选择耐热DNA聚合酶是PCR成败与否的一个关键因素,如何选择最合适的耐热聚合酶,是进行PCR实验首先要考虑的问题。目前市面上有许多耐热DNA聚合酶,虽然名称各不相同,但主要区别在于特异性、保真性、耐热性、扩增速率、扩增片段 查看更多>
碱裂解法从大肠杆菌制备质粒,是从事分子生物学研究的实验室每天都要用的常规技术。为了方便理解,这里罗列一下碱法质粒抽提用到三种溶液:溶液I,50 mM葡萄糖 / 25 mM Tris-Cl / 10 mM EDTA,pH 8.0;溶液II,0.2 N NaOH / 1% SDS;溶液III,3 M 醋酸钾 / 2 M 查看更多>
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Introduction:C. elegans RNA preps that have been widely used previously involved fairly slow lysis of the worms, potentially leading to degradation of the RNA. 查看更多>
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碱裂解法从大肠杆菌制备质粒,是从事分子生物学研究的实验室每天都要用的常规技术。可是我收研究生十几年了,几乎毫无例外的是我那些给人感觉什么都知道的优秀学生却对碱法质粒抽提的原理知之甚少。追其原因,我想大概是因为《分子克隆》里面只讲实验操作步骤,而没有对原理进行详细的论述 查看更多>
B.反转录酶具有DNA指导的DNA聚合酶活性 C.反转录酶能水解杂化链中的RNA D.反转录酶具有RNA指导的RNA聚合酶活性 E.反转录所需的引物可为tRNA 点击查看... 查看更多>
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我要P一个3kb左右的目的基因,需要一个保真性高的酶,因为后面要测序,而且我的两个引物的GC含量相差也很大,还需要一个载体连接去进行筛选,这个载体要4kb以上的,因为要和我的目的基因大小相差大一点的,而且这个载体上还要有多个切割位点,好让我切割下来,与最终的质粒相连。
最近,我看了很多这方面的资料,但是我对这个方面不是很了解,所以现在搞得头昏眼花的,不知道该选什么酶和载体,希望大家多多帮忙
在此十分感谢
TaqDNA聚合酶是Mg2+依赖性酶,该酶的催化活性对Mg2+浓度非常敏感。以活性程度很低的鲑鱼精子DNA为模板,dNTP的浓度为0.7~0.8mmol/L时,用不同浓度Mg2+进行PCR反应10min,测定结果为Mgcl2浓度在2.0mmol/L时该酶催化活性最高,此浓度能最大限度地激活TaqDNA聚合酶的活性,Mg2+过高就抑制酶活性,当Mgcl2浓度在10mmol/L时可抑制40~50%的酶活性。由于Mg2+能与dNTP结合而影响PCR反应液中游离的Mg2+浓度,因而Mgcl2的浓度在不同的反应体系中应适当调整,优化浓度。一般反应中Mg2+浓度至少应比dNTP总浓度高0.5~1.0mmol/L。适当浓度的KCl能使Taq DNA聚合酶的催化活性提高50~60%,其最适浓度为50mmol/L,高于75mmol/L时明显抑制该酶的活性。
聚合酶的聚合酶分类 123
小超制作6352017-11-05

可分为以下几个类群:(1)依赖DNA的DNA聚合酶;(2)依赖RNA的DNA聚合酶;(3)依赖DNA的RNA聚合酶;(4)依赖RNA的RNA聚合酶。前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,PolⅡ和PolⅢ等);DNA聚合酶只能在有引物的基础上,即在DNA或RNA引物的3′-OH延伸,这DNA的合成方向记为5′→3′。换言之DNA聚合酶催化反应除底物(αNTP)外,还需要Mg2+ 、模板DNA和引物,迄今细胞内尚无发现可从单体起始DNA的合成。同样,上述(3)和(4)是催化RNA生物合成反应中最主要的RNA合成酶,它们以四种三磷酸核糖核苷(NTP)为底物,并需有DNA模板以及Mn2 及Mg2 的存在下,在前一个核苷酸3′-OH与下一个核苷酸的5′-P聚合形成3′,5′-磷酸二酯键,其新生链的方向也是5′→3′。RNA聚合酶也大量存在于原核和真核生物的细胞中。如大肠杆菌RNA聚合酶分子量4.8×105,由5条多肽链组成,分别命名为α,α,β,β′,和γ,全酶可用α2ββ′λ表示。真核生物RNA聚合酶分子大于5×105,由10~12个大小不等亚基组成。聚合酶除作为自然界生命活动中不可缺少的组分外,在实验室中大多用作生命科学研究的工具酶类之一。向左转|向右转
DNA聚合酶:在DNA复制时,作用于游离的脱氧核苷酸,将游离的脱氧核苷酸连接形成新的脱氧核苷酸长链。
解旋酶:在DNA复制、转录时,作用于DNA双链,将双链DNA解开形成单链。
RNA聚合酶:在转录过程中,作用于游离的核糖核苷酸,将它们连接形成mRNA链
DNA聚合酶是DNA复制时起作用的酶。DNA复制酶这个说法很少见。
端粒酶 123
shineck62014-07-18
看到原核生物DNA复制结束时,引物水解后用DNA聚合酶1补充留下的空白链。但是真核生物是水解引物后要通过端粒酶先合成一段后再用DNA聚合酶修补…不太明白为什么真核生物不能直接用DNA聚合酶修补水解引物之后留下的空白呢?端粒酶与DNA聚合酶有什么区别呢?
不是
DNA聚合酶和DNA连接酶作用的位点都是3'5'磷酸二酯键;但DNA连接酶是作用在游离的DNA片段间,使其连接成为一条完整的DNA链,而DNA聚合酶则是将游离的脱氧核糖核苷酸连接成DNA片段。
合理选择耐热DNA聚合酶是PCR成败与否的一个关键因素。选择最合适的耐热聚合酶,是进行PCR实验首先要考虑的问题。许多耐热DNA聚合酶的主要区别在于特异性、保真性、耐热性、扩增速率、扩增片段长度等几个指标。
下面是六种不同耐热聚合酶的比较:
Taq:扩增效率最高的耐热DNA聚合酶,能很好的扩增6kb以下的DNA片段。扩增碱基出错率为10-5左右。
Pfu:目前保真度最高的耐热DNA聚合酶,碱基出错率为10-6,但扩增效率低于Taq酶,一般能很好的扩增2kb以下的片段。
TaqPlus:集扩增效率高和保真度好于一身。扩增效率比Pfu高,保真度比Taq好。能有效的扩增10kb以下的片段。
HotstartTaq:经过化学修饰的耐热DNA聚合酶。此酶在常温下,活性被化学基团封闭,要在94℃-95℃加热数分钟才能回复正常活力开始反应,避免了起始循环较低温度下的非特异性扩增,提高了反应的灵敏度和特异性。
LongTaq:具有3’-5’外切酶活性的耐热DNA聚合酶,它不但扩增效率高而且错配率低,对于简单模板可扩增长达40kb的模板,对复杂模板也可扩增长达15kb的片段。
TaqPlatinum:热启动高保真耐热DNA聚合酶。如果对保真度要求很高,而用Pfu扩增有难度,可选用TaqPlatinum,一般扩增长度可达4kb。
根据不同的实验目的选择最合适的酶,

克隆普通长度的目的DNA片段:Taq、TaqPlus
保真度要求较高,片段比较短,如点突变、基因筛选等:Pfu、TaqPlatinum
高保真长片段扩增,如构建基因图谱及分子遗传学研究等:LongTaq、TaqPlus
扩增基因组模板,需要降低背景:HotstartTaq、TaqPlatinum
扩增GC含量较高或二级结构较复杂的模板:TaqPlus、LongTaq、TaqPlatinum
实时荧光定量PCR反应:Taq、HotstartTaq、TaqPlatinum
从菌株或质粒模板,筛选鉴定目的克隆,扩增6kb以下的片段:Taq、TaqPlus、2×TaqPCRMasterMix
模板比较复杂或目的片段丰度低,用普通Taq酶扩增不出条带:2×TaqPCRMasterMix、2×PfuPCRMasterMix
A、DNA转录形成RNA时需要RNA聚合酶的催化,底物是核糖核苷酸,A错误;
B、酶大部分是蛋白质、少量是RNA,故某种酶的基本组成单位是氨基酸或核糖核苷酸,B错误;
C、内分泌细胞能产生激素,活的细胞能产生酶,故能产生激素的细胞就能产生酶,C正确;
D、酶通常是蛋白质,蛋白质在低温条件下更加稳定,利于保存,而且低温不会使酶失活,因此在最适温度保存没有意义,D错误.
相同点:都能以DNA为模板,从5'向3'进行核苷酸或脱氧核苷酸的聚合反应。
不同点
1、作用底物不同。RNA聚合酶底物是NTP;DNA聚合酶底物是dNTP。
2、RNA聚合酶作用不需要引物,而DNA聚合酶作用需要引物。
3、RNA聚合酶本身具有一定的解旋功能,而DNA聚合酶没有,当需要解开双链的时候要解旋酶和拓扑异构酶的帮助。
4、RNA聚合酶只具有5‘到3’端的聚合酶活性,而DNA聚合酶不仅有5‘到3’端的聚合酶活性,还具有3‘到5’端的外切酶活性。保证DNA复制时候校对,所以复制的忠实性高于转录的。
5、RNA聚合酶通常作用于转录过程;DNA聚合酶通常作用于DNA复制过程
DNA聚合酶有特异性的,DNA聚合酶只能催化核苷酸与核苷酸短链的连接,且具有方向性,由DNA5'端点开始复制到3'端的。
二者的区别在于作用的底物:DNA连接酶与DNA聚合酶都是形成磷酸二酯键。但DNA连接酶连接的是DNA片段(比如冈崎片段);DNA聚合酶是将单个脱氧核糖核苷酸按顺序连接到DNA链上。向左转|向右转
DNA连接酶DNA聚合酶作用的异同:DNA聚合酶只能将()加到己有的核苷酸片段末端,形成磷酸二酯键。DNA链接酶是链接()的末端,形成磷酸二酯键。