ATP-independent,non-catalyticThermostableligasethatcatalyzestheintramolecularligation(i.e.circularization)ofssDNAtemplates
Applications
- ProductionofssDNAtemplatesforrolling-circlereplicationorrolling-circletranscriptionexperiments.
- ProductionofssDNAtemplatesforRNApolymeraseandRNApolymeraseinhibitorassays.
CircLigase™IIssDNALigase*isathermostableenzymethatcatalyzesintramolecularligation(i.e.circularization)ofssDNAtemplateshavinga5´-phosphateanda3´-hydroxylgroup.IncontrasttoT4DNALigaseandAmpligase®DNALigase,whichligateDNAendsthatareannealedadjacenttoeachotheronacomplementaryDNAsequence,CircLigaseIIssDNALigaseligatesendsofssDNAintheabsenceofacomplementarysequence.TheenzymeisthereforeusefulformakingcircularssDNAmoleculesfromlinearssDNA.CircularssDNAmoleculescanbeusedassubstratesforrolling-circlereplicationorrolling-circletranscription.
LinearssDNAof>15bases,includingCDNA,iscircularizedbyCircLigaseIIenzyme.Understandardreactionconditions,virtuallynolinearconcatamersorcircularconcatamersareproduced.InadditiontoitsactivityonssDNA,CircLigaseIIenzymealsohasactivityinligatingasingle-strandednucleicacidhavinga3´-hydroxylribonucleotideanda5´-phosphorylatedribonucleotideordeoxyribonucleotide.
CircLigaseIIhasgreateractivityandanewReactionBufferforimprovedligationefficiency.
UnitDefinition:OneunitofCircLigaseIIenzymeconverts1pmolofalinear5´-phosphorylatedCircLigaseIIStandard55-merOligointoanexonucleaseI-resistantcircularformin1hourat60°Cunderstandardassayconditions. StorageBuffer:50%glycerolcontaining50mMTris-HCl(pH7.5),100mMNaCl,0.1mMEDTA,1mMDTT,and0.1%Triton®X-100. 10XReactionBuffer:0.33MTris-Acetate(pH7.5),0.66Mpotassiumacetateand5mmDTT. QualityControl:CircLigaseIIssDNALigaseisfreeofdetectablephosphatase,DNAexo-andendonuclease,andRNaseactivities. ProductCitations
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Figure1.CircLigase™IIssDNALigaseconvertslinearssDNA |
ORDERINFORMATION
CircLigase™IIssDNALigaseisprovidedat100U/μl.
Contents:CircLigase™IIssDNALigase,CircLigase™II10XReactionBuffer,50mMMnCl2,CircLigase™ssDNAControlOligo,Betaine,SterileWater.
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目前我准备做甲基化PCR,由于经费问题,可能无法购买高价的试剂盒。看过甲基化PCR的原理后,在考虑经过修饰后,是否可以用RT-PCR的试剂盒(有现成的)来做甲基化PCR。请大牛指导!另求各位推荐性价比高的亚硫酸盐修饰试剂盒,谢谢!
目前常用方法有:化学修饰法、反应动力学法、X-射线衍射法等.1.化学修饰法:此方法是研究最早,应用最广泛的方法.原则上讲,酶分子侧链上的各种基团
自身dna没有这个特异序列
近日,国际微生物学权威期刊MolecularMicroBIOLOGy在线发表了上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室由德林教授研究小组的最新研究进展“RegulationofDNAphosphorothioatemodificationsbythetranscriptionalregulatorDptBinSalmonella”。该研究揭示了DNA磷硫酰化修饰在转录水平上调控的分子机制。
DNA磷硫酰化修饰是近年发现的一种新型表观遗传学生理修饰,该修饰位于DNA大分子骨架上,由硫原子取代了DNA磷酸骨架上非桥联氧原子而形成了具有序列特异性和空间构象专一性的磷硫酰化修饰。这种新型表观遗传学修饰的调控机制目前尚不清楚,但该发现拓展了经典的DNA组成理论,在国内外引起了广泛关注。
由德林教授研究小组成秋香和曹博研究发现,敲除沙门氏菌中控制磷硫酰化修饰基因dptBCDE中的dptB基因后,细胞内磷硫酰化修饰水平增强,同时在细胞快速生长时期,该基因的下游DNA磷硫酰化基因转录水平明显增高。当用dptB基因回补其突变株时,下游修饰基因的转录和细胞内磷硫酰化修饰恢复到与野生型沙门氏菌相当水平,表明dptB在转录水平上负调控DNA磷硫酰化修饰基因的表达。同时,通过精确定位DptB在DNA磷硫酰化修饰基因上游调控区的2个DNA结合区域,研究小组发现每个靶序列中都含有1对保守的正向重复序列,进一步研究也表明,这种负调控机制是DNA磷硫酰化修饰中普遍存在的调控方式。
该研究是由德林教授研究小组继破译DNA磷硫酰化修饰基因组图谱(Caoetal,NatureCommunication,2014,5:3951),解析DNA磷硫酰化修饰限制系统作用机制(Caoetal,MolecularMicrobiology2014,93(4):776-85)之后,在这种新型表观遗传学修饰生物学研究上的又一重要进展,对理解基因组上的低频率的修饰机制和修饰的生理功能具有重要的意义。
文章链接:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/mmi.13096/pdf
摘要:随着转基因技术的发展,获取目的基因片段的方法也越来越多样化,获取目的基因片段的技术也日新月异,但是无论获取的方法和手段怎么样发展,获取的主要思路始终在围绕一根主线在开展。
关键词:基因 ,遗传效应,基因克隆,体外重组
一、基因工程
基因工程作为一门理论性与实践性较强的学科,其方法与技术已经渗透到现代生命科学的各个分支领域,成为生命科学的一门核心技术。基因工程包含许多独特的实验方法和技术,不仅内容丰富,涉及面广,实用性也强。基因工程是通过DNA 重组技术, 获得具有特殊生物遗传性状和功能的遗传工具生物体, 基因工程技术广泛应用于农业、医学、食品工业等。本文就基因工程的应用现状综合阐述。
基因工程技术是一项极为复杂的高新生物技术, 它利用现代遗传学与分子生物学的理论和方法, 按照人类所需, 用DNA 重组技术对生物基因组的结构和组成进行人为修饰或改造, 从而改变生物的结构和功能, 使之有效表达出人类所需要的蛋白质或人类有益的生物性状。基因工程从诞生至今, 仅有30 年的历史, 然而, 无论是在基础理论研究领域, 还是在生产实际应用方面, 都已取得了惊人的成绩。首先,基因工程给生命科学自身的研究带来了深刻的变化。目前科学家已完成了多种细胞器的基因组全序列测定工作。其次, 基因工程具有广泛的应用价值, 能为工农业生产、医药卫生、环境保护开辟新途径。
基因工程( 又称DNA 重组技术、基因重组技术) , 是20 世纪70 年代初兴起的技术科学, 是用人工的方法将目的基因与载体进行DNA重组, 将DNA 重组体送入受体细胞, 使它在受体细胞内复制、转录、翻译, 获得目的基因的表达产物。这种跨越天然物种屏障, 把来自任何生物的基因置于毫无亲缘关系的新的寄主生物细胞之中的能力, 是基因工程技术区别于其他技术的根本特征。 基因工程研究内容为:
(1) 从复杂的生物有机体基因组中, 经过酶切消化或PCR 扩增等步骤, 分离出带有目的基因的DNA 片段。
(2) 在体外, 将带有目的基因的外源DNA 片段连接到能够自我复制并具有选择记号的载体分子上, 形成重组DNA分子。
(3)重组DNA 分子转移到适当的受体细胞, 并与之一起增殖。
(4) 从大量的细胞繁殖群体中, 筛选出获得了重组DNA 分子的受体细胞克隆。
第一代热启动Taq酶是一种DNA聚合酶。 第一代指的是直接从Taq(这是一种细菌)体内提取的天然聚合酶,没有进行化学修饰的,为了达到更好的聚合催化效果,往往需要经过酶工程处理,得到的聚合酶催化效率更高。 热启动是指这种酶的反应温度条件
Taq DNA polymerase是从克隆有Thermu aquaticus DNA Polymerase基因的大肠杆菌经诱导表达后,再经过柱纯化分离出来的一个约94 KD的重组蛋白。无外源核酸酶和细菌DNA污染,稳定性好,特异性强,适用于常规PCR扩增。
限制性核酸内切酶的研究和应用发展很快,已提纯的限制性核酸内切酶有100多种,许多已成为基因工程研究中必不可少的工具酶。
限制性核酸内切酶可被分成三种类型。Ⅰ型和Ⅲ型限制酶水解DNA需要消耗ATP,全酶中的部分亚基有通过在特殊碱基上补加甲基基团对DNA进行化学修饰的活性。
Ⅰ型和Ⅲ型酶具有限制和修饰两种作用,而特异性弱,切割位点的序列不固定,不已知,不宜用于基因克隆中。
Ⅱ型限制酶水解DNA不需要ATP也不以甲基化或其它方式修饰DNA,能在所识别的特殊核苷酸顺序内或附近切割DNA。因此,被广泛用于DNA分子克隆和序列测定。


