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separopore/Glycine Separopore® 4B/25 mL/20181065-3
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2021-09-23
DNA由四种核苷制成，每种核苷都有自己的字母-A，G，C和T.然而，由于DNA的结构在1953年被破译，科学家们发现了其他几种常被添加到DNA序列中的变体。替换通常的四个字母之一。这些变体可以是传统核苷的修饰形式，通常有助于细胞控制哪些基因被打开和关闭，并且在DNA中被称为“表观遗传标记”。在细菌中，它们还可以保护DNA免受其他生物如病毒的侵袭。到目前为止，这些DNA修饰是偶然发现的，因为科学家在DNA的化学分析中发现了意想不到的信号。然而，麻省理工学院，佛罗里 查看更多
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2021-09-22
埃默里大学的科学家们发现了一个函数,一个神秘的DNA修饰在果蝇的大脑发育,这可能为它的作用在人类提供线索。研究结果将发表在分子细胞。表观遗传学可能意味着“以上基因”,但很多领域的焦点是DNA甲基化,DNA本身的化学改性。DNA甲基化并不改变实际的字母(A、C、G和T),但它确实改变细胞DNA是如何处理的。一般来说,基因关闭,对细胞分化至关重要。最常见形式的DNA甲基化的研究出现在DNA字母C(胞嘧啶)。果蝇,尽管是一个有用的遗传模型的发展,很少有这种形式的DNA 查看更多
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2021-09-04
路德维希癌症研究科学家在当前的Nature Biotechnology杂志上报道了一种新的改进方法，用于检测DNA的化学修饰。这些修饰或“表观遗传”标记有助于控制基因表达及其在基因组中的异常分布。在牛津大学路德维希癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler的带领下，该研究表明他们的方法，称为TET辅助吡啶硼烷测序，或TAPS，是一种损害较小，效率更高的替代品。亚硫酸氢盐测序，目前用于绘制DNA 表观遗传修饰 查看更多
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2021-09-10
5月2日，国际权威学术期刊《自然》在线发表了来自中科院上海生物化学与细胞生物学研究所徐国良院士联合复旦大学唐惠儒教授和中科院武汉水生生物研究所黄开耀研究员等多个课题组合作完成的研究成果“A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an algal TET homologue”。该研究首次在莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii）这种单细胞真核生物中鉴定到一种新... 查看更多
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2021-09-11
RNA加工修饰，主要加工方式是切断和碱基修饰，真核生物tRNA前体一般无生物学特性，需要进行加工修饰。... 查看更多
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2021-09-18
埃默里科学家已经确定了果蝇大脑发育中神秘DNA修饰的功能，这可能会提示其在人类中的作用。结果计划在Molecular Cell上发表。表观遗传学可能意味着“高于基因”，但该领域的许多重点是DNA甲基化，DNA本身的化学修饰。甲基化不会改变实际的DNA字母(A，C，G和T)，但它确实改变了细胞处理DNA的方式。通常，它关闭基因并且对于细胞分化是必需的。最常研究的DNA甲基化形式出现在DNA字母C(胞嘧啶)上。果蝇尽管是一种有用的遗传发育模型，却几乎没有这种形式的DNA甲基化 查看更多
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2021-09-21
埃默里大学的科学家们发现了一个函数,一个神秘的DNA修饰在果蝇的大脑发育,这可能为它的作用在人类提供线索。研究结果将发表在分子细胞。表观遗传学可能意味着“以上基因”,但很多领域的焦点是DNA甲基化,DNA本身的化学改性。DNA甲基化并不改变实际的字母(A、C、G和T),但它确实改变细胞DNA是如何处理的。一般来说,基因关闭,对细胞分化至关重要。最常见形式的DNA甲基化的研究出现在DNA字母C(胞嘧啶)。果蝇,尽管是一个有用的遗传模型的发展,很少有这种形式的DNA 查看更多
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2021-09-07
一种新型测序技术或能高效检测癌症相关的DNA修饰 近日，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中，来自美国路德维希癌症研究所的科学家们通过研究开发了一种新方法来检 查看更多
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2021-09-03
昆士兰大学的研究人员发现了DNA修饰，增强了我们消除恐惧的能力。该研究结果发表在“ 自然神经科学 ”杂志上，可以帮助指导恐惧相关焦虑症新疗法的开发。昆士兰大学昆士兰脑研究所(QBI)的Timothy Bredy教授说，虽然恐惧是一种重要的生存机制，它利用环境中的线索来促使某些反应，但是当不再需要恐惧时，抑制恐惧的能力也是如此。“你仍然希望记住那里有危险的东西，我要小心，但你不希望它损害你正常运作的能力，”布雷迪教授说。恐惧灭绝可以起到抵抗 查看更多
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2021-09-05
DNA活性可以改变而不改变DNA片段本身的序列。基因激活和失活可以是物种如何产生独特个体的基础。在模式物种的背景下，很好地理解了一些改变基因活性的过程。然而，科学家仍在努力解决一些过程，如DNA甲基化，如何改变许多不同生物体中的基因活性。考虑到地球上的自然变异量，适用于所有物种的更广泛的理论已被证明是难以捉摸的。现在，一组科学家发表了一项关于自然生态学和进化的研究，比较和关联40种不同真菌物种的DNA甲基化。该论文是开发统一DNA甲基化理论的一项更大努力的一部分，开始填补与DNA甲基化 查看更多
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2021-09-08
消除恐惧记忆的灵活度来自DNA修饰 昆士兰大学脑研究所的Timothy Bredy教授说，恐惧是一种重要的生存机制，利用环境中的暗示来激发某些身体反应，反过来，在不再需要它时，这种能力 查看更多
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2021-09-20
埃默里科学家已经确定了果蝇大脑发育中神秘DNA修饰的功能，这可能会提示其在人类中的作用。结果计划在Molecular Cell上发表。表观遗传学可能意味着“高于基因”，但该领域的许多重点是DNA甲基化，DNA本身的化学修饰。甲基化不会改变实际的DNA字母(A，C，G和T)，但它确实改变了细胞处理DNA的方式。通常，它关闭基因并且对于细胞分化是必需的。最常研究的DNA甲基化形式出现在DNA字母C(胞嘧啶)上。果蝇尽管是一种有用的遗传发育模型，却几乎没有这种形式的DNA甲基化 查看更多
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智慧树知到《免疫学基础与病原生物学》章节测试答案 问题易123
zjuaxiu2005-01-11
在哺乳动物细胞，RNA的转录在核内，而翻译在胞质中，所以需要一个RNA从核到胞质的转运过程。这种情况同样适用于HIV——整合到宿主的病毒基因在转录后也需要这一过程。
人们已经发现:HIV的Rev蛋白募集细胞转运因子Crm1来转运HIV-1的一些必须mRNA。而宿主mRNA的转运主要依赖另一个转运因子：theTap–Nxt1dimer。另外宿主mRNA的转运还需要另一个的酶——Dbp5的参与。Dbp5是含DEAD-box的解旋酶家族的一个成员。DEAD-box解旋酶利用ATP释放的能量来伸展RNA结构，游离RNA-蛋白质复合体。这个蛋白家族被认为和RNA的每一个步骤都有关系包括：前mRNA的剪切，mRNA的转运，核糖体的组装，mRNA的翻译等。Dbp5首先再酵母中被鉴定发现——积聚的核边缘的胞浆蛋白，对核mRNA的转运是必须的。后来的研究还发现其与核孔复合体（NPCs）有特异的association。最近的实验还发现Dbp5在核和胞浆之间穿梭。
给青蛙卵注射突变的Dbp5（不能利用ATP）可以阻断细胞mRNA的转运，而不影响Rev-Crm1介导的HIV－1的mRNA的转运！这有两种可能性：1,Rev-Crm1介导的mRNA不需要remodelling；2,它依赖其他的解旋酶。
Yedavalli等发现DEAD家族的另一个成员：DDX3，证实了后一种假设。——过表达的DDX3可以特异的增强Rev－Crm1依赖的核mRNA转录；抑制DDX3则相反。且DDX3可以与Crm1和Rev在体内特异的结合。所以作者认为这可能是HIV治疗的又一靶点。但这仍存有疑问：进化中DDX3不可能只为了HIVmRNA的转运而存在，抑制它可能会有不可预测或有害的后果。
cell上Yedavalli等发表的该文章的全文：http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6WSN-4DN8MNH-9&_coverDate=10%2F29%2F2004&_alid=235528316&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_qd=1&_cdi=7051&_sort=d&view=c&_acct=C000053666&_version=1&_urlVersion=0&_userid=1553337&md5=7cf4d401bba6145b024a32f3309cc453
Nature上对该文章的一篇评述：NuclearRNAexportunwound——ThewaysinwhichHIVcansubvertcellularprocessesforitsownendsseemboundless.Thelatestdiscovery—acellularenzymethathelpstoexportHIVRNAfromthenucleus—revealsapossIBLedrugtarget。
人们已经发现:HIV的Rev蛋白募集细胞转运因子Crm1来转运HIV-1的一些必须mRNA。而宿主mRNA的转运主要依赖另一个转运因子：theTap–Nxt1dimer。另外宿主mRNA的转运还需要另一个的酶——Dbp5的参与。Dbp5是含DEAD-box的解旋酶家族的一个成员。DEAD-box解旋酶利用ATP释放的能量来伸展RNA结构，游离RNA-蛋白质复合体。这个蛋白家族被认为和RNA的每一个步骤都有关系包括：前mRNA的剪切，mRNA的转运，核糖体的组装，mRNA的翻译等。Dbp5首先再酵母中被鉴定发现——积聚的核边缘的胞浆蛋白，对核mRNA的转运是必须的。后来的研究还发现其与核孔复合体（NPCs）有特异的association。最近的实验还发现Dbp5在核和胞浆之间穿梭。
给青蛙卵注射突变的Dbp5（不能利用ATP）可以阻断细胞mRNA的转运，而不影响Rev-Crm1介导的HIV－1的mRNA的转运！这有两种可能性：1,Rev-Crm1介导的mRNA不需要remodelling；2,它依赖其他的解旋酶。
Yedavalli等发现DEAD家族的另一个成员：DDX3，证实了后一种假设。——过表达的DDX3可以特异的增强Rev－Crm1依赖的核mRNA转录；抑制DDX3则相反。且DDX3可以与Crm1和Rev在体内特异的结合。所以作者认为这可能是HIV治疗的又一靶点。但这仍存有疑问：进化中DDX3不可能只为了HIVmRNA的转运而存在，抑制它可能会有不可预测或有害的后果。
cell上Yedavalli等发表的该文章的全文：http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6WSN-4DN8MNH-9&_coverDate=10%2F29%2F2004&_alid=235528316&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_qd=1&_cdi=7051&_sort=d&view=c&_acct=C000053666&_version=1&_urlVersion=0&_userid=1553337&md5=7cf4d401bba6145b024a32f3309cc453
Nature上对该文章的一篇评述：NuclearRNAexportunwound——ThewaysinwhichHIVcansubvertcellularprocessesforitsownendsseemboundless.Thelatestdiscovery—acellularenzymethathelpstoexportHIVRNAfromthenucleus—revealsapossIBLedrugtarget。
做mRNA用的血清保存时用的管子要用无RNA酶的吗? 核酸基因技术...123
pwqbq2021-07-22
要收集临床病人的血清做mRNA，每天收集然后集中检测，问题来了：保存的EP管要用DEPC处理过的吗，就算保存时用的无RNA酶的管子，可是抽血的真空管也没处理过啊。我现在就用普通的管子冻在-70了，请教大家这样行不行啊？
限制酶可以用来切割RNA和单链DNA吗?123
自恋帝王2021-07-23
并在每条链中特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键进行切割的一类酶，辅因子的需求切位与作用方式，可将限制酶分为三种类型，简称限制酶，分别是第一型（Type I）。根据限制酶的结构、第二型（Type II）及第三型（Type III）不能，又催化非甲基化的DNA的水解。限制酶又称限制性核酸内切酶，专一对DNA起作用。限制性核酸内切酶是可以识别特定的核苷酸序列。III型限制性内切酶同时具有修饰及认知切割的作用。Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化；而Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解
流式细胞周期分析 生物科学 细胞科学论坛学术科研互动平台123
欲醉0001272017-11-27
这是因为做细胞周期的时候要用荧光染料染DNA，一次判断细胞DNA的相对含量。这些荧光染料，比如PI，可以染核酸，无法特异性的分别DNA和RNA。只有用RNA酶消化掉RNA后，才能消除RNA的干扰。不然DNA和RNA都会被染色。
提取RNA,氢氧化钠到底能不能去除RNA酶 核酸基因技术123
mingrikeji102017-04-17
大家都知道，提取RNA的时候，去除RNA酶污染，有时候是非常关键的。好多情况下，我们都是在用DEPC，但是DEPC有毒，又容易和Tris试剂中的巯基反应，没办法配制Tris试剂。
我看到过一些资料好像是说氢氧化钠配制的溶液也可以去除RNA酶，按照道理来讲，高浓度的碱可以使得蛋白变性，自然也可以使得RNA酶变性。
然后我试了试，我配制1Mol/L的氢氧化钠,这个浓度已经很高了，用配制的氢氧化钠去处理了一些吸管，烧杯，提取过程中要用到的东西。然后我又用无RNA酶水（这个实验室以前配制了不少）泡了泡这些氢氧化钠处理过的吸管烧杯之类的东西。自然，我也提取RNA试了试，似乎却没有成功。我发现最后提取的RNA浓度低，仅仅为20纳克/微升。虽然A260/A280，比值能到1.98，还不错。但是浓度很低。我跑电泳就能够猜到，没有看出来有条带。自然我后面做pcr的actin也没有结果。
虽然我这次用到的组织样，可能很少，只有小指甲的三分之一，但对于是否提取出来了RNA，我依然产生了怀疑。
幸亏我是做一个植物标本，我还有无限制的样本可以让我折腾。因此我想问的是，NaOH到底能不能去除RNA酶污染。
如果可以，该怎么用。该怎么用，该怎么用。
RNA解旋酶DDX46能显著抑制病毒感染诱导的干扰素表达贤集网123
wangyy19902021-07-26
https://www.nature.com/articles/ni.3830.epdf?referrer_access_token=-Pjl2rt1nZv_1Z8JIoznz9RgN0jAjWel9jnR3ZoTv0PyprITrhfI0J5ucCRfVO-aui0xL-EVR7N2JR4xNKbXmYtj4yXphjh43zAiP6r70OSxNUbkTgT9CKdP6rhb181-RAaL3nGfbbFavHe89R525v6eyOP-tI8-8kcwVAVmKJT1UwT0dPSmOENdZt03DCnok55kvZGMawTEwNU1ehYjDg%3D%3D&tracking_referrer=news.sciencenet.cn
针对DDX家族成员在RNA识别和代谢及其在调控抗病毒天然免疫应答中发挥的重要功能，通过筛选多种DDX家族成员在病毒感染巨噬细胞天然免疫应答中的作用，发现了DDX46能显著抑制病毒感染诱导的干扰素表达
DDX46能结合到抗病毒效应分子mRNA的CCGGUU保守基序上，当病毒感染时DDX46与m6A去甲基化酶ALKBH5结合增加，使得与DDX46结合的抗病毒效应分子mRNA发生去甲基化修饰而导致其核滞留，阻滞了这些抗病毒效应分子的蛋白表达从而降低干扰素产生，最终抑制了抗病毒天然免疫应答反应
冷诱导RNA结合蛋白的生物学功能研究进展123
kwcswgs2012-12-03
来自瑞士日内瓦大学的J?rgMorf及其同事发现冷诱导的RNA结合蛋白（CIRP）的周期性积累会受到体温的调控，他们还发现CIRP赋予了昼夜节律振荡器的健壮性。
详情：http://www.bioku.cn/201212/science-cirp-circADIan-gene-clip-posttranscriptional-modification-fibroblast/
在哺乳动物组织中，节律基因的表达受到局部的振荡器或视交叉上核中生物钟主钟控制的系统信号的调控。本研究发现是受刺激的体温循环而不是外周振荡器，控制纤维母细胞中的冷诱导RNA结合蛋白（CIRP）的节律性表达。反过来，功能缺失性实验表明CIRP是高振幅的节奏基因表达所需的。利用基于生物素-链亲和素的交联和免疫沉淀反应（CLIP），本研究对CIRP结合的RNA进行了全转录组分析，发现了一些编码昼夜节律振荡器蛋白的转录物，包括CLOCK蛋白。此外，在CIRP缺失的纤维母细胞中，CLOCK的含量大大减少。因为在这些细胞中，CLOCK的异位表达提高了节律基因的表达水平，因此我们猜测CIRP通过调节CLOCK的表达水平赋予了昼夜节奏振荡器的健壮性。
详情：http://www.bioku.cn/201212/science-cirp-circADIan-gene-clip-posttranscriptional-modification-fibroblast/
在哺乳动物组织中，节律基因的表达受到局部的振荡器或视交叉上核中生物钟主钟控制的系统信号的调控。本研究发现是受刺激的体温循环而不是外周振荡器，控制纤维母细胞中的冷诱导RNA结合蛋白（CIRP）的节律性表达。反过来，功能缺失性实验表明CIRP是高振幅的节奏基因表达所需的。利用基于生物素-链亲和素的交联和免疫沉淀反应（CLIP），本研究对CIRP结合的RNA进行了全转录组分析，发现了一些编码昼夜节律振荡器蛋白的转录物，包括CLOCK蛋白。此外，在CIRP缺失的纤维母细胞中，CLOCK的含量大大减少。因为在这些细胞中，CLOCK的异位表达提高了节律基因的表达水平，因此我们猜测CIRP通过调节CLOCK的表达水平赋予了昼夜节奏振荡器的健壮性。
植物中依赖RNA 的RNA 聚合酶6(RDR6)研究进展123
牧极利2017-11-27
解旋酶解旋DNA，然后由RNA聚合酶根据DNA序列来造出相应的mRna链，在蛋白质合成中起作用
RNA聚合酶作用的部位。, 123
2017-11-27
DNA聚合酶的作用位点:3'-5'-磷酸二酯键
RNA聚合酶的作用位点:3'-5'-磷酸二酯键
DNA解旋酶的作用位点:DNA中互补碱基之间的氢键
RNA聚合酶的作用位点:3'-5'-磷酸二酯键
DNA解旋酶的作用位点:DNA中互补碱基之间的氢键
翻案了?当年满城风雨的韩春雨NgAgo基因编辑技术或许真的有效 ...123
freecell2021-07-21
于生命起源的各种假说中，至今日仍无有力的结果可说明功能是如何在不同的系统间进行传承。然而，利用活体外演化技术将RNA酶（ribozyme）转换成DNA酶（deoxyribozyme），研究人员不但证明两种相似序列的巨分子系统间功能转移的可能性，也为难解的生命起源之谜提供了些许的线索。
从地球形成之初的一片混沌到第一个生命的出现，期间究竟发生了哪些事情一直是许多科学家想知道的事情。藉由巴斯德对于自然发生说的驳斥到达尔文的天择说，我们对于生命的起源这个大问题（BigQuestion）的答案也慢慢有越来越多的认识，而透过具有催化功能之RNA的发现，“RNA世界（RNAworld）”的假说也渐渐成为目前解释生命起源里最主流的说法。
尽管RNA同时具有可携带遗传讯息与催化的能力，使其被认为最适合作为早期的生命物质，但在RNA之前的生命物质为何、RNA如何将携带遗传讯息的能力传给目前的DNA及如何将酶催化等功能移转给蛋白质等问题却一直缺乏有力的假说。特别是功能（例如酶活性），由于其系取决于三度空间之排列方式，功能并无法如遗传讯息般，可经由配对（base-pairing）方式有效地在DNA与RNA之间以线性方式传递，造成生物分子间的功能传递机制始终不明。
藉由活体外演化的技术，来自ScrippsResearchInstitute的研究人员成功证明了两种系统间除了遗传讯息可透过一对一对应之方式转移，在一定次数的突变下，功能也有可能在两系统间进行转移。于其实验中，研究人员以R3CRNA连接（由57个核酸所组成的RNA酶）为基础先合成了相对应的DNA序列，如所预期，初合成之DNA序列并不具任何催化活性。然而，在透过一定循环的活体外演化技术后，科学家成功地在试管中发现了一段具有和原始之RNA连接?活性相当的DNA序列，这证明了以核酸为基础之遗传讯息系统之间，除了遗传讯息可透过线性的方式进行传递，在一定次数的突变之下，功能也可以同样的方式在两系统间进行转移。
原学术论文：
NatashaPaul,GregSpringsteen,andGeraldF.Joyce,2006,ConversionofaRibozymetoaDeoxyribozymethroughInVitroEvolution,Chemistry&BIOLOGy,13,p.329–338
从地球形成之初的一片混沌到第一个生命的出现，期间究竟发生了哪些事情一直是许多科学家想知道的事情。藉由巴斯德对于自然发生说的驳斥到达尔文的天择说，我们对于生命的起源这个大问题（BigQuestion）的答案也慢慢有越来越多的认识，而透过具有催化功能之RNA的发现，“RNA世界（RNAworld）”的假说也渐渐成为目前解释生命起源里最主流的说法。
尽管RNA同时具有可携带遗传讯息与催化的能力，使其被认为最适合作为早期的生命物质，但在RNA之前的生命物质为何、RNA如何将携带遗传讯息的能力传给目前的DNA及如何将酶催化等功能移转给蛋白质等问题却一直缺乏有力的假说。特别是功能（例如酶活性），由于其系取决于三度空间之排列方式，功能并无法如遗传讯息般，可经由配对（base-pairing）方式有效地在DNA与RNA之间以线性方式传递，造成生物分子间的功能传递机制始终不明。
藉由活体外演化的技术，来自ScrippsResearchInstitute的研究人员成功证明了两种系统间除了遗传讯息可透过一对一对应之方式转移，在一定次数的突变下，功能也有可能在两系统间进行转移。于其实验中，研究人员以R3CRNA连接（由57个核酸所组成的RNA酶）为基础先合成了相对应的DNA序列，如所预期，初合成之DNA序列并不具任何催化活性。然而，在透过一定循环的活体外演化技术后，科学家成功地在试管中发现了一段具有和原始之RNA连接?活性相当的DNA序列，这证明了以核酸为基础之遗传讯息系统之间，除了遗传讯息可透过线性的方式进行传递，在一定次数的突变之下，功能也可以同样的方式在两系统间进行转移。
原学术论文：
NatashaPaul,GregSpringsteen,andGeraldF.Joyce,2006,ConversionofaRibozymetoaDeoxyribozymethroughInVitroEvolution,Chemistry&BIOLOGy,13,p.329–338
嵌合抗原受体修饰T细胞治疗肝细胞癌研究进展123
爱康得2021-07-24
相关疾病：肿瘤类癌综合征癌症卵巢癌文章来源:http://www.impactjournals.com/oncotarget/index.php?journal=oncotarget&page=article&op=view&path[]=5029&pubmed-linkout=1Keywords:
在dna复制中,以下哪一种酶去除rna引物并用脱氧核糖核苷酸替代_...123
9510272017-10-01
相同点：都能以DNA为模板，从5'向3'进行核苷酸或脱氧核苷酸的聚合反应。不同点:DNA聚合酶识别脱氧核糖核苷酸，在DNA复制中起作用；而RNA聚合酶聚合的是核糖核苷酸，在转录中起作用。
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