2XReadyGoPCRMasterMixisa2Xconcentratedsolutionof Taq DNAPolymerase,dNTPs,andallofthecomponentsrequiredforPCR,exceptDNAtemplateandprimers.Thispre-mixedformulationsavestimeandreducescontaminationduetoareducednumberofpipettingstepsrequiredforPCRsetup.ThemixisoptimizedforefficientandreproducIBLePCR.
TheMasterMixhasfourversions,withstandardbufferandGCbuffer,colorlessandgreen.TheMasterMixwithGCbufferisusedforamplificationofGC-richtarget(GCcontentis>65%).ThegreenoneissupplementedwithtwotrackingdyesfortheconvenienceofdirectgelloADIngofPCRproducts.
Ona1%agarosegelin1XTBE,onedyemigratesatapproximately4kbandanothermigratesatapproximately50bp.
Highlights
- Convenient:Ready-to-usemix,directloadingofPCRproductsongel
- Thermostable:Enzymeinthemixretainsatleast85%activityafter60minat95°C
- GeneratesPCRproductswith3"-dAoverhangs
- Incorporatesmodifiednucleotides (e.g.,biotin-,digoxigenin-,fluorescently-labelednucleotide)
- Efficientamplificationofcomplextarget
DataSheet:2XReadyGoPCRMasterMix
VitaNaviTechnolog是华盛顿大学BarnesWayne教授创办的一家专门从事Taq酶及其相关产品研发与销售的生物公司。BarnesWayne教授是国际上著名的Taq酶专家，也是长片段基因PCR扩增技术的发明人和专利所有人（1993，PNAS；U.S.Patent5,436,149）。20多年来，BarnesWayne教授始终致力于PCR聚合酶，研发了系列TaqDNA聚合酶产品，远销全球40多个国家，是目前国际上生产PCR聚合酶的主要供应商之一。美国VitaNaviTechnology公司研发的新型高耐受性DNA聚合酶为基因检测技术带来了根本性的革新，彻底解决了依赖于纯化的核酸DNA为模板进行PCR扩增这一瓶颈问题。 产品简介 Omni酶是从文库中筛选出来的具有极高耐受性的Taq或者Klentaq突变体，可以直接以全血、血清、土壤、牛奶、巧克力或奶酪等材料为模板一步扩增目的基因，避免了繁琐的核酸DNA提取过程 产品特征：1.对全血、血清、血浆、土壤、植物、巧克力、奶酪和牛奶中的抑制因子具极高的耐受性，可直接对样品进行PCR检测，无需DNA分离。2.可以耐受高达40%的全血，20%的血浆或血清。3.可以从人血液中一步扩增疟疾基因。4.Omni酶节省时间、降低成本.5.直接从微量样品中的扩增，避免样品提取而丢失或污染DNA。
一、Klentaq1/KlentaqLA?实例1：用KelntaqLA扩增大于20kb的大片段基因。??二、高耐受性(Inhibitor-Resistant)聚合酶：OmniTaq/OmniKlentaq产品特征：1.对全血、血清、血浆、土壤、植物、巧克力、奶酪和牛奶中的抑制因子具极高的耐受性，可直接对样品进行PCR检测，无需进行DNA分离纯化。2.可以耐受高达40%的全血，20%的血浆或血清，已应用于多种遗传病的分子诊断和临床检验。3.可用于法医、环境监测、农业、动植物检疫和临床诊断等领域。4.可以从人血液中一步扩增疟疾基因。5.与PCR增强剂结合使用时，其耐受性将进一步提高。6.使用Omni酶不仅节省时间、降低成本，而且实现了从微量样品中的扩增，避免因提取过程所致的DNA丢失或污染。实例2：用OmniTaq（OT）和OmniKlentaq（OKT）从肝素抗凝血液中一步扩增乙肝病毒基因。?实例3：用新突变的Omni酶从富含腐殖酸的人基因组中扩增1.1kb的CCR5基因。?实例4：用新突变的Omni酶从巧克力和黑胡椒中直接扩增基因。?三、热启动聚合酶(Hot-start)聚合酶：CesiumTaq/CesiumKlentaq产品特征：1.CesiumTaq和CesiumKlentaq是一种冷敏感的突变体，在室温条件下聚合酶的活性很低，当升高温度进入PCR循环时聚合酶的活性就全部释放出来，因而具有内置式热启动功能。2.与现有化学修饰或抗体封阻的热启动聚合酶相比，CesiumTaq和CesiumKlentaq的聚合酶活性更高，扩增效果更好。3.CesiumKlentaq具有热启动和高耐受性双重效果。实例5：用CesiumKlentaq扩增基因热启动效果比较?四、PCR增强剂（PCRenhancingcocktails,PEC）产品特征：1.联合使用PEC-1或PEC-2与高耐受性Taq酶（OmniTaqandOmniKlentaq）可以更好的克服样品中各种物质对PCR反应的抑制作用，进一步提高PCR扩增效率，简化PCR操作流程提高。2.PEC有助于从基因组中扩增GC含量高达80%的基因。3.PEC也可用于qPCR（SYBR和Taqmanprobe）。4.新研发的PCR增强剂PEC-3andPEC-4有助于从食品中扩增基因。?实例6：联合使用OmniTaqorOmniKlentaq及PCR增强剂（PEC）从不同类型的牛奶中检测沙门氏杆菌Inv基因。??实例7：联合使用OmniTaqorOmniKlentaq及PCR增强剂（PEC）从人的基因组DNA或全血中直接扩增3个高GC含量的基因。?五、各种特异性一步PCR试剂盒VitaNaviTech公司开发了系列一步法PCR和qPCR试剂盒，可以直接从样品中扩增目的基因。1.DirectBloodPCRKit：从血液中直接扩增目的基因实例8：使用DirectBloodPCRKit从全血中一步扩增CCR5基因
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1.模板提取（一般为RNA）：Trizol、氯仿、异丙醇、无水乙醇、DEPC处理水
2.模板浓度测定：分光光度计或NanoDrop
3.逆转录：逆转录试剂盒（或者一步法试剂盒），这一步可以用普通PCR做，也可以用水域做。
4.荧光定量PCR试剂：通常有用SYBR Green Mix做的，但是这里建议你用EvaGreen做，灵敏度和平行性都要好于SYBR Green，并且如果你那是ABI或者Stratagene的PCR如果用SYBR Green还需要加一步Rox很麻烦。
5.其他：除了以上的那些还需要离心管、PCR管或板（Axygen反应比较好）、移液枪等，暂时就想到这么多。
组织用Trizol法提取总RNA浓度、纯度都很好，但逆转录后跑PCR，CT值偏高，内参的在22-27之间，目的基因在30-36之间，不知道是怎么回事，如何来解决，求高手赐教。我用的Takara的试剂盒。
跑到还有半小时的时候，跳出一个对话框：“analysiscannotproceed:notenoughsamplesdefined”，最后做出来的结果有扩增曲线但是没有熔解曲线，请各位大神帮忙解释一下。
两步法，是因为设计引物的时候把退火温度设为酶的工作温度，而且定量PCR的产物都很短，需要的时候都短，所以两步法更方便。三步法的话，花的时间长，不利于快速实验。
RNA 质量
RNA 质量主要包括RNA的纯度（没有蛋白质和DNA的污染）以及完整性。传统的RNA质量的评价通过分析A260/A280的比值或者对琼脂糖凝胶电泳rRNA的条带的分析。Agilent Bioanalyser/BioRad Experion 微流体毛细电泳系统也是一种较新的分析方法。Agilent的2100也是一种十分好的分析RNA质量的方法，它通过分析18S以及28S rRNA的分析图谱，通过图谱来反应RNA的量和完整性，其完整性通过完整性系数（RIN）来反应。样品的RINs在10-4之间。10代表完整的RNA，4代表没有完整的rRNA带。
由于以上的方法并非100%准确定反应mRNA的完整性，因为他们只是反应rRNA的量来间接测定mRNA的完整性。这里推荐一种方法：采用GAPDH的3’：5’分析法。
我们使用oligo dT进行逆转录，然后对逆转录的cDNA用multiplex荧光定量评价。设计三个taqman探针来定量三种相同大小的扩增产物。探针设计的位点分别位于3’；5’以及中部。扩增产物的之间的比值反应RNA的完整性。如果3’；5’的比值在1，反应较高度完整性，如果高于5说明降解。
QRT-PCR抑制物的组成
QRT-PCR抑制物严重减少了PCR的灵敏度以及热动力学反应，高度的抑制还导致假阴性的结果。
抑制物的来源：生物样品的核酸抽提以及共沉淀中的混合物，盐离子，尿素，血红素，heparin以及IgG.
是否有抑制物的评价体系：
1.通过对目的样品进行梯度稀释进行PCR扩增效率的检测
2.通过内部扩增对照来反应样品处理过程中样本的情况
3.用细菌检测临床样品的抑制
4.通过标准人工合成的扩增进行RT-PCR来反应目标检测物的抑制情况
反转录反应系统
1.RT和PCR单一酶系统
2.RT和PCR分离的酶系统
3.RNA逆转录引物的选择
引物主要有三种：
1.随机引物：随机引物，特别是6nt引物对所有的靶位点不产生十分稳定一致的结果，建议使用15nt的随机引物.
2.oligo-dT：只能用于mRNA完整的样品，特别有polyA .而且对于一些特殊的变异体以及较长的3’UTR的区域比较困难
3.特异引物：最特异最灵敏的方法。特别RNA量足够情况下建议使用此法。
如果要测量细胞表面2个受体的比率，最好用流式细胞仪来测量
