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Itsi-Biosciences/Protein Fraction & Enrichment Kit [ProFEK, K-0015]/20 Assays/K-0015-20
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Itsi-Biosciences/Protein Fraction & Enrichment Kit [ProFEK, K-0015]/20 Assays/K-0015-20
品牌 / 
Itsi
货号 / 
K-0015-20
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Biological samples contain a complex mixture of proteins, which in living cells are localized in the membrane, nucleus and/or cytoplasm. Therefore, to identify the proteins that are predominant in each region, it is necessary to reduce the complexity of the total protein lysate by fractionating the lysate into membrane, nuclear and cytosol fractions. Reduction in sample complexity is also important when the detection of protein(s) that occur at low concentrations in any of the regions is desired. An ideal method should be reproducible, simple, convenient and cost effective.

ITSI has a unique kit for fractionation and enrichment of proteins found in the nuclear, cytosol and membrane regions. The ITSIPrep ProFEK (K-0015) Protein Fraction and Enrichment Kit (ProFEK) provides a validated, fast, and cost-effective method to fractionate and enrich for membrane, cytosol, and nuclear proteins without ultra centrifugation. The optimized reagents and procedure provided with the kit allow for reproducible results and identification of unique region associated proteins. The extracted membrane, nuclear, and/or cytoplasmic protein fractions can be analyzed by mass spectrometry, SDS-PAGE (Fig 1), 2D-PAGE, 2D-DIGE (Fig 2), and western blotting.

Fig 1: 1D-PAGE gel image of chicken heart protein lysate fractionated with ITSIPrep ProFEK kit into Nuclear (lane 1), Cytosol (lane 2) and Membrane (lane 3) protein fractions. A and B represent protein fractions obtained with 1x and 2x volume of solvent respectively, MWW is molecular weight marker and WT is Whole (unfractionated) tissue lysate.

Benefits of using the ITSIPrep Protein Fractionation and Enrichment Kits:

– Lowest cost/sample for selective enrichment of nuclear, cytosol and membrane proteins– No ultra centrifugation required– Reproducible results– Easy-to-follow protocol

Fig 2: Images showing proteins from human tissue lysate fractionated with ITSIPrep ProFEK kit to concentrate Nuclear, Cytosol and Membrane proteins prior to analysis by 2D-DIGE

Each Kit contains optimized reagents and consumables including:

  • ProFEK Buffer 1
  • ProFEK Buffer 2
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  • ProFEK Buffer 3
  • Disposable Pestle/Tube for sample homogenization
  • Standard protocol

K-0015-20 (20 Assays) – $69.00

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聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。它具有特异、敏感、产率高、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点;能在一个试管内将所要研究 的目的基因或某一DNA片段于数小时内扩增至十万乃至百万倍,使肉眼能直接观察和判断;可从一根毛发、一滴血、甚 查看更多>
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  由上海东松医疗科技有限公司组织招标的《上海交通大学医学院附属仁济医院血流测量仪等设备》(招标编号:0811-DSITC170015)询价采购项目,于2017年1月12日在中国上发布招标信息。  经评审小组评议及用户确认,现将本次评审结果公告如下:  设备名称及数量:  第1包:血流测量仪/壹套  成交供应商:帕瑞医学科技(北京)有限公司  第2包:细胞钙成像系统/壹套  成交供应商:默瑞(上海)生物科技有限公司  第3包:荧光定量P... 查看更多>
  PCR技术自1985年建立以来,发展之迅速、应用之广泛,表明其具有强大的生命力.近些年来,基于PCR的基本原理,许多学者充分发挥创造性思维,对PCR技术进行研究和改进,使PCR技术得到了进上步地完善,并在此基础上派生出了许多新的用途.原位PCR技术  原位PCR就是在组织细胞里进行PCR反应,它结合 查看更多>
1 导言小RNA(miRNAs)是一种内源性非编码蛋白的小分子RNA,它们是许多基础的细胞过程中基因表达的主要调节因子,这些过程包括细胞增殖、细胞分化以及细胞凋亡等。miRNA在肿瘤生长过程中也发挥着重要作用。一般来说,miRNA通过控制翻译过程来 查看更多>
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The molecular events that lead to the perception of pain are a key research field in medicine and drug discovery. The opioid receptors modulate pain signaling 查看更多>
定量PCR(即时聚合酶链锁反应,Real-time Polymerase Chain Reaction,简称 Real-time PCR、即时PCR),又称定量即时聚合酶链锁反应(Quantitative real time polymerase chain reaction,简称 Q-PCR/qPCR/rt-qPCR、定量即时PCR、即时定量PCR),是一种在DNA扩增反应中,以萤光染剂侦测每次聚合酶链锁反应(PCR)循环后产物总量的方法... 查看更多>
通善 实时荧光定量PCR服务 实验技术服务基因组DNA提取服务项目材料要求服务价格获得DNA量周期细菌基因组DNA提取对数生长期的新鲜菌液1-2ml50元/样品1-2ug1-2周细胞基因组DNA提取1×106新鲜或冻存的细胞50元/样品≈10ug1-2周血液基因组DNA提取1ml新鲜或液氮冻存的样本50元/样品≈10ug1-2周组织基因组DNA提取100mg新鲜或-20度冻存的样本50元/样品≈10ug1-2周服务项目材料要求服务价格获 查看更多>
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定量PCR方法及数据分析123
有木有3803722021-08-06
你所说的PCR应该就是最常规的PCR,以DNA为模板,通过上下游引物,实现DNA的扩增RT-PCR一般情况下是指反转录PCR(reversetranscription),尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也(realtimefluores-cencequantitativePCR)也简称RT-PCR,但是我觉得这是不对的,不推荐。基本操作过程是将所提取的RNA进行反转录,然后将所获得的cDNA作为模板,设计引物进行扩增,是一种检测基因表达的常用方法。实时荧光定量PCR也就是Real-TimePCR,原理有点多,请自行百度百科,其最大的作用是检测样品中的初始DNA浓度。至于三者的关系,RT-PCR和实时定量PCR应该都属于PCR,在RNA实验中,这二者都会应用到。例如你要比较2个组织中的某基因的表达差异,首先你要提取2个组织的总RNA,然后通过RT-PCR检测该基因是否在2个组织中有表达,然后通过实时定量PCR测定该基因在2个组织中的表达量是否具有显著性差异。
为什么荧光定量pcr可以准确定量
实时定量的引物设计要求比较高,可以按普通引物设计的方法来做,但是设计时要注意扩增的片段不能太大,最好在250bp-100bp之间。同时要保证这对引物有绝对的特异性,因为要是产生非特异性扩增的话,就不能准确的计量模板量了,这样就失去了实时定量的意义了
用已知浓度的DNA样本(通常是质粒)梯度稀释成一系列的样本。做实验的时候,这些标准品和待测样本加在同样一块96孔盘的不同孔内。一起做PCR。
标准品的荧光强度和已知的浓度作图,可以得到一条标准曲线。而待测样本的荧光强度测出以后,就可以在标准曲线上算出样本浓度了。
所谓Ct值,就是最先出现超过阈值信号的那个循环数。或者说是到了第几个循环才出现超过阈值的信号。

C代表的是cycle,循环数目,T代表的是threshold,阈值。

所以表达量越少的话,需要越多的循环才能扩增出来。也就是CT值越高

请教园友:

一般做mRNA表达的时候,需要注意提取的RNA中是否有DNA污染,或者通过设计跨内含子的引物来解决。那么,检测MmiRNA的时候,需要注意RNA中DNA污染的问题么?

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。
一般都是相对量。则用delta delta CT方法来计算。举例如下:
对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。
首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是对照组的2倍。
基因A: delta CT=20-18=2。2的2次方是4。也就是说基因A的量在实验组是对照组的4倍。但是由于加样量是2倍,所以4处以2=2,最后的相对量是2倍。

几点注意:
1。必须确定扩增的特异性
2。 只有相同目标的CT值才能相减(扩增效率有可能不同)
3。 2的某次方只是理论值,实际扩增效率低于2。
4。 最好不用Syber Green
如果你想做荧光定量PCR的根据实验思路来说应该需要一下试剂和仪器
1.模板提取(一般为RNA):Trizol、氯仿、异丙醇、无水乙醇、DEPC处理水

2.模板浓度测定:分光光度计或NanoDrop

3.逆转录:逆转录试剂盒(或者一步法试剂盒),这一步可以用普通PCR做,也可以用水域做。

4.荧光定量PCR试剂:通常有用SYBR Green Mix做的,但是这里建议你用EvaGreen做,灵敏度和平行性都要好于SYBR Green,并且如果你那是ABI或者Stratagene的PCR如果用SYBR Green还需要加一步Rox很麻烦。

5.其他:除了以上的那些还需要离心管、PCR管或板(Axygen反应比较好)、移液枪等,暂时就想到这么多。
ROX Reference Dye,可用于需要Dye的Real Time PCR扩增仪,用于ABI、Stratagene等公司的Real Time PCR扩增仪上,用以校正孔与孔之间产生的荧光信号误差.并不是每次都会用到.
一般有ROX Reference Dye和ROX Reference Dye II两种,针对不同的PCR仪.一般ABI PRISM 7000/7700/7900HT和7300 Real-Time PCR System使用ROX Reference Dye,而7500 Real-Time PCR System和7500 Fast Real-Time PCR System使用ROX Reference Dye II.其它牌子如Thermal Cycler Dice Real Time System、LightCycler 等Real Time PCR扩增仪时不必使用.
怎么看荧光定量PCR的试剂盒好不好123
OneShine往圣生物2021-08-02

一般说来,应选用口碑较好的经过大量客户实验验证的荧光定量PCR试剂盒,因为只有选对了试剂盒才能够做成漂亮的实验结果来,特别是对于一些珍贵的样品更不能因为节约一些蝇头小利而糟蹋了样品本身。OneShineSybrGreenpreMix试剂盒在研发之初就考虑到了一般科研环境中方方面面的影响,例如我们就光照强度、光照时间对本产品的影响做了严苛的实验论证,得到1ml本产品盛装于1.5ml离心管中放置在2000Lux光照强度下可以保存12h,超过12h产品性能则会下降。

OneShineSybrGreenpreMix这款试剂盒除了价格适中外,还主要有以下优点:

1、适用于RealTimePCR反应,可以快速、准确地对目的基因进行定量检测。

2、在2×OneShineSybrGreenpreMix中,预先混有SybrGreen,PCR体系配制时只需入模板、引物、ddH2O即可,操作方便快捷。

3、含有更耐高温并持续稳定的DNAPolymerase,可以维持更多的循环数,提供了选择循环数更大的空间。更大的Ct值选择范围就意味着可以支持微量目的基因检测,检测范围fM-nM。

4、反应的Buffer更适合,使反应的基线更水平,无荧光污染信号。使线性期更陡峭,避免了Ct值的无效浮动。使平台期更平直。也确保了引物与模板能够更特异地结合。

5、SybrGreen更耐高温更足量,确保只要扩增反应在进行,目的DNA双链在增加,就有线性强度的荧光产生。

6、dNTPs更足量,确保反应有更高的平台期荧光信号。

7、Mg2+浓度更适合,确保线性期有爆发式的目的DNA片段合成,提高了线性期反应体系的扩增系数和线性期的长度。

8、更高的仪器适配性,SybrGreen染料可以被各大主流仪器的激发光所激发,产生明亮的荧光信号,有利于仪器对信号的捕捉和处理。

我们的产品与市面上目前常见的一种产品相比较有如下区别:

A公司的产品没有熔解温度,或者熔解温度太高。但是A公司的产品Ct值出现略早,这是因为A公司使用了一种小分子量的DNA聚合酶,这种酶与模板和引物的结合较快和较松散,但是扩增的效率和扩增的特异性就不能保证了,类似于温水煮青蛙不温不火的;这种酶还有一个弱点就是不耐冻融。我们使用的是Taq酶,是一种分子量较大的DNA聚合酶,这种酶与模板和引物结合比较慢,但是慢工出细活,这种酶的特异性较好,一旦激活便呈现爆发式的扩增,类似于不鸣则已一鸣惊人。我们产品熔解温度是A公司不可比拟的,线性范围和斜率也是A公司不可比拟的。详见下图:


普通的PCR大多数是定性实验,而实时荧光定量PCR则定量和定性都可以做。应用领域也不一样,普通PCR一般应用于基因组克隆、DNA测序、RNA反转录等,而实时荧光定量PCR一般应用于mRNA表达量分析、绝对定量、蛋白表达、SNP分析、阴阳性解析等领域。不是定量PCR比PCR好,而是两者应用与不同的领域,起到了不同的作用。
荧光定量PCR较普通PCR不同的一点就是可以实时检测PCR扩增产物,从而可进行绝对定量或者相对定量。
最近要做realtimePCR,taqman探针法,没有买市场上的产品,可否先用普通taq酶试试?
这样设想的前提是因为,普通Taq酶也具有5‘-3’外切酶活性,如果可以的话,与普通PCR相比,反应体系需要做什么样的改动呢?
用的是ABI的机器。
荧光定量PCR是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时在线监控反应过程,结合相应的软件可以对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度。|||原理不同:荧光定量pcr实时监测与dna结合的荧光染料激发的荧光;普通pcr通过检测插入dna中核算染料的量来测定pcr最终产物量,一般是紫外光。反应要求:荧光定量对扩增片段有较高的要求,一般为100-300bp;普通定量可以扩增长点的片段。如果不需要检测产物分子量大小,荧光定量可以不进行电泳就对产物进行定量分析,普通pcr必须电泳。结果:荧光定量可以实现精确定量,普通pcr则不行。荧光定量体现可以看到整个扩增过程,可以看到扩增效率,溶解温度,直接得到的标准曲线等,这些是普通pcr无法实现的。|||这个还真不大清楚|||貌似前者是定量,后者属于半定量。|||简单的讲PCR技术最早是用于扩增一段特异的PCR片段,用于克隆、测序等实验,后来也将其用于样本中特异的PCR片段有无或非很粗的相对定量,而荧光定量PCR技术则是为了测定样本中特异的PCR片段相对及绝对量,是一种测定特异的PCR片段含量的方式。如测定病人样本中病原体的含量、实验样本中某一特定的mRNA的含量等。前些年有人讲过普通PCR后,通过电泳也可以进行定量,其实是将PCR产物的定量与PCR样本中模板定量相混了。近两年没有人再讲这类的话了。|||引物设计是sybr定量PCR法的最大难点,机会好的话,设计一对引物就能得到很好的结果,机会不好的话7、8对引物也出不来,我就遇到过这样的问题,我在prime5.0上设计了8对引物,符合实验要求的一对也没有,我把退火温度提高到了68度也没能把引物二聚体搞定,后来我想通了,可能我这对引物把其它序列扩增出来了,而且扩增效率很高(我一个同学设计了十几对才找到一对好用的)。记住primer5.0设计出来的100%好的引物,到了定量PCR上不一定好使,这是我最大的经验。定量pCR的引物对匹配度要求不高,我现在使用的引物就有几个碱基不匹配,但实验结果很好。有一个办法可以帮助我们绕过引物设计这道坎,直接到罗氏网站上专区上找引物。罗氏网站在线有一个引物设计软件,你只要找好你目的基因的种属,输入你的片段序列就可以得到你要的引物。这个软件有很大的好处,他会自动地把你的种属序列背景扣除,最大限度地去除引物二聚体产生的可以。