
Overview:
KAT9(alsoknownasELP3)isthecatalyticsubunitofthehistoneacetyltransferase(HAT)elongatorcomplex,whichcontributestotranscriptelongationandalsoregulatesthematurationofprojectionneurons.TheknockdownofKAT9byantisensemorpholinosinzebrafishembryosresultedindose-dependentshorteningandabnormalbranchingofmotorneuronswithnoconcomitantmorphologicabnormalities(1).KAT9knockdownalsoimpairspaternalDNAdemethylationasindicatedbyreporterbinding,immunostaining,andbisulfitesequencing(2).
GeneAliases:
KAT9;ELP3;FLJ10422
GenbankNumber:
NM_018091
References:
1.Simpson,C.L.et.al:Variantsofelongatorprotein3(ELP3)geneareassociatedwithmotorneurondegeneration.Hum.Molec.Genet.18:472-481,2009.2.Okada,Y.et.al:Arolefortheelongatorcomplexinzygoticpaternalgenomedemethylation.Nature463:554-558,2010.
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植物材料 用最精确的方法,称取不超过100mg的植物材料,置于处理过的研钵,加入液氮进行研磨 将研磨得到的粉末,快速转移至无RNase,并经过液氮冷却的2mL离心管(自备),
但是,这样做的前提的,RNA提得要好,浓度要高,这样免得RNA降解到不能用了。因为在有二价阳离子的(DNAseI buffer含有)情况下,RNA在60度以上时必然发生非酶促降解。
想搞清一个问题,如何区别是因为small RNA 引起的调控呢?还是tRNA引起的调控,有没有有效的分离这两种RNA的办法呢?
样品处理:
a. 植物组织:取新鲜或-70℃冻存100mg组织在液氮中研磨,把粉末加入到1ml裂解液中混匀。
b. 动物组织:取新鲜或-70℃冻存100mg组织加1ml裂解液,用组织研磨杵或匀浆器匀浆处理。
c. 贴壁细胞:直接在培养板中加入裂解液裂解细胞,每106细胞加1ml 裂解液。用取样器吹打混匀。

