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ApexBio/RKI-1447/10mM (in 1mL DMSO)/A3771
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ApexBio/RKI-1447/10mM (in 1mL DMSO)/A3771
品牌 / 
ApexBio
货号 / 
A3771
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RKI-1447Potent ROCK1/ROCK2 inhibitor

Catalog No.A3771
SizePriceStockQty
10mM (in 1mL DMSO)
$99.00
In stock
5mg
$60.00
In stock
10mg
$110.00
In stock
25mg
$240.00
In stock
50mg
$400.00
In stock

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Publications citing ApexBio Products

Nature.2017 Jan 19;541(7637):417-420.
Nature.2018 Nov;563(7731):407-411.
Nature.2018 Jun 13.
Nature.2018 Jun 27.
Nature.2018 Mar 29;555(7698):673-677.
Nature.2017 Sep 7;549(7670):96-100.
Nature.2016 Apr 21;532(7599):398-401.
Science.2016 Aug 5;353(6299)594-8
Nat Nanotechnol.2017 Dec;12(12):1190-1198.
Nature Biotechnology.2017 Jun;35(6):569-576
Nat Med.2018 Sep 17.
Cell.2018 Dec 21. pii: S0092-8674(18)31561-7.
Cell.Available online 25 October 2018.
Cell.2018 Sep 27. pii: S0092-8674(18)31183-8.
Cell.2018 Jun 28;174(1):172-186.e21.
Cell.2018 Feb 22;172(5):1007-1021.e17.
Cell.2017 Nov 30;171(6):1284-1300.e21.
Cell.2017 Aug 17. pii: S0092-8674(17)30869-3.
Cell.2017 Jul 13;170(2):312-323
Nat Med.2018 Jan 29.
Nat Med.2017 Nov;23(11):1342-1351.
Cell.2017 Apr 6;169(2):286-300.
Cell.2015 Aug 27;162(5):987-1002.
Cell.2015 Feb 12;160(4):729-44.
Nature Medicine.2017 Apr;23(4):493-500.
Cancer Cell.2018 May 14;33(5):905-921.e5.
Cancer Cell.2018 Apr 9;33(4):752-769.e8.
Cancer Cell.2018 Mar 12;33(3):401-416.e8.
Cancer Cell.2017 Aug 14;32(2):253-267.e5.
Nat Methods.2018 Jul;15(7):523-526.
Cell Stem Cell.2018 May 3;22(5):769-778.e4.
Cell Stem Cell.2017 Nov 20. pii: S1934-5909(17)30375-2.

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Chemical structure

RKI-1447

Biological Activity

DescriptionRKI-1447 is a potent inhibitor of ROCK1 and ROCK2 with IC50 values of 14.5 nM and 6.2 nM, respectively.
TargetsROCK1ROCK2
IC5014.5 nM6.2 nM

RKI-1447 Dilution Calculator

Concentration (start)
x
Volume (start)
=
Concentration (final)
x
Volume (final)
C1
V1
C2
V2

calculate

RKI-1447 Molarity Calculator

Mass
=
Concentration
x
Volume
x
MW*
g/mol

calculate

Chemical Properties

Cas No. 1342278-01-6SDF Download SDF
Synonyms RKI 1447;RKI1447
Chemical Name 1-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-3-(4-pyridin-4-yl-1,3-thiazol-2-yl)urea
Canonical SMILES C1=CC(=CC(=C1)O)CNC(=O)NC2=NC(=CS2)C3=CC=NC=C3
Formula C16H14N4O2S M.Wt 326.37
Solubility ≥16.3 mg/mL in DMSO, ≥6.32 mg/mL in EtOH with ultrasonic and warming, <1.8 mg/ml="" in="" h2o=""> Storage Store at -20°C
Physical AppearanceA solidShipping ConditionEvaluation sample solution : ship with blue ice.All other available size:ship with RT , or blue ice upon request
General tipsFor obtaining a higher solubility , please warm the tube at 37 ℃ and shake it in the ultrasonic bath for a while.Stock solution can be stored below -20℃ for several months.

Background

RKI-1447 is a potent inhibitor of ROCK 1 and 2 (Rho-associated protein kinase 1 and 2).

ROCK is a serine-threonine kinase, which regulates cell shape and movement via acting on cytoskeleton.

RKI-1447 specifically and dose-dependently inhibits ROCK1 and ROCK2. RKI-1447 inhibited the phosphorylation of the ROCK substrates MLC-2 and MYPT-1 in human cancer cells. However, it does not affect the phosphorylation of the AKT, MEK, and S6 kinase at a high concentrations of 10 μmol/L. It indicated a high specificity. Additionally, it was also observed that RKI-1447 selectively suppressed ROCK-mediated cytoskeleton re-organization following LPA stimulation, but does not affect PAK-meditated lamellipodia and filopodia formation following PDGF and Bradykinin stimulation. RKI-1447 inhibited migration, invasion and anchorage-independent tumor growth of breast cancer cells [1]

In mouse model, tumors were monitored at the time of tumor onset and the beginning of treatment (once a day for 14 days) with vehicle (20% HPCD) or RKI-1447 (200 mg/kg/day), when tumor volumes reached 75 to 2,300 mm3. Tumors from mice treated with vehicle increased in average tumor volume of 68.3% but tumors from mice treated with the RKI-1447 increased in average tumor volume of only 8.8%. Thus, RKI-1447 inhibited mammary tumor growth by 87% [1].

Reference:[1] Patel R A et al. , RKI-1447 Is a Potent Inhibitor of the Rho-Associated ROCK Kinases with Anti-Invasive and Antitumor Activities in Breast Cancer. Cancer Res, 2012, 72(19): 5025-5034.

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2021-09-07
“微小残留病 (Minimal Residual Disease, MRD) 是指白血病/淋巴瘤/骨髓瘤患者经治疗缓释后,体内仍残留少量癌细胞的状态,其最终可能会引起疾病复发。因残留的癌细胞数量较少,不易察觉,所以需要一个更灵敏的MRD检测手段,这是实现个体化治疗的重要步骤。”围绕微小残留病(MRD)检测的争议之一是其评估的最佳技术。纽约纪念斯隆凯特琳癌症中心的Landgren教授在2017年美国血液学会(ASH)年会中接受采访,就MR... 查看更多>
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构建重组质粒,在pSET4S质粒上插入一段基因的上下游同源臂,双酶切验证正确,同时以重组质粒为模板PCR扩增插入的片段,均与阳性对照一致,但测序结果进行NCBI比对,发现插入的一段序列不正确。而且这个重组质粒曾经构建出来过,因其中一个碱基突变所以重新构建,使用了primestar重新构建却总是测序不正确或者酶切不正确
1.TaqMan探针法 针对染色体上的不同SNP位点分别设计PCR引物和TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增。探针的5’-端和3’-端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中存在PCR产物时,该探针与模板退火,即产生了适合于核酸外切酶活性的底物,从而将探针5’-端连接的荧光分子从探针上切割下来,破坏两荧光分子间的PRET,发出荧光。通常用于少量SNP位点分析。
2.SNaPshot法 该技术由美国应用生物公司(ABI)开发,是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析。
在基因组研究领域,人们对数据的可信度有一个基本的要求:单个碱基越准确越好,对单个碱基的覆盖深度越多倍越好,对整个基因组测得越完整越好,测序的“缺口(Gap)”越少越好。

  以这些标准看,目前的基因组测序结果,还没有一个是完美的。
人类基因组:缺点在哪里?
  首先,人类基因组还不够精确。人是“二倍体”,也就是有一半遗传物质来自父亲,一半遗传物质来自母亲,且在受精卵形成过程中,还会发生基因重组,这是人类遗传多样性的来源之一。科学家们需要更精确的“单倍型”数据,这样基因组才够“完美”,而这种“完美”正是研究者们追求的目标。
  其次,人类基因组还不够多元。
  按照传统的人种分类,人类按照肤色黑白黄棕,被粗分为四大类:尼格罗人种、高加索人种、蒙古人种、澳大利亚人种。基因组测序数据是从高加索人种开始的,人类基因组计划是人类的标准参考基因组,也是高加索人种的标准参考基因组。文特尔的基因组,测序对象是他自己,同样是高加索人种。
  然而,从基因组研究的角度,为了尽可能地包括各种遗传背景,需要为更多族裔建立自己的参考基因组。

资料来源:http://www.mv163.cn/jkgl/news/2015/1224/5227.html
没有专门的“测序酶”的说法。
你所说的“测序酶”在一般情况下就是“聚合酶”。
因为目前的的测序方法主要就是借助聚合反应。
当然,有些测序方法(比如曾经的SOLiD系统)是利用连接反应,那么它用的“测序酶”肯定是连接酶。
估计,也就是这个原因有人把它。

两个基因大小分别230kb和450kb,酶切后,450kb的有目的条带,但很弱,230kb的质粒条带亮,其下方有一很微弱条带,用的酶分别是:Ncol和Spel体系是(Takara,两个酶切体系不同,用的官网推荐体系):

NcoI1μl

Spel1μl

10×KBuffer2μl
0.1%BSA2μl
DNA3ul
灭菌水upto20μl37℃4h电泳1h

1.TaqMan探针法 针对染色体上的不同SNP位点分别设计PCR引物和TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增。探针的5’-端和3’-端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中存在PCR产物时,该探针与模板退火,即产生了适合于核酸外切酶活性的底物,从而将探针5’-端连接的荧光分子从探针上切割下来,破坏两荧光分子间的PRET,发出荧光。通常用于少量SNP位点分析。
2.SNaPshot法 该技术由美国应用生物公司(ABI)开发,是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析。
3.HRM法 高分辨率熔解曲线分析(HRM)是近几年兴起的SNP研究工具,它通过实时监测升温过程中双链DNA荧光染料与PCR扩增产物的结合情况,来判断是否存在SNP,而且不同SNP位点、是否是杂合子等都会影响熔解曲线的峰形,因此HRM分析能够有效区分不同SNP位点与不同基因型。这种检测方法不受突变碱基位点与类型的局限,无需序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨率熔解,即可完成对样品基因型的分析。该方法无需设计探针,操作简便、快速,成本低,结果准确,并且实现了真正的闭管操作。
4.Mass Array法 MassARRAY分子量阵列技术是Sequenom公司推出的世界上领先的基因分析工具,通过引物延伸或切割反应与灵敏、可靠的MALDI-TOF-MS技术相结合,实现基因分型检测。基于MassARRAY平台的iPLEX GOLD技术可以设计最高达40重的PCR反应和基因型检测,实验设计灵活,分型结果准确性高。根据应用需要,对数十到数百个SNP位点进行数百至数千份样本检测时,MassARRAY具有最佳的性价比,特别适合于对全基因组研究发现的结果进行验证,或者是有限数量的研究位点已经确定的情况。
5.Illumina BeadXpress法 采用Illumina公司的BeadXpress系统进行批量SNP位点检测,可以同时检测1-384个SNP位点,往往用于基因组芯片结果确认,适合高通量检测。微珠芯片具有高密度、高重复性、高灵敏度、低上样量、定制灵活等特点,极高的集成密度,从而获得极高的检测筛选速度,在高通量筛选时可显著降低成本。向左转|向右转
SNP数据构建系统进化树123
爆儿███2b揯2017-10-02
1.TaqMan探针法 针对染色体上的不同SNP位点分别设计PCR引物和TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增。探针的5’-端和3’-端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中存在PCR产物时,该探针与模板退火,即产生了适合于核酸外切酶活性的底物,从而将探针5’-端连接的荧光分子从探针上切割下来,破坏两荧光分子间的PRET,发出荧光。通常用于少量SNP位点分析。
2.SNaPshot法 该技术由美国应用生物公司(ABI)开发,是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析。
蛋白质的酶水解过程研究123
℡欠诚灬2017-10-03
●目前用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶(proteolytic enzyme)或称蛋白酶(proteinase)已有十多种。
●应用酶水解多肽不会破坏氨基酸,也不会发生消旋化。水解的产物为较小的肽段。向左转|向右转
1.TaqMan探针 针染色体同SNP位点别设计PCR引物TaqMan探针进行实荧光PCR扩增探针5’-端3’-端别标记报告荧光基团淬灭荧光基团溶液存PCR产物该探针与模板退火即产适合于核酸外切酶性底物探针5’-端连接荧光探针切割破坏两荧光间PRET发荧光通用于少量SNP位点析
2.SNaPshot 该技术由美应用物公司(ABI)发基于荧光标记单碱基延伸原理型技术称测序主要针等通量SNP型项目含测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临态位点5’-端同度延伸引物PCR产物模板反应体系引物延伸碱基即终止经ABI测序仪检测根据峰移位置确定该延伸产物应SNP位点根据峰颜色知掺入碱基种类确定该本基型于PCR产物模板通重PCR反应体系获通用于10-30SNP位点析

1、目的基因与质粒载体(pET21b)双酶切连接,转DH5a感受态细胞,挑取单菌落,菌落PCR可以P出目的条带(引物是pET21b载体上设计的),扩大培养,提取质粒,但是双酶切只有一条带,测序显示目的基因已连在载体上,双酶切了很多次,都切不出来目的条带,也不是酶切体系(20-100ul都尝试过)和酶切时间(3-4h,过夜都试过)的问题。

求高手指点,到底哪里出问题了!!!

利用NheI和HindIII双酶切插入目的片段,为什么双酶切有目的片段和切开的质粒,测序却没有?

并且测序后在NheI位点后的序列变成了-GGCTAGGTAC-Kpn位点(CGTTTAAACTTAAGCTTG消失。之前和之后的序列都相符),之间的怎么都没了?

PCR程延伸阶段温度升72摄氏度左右高温度所溶液四种脱氧核苷酸需要耐高温Taq DNA聚合酶作用据碱基互补配原则合新DNA链
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