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| Item | Catalog # | Description | Quantity | Price (USD) | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Plasmid | 50454 | Standard format: Plasmid sent in bacteria as agar stab | 1 | $75 | Add to Cart | |
| AAV8 | 50454-AAV8 | Virus (100 µL at titer ≥ 1×10¹³ vg/mL)and Plasmid.More Information | Add to Cart | |||
This material is available to academics and nonprofits only.
Backbone
- Vector backbonepAAV(Search Vector Database)
- Backbone sizew/o insert(bp)4818
- Total vector size (bp)7937
- Vector typeAAV
Growth in Bacteria
- Bacterial Resistance(s)Ampicillin
- Growth Temperature37°C
- Growth Strain(s)Stbl3
- Copy numberLow Copy
Gene/Insert
- Gene/Insert namehM3D(Gq)-IRES-mCitrine
- SpeciesH. sapiens (human)
- Insert Size (bp)3119
- MutationSee supplemental documents for DREADD mutations
- Entrez GeneCHRM3(a.k.a. EGBRS, HM3, PBS)
- Promoterhuman Synapsin 1
- Tag/ Fusion Protein
- HA (N terminal on insert)
Cloning Information
- Cloning methodRestriction Enzyme
- 5′ cloning siteAsc I(not destroyed)
- 3′ cloning siteNhe I(not destroyed)
- 5′ sequencing primerTCGTGTCGTGCCTGAGAGCG
- 3′ sequencing primerGCATTAAAGCAGCGTATCCACATAGC (Common Sequencing Primers)
Resource Information
- Supplemental Documents
- DREADD information
- Terms and Licenses
- UBMTA
- Ancillary Agreement for Plasmids Containing FP Materials
- genOway Notice of RIghts
- Industry Terms
- Not Available to Industry
- Article Citing this Plasmid
- 1 Reference
Depositor Comments
Please see http://pdspit3.mml.unc.edu/projects/dreadd/wiki/WikiStart for more information.
Information for AAV8 (Catalog # 50454-AAV8)(Back to top)
Purpose
Ready-to-use AAV8 particles produced from pAAV-hSyn-DIO-HA-hM3D(Gq)-IRES-mCitrine (#50454). In addition to the viral particles, you will also receive purified pAAV-hSyn-DIO-HA-hM3D(Gq)-IRES-mCitrine plasmid DNA.
Synapsin-driven, Cre-dependent, excitatory hM3D DREADD expression, with physically separate mCitrine expression for cell body labeling. These AAV preparations are suitable purity for injection into animals.Delivery
- Volume100 µL
- Titer≥ 1×10¹³ vg/mL
- Pricing$350 USD for preparation of 100 µL virus + $30 USD for plasmid.
- StorageStore at -80℃. Thaw just before use and keep on ice.
- ShipmentViral particles are shipped frozen on dry ice. Plasmid DNA (≥ 200ng) will also be included in the shipment.
Viral Production & Use
- Packaging Plasmidsencode adenoviral helper sequences and AAV rep gene, AAV8 cap gene
- BufferPBS + 0.001% Pluronic F-68
- SerotypeAAV8
- PurificationIodixanol gradient ultracentrifugation
- Reporter GenemCitrine (Cre-dependent)
Biosafety
Requestor is responsible for compliance withtheir institution"s biosafety regulations.Lentivirus is generally considered BSL-2. AAV isgenerally considered BSL-1, but may requireBSL-2 handling depending on the insert.Biosafety Guide
Resource Information
- Terms and Licenses
- Ancillary Agreement for Penn Vectors
- Terms of Use for Viral Vectors
- Industry Terms
- Not Available to Industry
Viral Quality Control
- Addgene ensures high quality viral vectors by optimizing and standardizing production protocols and performing rigorous quality control (QC) (see a list of our QC assays). Thespecific QC assays performed varies for each viral lot. To learn which specific QC assays were performed on your lot, please contact us.
- Titer: the exact titer of your sample will be reported on the tube. The titer you see listed on this page is the guaranteed minimum titer. See how titers are measured.
Visit our viral production page for moreinformation.
Addgene Comments
Using FLEX vectors in vivo: LoxP sites in FLEX plasmids are known to recombine during DNA amplification and viral vector production, which may result in a minority of Cre-activated (i.e., "flipped") viral vectors. Addgene has measured this occurs in 0.01-0.03% of viral vectors in our typical production protocol. This can lead to a small number of cells exhibiting Cre-independent transgene expression in vivo. To address this, we recommend titrating to find the optimal AAV dosage required for Cre-dependent transgene expression and function in vivo. This may include reducing the viral vector dosage in order to reduce the likelihood of Cre-independent expression.
ebiomall.com
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请教各位高手：
1.本人最近用权威文献中的引物PCR，使用前在NCBI上BLAST了一下，可是并没有结果。这个引物可用吗？
2.自己用OLIGO7设计了一对引物，评分良好，BLAST特异性好。可是实际一直P出某条非目的条带。退火温度也按TM值调节过了。实在想不出什么原因。
3.使用NCBI上的PRIMER-BLAST设计的引物，在NCBI自己的BLAST却找不到目的片段，这是为啥？引物可用吗？
谢谢！
在这里我向大家隆重推荐一个在线的引物设计软件，是斯坦福大学的，我认为是最好的在线引物设计软件，我用它设计接近100多对引物，可以说是屡试不爽。它用起来也很简单，最重要的是效果非常好，考虑的因素也非常的多。
先不说那么多了：网址：http://www.yeastgenome.org/cgi-bin/web-primer
下面我继续图示。
帖子发表之后很多战友PM我，让我帮设计引物，其实这很让我失望的，我的本意是让大家掌握这种方法，而不是告诉大家我是一个专家，其实我水平也有限，所以我不会帮大家设计引物，我认为这是科研工作的一部分、基本功，祝大家好运、实验顺利。
accctcccgccccccccgtat
(互补碱基不写了）
那么一般来说,你就要导入以accctc结尾的引物使得增幅继续下去,具体方法和注意事项楼主可以看gee_an大侠的资料.
查了一下测序公司的网页,如果要同定微生物,楼主需要准备如下东东：
1、待测菌体.试管或培养皿都可以,但必须是纯粹的待测菌体,不能含有其他的微生物.
2、提纯的DNA.如果1有致病性或传染性,那么楼主就得自己提纯DNA再交给测序公司.DNA纯度要求可以做PCR.
反应的催化剂，或在某种代谢合成反应链中起辅助作用的。
帮忙设计这段DNA序列的2个引物，forwardprimer还有reverseprimer，要只含有6个bp
麻烦写详细3端和5端，可以的话写下设计方法，感激不尽啊
刚开始学很是困惑，老师也没详细讲。。。
我们在设计pcr引物的时候，经常需要将设计好的正反向引物与基因组DNA序列进行比对验证，但是因为反向引物是反向互补的，所以有些麻烦。因此，在这里介绍两个非常的小工具，一个是在线的模拟PCR，一个是本地运行的程序包，我会以附件形式上传，不需要蚁豆即可下载。两个都写得非常详细，相信大家都能看懂。不知道这个帖子能不能加分？希望版主看到后给予加分奖励
方法一：UCSC中的In-SilicoPCR
1、登录UCSC，网址链接http://www.genome.ucsc.edu/index.html，点击右侧工具的In-SilicoPCR，或者在Tools下拉框中点击In-SilicoPCR，如下所示：
2、点击In-SilicoPCR后，出现如下界面，我们需要将自己设计好的正向引物和反向引物分别粘贴至各自空白框，点击submit。对其它几个参数做点说明吧，MaxProductSize是指被放大区域的最大长度，MinPerfectMatch是指和引物的3‘末端PerfectMatch的最小碱基数目，MinGoodMatch:是指和引物的3‘末端GoodMatch的最小碱基数目，GoodMatch是3个碱基里最少匹配2个，FlipReversePrimer:反向引物反向互补。
3、我用自己设计的基因举例说明：HNF-1α的EXON2，参考序列：NM_000545，正向引物5’-3‘：CAGCCCTTGCTGAGCAGATCC，反向引物5’-3‘：CCACTGACTTCCTTTCCATCTACC。正向引物和反向引物分别粘贴至各自空白框，点击submit。出现如下结果，其中第一个红色标记指染色体位置，第二个红色标记指长度，第三个红色标记是我们输入的正反向引物，第四个标记可以直接链接至Primer3在线设计引物，网址http://primer3.ut.ee/。比对染色体位置就可以知道我们设计的引物是否包括HNF-1α的EXON2。
方法二：Reverse程序
这个程序是一位程序员朋友专门为我们编写的，操作非常简单，输入反向互补的引物序列后，就可以得到原始碱基序列。文件夹内一共才3个文件。
举例说明，HNF-1α的EXON2，参考序列：NM_000545，正向引物5’-3‘：CAGCCCTTGCTGAGCAGATCC，反向引物5’-3‘：CCACTGACTTCCTTTCCATCTACC。
1、点击target，粘贴反向引物序列。
2、点击右上角关闭键，这时候会弹出对话框，点击保存。
3、打开文件夹中的reverse_complement应用程度，按任意键即可自动关闭。
4、打开文件夹中的result，就可以得到反向互补引物序列对应的原始序列。
5、这时候就可以将正向序列和刚刚得到的原始序列一起代入HNF-1α的EXON2中检验我们设计的引物是否覆盖了目标片段。
好了，就这两个小工具了，非常实用，希望大家有所收获。有什么疑问可以给我留言或者私信我，支持我的战友就请给我投票吧。版主能给予我加分奖励吗？
reverse_complement.rar(95.82k)
它只是一个检验科的检验设备，用来化验血液、尿液中的成分浓度，医生据此来诊断疾病，可以查很多项目，如乙肝五项等等，不能直接检查什么疾病。
非要说差别，可能就在测序引物是让片段线性增加，PCR引物是让片段指数增加。
转换酶中的一类。催化氨基酸和a-氧代酸（a-酮酸
)或醛酸之间的氨基转换反应，生成与原来的a-氧代酸或醛酸相应的a-氨基酸或ω-
氨基酸，原来氨基酸转变成相应的氧代酸。转氨酶催化的反应都是可逆的。转氨酶可按底物的不同分成3大类。L-a-氨基酸（酮酸转氨酶） 、ω-
氨基酸（酮酸转氨酶）和D-氨基酸转氨酶。转氨酶的辅基是磷酸吡哆醛或磷酸吡哆胺，两者在转氨基反应中可互相变换。
转氨酶参与氨基酸的分解和合成。氨基酸转氨后生成的酮酸或醛酸可经氧化分解而供能，也可转变成糖类或脂肪酸。相反，酮酸或醛酸也可经转氨酶的作用而生成非必需氨基酸。某些氨基酸之间的互变也有转氨酶参与。在高等动物各组织中，活力最高的转氨酶是谷氨酸
： 草酰乙酸转氨酶（ GOT ）和谷氨酸：丙酮酸转氨酶（GPT）。
转氨酶是人体代谢过程中必不可少的“催化剂”，主要存在于肝细胞内。当肝细胞发生炎症、坏死、中毒等，造成肝细胞受损时，转氨酶便会释放到血液里，使血清转氨酶升高。
通常，体检中主要检查的转氨酶有丙氨酸转氨酶（ALT，俗称谷丙转氨酶）和天门冬氨酸转氨酶（AST，俗称谷草转氨酶），其中尤以前者（ALT）最为常用。1%的肝脏细胞损害，可以使血中ALT的浓度增加1倍。因此，ALT水平可以比较敏感地监测到肝脏是否受到损害。
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