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引物设计流程之基因编码区(CDS)扩增引物设计
来自 : mayitao
实验方法原理
实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤

1)从杂交过的小鼠胚或鸡胚或器官样本移除杂交溶液并加入800μL预杂交溶液A,7℃洗5min。


2)不要移除预杂交溶液,向试管中再加入400μL2×SSC,pH4.5溶液,70℃洗5min,重复加2×SSC2次,并再洗2次。


3)移去混合液,并在0.1%CHAPS/2×SSC中70℃洗两次,每次洗30min。


4)用含有20μg/mlRNA酶A的0.1%(V/V)CHAPS/2×SSC溶液37℃消化1h。


5)先用MAB室温下洗样本两次,每次10min,再在70℃用MAB洗2次,每次30min。


6)PBS室温下洗样本两次,每次10min。


7)PBT室温下洗5min。


8)室温下用封闭液封闭样本2〜3h。


9)移去封闭液,加入2ml预吸附处理的连接碱性磷酸酶的抗地高辛抗体Fab片段。4℃下轻摇过夜。


10)移除溶液并加入0.1%(m/V)BSA/PBT溶液,将样本转移到20ml的带咬合盖玻璃小瓶中,用0.1%(m/V)BSA/PBT溶液室温下洗5次,每次45min并轻轻摇晃。


11)用PBT溶液洗2次,每次30min。


12)NTMT缓冲液洗3次,每次10min。


如果使用BoehringerMannheim公司的BM紫AP底物溶液则只需洗2次。


13)将样本完全浸没于3mlNBT/BCIP显色溶液或者BM紫AP底物溶液中孵育。用锡箔包住小瓶轻轻摇晃20min开始显色。


14)用肉眼或者用解剖镜观察染色情况。当信号达到希望的水平时(20min〜48h),用PBT至少洗6次以停止显色反应。


显色的样本能够在4℃下含有100mmol/LEDTA的PBT中保存2〜3个月而不影响信号强度。


15)可选:在4%PFA/PBT中4℃固定样本过夜。用PBT洗样本数次然后在PBT中4℃存储。


16)样本放在PBT溶液中在皮氏培养皿拍照。

注意事项
其他

其他试剂


20μg/mlRNaseA(BoehringerMannheim)溶于0.1%CHAPS/2×SSC,70℃。

马来酸缓冲液(MAB)70℃和室温,PBS,PBT:0.1%Tween-20/PBS,封闭液

连接碱性碟酸酶的抗地高辛抗体的Fab片段(BoehringerMannheim),预吸附的40℃,0.1%(m/V)BSA/PBT,碱性磷酸酶缓冲液pH9.5(NTMT),新鲜配制

2mmol/L左旋咪唑/NTMT(可选的),NBT/BCIP底物溶液或者BM紫AP底物

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