
ProductName | Farnesoid-X-activatedReceptor,FarnesoidXreceptor |
Size | 10,000U |
Description | Farnesoid-X-receptor(FXR)wasoriginallyidentifiedandclonedinratasanorphannuclearhormonereceptorbasedonhybridizationwithadegenerateoligonucleotidedesignedfromthehighlyconservednuclearhormonereceptorDNAbindingdomain(1).FXRfunctionsasaheterodimerwithRXRandbindstosequenceelementsinthepromotersoftargetgenes.TheFXR/RXRheterodimerbindswithhighestaffinitytoinvertedrepeatsseparatedby1bp(IR-1)andwithlowaffinitytodirectrepeatsseparatedby4and5bp(DR-4andDR-5)(1,2).Asisthecaseforothernuclearhormonereceptors,FXRregulatestargetgeneactivityinresponsetoligand.WhileinitialstudiessuggestedthatfarnesolandretinoidmetaboliteswerelikelyligandsforFXR,currentdatasupportthenotionthatFXRisabileacidsensorthatplaysanintegralroleinbileacidsynthesisandtransport(1,3-6).Inthesmallintestine,FXRregulatesbileaciduptakethroughtheupregulationoftheilealbileacidbindingproteingeneviabindingtoanupstreamresponseelement(7).TheFXR/RXRheterodimercanbeactivatedbythebilesaltchenodeoxycholicacid(CDCA)andFXRisrequiredforthebilesalt-dependenttranscriptionalcontrolofthehumanABCB11gene(thebilesaltexportpump)(8).Inaddition,FXRhasbeenshowntoinhibitthecholesterol7-hydrolasegene(CYP7A1)transcription(9). |
Applications | FXRhasbeenappliedinDNAandprotein-proteininteractionsassays |
Source | E.coli |
FusionTag | HisTag |
PurificationMethod | FPLC |
UnitDefinition(Activity) | 1unitequalsto1nanogrampurifiedprotein.20unitsaresufficientforagel-mobilityshiftassayand100unitsaresufficientforaprotein-proteininteractionassay |
Purity | ~95%asdeterminedbySDS-PAGE |
GeneID | 9971 |
GeneName | FXR |
GeneSynonyms | BAR;FXR;HRR1;HRR-1;RIP14 |
MW | 56.6kDa |
ProteinSequence | MGSKMNLIEHSHLPTTDEFSFSENLFGVLTEQVAGPLGQNLEVEPYSQYSNVQFPQVQPQ ISSSSYYSNLGFYPQQPEEWYSPGIYELRRMPAETLYQGETEVAEMPVTKKPRMGASAGR IKGDELCVVCGDRASGYHYNALTCEGCKGFFRRSITKNAVYKCKNGGNCVMDMYMRRKCQ ECRLRKCKEMGMLAECLLTEIQCKSKRLRKNVKQHADQTVNEDSEGRDLRQVTSTTKSCR EKTELTPDQQTLLHFIMDSYNKQRMPQEITNKILKEEFSAEENFLILTEMATNHVQVLVE FTKKLPGFQTLDHEDQIALLKGSAVEAMFLRSAEIFNKKLPSGHSDLLEERIRNSGISDE YITPMFSFYKSIGELKMTQEEYALLTAIVILSPDRQYIKDREAVEKLQEPLLDVLQKLCK IHQPENPQHFACLLGRLTELRTFNHHHAEMLMSWRVNDHKFTPLLCEIWDVQ |
StorageBuffer | 20mMTris-HCl,pH8.0,250mMNaCl,50%Glycerol |
Storage | -20to-80°C. |
Shipping | 4°Cordryice |
References | 1.Formanetal.,(1995)Cell81,687-693 |
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当面对某个基因表达调控研究时,第一个想到的研究对象是什么?没错,就是基因的启动子。通过启动子区域对基因表达进行调控是最直接有效的手段,所以也是研究基因表达调控的重点。现在的基因数据库信息丰富,拿到基因及其启动子序列非常简单。那么问题又来了,拿到启动子序列以后,下一步怎么找相关的调控蛋白/转录因子呢?生物信息学方法预测?你会得到很多可能的目标调控蛋白/转录因子,还要做实验一个一个验证。凝胶迁移(EMSA),染色质免疫共沉淀(ChIP)?只能针对已知能与启动子结合的调控蛋白/转录因子,而且还需要相应探针/抗体,对于大量筛选无能为力。
美国Signosis的转录因子(结合启动子)微孔板芯片检测试剂可以方便、高效地解决这一问题。该方法专门用于筛查与特定DNA序列(通常是含有转录因子结合位点的启动子序列)相互作用的调控蛋白/转录因子,获得目的基因的启动子序列后,使用该方法可以筛查48/96种常见的调控蛋白/转录因子与启动子序列结合情况。该方法利用转录因子与特定DNA序列结合的特点,针对每一种转录因子设计相应的生物素标记探针;当混合探针与核蛋白样本共同孵育时,探针与相应的转录因子结合形成转录因子/探针复合物;除去游离的探针,收集转录因子/探针复合物;分离复合物中的DNA探针,探针的量与探针的量与转录因子含量呈正相关。在探针混合物中同时加入启动子片段,如果DNA序列中含有转录因子结合位点,就会与生物素标记的探针竞争性结合转录因子,转录因子与相应探针形成的复合物减少。通过比较有无目的基因启动子片段中转录因子探针检测差异,可以分析出与无目的基因启动子片段相互作用的转录因子种类。
这种方法可以简单、快速地在48/96种常见转录因子筛选出与目的启动子片段相互作用的调控蛋白/转录因子,从而进一步探索目的基因的表达调控。待筛选的调控蛋白/转录因子都是在生命活动中起重要通的调控蛋白/转录因子,大大方便了后续的基因表调控、信号通路及其它方面的研究。
http://www.biomart.cn/infosupply/17197307.htm
转录因子(启动子结合)微孔板阵列检测试剂I(FA-2001_Promoter-binding_TF_profiling_assay_I).pdf(91.72k)
翻译是指mRNA在核糖体的帮助下翻译成肽链
基因表达则是二者的统一,即DNA转录成RNA,RNA翻译成肽链,并最终折叠成有意义的蛋白质
大家好,本人实验小白一枚,目前在寻找自己的毕业课题,有个实验问题想请教论坛里面的各位大侠。前期的实验证明某个转录因子具有抑癌作用,在正常肝脏组织中高表达,在肝癌组织中低表达,在HepG2,SMMC-7721等肝癌细胞株中缺失表达。我现在想用染色质免疫共沉淀结合高通量测序的方法筛选它的下游基因,由于在肝癌细胞株中缺失表达,我可以构建一个过表达转录因子的质粒到肝癌细胞株中做染色质免疫共沉淀吗?或者还有更好的方法筛选下游基因吗?谢谢!
基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。即表达=转录+翻译
转录量和拷贝数是相等的(产生的RNA),但和表达量(蛋白质,最终产物)不同意思,只是表达的第一步,只有转录的也都同样顺利翻译成蛋白质才有同时满足的可能。
转录增加 不等于 表达增加表达增加 也不等于 转录增加成功转录 不代表 成功表达成功表达 说明 成功转录


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