Biological Activity
Proliferating cell nuclear antigen (PCNA) inhibitor. Directly binds PCNA trimers (Kd = 0.41 μM), reduces chromatin-associated PCNA in cells, inhibits cell growth through induction of S and G2M arrest, and attenuates DNA replication in cells. Inhibits growth of a range of tumor cell lines in vitro with IC50 values in the nanomolar to low micromolar range. Inhibits growth of prostate tumor xenografts in mice.
Technical Data
| M. Wt | 310.37 |
| Formula | C17H14N2O2S |
| Storage | Store at +4°C |
| Purity | ≥98% (HPLC) |
| CAS Number | 444930-42-1 |
| PubChem ID | 5410824 |
| InChI Key | WNYIQPCMVYAJLQ-JLHYYAGUSA-N |
| Smiles | O=C(C1=C(C)C=CS1)N/N=C/C2=C(O)C3=CC=CC=C3C=C2 |
The technical data provided above is for guidance only. For batch specific data refer to the Certificate of Analysis.
All Tocris products are intended for laboratory research use only.
Solubility Data
| Solvent | Max Conc. mg/mL | Max Conc. mM | |
|---|---|---|---|
| Solubility | |||
| DMSO | 31.04 | 100 |
Preparing Stock Solutions
The following data is based on the product molecular weight 310.37. Batch specific molecular weights may vary from batch to batch due to solvent of hydration, which will affect the solvent volumes required to prepare stock solutions.
| Concentration / Solvent Volume / Mass | 1 mg | 5 mg | 10 mg |
|---|---|---|---|
| 1 mM | 3.22 mL | 16.11 mL | 32.22 mL |
| 5 mM | 0.64 mL | 3.22 mL | 6.44 mL |
| 10 mM | 0.32 mL | 1.61 mL | 3.22 mL |
| 50 mM | 0.06 mL | 0.32 mL | 0.64 mL |
Molarity Calculator
Reconstitution Calculator
Dilution Calculator
Product Datasheets
References
References are publications that support the products' biological activity.
Tan et al (2012) Small-molecule targeting of proliferating cell nuclear antigen chromatin association inhibits tumor cell growth. Mol.Pharmacol. 81 811 PMID: 22399488
Dillehay et al (2014) Antitumor effects of a novel small molecule targeting PCNA chromatin association in prostate cancer. Mol.Cancer Ther. 13 2817 PMID: 25253786
Keywords: PCNA I1, supplier, PCNA11, Proliferating, cell, nuclear, antigen, PCNA, inhibits, inhibitors, anticancer, cell, cycle, arrest, DNA,, RNA, and, Protein, Synthesis, DNA,, RNA, and, Protein, Synthesis, Tocris Bioscience
TocrisBioscience是一家专卖生命科学研究chemicals,peptidesandantibodies的知名品牌，其产品也广为各大药厂、大学、研究机构，超过五万名科学研究者所采用。目前，產品內容已超過一千六百種以上，並每年持續不斷的增加新的產品。目前，产品内容已超过一千六百种以上，并每年持续不断的增加新的产品。 Tocrisbioscience是位于英国布里斯托尔（Bristol）的高品质试剂提供商，共有2000多种产品，主要集中在神经科学和信号传导领域，产品类型包括小分子、多肽、抗体、配体和化合物筛选文库等，主要产品包括GPCRligands，神经传递素，离子通道调控剂，信号通路抑制剂等，这些产品被广泛选择性地用于阻断或激活生物学通路。Tocris是世界上神经科学研究领域无可争议的领导者，其生产的影响神经系统的化学物质被多次引用，这些物质很多都来自JeffWatkins（Tocris的创立人）在Bristol大学原创性的研究工作。 TocrisBioscience的主要产品包括：SmallMoleculesPeptidesAptamersControlledSubstancesCompoundLibrariesDREADDLigandsFluorescentImagingLigandSetsOptopharmacologyReagentsToxins 按照研究领域细分：CancerCardiovascularSystemEndocrinologyImmunologyNeurosciencePain&InflammationRespiratorySystem
关于Tocris高品质生命科学试剂的领先供应商超过三十年来，TocrisBioscience一直与科学家携手合作，致力于为生命科学研究提供最尖端和最具创新性的研究工具。我们了解，对于研究人员，试剂的可靠性是至关重要的，从这一点出发，我们为客户提供最高品质的产品，让您在发表研究成果时倍感自信。要了解关于Tocris的更多信息，请点击下方的图块。Tocris是Bio-Techne的分支机构，专精于生命科学领域，旗下包含多个著名品牌，如 R&DSystems、NovusBIOLOGicals、ProteinSimple 和 AdvancedCellDiagnostics。Bio-Techne汇聚众多品牌的力量，为研究人员提供全方位的产品，包括研究试剂、定量分析和蛋白质分析平台。要了解关于Bio-Techne及其旗下品牌的更多信息，请访问 bio-techne.com。Tocris职业发展环境保护活动和会议授权我们的理念我们的历史Tocris新闻
TocrisBioscience主要产品分类 1、小分子在生物科学中，小分子作为研究材料具有许多优点，它们可设计成是选择性的、有效的、水溶性的或细胞可渗透的。应用作为激动剂和GPCR的拮抗剂，以及酶抑制剂，核受体配体和离子通道调节剂。许多常用药物是小分子，不像肽和蛋白质，它们可被设计为代谢稳定和口服活性。2、肽肽是由酰胺键连接的α-氨基酸形成的链。肽通常由20种天然存在氨基酸与非天然氨基酸组成。3、对照底物对照底物包含药物或化合物，来自于英国药物生产商的前沿技术。4、毒素毒素是由活细胞或组织产生的有毒物质。5、复合笼利用光解技术，使邻近的受体配体释放，防止扩撒效应。6、光控开关配体光控开关配体是光敏感的化合物，不同波长的光应于神经元的离子通道和受体的调节，能控制神经信号的强度。7、荧光探针结合到受体或蛋白质的荧光探针使研究人员能够检测的复杂生物分子的组件，如活细胞，具有高灵敏度和选择性。Tocris也提供荧光染料、标签等。8、筛选文库9、其他试剂
ebiomall.com
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比如，我需要Amitriptyline，阿密曲替林（一种抗抑郁药）。找哪家公司购买比较好？
另外，说明书上会有保存温度吗？
一般合成的都是粉末状的吧，溶解于溶剂后多少度保存比较好呢？
1.这是我找试剂商购买的进口药，但上面没有显示保存温度以及溶解后的保存温度。求各位大神给我一个建议
2.这是通过casnumber查到的相关信息
性质是易溶于水、甲醇、氯仿的。
但上面那个说明书又是显示轻微溶解于水、甲醇、氯仿的。
这下就有点矛盾了，不知道该相信谁了
生物膜的生物屏障作用阻止了许多高分子物质进入细胞内，然而穿透细胞膜进入细胞内是许多作用靶点在细胞内的生物大分子发挥作用的先决条件，，从而很大程度地限制了这些物质在治疗领域的应用。因此，如何引导这些物质穿透细胞膜是一个迫切需要解决的问题，目前介导生物大分子穿透细胞膜的方法主要包括细胞穿透肽（cellpenetratingpeptides，CPPs）、脂质体、腺病毒、纳米颗粒、影细胞等，而CPPs是一类以非受体依赖方式，非经典内吞方式直接穿过细胞膜进入细胞的多肽，它们的长度一般不超过30个氨基酸且富含碱性氨基酸，氨基酸序列通常带正电荷。
细胞穿透肽（cellpenetratingpeptides，CPPs）的一个重要特点是可以携带多种不同大小和性质的生物活性物质进入细胞，包括小分子化合物、染料、多肽、多肽核酸（peptidenucleoacid,PNA）、蛋白质、质粒DNA、siRNA、200nm的脂质体、噬菌体颗粒和超顺磁性粒子等，这一性质为其成为靶向药物的良好载体提供了可能。CPPs作为载体的优势在于低毒性和无细胞类型的限制，尽管CPPs可输送不同类型的物质进入细胞，但其实际应用多集中于寡肽、蛋白质、寡聚核苷（oligonucleotides，ONs)或类似物的细胞转运。
1型人免疫缺陷病毒转录激活因子TAT（humanimmunodeficiencyvirus-1transcriptionactivator，HIV-1TAT）是第一个被发现的细胞穿透肽，它凭借一种无毒的、高效的方式进入细胞。
跨膜机理
不同的细胞穿透肽（CPP）跨膜机制不同，一个细胞穿透肽（CPP）的具体机制有赖于几个参数，如分子大小（携带物质）、温度、细胞类型和细胞内外的稳定性等。细胞穿透肽（CPP）进入细胞的具体机制目前还不清楚，比较流行的推测包括以下三种：
A:倒置胶粒模型（invertedmicellemodel），CPPs通过细胞膜上磷脂分子的移动形成倒置胶粒结构，而进入胞浆。
B:直接穿透，即孔隙结构模型(poreformationmodel)，CPPs在细胞膜上组成跨膜的孔隙结构而进入胞浆。
C:内吞方式进行细胞摄取。
来源:Cell-penetratingpeptidesandtheirtherapeuticapplications,VictoriaSebbage,BioscienceHorizons,Volume2,Number1,March2009.
CPPS序列
名称来源序列
Tatfamily
Tat(48-60)HIV-1proteinGRKKRRQRRRPPQQ
OligoarginineTatderivativeRn
Penetraliafamily
p-AntpAntermapediahomeodomainRQIKIWFQNRRMKWKK
plslIgl-1homeodomainRVIRVWFQNKRCKDKK
ChimericCPPs
TransportanGalanin-mastoparanGWTLNSAGYLLGKINLKALAALAKKIL
MPGpeptides
P-betagp41-SV40GALFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV
P-alphagp41-SV40GALFLAFLAAALSLMGLWSQPKKKRRV
Pep-1Trp-richmotif-SV40KETWWETWWTEWSQPKKKRRV
细胞穿透肽HIVTAT
细胞穿透肽（如HIVTAT）可以以直接穿透和内吞两种方式进入细胞。HIVTAT或者简单的多聚精氨酸可被设计作为有效的药物载体，但CPP（如HIVTAT）是如何实现胞膜转运，目前仍不清楚。
简单的HIVTAT是如何促进象直接穿透和内吞作用的入胞机制的呢？来自GerardWong实验室的研究人员研究了在不同的条件下，HIVTAT是如何与细胞质膜、细胞骨架、特异的胞膜受体相互作用，从而诱导了多重转运途径。
有趣的是，TAT在不同条件下可与同一序列发生多种不同的反应，因而与胞膜、细胞骨架、特异受体相互作用可产生多种转运途径。
CPP的跨膜机制与多肽序列存在很敏感的关系，如果在一个纯亲水性的CPP中增加一个疏水残基，就能彻底地改变其转运机制，例如，最简单的CPP原型-多聚精氨基（polyR），可以诱导细胞膜上形成跨膜的孔隙结构。疏水氨基酸通过插入胞膜来形成正曲率，精氨酸可同时形成正曲率和负曲率，赖氨酸只能沿一个方向形成负曲率，这就意味着在精氨酸与赖氨酸/疏水物之间存在补偿关系。
如果疏水性有助于形成负高斯曲率（Gaussiancurvature），那为什么TAT肽中的疏水含量相对较低呢？其原因是CPPs都是利用尽可能少的疏水基去形成saddle-splaycurvature。序列上的差异很可能只会在膜上诱导短暂的类似孔隙的跨膜结构，从而形成对CPP来说更短的孔隙寿命。由于CPP的氨基酸组成不同，TAT肽在有或无受体情况下都可以介导细胞内吞作用。
参照药物为rDNA的肽类产品，如果高纯度合成后如何申报存在争议，最近刚出指南草案，给出了一些意见，见附件。
其中该指南指出五种肽，胰高血糖素、利拉鲁肽、奈西立肽、特立帕肽、替度鲁肽。这一类品种都是属于小于等于40aa的肽类产品，其余类似的品种应该也可以参考。
其中提出一些注意事项：
杂质分布相似--------这个还挺难的，不同途径出来的杂质不同，降解杂质会比较一致。化学合成肯定有新的种类，对合成与纯化工艺也是挑战；
对于每种相关的杂质证明合成中杂质水平相同或者更低；
证明合成肽不含超过药物成分0.5%的任何新杂质；
鉴定新的肽相关杂质；
对新的肽相关杂质论证不影响安全性和有效性----------------其中包括免疫原性是个大问题，具体如何做可能需要关注；
说到底就是要去除的非常干净就容易获批。
ANDAsforCertainHighlyPurifiedSyntheticPeptideDrugProductsThatRefertoListedDrugsofrDNAOrigin.pdf(104.95k)
比如硝苯地平的合成反应可以写成一步合成反应，除此之外还有哪些呢？来自刚入门的药物化学狗的提问，望各位大佬多多关照
1.我该如何处理和保存多肽？
冻干粉形式的多肽，经密封包装可在常温条件下稳定运输，溶解状态的多肽不宜长期保存。
多肽保存指南：需要长期保存的多肽，应以冻干粉形式存放在含有干燥剂的密封容器内，置于-20°C保存，-80°C效果更好，可以最大限度地避免多肽降解。这种储存方式可以使多肽可保存数年，避免了被细菌降解和氧化，也可以避免二级结构的形成。
打开包装：在打开包装和称重前，请先将多肽在干燥器中平衡至室温。因多肽往往具有吸湿性，未经平衡到室温的多肽在打开盖子后易凝结，从而降低了多肽产品的稳定性。
称重：迅速称取您所需的多肽，并将剩余多肽继续储存在-20°C或更低温度。与其他多肽相比，含有半胱氨酸、蛋氨酸、色氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺和谷氨酸N-末端的多肽保存期更短。
2.如何溶解多肽？
多肽的溶解性很大程度上取决于多肽的极性。酸性的蛋白溶解于碱性溶液，而碱性蛋白可溶解于酸性溶液，含有大量不带电荷的极性氨基酸残基或疏水性氨基酸的疏水性多肽和中性多肽可先溶解于少量有机溶剂中，如DMSO、DMF、醋酸、乙腈、甲醇、丙醇或异丙醇，然后加水（蒸馏水）稀释。含有甲硫氨酸或半胱氨酸的多肽不能用DMSO溶解，因为DMSO可能造成侧链氧化。
多肽溶解测试：在多肽溶解之前先取小部分进行多肽溶解测试，您需要测试几种不同的溶剂，直到找到最适当的一种。超声处理有助于打碎颗粒并增加溶解度。（注意:超声处理会引起溶液发热和多肽降解。）
将每个酸性氨基酸赋值为－1，包括天冬氨酸（D）、谷氨酸（E）、以及羧基末端-COOH。每个碱性氨基酸赋值为＋1，包括精氨酸（R）、赖氨酸（K）、组氨酸（H）以及氨基末端-NH2。然后计算整个多肽的电荷数。
如果整段肽所带电荷是阳性的，说明该肽是碱性的。可先尝试用蒸馏水来溶解；如果不溶于水，接着尝试用少量10%-25%醋酸溶解，如果仍然失败的话，添加一些TFA（10-50微升）来增溶，然后用水稀释至理想浓度。
如果整段肽所带电荷是阴性的，说明该肽是酸性的。酸性的多肽可以尝试用PBS（PH7.4）来溶解，如果不溶的话，添加少量的碱性溶剂，如0.1M的碳酸氢铵，然后加水稀释至理想浓度。含有游离半胱氨酸的多肽应溶于脱气的酸性缓冲液中，因为当PH值大于7时，巯基会被迅速氧化成二硫化物。
如果整段肽电荷是零，说明肽是中性的。中性肽通常溶于有机溶剂。首先，尝试添加少量乙腈、甲醇或异丙醇。对于高度疏水的多肽，可使用少量的二甲基亚砜溶解，然后用水稀释至理想浓度。对于含有自由半胱氨酸的肽，需使用DMF而不是DMSO。对于有聚集倾向的肽，可添加6M盐酸胍或8M尿素，然后进行必要的稀释。
为了防止或尽量减少多肽降解，请将多肽以冻干粉形式保存在-20°C，-80°C更佳。如果需要保存溶液肽，最好分成小样存放，以避免反复冻融。一份样品融冻后未用完，应扔掉。细菌降解有时会成为溶液肽的麻烦，所以请将肽溶于无菌水或肽溶液过滤除菌。
碱性氨基酸:K,R,H,N-terminus
酸性氨基酸:D,E,C-terminus
极性中性氨基酸:F,I,L,M,V,W,Y
非极性疏水氨基酸:G,A,S,T,C,N,Q,P,乙酰基，酰胺基
举例说明：
RKDEFILGASRHD:(+5)+(-4)=+1认为是碱性多肽，见步骤2
EKDEFILGASEHR:(+4)+(-5)=-1认为是酸性多肽，见步骤3
AKDEFILGASEHR:(+4)+(-4)=0认为是中性多肽，见步骤4
3.一个肽段是否可溶能预测吗？
我们无法通过研究多肽的结构来预测其在水中的溶解度。然而，赖氨酸的ε-氨基和精氨酸的胍通常有助于预测溶解度，尤其是短肽。与此相反，含有天门冬氨酸和谷氨酸的酸性肽往往是不易溶于水的，但易溶于稀氨水或碱性缓冲液。
4.如何选择适合自己研究的多肽纯度？
粗品肽不推荐用于生物实验。粗肽可能含有大量的非肽类杂质，如残留的有机溶剂、清除剂、TFA和其他不完整肽。TFA不能被完全消除，通常交付的肽以TFA盐的形式存在。如果残留的TFA影响您的实验，我们推荐其他盐形式，如醋酸盐和盐酸盐等。这些盐通常比常规TFA盐贵20-30%以上。这是由于在转化过程中出现更多的肽损失和需要更多的原材料。
建议对各种项目采用以下级别的肽纯度：
>70%肽纯度
肽微阵列
层析法
酶联免疫吸附试验检测抗血清滴度
>80%肽纯度
免疫印迹法（非定量）
酶底物肽（非定量）
封闭肽（非定量）
亲和纯化
磷酸化检测
蛋白电泳的应用和免疫细胞化学
>95%肽纯度
标准酶联免疫吸附试验和RIA（定量）
受体配体相互作用（定量）
体内、体外
生物学测定
酶的研究和阻断实验（定量）
NMR研究
质谱分析
其他定量检测
>98%肽纯度
SAR研究
临床试验
APIs(药物活性成分)
工业品
X-ray晶体研究
其他敏感的实验：酶与底物、受体与配体相互作用、阻断和竞争实验
5.什么是多肽的纯度？
多肽的纯度是指HPLC方法在214nm处检测到的目标多肽的含量(214nm是肽链的吸收波长)，紫外分光光度计检测不到水和残留的盐不。可发现其他的杂质包括：缺失序列（缺失了一个或多个氨基酸残基的靶序列），截断序列（加帽过程中产生的序列）脱保护不完全序列（产生于整个合成过程或最后的裂解过程）。
多肽纯化不涉及水和盐。HPLC纯化会产生少量的TFA，如：游离的氨基末端和其他侧链如Arg、Lys、His都可生成少量TFA杂质。通常交付的多肽多含有微量TFA和残留水。即使处于冻干状态，水也会因共价结合的能力不同而不同程度地存在着。
纯化前的多肽中包含的杂质包括多肽和非多肽物质,纯化后的多肽中包含的杂质除了TFA盐，大多数为序列被修改的多肽。
缺失了一个或多个氨基酸残基的靶序列
为避免缺失序列的产生而进行的加帽操作，截断序列即产生于加帽过程中
产生于整个合成过程或最后的裂解过程
保护基重新附着在多肽的其他位置
6.什么是肽净含量？
肽净含量不同于多肽纯度。肽净含量是指与非肽物质（主要为抗衡离子和水）相比的多肽量。可通过氨基酸分析来确定肽净含量。通常，亲水性多肽即使在严格的冻干状态下，也会吸收微量的水。因纯化和冻干工艺，会导致不同批次的肽净含量有所不同。
7.如何合成多肽？
不同于天然蛋白质的合成，人工合成的方向是从C到N端。泽溪源的多肽合成是基于PeptideSyn技术平台的Fmoc或t-Boc法的多肽合成。具体合成由下列几个循环组成：①去保护：Fmoc保护的柱子和单体必须用piperidine去除氨基的保护基团。②激活和交联：下一个氨基酸的羧基被一种活化剂所活化。活化的单体与游离的氨基反应交联，形成肽键。③循环：这两步反应反复循环直到合成完成。接着合成的肽从树脂切割和去保护。最后被沉淀、洗脱、冷冻干燥。
8.WhatsaltformshouldIuse?
PeptidesareusuallydeliveredasTFAsalts.IfresidualTFAwouldbeproblematicforyourexperiment,werecommendothersaltformssuchasacetateandhydrochloride.Thesesaltformsareusually20-30%moreexpensivethantheregularTFAsaltbecauseofthepeptidelossthattakesplaceduringthesaltconversionandthegreateramountsofrawmaterialsrequired.
9.如何对合成的多肽进行质检？
公司对客户提供的所有材料均严格保密。泽溪源总是在发送产品时，同时免费提供HPLC和MS检测结果。公司所有多肽均采用反相色谱法纯化。以质谱法测定肽的分子量来确定产品是否正确，MS检测结果还可显示大部份的主要杂质。如果必要，还可提供肽净含量检测，如氨基酸分析或元素分析。这些方法可以证实多肽的氨基酸组成，他们均可作为多肽确认的补充方法。所有交付的肽均达到了客户要求的纯度。没有达到纯度要求的那些多肽均被丢弃。当然如果客户需要，也可以发送给他们。
10.公司对合成的多肽提供分装服务吗？
根据要求，泽溪源可以将您的部分或全部订单，免费分装成小份。由于少量分装可以避免多次反复冻融，减少容器的开盖和闭合的次数，减少处理不当或细菌污染的机会，让您的多肽更加稳定。
11.什么是原料药（APIs）、目录肽（catalogpeptides）、合成肽（custompeptidesynthesis）？
原料药（活性药物成分）是医药中具有药物活性的成分，如缩宫素、恩夫韦地等。目录肽是市场上销售的多肽，他们通常以较高的纯度水平批量生产。合成肽通常是根据客户的具体要求定制，如特定序列、修饰、不同纯度、不同长度等要求。公司提供的API肽合成周期为2-3周。
12.单个订单的最少合成量是多少？
公司提供的单条订单的最少合成量是1mg，用于研究的多肽和GMP药物肽合成的量在泽溪源没有上限。
13.能够合成的多肽的最大长度是多少？
我们成功合成了长度为120个氨基酸的多肽。50个氨基酸长度的多肽属于常规合成。
14.什么是固相合成？
氯甲基聚苯乙烯树脂作为不溶性的固相载体，首先将一个氨基被封闭基团保护的氨基酸共价连接在固相载体上。在三氟乙酸的作用下，脱掉氨基的保护基，这样第一个氨基酸就接到了固相载体上了。然后氨基被封闭的第二个氨基酸的羧基通过N,Nˊ-二环己基碳二亚胺（DCC，Dicyclohexylcarbodiimide）活化，羧基被DCC活化的第二个氨基酸再与已接在固相载体的第一个氨基酸的氨基反应形成肽键，形成二肽。重复上述肽键形成反应，使肽链从C端向N端延长，直至达到所需要的肽链长度。
15.什么是树脂和链接剂?
树脂是一种以聚苯乙烯等为基质的聚合物支架，是人工合成的固相介质。不同的树脂有不同的特性。如聚乙二醇在非极性溶剂中膨胀，而聚苯乙烯在极性和非极性溶剂中都膨胀。链接剂是链接树脂支架与基质的中间结构。不同的链接剂，适用于基质中的不同功能团。
16.什么是保护基团？
保护基团是能够结合功能基团并阻断其反应活性的片段。有些是acid-lABIle保护基团，如Boc和tert-Bu酯类物质。有些是baselabile保护基团，如Fmoc和Fm酯类物质。还有一些是fluoride-labile保护基团，如Tmsec和Tmse酯类物质。为确保羧基和氨基间的有效耦合，保护基团应该易于被附加和去保护，且不影响其它肽段。
17.为什么要进行N端乙酰化，C端酰胺化修饰？
化学合成的肽往往携带游离的氨基和游离的羧基。而肽的序列往往代表了母本蛋白的序列，为了与母本蛋白更为接近，肽末端往往需要封闭，即N端乙酰化和C端酰胺化，这些修饰会减少多肽的总电荷，降低多肽的溶解度，也可以使肽模拟它在母本蛋白中α氨基和羧基的原始状态。
如果需要对N端进行乙酰化修饰或对C端进行酰胺化修饰，请在下单时明确。合成一旦结束，则不能再进行修改。
18.荧光标记时，肽和修饰标记的染料之间需要加一个间隔吗？
多数染料属于大分子量芳香族氨基酸，在多肽中引入这一类大型分子，为了避免多肽与标签之间发生相互作用，维持蛋白的构象及其生物学活性，我们推荐引入一个可弯曲的间隔区，比如Ahx,Ahx是一个含有6碳分子的环状结构，可以维持荧光标签的稳定性。否则，FITC很容易结合多肽序列中的半胱氨酸残基或者赖氨酸残基。
通常情况下，生物素、FITC一类的染料既可以标记在蛋白的氨基端也可以标记在蛋白的羧基端。然而，为了在最短时间内，最便捷又高效地合成多肽，泽溪源推荐客户选择标记在氨基端。因为一个多肽的合成往往是从羧基端开始的，这样一来，氨基端的修饰便成为最后一个环节，不需要再进行特别的结合作用。反之，羧基端修饰需要额外的环节，因此过程更加复杂。
19.怎样计算多肽的浓度？
PeptidePurityisthepercentagetargetsequenceamongstthetotalquantityofpeptides.Becausepeptidebondformationinsynthesisisnot100%efficient,notallpolypeptidechainsarethetargetsequence.Somechainsmaynotgotocompletion,oraminoacidsmaynotproperlybondoncertainchains.Thesedeletedsequencesmakeupacertainpercentageofpeptidesinyourmixture.WeanalyzeandpurifycrudepeptidesusingReversePhaseHPLCinconjunctionwithMassSpecAnalysistoattainthedesiredtargetsequencepurity.
Afteryourpeptideispurifiedandlyophilized,thewhitepeptidepowderwillcontainsomenon-peptidecomponentssuchaswater,absorbedsolvents,counterionsandsalts.Netpeptidecontentconsistsoftheactualpercentageweightofpeptideinyourfinalproduct.Thisnumbervaries,anywherefrom50to90percent,dependingonthepurity,sequenceandmethodofsynthesisandpurification.WhencalculatingtheconcentrationofpeptidesolutionforBIOLOGicalassaysorothersensitivepeptideexperiments,itisessentialthatyouaccountforpeptidecontent.Peptideconcentrationscanbedeterminedbysubtractingawaythenon-peptideweightdeterminingthevolumeofsolventinwhichtodissolve.Forexample,whenusing1mgoffinalproducttomakea1mg/mlsolutionofpeptidewithacontentof80%,youwoulduse800ulofsolventinsteadof1000ul.
Peptidecontentisnotanindicationofpeptidepurity;thesearetwomeasurements.PurityisdeterminedbyHPLCandindicatesthepresence/absenceofcontaminatingpeptideswithundesiredsequences.Netpeptidecontentonlygivesinformationonthepercentoftotalpeptideversustotalnon-peptidecomponentsindependentlyofthepresenceofmultiplepeptides.NetpeptidecontentisaccuratelyfoundbyperformingaminoacidanalysisorUVspectrophotometry.
Itisdifficulttodeterminetheactualpeptideconcentrationbasedontheweightofthelyophilizedpeptide.Lyophilizedpeptidesmaycontain10-70%waterandsaltsbyweight.Morehydrophilicpeptidesgenerallycontainmoreboundwaterandsaltscomparedtohydrophobicpeptides.
Ifthepeptidehasachromophoreinthesequence(WorYresidues),peptideconcentrationcanbeconvenientlydeterminedbasedontheextinctioncoefficientoftheseresidues.
Thefollowingstepscanbeusedforthecalculations:
Molarextinctioncoefficientsofchromophoricresiduesat280nmatneutralpHusinga1-cmcell:
Tryptophan5560AU/mmole/ml
Tyrosine1200AU/mmole/ml
Theextinctioncoefficientofeachchromophoreinthepeptidesequenceisgenerallyconsideredtobeadditive,thatis,theoverallmolarextinctioncoefficientofthepeptidedependsonthetypesandnumberofthesechoromophoricresiduesinthesequence.
Calculations:mgpeptideperml=(A280xDFxMW)/e,whereA280istheactualabsorbanceofthesolutionat280nmina1-cmcell,DFisthedilutionfactor,MWisthemolecularweightofthepeptideandeisthemolarextinctioncoefficientofeachchromophoreat280nm
Hypotheticalexample:A50XdilutedsolutionofapeptidewiththesequenceGRKKRRQRRRPPQQ(MW=1847)reads0.5AUat280nmina1-cmcell.Tocalculatetheoriginalpeptideconcentrationinthestockpeptidesolution:
Mgpeptide/ml=(0.5AUx50x1847mg/mmole)/[(1x5560)+(2x1200)]AU/mmole/ml=5.8
Cautions:
Anyabsorbancecalculationassumesthatthepeptideisunfoldedandthechromophoresareexposed,whichisusuallythecaseinshort,solublepeptides.Iftherearedoubtsaboutthesolubilityorthefoldingofthepeptide,itisadvisabletomakethemeasurementunderdenaturingconditions(e.g.,6MGdnHClor8Murea).Obviously,thesepeptidesolutionswillberendereduseless,unlessthedenaturantsareremoved.
IfthesequencedoesnothaveTrporTyr,theonlypracticaloptionistodoaminoacidanalysis.
20.如何利用SDS-PAGE法去除小的多肽？
您的样品中是否含有<20kDa的目标蛋白？请点击下载关于用SDS-PAGE法去除小分子合成肽的方案。Tricine-SDS-PAGE方案其中包括考玛斯亮蓝染色和电泳的实验方法。
Tricine-SDS-PAGE被普遍用于分离分子量为1-100kDa的蛋白，它被认为是分辨<30kDa蛋白的首选电泳系统。
21.如何将多肽溶解在DMSO中？
二甲基亚砜（DMSO）是一种含硫有机化合物，分子式为（CH3)2SO，常温下为无色无臭的透明液体。DMSO作为冷冻保护剂经常应用于细胞库。在细胞冷冻过程中，DMSO可防止胞内/胞外晶体的形成，其工作浓度为10%。DMSO通常可与盐或血清白蛋白结合。
疏水性多肽可以很容易地溶解在DMSO中。但DMSO可增加细胞的通透性，若多肽溶解于DMSO中则会对细胞产生毒性作用。高浓度的DMSO绝不可应用于细胞培养中。浓度为5%的DMSO即可让细胞膜溶解。大多数细胞株可以容忍0.5%DMSO，少许可以容忍1%的浓度，而不表现出严重的细胞毒性。然而原代细胞培养对其更敏感。所以如果是用原代细胞做剂量/反应曲线(可行性)，其浓度应低于0.1%。
对于某些疏水性非常高的多肽，可先尝试将其溶解在少量的DMSO(30-50ul,100%)中，然后慢慢(一滴一滴地)将其添加到不断搅拌的水溶液如PBS或其他想要的缓冲液中，直至理想浓度。如果滴加过程中，肽溶液开始变浑浊，说明已经达到了溶解极限。另外，超声波有助于多肽溶解。
经验:
对几乎所有的细胞来说，浓度为0.1%DMSO是安全的。
广泛被用于细胞培养的DMSO终浓度为0.5%，不会引起细胞毒性。
虽然对部份细胞来说，1%DMSO也不会产生细胞毒性，但我们推荐0.5%。
也有5%DMSO成功地应用于某些细胞的案例。
始终保持终浓度在0.5%，但储存时可200倍高浓度溶于100%的DMSO中。
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